MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa NCGM2.S1 chromosome 1

Total Repeats: 4508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017549	TGACC	2	10	3816	3825	20 %	20 %	20 %	40 %	386062976
2	NC_017549	CTGCT	2	10	5076	5085	0 %	40 %	20 %	40 %	386062977
3	NC_017549	GCCGC	2	10	6638	6647	0 %	0 %	40 %	60 %	386062977
4	NC_017549	CCCTG	2	10	8897	8906	0 %	20 %	20 %	60 %	386062980
5	NC_017549	CGCGG	2	10	9474	9483	0 %	0 %	60 %	40 %	386062980
6	NC_017549	GCGCG	2	10	10649	10658	0 %	0 %	60 %	40 %	386062981
7	NC_017549	GCTTG	2	10	10896	10905	0 %	40 %	40 %	20 %	386062981
8	NC_017549	CAGCG	2	10	11106	11115	20 %	0 %	40 %	40 %	386062981
9	NC_017549	ACGGT	2	10	12337	12346	20 %	20 %	40 %	20 %	386062981
10	NC_017549	CGGCG	2	10	12388	12397	0 %	0 %	60 %	40 %	386062981
11	NC_017549	CGTGC	2	10	14356	14365	0 %	20 %	40 %	40 %	386062984
12	NC_017549	GCAGC	2	10	18022	18031	20 %	0 %	40 %	40 %	386062988
13	NC_017549	GCCTT	2	10	18365	18374	0 %	40 %	20 %	40 %	386062988
14	NC_017549	GCCTT	2	10	18665	18674	0 %	40 %	20 %	40 %	386062988
15	NC_017549	CGGCG	2	10	19518	19527	0 %	0 %	60 %	40 %	386062989
16	NC_017549	CTGCC	2	10	20322	20331	0 %	20 %	20 %	60 %	386062990
17	NC_017549	CGGCG	2	10	20723	20732	0 %	0 %	60 %	40 %	386062990
18	NC_017549	CTCGG	2	10	21441	21450	0 %	20 %	40 %	40 %	386062991
19	NC_017549	CGAGC	2	10	22513	22522	20 %	0 %	40 %	40 %	386062992
20	NC_017549	TTCGG	2	10	23047	23056	0 %	40 %	40 %	20 %	386062993
21	NC_017549	GGCGC	2	10	23523	23532	0 %	0 %	60 %	40 %	386062993
22	NC_017549	CCGGG	2	10	27026	27035	0 %	0 %	60 %	40 %	386062997
23	NC_017549	TGGCG	2	10	27546	27555	0 %	20 %	60 %	20 %	386062997
24	NC_017549	GGCCT	2	10	29637	29646	0 %	20 %	40 %	40 %	386062999
25	NC_017549	AGCGC	2	10	30444	30453	20 %	0 %	40 %	40 %	386063000
26	NC_017549	CAAGC	2	10	31505	31514	40 %	0 %	20 %	40 %	386063001
27	NC_017549	CGGCC	2	10	32501	32510	0 %	0 %	40 %	60 %	386063002
28	NC_017549	CAGCT	2	10	34766	34775	20 %	20 %	20 %	40 %	386063004
29	NC_017549	GCCGA	2	10	37269	37278	20 %	0 %	40 %	40 %	386063008
30	NC_017549	GGCCG	2	10	37784	37793	0 %	0 %	60 %	40 %	386063008
31	NC_017549	ATCGG	2	10	37800	37809	20 %	20 %	40 %	20 %	386063008
32	NC_017549	TCCCT	2	10	39294	39303	0 %	40 %	0 %	60 %	386063010
33	NC_017549	GCGCT	2	10	39926	39935	0 %	20 %	40 %	40 %	386063010
34	NC_017549	CGGCG	2	10	44406	44415	0 %	0 %	60 %	40 %	386063014
35	NC_017549	CGGCG	2	10	47319	47328	0 %	0 %	60 %	40 %	386063014
36	NC_017549	GCCGG	2	10	47657	47666	0 %	0 %	60 %	40 %	386063014
37	NC_017549	GGCGC	2	10	49665	49674	0 %	0 %	60 %	40 %	386063014
38	NC_017549	ACGCC	2	10	49982	49991	20 %	0 %	20 %	60 %	386063014
39	NC_017549	CTGCG	2	10	51665	51674	0 %	20 %	40 %	40 %	386063014
40	NC_017549	TCGCA	2	10	51721	51730	20 %	20 %	20 %	40 %	386063014
41	NC_017549	CGTGA	2	10	56693	56702	20 %	20 %	40 %	20 %	386063015
42	NC_017549	GCCAG	2	10	56853	56862	20 %	0 %	40 %	40 %	386063015
43	NC_017549	CCACA	2	10	59883	59892	40 %	0 %	0 %	60 %	386063016
44	NC_017549	TCCCC	2	10	61700	61709	0 %	20 %	0 %	80 %	386063019
45	NC_017549	GGTCC	2	10	61755	61764	0 %	20 %	40 %	40 %	386063019
46	NC_017549	CAGGG	2	10	64412	64421	20 %	0 %	60 %	20 %	386063021
47	NC_017549	CGGTG	2	10	68336	68345	0 %	20 %	60 %	20 %	386063026
48	NC_017549	GCCGG	2	10	71228	71237	0 %	0 %	60 %	40 %	386063029
49	NC_017549	CGCGC	2	10	73890	73899	0 %	0 %	40 %	60 %	386063031
50	NC_017549	TCCAT	2	10	74019	74028	20 %	40 %	0 %	40 %	386063031
51	NC_017549	CGGCG	2	10	75048	75057	0 %	0 %	60 %	40 %	386063033
52	NC_017549	CGGCG	2	10	76935	76944	0 %	0 %	60 %	40 %	386063035
53	NC_017549	GGTCG	2	10	78894	78903	0 %	20 %	60 %	20 %	386063039
54	NC_017549	TCGGG	2	10	79046	79055	0 %	20 %	60 %	20 %	386063039
55	NC_017549	AGCGC	2	10	82008	82017	20 %	0 %	40 %	40 %	386063042
56	NC_017549	TGCTC	2	10	85724	85733	0 %	40 %	20 %	40 %	386063046
57	NC_017549	CGCCT	2	10	88794	88803	0 %	20 %	20 %	60 %	386063048
58	NC_017549	CCGCG	2	10	89050	89059	0 %	0 %	40 %	60 %	386063049
59	NC_017549	GGCGC	2	10	90434	90443	0 %	0 %	60 %	40 %	386063050
60	NC_017549	GGTCA	2	10	91373	91382	20 %	20 %	40 %	20 %	386063051
61	NC_017549	GCGCC	2	10	95935	95944	0 %	0 %	40 %	60 %	386063054
62	NC_017549	CGCGC	2	10	97975	97984	0 %	0 %	40 %	60 %	386063054
63	NC_017549	AGGCC	2	10	99558	99567	20 %	0 %	40 %	40 %	386063055
64	NC_017549	ACCAC	2	10	101646	101655	40 %	0 %	0 %	60 %	386063056
65	NC_017549	GCGCC	2	10	103184	103193	0 %	0 %	40 %	60 %	386063058
66	NC_017549	TCGGC	2	10	104729	104738	0 %	20 %	40 %	40 %	386063059
67	NC_017549	ACCGC	2	10	109712	109721	20 %	0 %	20 %	60 %	386063065
68	NC_017549	TCGAC	2	10	111832	111841	20 %	20 %	20 %	40 %	386063066
69	NC_017549	AGGCG	2	10	113769	113778	20 %	0 %	60 %	20 %	386063067
70	NC_017549	GCCCT	2	10	117621	117630	0 %	20 %	20 %	60 %	386063071
71	NC_017549	CTGCG	2	10	122170	122179	0 %	20 %	40 %	40 %	386063074
72	NC_017549	CCGCG	2	10	122502	122511	0 %	0 %	40 %	60 %	386063075
73	NC_017549	TGAAG	2	10	124925	124934	40 %	20 %	40 %	0 %	386063077
74	NC_017549	TGGCC	2	10	126961	126970	0 %	20 %	40 %	40 %	386063079
75	NC_017549	GCCCG	2	10	127213	127222	0 %	0 %	40 %	60 %	386063079
76	NC_017549	CGCGG	2	10	127564	127573	0 %	0 %	60 %	40 %	386063079
77	NC_017549	CGCGC	2	10	128869	128878	0 %	0 %	40 %	60 %	386063080
78	NC_017549	GGCGG	2	10	130652	130661	0 %	0 %	80 %	20 %	386063081
79	NC_017549	TGGAG	2	10	134334	134343	20 %	20 %	60 %	0 %	386063083
80	NC_017549	TCCGC	2	10	134644	134653	0 %	20 %	20 %	60 %	386063084
81	NC_017549	CGGCG	2	10	136300	136309	0 %	0 %	60 %	40 %	386063087
82	NC_017549	CCGCG	2	10	136901	136910	0 %	0 %	40 %	60 %	386063088
83	NC_017549	CGCGG	2	10	138008	138017	0 %	0 %	60 %	40 %	386063089
84	NC_017549	GCAGC	2	10	138320	138329	20 %	0 %	40 %	40 %	386063089
85	NC_017549	CGGCG	2	10	138804	138813	0 %	0 %	60 %	40 %	386063090
86	NC_017549	CTCGC	2	10	138994	139003	0 %	20 %	20 %	60 %	386063090
87	NC_017549	AGCGC	2	10	144421	144430	20 %	0 %	40 %	40 %	386063096
88	NC_017549	GGCGA	2	10	144759	144768	20 %	0 %	60 %	20 %	386063097
89	NC_017549	GCCCG	2	10	146941	146950	0 %	0 %	40 %	60 %	386063100
90	NC_017549	GGCCG	2	10	148770	148779	0 %	0 %	60 %	40 %	386063103
91	NC_017549	GCCGG	2	10	148963	148972	0 %	0 %	60 %	40 %	386063103
92	NC_017549	CGGAG	2	10	149088	149097	20 %	0 %	60 %	20 %	386063103
93	NC_017549	GGCCG	2	10	151525	151534	0 %	0 %	60 %	40 %	386063106
94	NC_017549	ATGGC	2	10	151544	151553	20 %	20 %	40 %	20 %	386063106
95	NC_017549	TCTTG	2	10	153348	153357	0 %	60 %	20 %	20 %	386063107
96	NC_017549	CGGCG	2	10	160034	160043	0 %	0 %	60 %	40 %	386063113
97	NC_017549	GCGCA	2	10	160928	160937	20 %	0 %	40 %	40 %	386063114
98	NC_017549	CTGGT	2	10	161015	161024	0 %	40 %	40 %	20 %	386063114
99	NC_017549	CGACC	2	10	162787	162796	20 %	0 %	20 %	60 %	386063117
100	NC_017549	CGGCG	2	10	164877	164886	0 %	0 %	60 %	40 %	386063119
101	NC_017549	GGCCG	2	10	165847	165856	0 %	0 %	60 %	40 %	386063119
102	NC_017549	CTGGG	2	10	167263	167272	0 %	20 %	60 %	20 %	386063120
103	NC_017549	CGGTA	2	10	168919	168928	20 %	20 %	40 %	20 %	386063122
104	NC_017549	GCACA	2	10	169566	169575	40 %	0 %	20 %	40 %	386063122
105	NC_017549	CCGGC	2	10	170893	170902	0 %	0 %	40 %	60 %	386063124
106	NC_017549	CGGCG	2	10	173271	173280	0 %	0 %	60 %	40 %	386063126
107	NC_017549	GCCCT	2	10	173501	173510	0 %	20 %	20 %	60 %	386063128
108	NC_017549	GACCT	2	10	173621	173630	20 %	20 %	20 %	40 %	386063128
109	NC_017549	CCGCG	2	10	173743	173752	0 %	0 %	40 %	60 %	386063128
110	NC_017549	CAGGC	2	10	174296	174305	20 %	0 %	40 %	40 %	386063128
111	NC_017549	GACCC	2	10	175087	175096	20 %	0 %	20 %	60 %	386063129
112	NC_017549	CTGGC	2	10	175847	175856	0 %	20 %	40 %	40 %	386063130
113	NC_017549	GCCGC	2	10	176344	176353	0 %	0 %	40 %	60 %	386063131
114	NC_017549	GACCC	2	10	178261	178270	20 %	0 %	20 %	60 %	386063131
115	NC_017549	ACCCG	2	10	180754	180763	20 %	0 %	20 %	60 %	386063134
116	NC_017549	CACCG	2	10	181667	181676	20 %	0 %	20 %	60 %	386063136
117	NC_017549	GGCCC	2	10	184214	184223	0 %	0 %	40 %	60 %	386063138
118	NC_017549	CTGGT	2	10	184745	184754	0 %	40 %	40 %	20 %	386063139
119	NC_017549	GCCAT	2	10	188721	188730	20 %	20 %	20 %	40 %	386063140
120	NC_017549	GGCGG	2	10	190144	190153	0 %	0 %	80 %	20 %	386063143
121	NC_017549	GCGAG	2	10	191266	191275	20 %	0 %	60 %	20 %	386063144
122	NC_017549	CGCGC	2	10	193404	193413	0 %	0 %	40 %	60 %	386063145
123	NC_017549	GCCGC	2	10	193453	193462	0 %	0 %	40 %	60 %	386063145
124	NC_017549	CAGGC	2	10	194344	194353	20 %	0 %	40 %	40 %	386063146
125	NC_017549	CATGA	2	10	194367	194376	40 %	20 %	20 %	20 %	386063146
126	NC_017549	GCCGC	2	10	197305	197314	0 %	0 %	40 %	60 %	386063148
127	NC_017549	GGACA	2	10	197780	197789	40 %	0 %	40 %	20 %	386063149
128	NC_017549	TCGCT	2	10	199767	199776	0 %	40 %	20 %	40 %	386063152
129	NC_017549	AGCAG	2	10	199860	199869	40 %	0 %	40 %	20 %	386063152
130	NC_017549	AATCG	2	10	199934	199943	40 %	20 %	20 %	20 %	386063153
131	NC_017549	AGGCC	2	10	201791	201800	20 %	0 %	40 %	40 %	386063153
132	NC_017549	CCAGC	2	10	201831	201840	20 %	0 %	20 %	60 %	386063153
133	NC_017549	GCGCT	2	10	202788	202797	0 %	20 %	40 %	40 %	386063154
134	NC_017549	TGCTC	2	10	205062	205071	0 %	40 %	20 %	40 %	386063157
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254	NC_017549	CTGGG	2	10	411351	411360	0 %	20 %	60 %	20 %	386063344
255	NC_017549	GCCGA	2	10	414227	414236	20 %	0 %	40 %	40 %	386063347
256	NC_017549	GCCAG	2	10	415370	415379	20 %	0 %	40 %	40 %	386063348
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258	NC_017549	CGAGC	2	10	423363	423372	20 %	0 %	40 %	40 %	386063356
259	NC_017549	TGCGC	2	10	423469	423478	0 %	20 %	40 %	40 %	386063356
260	NC_017549	CAGGC	2	10	424732	424741	20 %	0 %	40 %	40 %	386063357
261	NC_017549	GGGTG	2	10	425856	425865	0 %	20 %	80 %	0 %	386063359
262	NC_017549	GTCGG	2	10	426776	426785	0 %	20 %	60 %	20 %	386063359
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