MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	CTATTA	2	12	1722	1733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017546	ATTTTC	2	12	19814	19825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017546	ATTTAT	2	12	77058	77069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017546	GTGGCT	2	12	82578	82589	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017546	AATAAA	2	12	199464	199475	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017546	GAAAAC	2	12	226480	226491	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017546	ATTCAA	2	12	237365	237376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017546	AAGGAA	2	12	238936	238947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017546	TAGGCG	2	12	240589	240600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017546	ATTCAA	2	12	243387	243398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017546	AAGGAA	2	12	244958	244969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017546	TAGGCG	2	12	246611	246622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017546	AGTCAA	2	12	248425	248436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017546	TTATAT	2	12	263211	263222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017546	AACTTT	2	12	288915	288926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017546	AATACA	2	12	297505	297516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017546	TTGGTT	2	12	327476	327487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017546	AAATGA	2	12	388407	388418	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017546	ATGATA	2	12	390227	390238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017546	AGTGCT	2	12	401865	401876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017546	TTGTTT	2	12	410569	410580	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017546	TCTCCC	2	12	434502	434513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017546	ACAAAA	2	12	472516	472527	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017546	ACACGG	2	12	505945	505956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017546	CTATAA	2	12	510305	510316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017546	GGGGAA	2	12	542923	542934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017546	TTTAGT	2	12	543113	543124	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017546	AGATTT	2	12	569535	569546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017546	ATCATT	2	12	638193	638204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017546	ATCATT	2	12	680196	680207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017546	GTTTTA	2	12	707469	707480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017546	TATAGG	2	12	724687	724698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017546	TTACTT	2	12	851316	851327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017546	TGAAAT	2	12	862451	862462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017546	AAATAG	2	12	889112	889123	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017546	GTAATC	2	12	895915	895926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017546	TTACAA	2	12	895933	895944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017546	AAAGAA	2	12	896967	896978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017546	ATGAAA	2	12	904536	904547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017546	TTGACT	2	12	1027798	1027809	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017546	AGGAAG	2	12	1037991	1038002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017546	CTTTTT	2	12	1097728	1097739	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017546	TTATGG	2	12	1137438	1137449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017546	TTTAGT	2	12	1141446	1141457	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017546	CTTTTT	2	12	1214016	1214027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017546	GAAAAA	2	12	1243993	1244004	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017546	GATTTT	2	12	1284681	1284692	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017546	AAAAAC	2	12	1296107	1296118	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017546	TATTAA	2	12	1313444	1313455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017546	TATTAA	2	12	1464234	1464245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017546	ATAAAA	2	12	1498413	1498424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017546	TTTCAT	2	12	1506807	1506818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017546	CTCTTC	2	12	1609489	1609500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017546	TAATTA	2	12	1645813	1645824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017546	GGTTGT	2	12	1660140	1660151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017546	GGTTGT	2	12	1661601	1661612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017546	GAATAA	2	12	1663156	1663167	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017546	GTAAAC	2	12	1664306	1664317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017546	ACAAAA	2	12	1672928	1672939	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017546	AAAATA	2	12	1677245	1677256	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017546	TAAAAA	2	12	1678154	1678165	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017546	TAAAAA	2	12	1704896	1704907	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017546	AAATAA	2	12	1722706	1722717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017546	ATGAAA	2	12	1724396	1724407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017546	TAGATT	2	12	1729174	1729185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017546	CGCCTA	2	12	1764978	1764989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017546	TTTCCT	2	12	1766630	1766641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017546	TTGAAT	2	12	1768202	1768213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017546	TATCTG	2	12	1776584	1776595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017546	CTATAA	2	12	1815830	1815841	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017546	AAAAAC	2	12	1840463	1840474	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017546	CGCCTA	2	12	1870898	1870909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017546	TTTCCT	2	12	1872550	1872561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017546	TTGAAT	2	12	1874122	1874133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017546	GTTTTA	2	12	1882042	1882053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017546	AAAAAG	2	12	1965168	1965179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017546	CTCTAT	2	12	1982884	1982895	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017546	TCATTT	2	12	1984081	1984092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017546	GTTTTC	2	12	2011249	2011260	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017546	CAAAAA	2	12	2028972	2028983	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017546	GAAAAA	2	12	2032833	2032844	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017546	AGAAAA	2	12	2039665	2039676	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017546	TTTTAT	2	12	2128528	2128539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017546	ATTCAA	2	12	2186194	2186205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017546	TTATAT	2	12	2247666	2247677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017546	TAGTAA	2	12	2298758	2298769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017546	AATTTT	2	12	2300480	2300491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017546	AAATTG	2	12	2306655	2306666	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017546	CTCTGT	2	12	2313500	2313511	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017546	AAATTA	2	12	2412627	2412638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017546	TAATGC	2	12	2412667	2412678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017546	TTTATA	2	12	2414966	2414977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017546	TAATAC	2	12	2437203	2437214	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017546	CGCCTA	2	12	2458006	2458017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017546	TTTCCT	2	12	2459909	2459920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017546	TTGAAT	2	12	2461481	2461492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017546	TTCAAA	2	12	2546030	2546041	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017546	CTTTTT	2	12	2611258	2611269	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017546	ATCTAA	2	12	2616942	2616953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017546	ATCCCA	2	12	2631170	2631181	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017546	AAAAGA	2	12	2636999	2637010	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017546	TTTTTA	2	12	2642995	2643006	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017546	CGCCTA	2	12	2693008	2693019	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017546	TTTCCT	2	12	2694911	2694922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017546	TTGAAT	2	12	2696483	2696494	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017546	CCTCTT	2	12	2739968	2739979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017546	TAAATC	2	12	2761438	2761449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017546	TTTTAT	2	12	2843145	2843156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017546	ATATTT	2	12	2890055	2890066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017546	TTAACT	2	12	2890362	2890373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017546	TATCAA	2	12	2916583	2916594	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017546	AAATGA	2	12	2916597	2916608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017546	TAAAAA	2	12	2916667	2916678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017546	AAGTAT	2	12	2917534	2917545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.