MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 6225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	TA	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017551	AG	4	8	222	229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017551	TA	4	8	655	662	50 %	50 %	0 %	0 %	386072489
4	NC_017551	TC	3	6	872	877	0 %	50 %	0 %	50 %	386072489
5	NC_017551	AT	3	6	1114	1119	50 %	50 %	0 %	0 %	386072489
6	NC_017551	AT	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	386072489
7	NC_017551	AC	3	6	1457	1462	50 %	0 %	0 %	50 %	386072489
8	NC_017551	TA	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017551	TA	3	6	2955	2960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017551	AG	3	6	3290	3295	50 %	0 %	50 %	0 %	386072490
11	NC_017551	TC	3	6	3349	3354	0 %	50 %	0 %	50 %	386072490
12	NC_017551	TA	3	6	4602	4607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017551	TA	3	6	4993	4998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017551	AG	3	6	10108	10113	50 %	0 %	50 %	0 %	386072494
15	NC_017551	TC	3	6	10391	10396	0 %	50 %	0 %	50 %	386072494
16	NC_017551	GA	3	6	10414	10419	50 %	0 %	50 %	0 %	386072494
17	NC_017551	AT	3	6	10426	10431	50 %	50 %	0 %	0 %	386072494
18	NC_017551	AT	3	6	10767	10772	50 %	50 %	0 %	0 %	386072494
19	NC_017551	AC	3	6	13355	13360	50 %	0 %	0 %	50 %	386072497
20	NC_017551	CA	3	6	13622	13627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017551	AC	3	6	14116	14121	50 %	0 %	0 %	50 %	386072498
22	NC_017551	AT	3	6	14289	14294	50 %	50 %	0 %	0 %	386072498
23	NC_017551	AT	3	6	15128	15133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017551	AC	3	6	15226	15231	50 %	0 %	0 %	50 %	386072499
25	NC_017551	AT	3	6	16998	17003	50 %	50 %	0 %	0 %	386072500
26	NC_017551	TC	3	6	17823	17828	0 %	50 %	0 %	50 %	386072501
27	NC_017551	GA	3	6	18149	18154	50 %	0 %	50 %	0 %	386072501
28	NC_017551	AT	3	6	20199	20204	50 %	50 %	0 %	0 %	386072504
29	NC_017551	TC	3	6	20422	20427	0 %	50 %	0 %	50 %	386072504
30	NC_017551	AT	4	8	20787	20794	50 %	50 %	0 %	0 %	386072505
31	NC_017551	AT	3	6	21751	21756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017551	TA	3	6	23138	23143	50 %	50 %	0 %	0 %	386072508
33	NC_017551	CT	4	8	23241	23248	0 %	50 %	0 %	50 %	386072508
34	NC_017551	TA	3	6	23282	23287	50 %	50 %	0 %	0 %	386072508
35	NC_017551	TA	3	6	23708	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017551	TG	3	6	24178	24183	0 %	50 %	50 %	0 %	386072509
37	NC_017551	GA	3	6	24536	24541	50 %	0 %	50 %	0 %	386072509
38	NC_017551	TA	3	6	25743	25748	50 %	50 %	0 %	0 %	386072509
39	NC_017551	GA	3	6	26788	26793	50 %	0 %	50 %	0 %	386072510
40	NC_017551	CA	3	6	27758	27763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017551	AT	4	8	29721	29728	50 %	50 %	0 %	0 %	386072512
42	NC_017551	TC	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	386072512
43	NC_017551	AT	3	6	30752	30757	50 %	50 %	0 %	0 %	386072512
44	NC_017551	TG	3	6	32633	32638	0 %	50 %	50 %	0 %	386072514
45	NC_017551	GA	3	6	32668	32673	50 %	0 %	50 %	0 %	386072514
46	NC_017551	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	386072514
47	NC_017551	GA	3	6	36379	36384	50 %	0 %	50 %	0 %	386072518
48	NC_017551	GA	3	6	36800	36805	50 %	0 %	50 %	0 %	386072518
49	NC_017551	CG	3	6	38387	38392	0 %	0 %	50 %	50 %	386072519
50	NC_017551	AT	3	6	43234	43239	50 %	50 %	0 %	0 %	386072523
51	NC_017551	TA	3	6	43263	43268	50 %	50 %	0 %	0 %	386072523
52	NC_017551	TA	4	8	44378	44385	50 %	50 %	0 %	0 %	386072524
53	NC_017551	AG	3	6	44513	44518	50 %	0 %	50 %	0 %	386072524
54	NC_017551	AT	3	6	44650	44655	50 %	50 %	0 %	0 %	386072524
55	NC_017551	AT	3	6	46320	46325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017551	TC	3	6	46958	46963	0 %	50 %	0 %	50 %	386072526
57	NC_017551	AT	3	6	50326	50331	50 %	50 %	0 %	0 %	386072529
58	NC_017551	TA	3	6	51008	51013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017551	TA	3	6	51170	51175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017551	TA	3	6	51376	51381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017551	TA	3	6	51764	51769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017551	GA	3	6	52071	52076	50 %	0 %	50 %	0 %	386072531
63	NC_017551	TC	3	6	52260	52265	0 %	50 %	0 %	50 %	386072531
64	NC_017551	TA	3	6	53270	53275	50 %	50 %	0 %	0 %	386072531
65	NC_017551	TG	3	6	55105	55110	0 %	50 %	50 %	0 %	386072533
66	NC_017551	AG	3	6	55498	55503	50 %	0 %	50 %	0 %	386072533
67	NC_017551	AG	3	6	57688	57693	50 %	0 %	50 %	0 %	386072535
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70	NC_017551	AT	3	6	59294	59299	50 %	50 %	0 %	0 %	386072537
71	NC_017551	AG	3	6	59888	59893	50 %	0 %	50 %	0 %	386072537
72	NC_017551	AT	3	6	60103	60108	50 %	50 %	0 %	0 %	386072537
73	NC_017551	AT	3	6	60625	60630	50 %	50 %	0 %	0 %	386072538
74	NC_017551	GA	3	6	62207	62212	50 %	0 %	50 %	0 %	386072538
75	NC_017551	GA	3	6	62737	62742	50 %	0 %	50 %	0 %	386072539
76	NC_017551	AT	3	6	63137	63142	50 %	50 %	0 %	0 %	386072539
77	NC_017551	GA	3	6	65414	65419	50 %	0 %	50 %	0 %	386072541
78	NC_017551	AT	3	6	67646	67651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017551	TC	3	6	68165	68170	0 %	50 %	0 %	50 %	386072543
80	NC_017551	AC	3	6	68833	68838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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82	NC_017551	TA	3	6	71311	71316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017551	AG	3	6	71409	71414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017551	TA	3	6	71425	71430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017551	TC	3	6	71853	71858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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90	NC_017551	AG	3	6	75594	75599	50 %	0 %	50 %	0 %	386072548
91	NC_017551	AG	3	6	76249	76254	50 %	0 %	50 %	0 %	386072548
92	NC_017551	GA	3	6	76431	76436	50 %	0 %	50 %	0 %	386072548
93	NC_017551	AG	3	6	76542	76547	50 %	0 %	50 %	0 %	386072548
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98	NC_017551	AT	3	6	80499	80504	50 %	50 %	0 %	0 %	386072550
99	NC_017551	TA	3	6	80564	80569	50 %	50 %	0 %	0 %	386072550
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101	NC_017551	TA	3	6	82568	82573	50 %	50 %	0 %	0 %	386072550
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103	NC_017551	TA	3	6	83493	83498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017551	TA	3	6	84156	84161	50 %	50 %	0 %	0 %	386072552
105	NC_017551	TA	3	6	86396	86401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017551	TA	3	6	86410	86415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017551	AT	3	6	86955	86960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017551	AT	3	6	87759	87764	50 %	50 %	0 %	0 %	386072556
109	NC_017551	AT	4	8	88442	88449	50 %	50 %	0 %	0 %	386072557
110	NC_017551	AT	3	6	88520	88525	50 %	50 %	0 %	0 %	386072557
111	NC_017551	GT	3	6	89413	89418	0 %	50 %	50 %	0 %	386072558
112	NC_017551	AT	3	6	89573	89578	50 %	50 %	0 %	0 %	386072558
113	NC_017551	AT	3	6	89948	89953	50 %	50 %	0 %	0 %	386072558
114	NC_017551	TC	3	6	91330	91335	0 %	50 %	0 %	50 %	386072559
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116	NC_017551	AT	3	6	93867	93872	50 %	50 %	0 %	0 %	386072562
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119	NC_017551	TA	3	6	94501	94506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017551	CT	3	6	94935	94940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017551	CT	3	6	95390	95395	0 %	50 %	0 %	50 %	386072564
122	NC_017551	AT	3	6	96130	96135	50 %	50 %	0 %	0 %	386072564
123	NC_017551	TC	3	6	97369	97374	0 %	50 %	0 %	50 %	386072566
124	NC_017551	GA	3	6	97967	97972	50 %	0 %	50 %	0 %	386072567
125	NC_017551	TA	3	6	99338	99343	50 %	50 %	0 %	0 %	386072569
126	NC_017551	AT	3	6	99976	99981	50 %	50 %	0 %	0 %	386072569
127	NC_017551	AT	3	6	100245	100250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017551	GC	3	6	100642	100647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017551	GA	3	6	102095	102100	50 %	0 %	50 %	0 %	386072572
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131	NC_017551	TA	3	6	104060	104065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017551	TA	3	6	104451	104456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_017551	AT	3	6	106249	106254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017551	TA	3	6	106271	106276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017551	TA	3	6	106322	106327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017551	AT	3	6	106498	106503	50 %	50 %	0 %	0 %	386072575
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