MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 36042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	GGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072489
2	NC_017551	GAA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072489
3	NC_017551	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072489
4	NC_017551	AGC	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072489
5	NC_017551	TCT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
6	NC_017551	GAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072489
7	NC_017551	TCA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072489
8	NC_017551	GAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072489
9	NC_017551	CTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
10	NC_017551	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
11	NC_017551	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
12	NC_017551	CAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072489
13	NC_017551	TAC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072490
14	NC_017551	TAT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
15	NC_017551	CTG	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386072490
16	NC_017551	AAG	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
17	NC_017551	AAC	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072490
18	NC_017551	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
19	NC_017551	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
20	NC_017551	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072490
21	NC_017551	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
22	NC_017551	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
23	NC_017551	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
24	NC_017551	TTG	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072490
25	NC_017551	GAA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
26	NC_017551	TAT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
27	NC_017551	ACA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072490
28	NC_017551	TAT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
29	NC_017551	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
30	NC_017551	AGA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
31	NC_017551	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072490
32	NC_017551	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
33	NC_017551	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
34	NC_017551	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
35	NC_017551	AAG	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
36	NC_017551	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
37	NC_017551	GGT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072491
38	NC_017551	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072491
39	NC_017551	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
40	NC_017551	TTC	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072491
41	NC_017551	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072491
42	NC_017551	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072491
43	NC_017551	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
44	NC_017551	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072491
45	NC_017551	GGA	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072491
46	NC_017551	GAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072491
47	NC_017551	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072491
48	NC_017551	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
49	NC_017551	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072491
50	NC_017551	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
51	NC_017551	ACG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072491
52	NC_017551	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072492
53	NC_017551	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072492
54	NC_017551	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072492
55	NC_017551	CTT	2	6	6426	6431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072492
56	NC_017551	TTC	2	6	6546	6551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072492
57	NC_017551	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
58	NC_017551	GTT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072493
59	NC_017551	GGT	2	6	6932	6937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
60	NC_017551	ATG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072493
61	NC_017551	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
62	NC_017551	TTC	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
63	NC_017551	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386072493
64	NC_017551	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072493
65	NC_017551	AAG	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
66	NC_017551	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
67	NC_017551	GGT	3	9	7838	7846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
68	NC_017551	GGT	2	6	7925	7930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
69	NC_017551	TTC	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
70	NC_017551	GAA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
71	NC_017551	CTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
72	NC_017551	CCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072493
73	NC_017551	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072493
74	NC_017551	AGA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
75	NC_017551	AAG	2	6	8688	8693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
76	NC_017551	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
77	NC_017551	TTG	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072494
78	NC_017551	ATC	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072494
79	NC_017551	CGG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072494
80	NC_017551	GAA	2	6	9029	9034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
81	NC_017551	TTA	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072494
82	NC_017551	ATG	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072494
83	NC_017551	AAC	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072494
84	NC_017551	TTC	2	6	9145	9150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072494
85	NC_017551	TCC	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072494
86	NC_017551	ATT	2	6	9299	9304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072494
87	NC_017551	AGA	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
88	NC_017551	AGA	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
89	NC_017551	TCC	2	6	9838	9843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072494
90	NC_017551	ACA	2	6	9853	9858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072494
91	NC_017551	TGA	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072494
92	NC_017551	AGA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
93	NC_017551	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
94	NC_017551	ATC	2	6	9983	9988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072494
95	NC_017551	AAG	2	6	10050	10055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
96	NC_017551	TTC	2	6	10114	10119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072494
97	NC_017551	GAA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
98	NC_017551	GGT	2	6	10226	10231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072494
99	NC_017551	GAT	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072494
100	NC_017551	ATA	2	6	10302	10307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072494
101	NC_017551	AAG	2	6	10374	10379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
102	NC_017551	ATC	2	6	10403	10408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072494
103	NC_017551	TCT	2	6	10474	10479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072494
104	NC_017551	TTA	2	6	10500	10505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072494
105	NC_017551	ATT	2	6	10550	10555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072494
106	NC_017551	CAT	2	6	10666	10671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072494
107	NC_017551	GAA	2	6	10683	10688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
108	NC_017551	GTG	2	6	10695	10700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072494
109	NC_017551	AAG	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
110	NC_017551	GAA	2	6	10784	10789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
111	NC_017551	GAA	2	6	10814	10819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
112	NC_017551	GGC	2	6	10838	10843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072494
113	NC_017551	ATT	2	6	10922	10927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072494
114	NC_017551	CAA	2	6	10937	10942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072494
115	NC_017551	CTG	2	6	10992	10997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386072494
116	NC_017551	GCT	2	6	11175	11180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386072495
117	NC_017551	GAA	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072495
118	NC_017551	CAT	2	6	11351	11356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072495
119	NC_017551	GTT	2	6	11371	11376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072495
120	NC_017551	GAG	2	6	11398	11403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072495
121	NC_017551	GAA	2	6	11550	11555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072495
122	NC_017551	AGG	2	6	11695	11700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072495
123	NC_017551	GAA	2	6	11793	11798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072495
124	NC_017551	ACA	2	6	11831	11836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072495
125	NC_017551	GAT	2	6	11846	11851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072495
126	NC_017551	GAA	2	6	11865	11870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072495
127	NC_017551	ATT	2	6	11948	11953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072495
128	NC_017551	ACT	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072495
129	NC_017551	CGA	3	9	12218	12226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072496
130	NC_017551	TTG	2	6	12694	12699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072497
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