MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 1058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	GAAATT	2	12	6167	6178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386048936
2	NC_017546	TGAAGA	2	12	9485	9496	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386048937
3	NC_017546	TTATTT	2	12	10854	10865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386048938
4	NC_017546	CACATT	2	12	11135	11146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048938
5	NC_017546	GCAAAA	2	12	14025	14036	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386048941
6	NC_017546	CTTCAT	2	12	20831	20842	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386048946
7	NC_017546	TTTTGG	2	12	21195	21206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048946
8	NC_017546	AGTTGC	2	12	23584	23595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386048948
9	NC_017546	TAAAGC	2	12	23637	23648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386048948
10	NC_017546	ATTGAA	2	12	24844	24855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386048949
11	NC_017546	TCGATT	2	12	32373	32384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386048958
12	NC_017546	TCACCA	2	12	32655	32666	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386048959
13	NC_017546	CGATTA	2	12	38085	38096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386048963
14	NC_017546	TTATGT	2	12	42571	42582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386048966
15	NC_017546	AAAGAT	2	12	46224	46235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386048969
16	NC_017546	TGAAAT	2	12	47061	47072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386048970
17	NC_017546	TGGCGG	2	12	50196	50207	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386048974
18	NC_017546	TCAAAA	2	12	50316	50327	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386048974
19	NC_017546	ACAGTG	2	12	51900	51911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386048977
20	NC_017546	AAAAAT	2	12	52764	52775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386048979
21	NC_017546	TTTATA	2	12	55242	55253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048981
22	NC_017546	GCAGAA	2	12	56689	56700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386048981
23	NC_017546	AGGTAA	2	12	56780	56791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386048982
24	NC_017546	TGATCG	2	12	58168	58179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386048983
25	NC_017546	TGATTT	2	12	63513	63524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386048988
26	NC_017546	TTTTGC	2	12	64118	64129	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386048989
27	NC_017546	GATACA	2	12	75012	75023	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386048998
28	NC_017546	TAAATT	2	12	76884	76895	50 %	50 %	0 %	0 %	386049001
29	NC_017546	TGATAT	2	12	85263	85274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386049012
30	NC_017546	ATCACT	2	12	89422	89433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386049017
31	NC_017546	AAACAC	2	12	89855	89866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386049017
32	NC_017546	AAGATA	2	12	92854	92865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386049017
33	NC_017546	TATAAA	2	12	95072	95083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386049018
34	NC_017546	TATTAG	2	12	105303	105314	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386049028
35	NC_017546	TAAAAT	2	12	115136	115147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386049039
36	NC_017546	CAAAAT	2	12	115277	115288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386049039
37	NC_017546	GTCCGC	2	12	115409	115420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386049039
38	NC_017546	GTTTTA	2	12	122045	122056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386049047
39	NC_017546	TGATTT	2	12	124059	124070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386049051
40	NC_017546	AAGTAA	2	12	128030	128041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386049054
41	NC_017546	ATCTGT	2	12	132212	132223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386049061
42	NC_017546	TCTATT	2	12	134151	134162	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386049062
43	NC_017546	GATATT	2	12	144179	144190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386049074
44	NC_017546	TCTGAA	2	12	145415	145426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386049076
45	NC_017546	GTTGCA	2	12	152257	152268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386049085
46	NC_017546	GATTGC	2	12	152319	152330	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386049085
47	NC_017546	TTAAAA	2	12	152992	153003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386049086
48	NC_017546	GGCGGT	2	12	157969	157980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386049089
49	NC_017546	CGAATT	2	12	160902	160913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386049090
50	NC_017546	GTAAAA	2	12	164054	164065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386049093
51	NC_017546	TTTTAC	2	12	166101	166112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386049097
52	NC_017546	TTTTTA	2	12	167139	167150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386049099
53	NC_017546	AAAGTG	2	12	168351	168362	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386049100
54	NC_017546	TACTAG	2	12	173358	173369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386049104
55	NC_017546	AAGCGA	2	12	175862	175873	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386049106
56	NC_017546	CAATCC	2	12	179177	179188	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386049108
57	NC_017546	AAAGAT	2	12	181187	181198	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386049110
58	NC_017546	ATGGCT	2	12	182312	182323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386049111
59	NC_017546	CAGAAA	2	12	182986	182997	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386049111
60	NC_017546	AAAAGA	2	12	183062	183073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386049111
61	NC_017546	AAAAAC	2	12	183392	183403	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386049111
62	NC_017546	TGAAGT	2	12	185432	185443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386049111
63	NC_017546	CATTGA	2	12	193565	193576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386049118
64	NC_017546	TGCAGC	2	12	194220	194231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386049119
65	NC_017546	TAAAAA	2	12	196458	196469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386049121
66	NC_017546	TTCTTT	2	12	214469	214480	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386049139
67	NC_017546	GAAAAA	2	12	216558	216569	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386049141
68	NC_017546	AGGAAA	2	12	216877	216888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386049141
69	NC_017546	GAAAAA	2	12	217783	217794	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386049143
70	NC_017546	AAGGAG	2	12	221720	221731	50 %	0 %	50 %	0 %	386049144
71	NC_017546	GCAAGT	2	12	223610	223621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386049146
72	NC_017546	TTAAAG	2	12	225553	225564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386049148
73	NC_017546	TGTCGG	2	12	227529	227540	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386049149
74	NC_017546	TCTCCA	2	12	231396	231407	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386049152
75	NC_017546	GGTTTT	2	12	233106	233117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386049153
76	NC_017546	ATTGAT	2	12	234053	234064	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386049155
77	NC_017546	AGAACC	2	12	235079	235090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386049156
78	NC_017546	TTTACC	2	12	248854	248865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386049158
79	NC_017546	AGTAAA	2	12	256111	256122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386049164
80	NC_017546	AAAGGT	2	12	258237	258248	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386049166
81	NC_017546	ACAGTA	2	12	263540	263551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386049174
82	NC_017546	AAAACA	2	12	263915	263926	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386049175
83	NC_017546	GCATGG	2	12	264096	264107	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386049175
84	NC_017546	CTGTAG	2	12	267040	267051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386049180
85	NC_017546	GACAAT	2	12	271409	271420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386049186
86	NC_017546	AAGAAA	2	12	273993	274004	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386049187
87	NC_017546	TACACT	2	12	278237	278248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386049188
88	NC_017546	TTCGTG	2	12	279749	279760	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386049188
89	NC_017546	GAATTA	2	12	286434	286445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386049193
90	NC_017546	CGAAAT	2	12	290733	290744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386049197
91	NC_017546	TCTTTT	2	12	293696	293707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386049199
92	NC_017546	ATCAAT	2	12	296103	296114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386049201
93	NC_017546	ATGAAA	2	12	296461	296472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386049202
94	NC_017546	CTTTTA	2	12	298334	298345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386049204
95	NC_017546	TAGAAA	2	12	299280	299291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386049205
96	NC_017546	ACGTTG	2	12	301211	301222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386049207
97	NC_017546	GAAAAC	2	12	303118	303129	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386049208
98	NC_017546	GCTGCG	2	12	308491	308502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386049214
99	NC_017546	TTTTGA	2	12	308891	308902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386049214
100	NC_017546	AAATAA	2	12	312198	312209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386049217
101	NC_017546	GAAGGG	2	12	313995	314006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386049218
102	NC_017546	GATTCA	2	12	317638	317649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386049221
103	NC_017546	GCAATT	2	12	317668	317679	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386049221
104	NC_017546	GAACCA	2	12	324458	324469	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386049227
105	NC_017546	TCCATT	2	12	327066	327077	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386049230
106	NC_017546	CTTTTT	2	12	331325	331336	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386049235
107	NC_017546	GTAGAT	2	12	332232	332243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386049236
108	NC_017546	TATCTG	2	12	337266	337277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386049241
109	NC_017546	ATATGA	2	12	338417	338428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386049242
110	NC_017546	TGCGGG	2	12	339924	339935	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386049243
111	NC_017546	GGACAT	2	12	343780	343791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386049248
112	NC_017546	TATATT	2	12	348798	348809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386049253
113	NC_017546	AGAAAA	2	12	350134	350145	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386049254
114	NC_017546	TGAAAC	2	12	351532	351543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386049256
115	NC_017546	CAAGAA	2	12	355945	355956	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386049257
116	NC_017546	TAGATT	2	12	357904	357915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386049258
117	NC_017546	TGCAGA	2	12	362207	362218	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386049260
118	NC_017546	GAGAAA	2	12	362895	362906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386049260
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120	NC_017546	CATTAA	2	12	372707	372718	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386049271
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456	NC_017546	TGGAAA	2	12	1410906	1410917	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386050343
457	NC_017546	GGACAA	2	12	1416568	1416579	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386050348
458	NC_017546	CGATTG	2	12	1419300	1419311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386050350
459	NC_017546	TAAAAG	2	12	1422038	1422049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386050352
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