MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 10509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	CTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017551	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017551	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017551	AGT	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017551	TCA	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017551	TCA	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017551	AGA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017551	CGA	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017551	ATT	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017551	AGT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017551	AAG	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017551	CAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017551	TGA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017551	ATG	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017551	AAT	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017551	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017551	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017551	TAC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017551	GTT	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017551	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017551	ATT	2	6	2857	2862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017551	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017551	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017551	TAC	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017551	AAT	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017551	TAT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017551	TAT	2	6	4357	4362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017551	ATA	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017551	TAT	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017551	TTA	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017551	AGA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017551	GGC	2	6	12196	12201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017551	CAT	2	6	12510	12515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017551	TCT	2	6	13463	13468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017551	TAA	2	6	13586	13591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017551	ACT	2	6	13657	13662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017551	TTG	2	6	14649	14654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017551	ACA	2	6	14882	14887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017551	ACT	2	6	15011	15016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017551	ATA	2	6	15038	15043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017551	CTA	2	6	15732	15737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017551	GTT	2	6	19433	19438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017551	ATC	2	6	19444	19449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017551	AAC	2	6	19574	19579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017551	TAA	2	6	19732	19737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017551	TTA	2	6	19784	19789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017551	GTT	2	6	21653	21658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017551	TAT	2	6	21690	21695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017551	AGA	2	6	21761	21766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017551	TTG	2	6	23720	23725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017551	AAC	2	6	23809	23814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017551	TGA	2	6	23817	23822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017551	TAA	2	6	23897	23902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017551	TCT	2	6	24104	24109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017551	TTC	2	6	25933	25938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017551	ACT	2	6	25949	25954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017551	ATG	2	6	26040	26045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017551	GAA	2	6	26074	26079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017551	TGA	2	6	26157	26162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017551	GAT	3	9	26201	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017551	TAG	2	6	26225	26230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017551	ATT	2	6	26413	26418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017551	ATA	2	6	26578	26583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017551	AAT	2	6	26627	26632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017551	TAC	2	6	26654	26659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017551	TAT	2	6	26660	26665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017551	TTA	2	6	27098	27103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017551	ATA	2	6	27121	27126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017551	GTT	2	6	27149	27154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017551	ATT	2	6	27235	27240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017551	ACT	2	6	27293	27298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017551	TAT	2	6	27355	27360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017551	ATA	2	6	27417	27422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017551	ACT	2	6	27523	27528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017551	TAT	2	6	27642	27647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017551	TTA	2	6	27885	27890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017551	AGA	2	6	27976	27981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017551	AAT	2	6	31534	31539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017551	ATT	2	6	31582	31587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017551	GAA	2	6	31662	31667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017551	CTT	2	6	31826	31831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017551	TAT	2	6	31883	31888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017551	ATT	2	6	31912	31917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017551	GTT	2	6	31933	31938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017551	CAA	2	6	32021	32026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017551	ATA	2	6	32035	32040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017551	ATT	2	6	33825	33830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017551	AAG	2	6	33860	33865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017551	GTT	2	6	37166	37171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017551	TTC	2	6	39490	39495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017551	GTT	2	6	39499	39504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017551	GAA	2	6	46302	46307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017551	TAT	2	6	46337	46342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017551	GTT	2	6	47931	47936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017551	CAA	2	6	48019	48024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017551	TGA	2	6	50895	50900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017551	TAA	2	6	51050	51055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017551	CTA	2	6	51151	51156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017551	TAA	2	6	51231	51236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017551	TAG	2	6	51241	51246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017551	GTA	2	6	51314	51319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017551	AGT	2	6	51320	51325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017551	GCT	2	6	51421	51426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017551	AAC	2	6	51476	51481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017551	TAA	2	6	51484	51489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017551	TAA	2	6	51523	51528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017551	TAA	2	6	51728	51733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017551	ATT	2	6	51817	51822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017551	AGT	2	6	53752	53757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017551	CAT	2	6	53809	53814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017551	GTT	2	6	53859	53864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017551	ACG	2	6	54059	54064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017551	TTG	2	6	54087	54092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017551	ATT	2	6	62297	62302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017551	TAC	2	6	63273	63278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017551	AGA	2	6	63376	63381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017551	TAT	2	6	63402	63407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017551	AGT	2	6	63420	63425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017551	AGT	2	6	63739	63744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017551	GTT	2	6	65148	65153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017551	ATC	2	6	65209	65214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017551	GAC	2	6	66216	66221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017551	ATT	2	6	67322	67327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017551	TAA	2	6	67445	67450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017551	TAT	2	6	67456	67461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017551	TTC	2	6	67596	67601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017551	ATA	2	6	67639	67644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017551	AAT	2	6	67868	67873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017551	ATG	2	6	68769	68774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017551	AAG	2	6	68792	68797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017551	AAT	2	6	71143	71148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017551	GAA	2	6	71302	71307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017551	GGA	2	6	71381	71386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017551	ATT	2	6	71472	71477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017551	GGA	2	6	71494	71499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017551	AGT	2	6	71515	71520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017551	GTT	2	6	71544	71549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017551	GCG	2	6	71563	71568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017551	TAT	2	6	71699	71704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017551	CTA	2	6	73162	73167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017551	TGT	2	6	73201	73206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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