MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 2193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	TACAT	2	10	228	237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017546	ACCAA	2	10	2107	2116	60 %	0 %	0 %	40 %	386048932
3	NC_017546	TTAAA	2	10	2500	2509	60 %	40 %	0 %	0 %	386048932
4	NC_017546	TTTAT	2	10	4142	4151	20 %	80 %	0 %	0 %	386048933
5	NC_017546	TTTGT	2	10	4263	4272	0 %	80 %	20 %	0 %	386048933
6	NC_017546	CAAAA	2	10	7009	7018	80 %	0 %	0 %	20 %	386048936
7	NC_017546	TTGAT	2	10	11691	11700	20 %	60 %	20 %	0 %	386048938
8	NC_017546	TTTTA	2	10	12364	12373	20 %	80 %	0 %	0 %	386048939
9	NC_017546	GTATG	2	10	13307	13316	20 %	40 %	40 %	0 %	386048940
10	NC_017546	AAAGA	2	10	14322	14331	80 %	0 %	20 %	0 %	386048941
11	NC_017546	ATGAA	2	10	17185	17194	60 %	20 %	20 %	0 %	386048943
12	NC_017546	GAATG	2	10	18927	18936	40 %	20 %	40 %	0 %	386048944
13	NC_017546	TAATT	2	10	20305	20314	40 %	60 %	0 %	0 %	386048946
14	NC_017546	ATTAA	2	10	21822	21831	60 %	40 %	0 %	0 %	386048947
15	NC_017546	AAATC	2	10	22283	22292	60 %	20 %	0 %	20 %	386048947
16	NC_017546	AACAT	2	10	22444	22453	60 %	20 %	0 %	20 %	386048947
17	NC_017546	TTTTA	2	10	23061	23070	20 %	80 %	0 %	0 %	386048948
18	NC_017546	GACCA	2	10	23145	23154	40 %	0 %	20 %	40 %	386048948
19	NC_017546	TGGAT	2	10	23404	23413	20 %	40 %	40 %	0 %	386048948
20	NC_017546	CAAAA	2	10	24405	24414	80 %	0 %	0 %	20 %	386048949
21	NC_017546	ATTAT	2	10	24890	24899	40 %	60 %	0 %	0 %	386048950
22	NC_017546	TCAGG	2	10	26059	26068	20 %	20 %	40 %	20 %	386048952
23	NC_017546	TTTAC	2	10	27059	27068	20 %	60 %	0 %	20 %	386048953
24	NC_017546	GAAAA	2	10	33000	33009	80 %	0 %	20 %	0 %	386048959
25	NC_017546	TGAAA	2	10	34155	34164	60 %	20 %	20 %	0 %	386048960
26	NC_017546	GAATG	2	10	36026	36035	40 %	20 %	40 %	0 %	386048962
27	NC_017546	AAATT	2	10	36153	36162	60 %	40 %	0 %	0 %	386048962
28	NC_017546	ATGGA	2	10	38274	38283	40 %	20 %	40 %	0 %	386048963
29	NC_017546	AAAAC	2	10	40380	40389	80 %	0 %	0 %	20 %	386048964
30	NC_017546	TTATT	2	10	41869	41878	20 %	80 %	0 %	0 %	386048966
31	NC_017546	AAAAG	2	10	43083	43092	80 %	0 %	20 %	0 %	386048966
32	NC_017546	ATAAA	2	10	43907	43916	80 %	20 %	0 %	0 %	386048967
33	NC_017546	ATTTT	2	10	45712	45721	20 %	80 %	0 %	0 %	386048969
34	NC_017546	GAAAC	2	10	46970	46979	60 %	0 %	20 %	20 %	386048970
35	NC_017546	GACTT	2	10	47209	47218	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017546	ATTTT	2	10	47296	47305	20 %	80 %	0 %	0 %	386048971
37	NC_017546	AAATG	2	10	48426	48435	60 %	20 %	20 %	0 %	386048972
38	NC_017546	ATGGT	2	10	49463	49472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017546	GTAGA	2	10	49512	49521	40 %	20 %	40 %	0 %	386048973
40	NC_017546	TTACT	2	10	50494	50503	20 %	60 %	0 %	20 %	386048975
41	NC_017546	GAAAT	2	10	51152	51161	60 %	20 %	20 %	0 %	386048976
42	NC_017546	CTTAG	2	10	51251	51260	20 %	40 %	20 %	20 %	386048976
43	NC_017546	TAAAA	2	10	52502	52511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017546	TGCTA	2	10	52676	52685	20 %	40 %	20 %	20 %	386048979
45	NC_017546	TTTTA	2	10	52844	52853	20 %	80 %	0 %	0 %	386048979
46	NC_017546	AGTTA	2	10	54160	54169	40 %	40 %	20 %	0 %	386048980
47	NC_017546	TTATG	2	10	54709	54718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017546	CGCAA	2	10	57673	57682	40 %	0 %	20 %	40 %	386048983
49	NC_017546	TTTTA	2	10	58621	58630	20 %	80 %	0 %	0 %	386048984
50	NC_017546	AAACG	2	10	63004	63013	60 %	0 %	20 %	20 %	386048988
51	NC_017546	ATTAT	2	10	63972	63981	40 %	60 %	0 %	0 %	386048988
52	NC_017546	CGAAA	2	10	64490	64499	60 %	0 %	20 %	20 %	386048989
53	NC_017546	AAAAC	2	10	64500	64509	80 %	0 %	0 %	20 %	386048989
54	NC_017546	AACAA	2	10	65923	65932	80 %	0 %	0 %	20 %	386048991
55	NC_017546	GAGAG	2	10	70982	70991	40 %	0 %	60 %	0 %	386048993
56	NC_017546	GCAAA	2	10	72164	72173	60 %	0 %	20 %	20 %	386048996
57	NC_017546	CAATA	2	10	72229	72238	60 %	20 %	0 %	20 %	386048996
58	NC_017546	GCCTT	2	10	73029	73038	0 %	40 %	20 %	40 %	386048997
59	NC_017546	CAAAA	2	10	73406	73415	80 %	0 %	0 %	20 %	386048997
60	NC_017546	GAAAT	2	10	75595	75604	60 %	20 %	20 %	0 %	386048999
61	NC_017546	ATAGC	2	10	75615	75624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017546	GCTTT	2	10	76393	76402	0 %	60 %	20 %	20 %	386049001
63	NC_017546	AGTAG	2	10	77738	77747	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017546	AGTAA	2	10	77988	77997	60 %	20 %	20 %	0 %	386049003
65	NC_017546	TTATA	2	10	78237	78246	40 %	60 %	0 %	0 %	386049004
66	NC_017546	TATTT	2	10	78332	78341	20 %	80 %	0 %	0 %	386049005
67	NC_017546	GCTTG	2	10	80311	80320	0 %	40 %	40 %	20 %	386049007
68	NC_017546	AAACT	2	10	80321	80330	60 %	20 %	0 %	20 %	386049007
69	NC_017546	GCGCT	2	10	82366	82375	0 %	20 %	40 %	40 %	386049009
70	NC_017546	TAAAG	2	10	84366	84375	60 %	20 %	20 %	0 %	386049010
71	NC_017546	TCATT	2	10	87558	87567	20 %	60 %	0 %	20 %	386049015
72	NC_017546	ATTTT	2	10	87810	87819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017546	CTAAA	2	10	89923	89932	60 %	20 %	0 %	20 %	386049017
74	NC_017546	AAGTT	2	10	90349	90358	40 %	40 %	20 %	0 %	386049017
75	NC_017546	GAAAA	2	10	91266	91275	80 %	0 %	20 %	0 %	386049017
76	NC_017546	TGAAA	2	10	91508	91517	60 %	20 %	20 %	0 %	386049017
77	NC_017546	AAATT	2	10	91852	91861	60 %	40 %	0 %	0 %	386049017
78	NC_017546	AGCGG	2	10	92436	92445	20 %	0 %	60 %	20 %	386049017
79	NC_017546	AGTTA	2	10	93845	93854	40 %	40 %	20 %	0 %	386049017
80	NC_017546	GAAAT	2	10	94932	94941	60 %	20 %	20 %	0 %	386049018
81	NC_017546	AAAAG	2	10	95244	95253	80 %	0 %	20 %	0 %	386049018
82	NC_017546	TGAAA	2	10	96241	96250	60 %	20 %	20 %	0 %	386049018
83	NC_017546	TGCAT	2	10	98901	98910	20 %	40 %	20 %	20 %	386049021
84	NC_017546	TTACT	2	10	99147	99156	20 %	60 %	0 %	20 %	386049021
85	NC_017546	GTTTT	2	10	100745	100754	0 %	80 %	20 %	0 %	386049023
86	NC_017546	GAAGT	2	10	101026	101035	40 %	20 %	40 %	0 %	386049023
87	NC_017546	AGCGG	2	10	102345	102354	20 %	0 %	60 %	20 %	386049024
88	NC_017546	ATATC	2	10	108149	108158	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017546	TTCCA	2	10	108934	108943	20 %	40 %	0 %	40 %	386049034
90	NC_017546	AAAAG	2	10	110835	110844	80 %	0 %	20 %	0 %	386049036
91	NC_017546	ACGGT	2	10	112379	112388	20 %	20 %	40 %	20 %	386049037
92	NC_017546	GAAAT	2	10	113618	113627	60 %	20 %	20 %	0 %	386049038
93	NC_017546	GAATT	2	10	114259	114268	40 %	40 %	20 %	0 %	386049038
94	NC_017546	AACCA	2	10	118135	118144	60 %	0 %	0 %	40 %	386049041
95	NC_017546	CTTTA	2	10	118464	118473	20 %	60 %	0 %	20 %	386049041
96	NC_017546	CTCGA	2	10	119815	119824	20 %	20 %	20 %	40 %	386049043
97	NC_017546	TTCCA	2	10	120149	120158	20 %	40 %	0 %	40 %	386049043
98	NC_017546	TACTG	2	10	120414	120423	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017546	TCTCT	2	10	120987	120996	0 %	60 %	0 %	40 %	386049044
100	NC_017546	TTTTA	2	10	121347	121356	20 %	80 %	0 %	0 %	386049045
101	NC_017546	AAAAG	2	10	121616	121625	80 %	0 %	20 %	0 %	386049046
102	NC_017546	AAAGT	2	10	122653	122662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017546	TTAGT	2	10	123774	123783	20 %	60 %	20 %	0 %	386049050
104	NC_017546	TTTAT	2	10	126774	126783	20 %	80 %	0 %	0 %	386049053
105	NC_017546	AAGTG	2	10	128796	128805	40 %	20 %	40 %	0 %	386049056
106	NC_017546	GTCAG	2	10	129257	129266	20 %	20 %	40 %	20 %	386049057
107	NC_017546	AATTT	2	10	130538	130547	40 %	60 %	0 %	0 %	386049059
108	NC_017546	TTGTT	2	10	132905	132914	0 %	80 %	20 %	0 %	386049061
109	NC_017546	ATTTT	2	10	134709	134718	20 %	80 %	0 %	0 %	386049063
110	NC_017546	AAAAT	2	10	136211	136220	80 %	20 %	0 %	0 %	386049063
111	NC_017546	AACTT	2	10	137537	137546	40 %	40 %	0 %	20 %	386049066
112	NC_017546	ACAAA	2	10	137639	137648	80 %	0 %	0 %	20 %	386049066
113	NC_017546	ACTTG	2	10	138433	138442	20 %	40 %	20 %	20 %	386049066
114	NC_017546	TTGGT	2	10	139229	139238	0 %	60 %	40 %	0 %	386049067
115	NC_017546	TGTTT	2	10	139572	139581	0 %	80 %	20 %	0 %	386049067
116	NC_017546	AGCCA	2	10	141098	141107	40 %	0 %	20 %	40 %	386049069
117	NC_017546	TATGA	2	10	142207	142216	40 %	40 %	20 %	0 %	386049071
118	NC_017546	TAACG	2	10	145188	145197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017546	TTTAT	2	10	145847	145856	20 %	80 %	0 %	0 %	386049077
120	NC_017546	ACTTT	2	10	147644	147653	20 %	60 %	0 %	20 %	386049080
121	NC_017546	ACGGC	2	10	149568	149577	20 %	0 %	40 %	40 %	386049082
122	NC_017546	TTTAA	2	10	149640	149649	40 %	60 %	0 %	0 %	386049082
123	NC_017546	AATTT	2	10	149826	149835	40 %	60 %	0 %	0 %	386049082
124	NC_017546	GATAA	2	10	149993	150002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017546	AATAA	2	10	151099	151108	80 %	20 %	0 %	0 %	386049083
126	NC_017546	GAATA	2	10	153059	153068	60 %	20 %	20 %	0 %	386049086
127	NC_017546	TTTAC	2	10	154258	154267	20 %	60 %	0 %	20 %	386049087
128	NC_017546	AGATG	2	10	154307	154316	40 %	20 %	40 %	0 %	386049087
129	NC_017546	ATATG	2	10	156974	156983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017546	TCTAA	2	10	159607	159616	40 %	40 %	0 %	20 %	386049090
131	NC_017546	AAATC	2	10	160122	160131	60 %	20 %	0 %	20 %	386049090
132	NC_017546	GGCTG	2	10	160159	160168	0 %	20 %	60 %	20 %	386049090
133	NC_017546	CGAAA	2	10	160737	160746	60 %	0 %	20 %	20 %	386049090
134	NC_017546	AAGAT	2	10	163126	163135	60 %	20 %	20 %	0 %	386049092
135	NC_017546	TGCGC	2	10	163247	163256	0 %	20 %	40 %	40 %	386049092
136	NC_017546	GAATT	2	10	163497	163506	40 %	40 %	20 %	0 %	386049093
137	NC_017546	AAATA	2	10	166552	166561	80 %	20 %	0 %	0 %	386049097
138	NC_017546	TTCTT	2	10	167757	167766	0 %	80 %	0 %	20 %	386049099
139	NC_017546	CTAAA	2	10	167905	167914	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017546	TTCCA	2	10	168308	168317	20 %	40 %	0 %	40 %	386049100
141	NC_017546	AACCT	2	10	170079	170088	40 %	20 %	0 %	40 %	386049101
142	NC_017546	ACAAA	2	10	172803	172812	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017546	ACTTT	2	10	174084	174093	20 %	60 %	0 %	20 %	386049104
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149	NC_017546	GCGTT	2	10	186993	187002	0 %	40 %	40 %	20 %	386049112
150	NC_017546	AAGCG	2	10	187359	187368	40 %	0 %	40 %	20 %	386049112
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156	NC_017546	AATTT	2	10	194101	194110	40 %	60 %	0 %	0 %	386049119
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158	NC_017546	TTGTC	2	10	199389	199398	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_017546	GAAAA	2	10	232126	232135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017546	GAAAA	2	10	232329	232338	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017546	GAATA	2	10	235417	235426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017546	AAATT	2	10	237102	237111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017546	TAATT	2	10	237303	237312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017546	TCGTG	2	10	238462	238471	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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202	NC_017546	TCGTG	2	10	244484	244493	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
203	NC_017546	AAGGT	2	10	245952	245961	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_017546	AGTGA	2	10	280317	280326	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
221	NC_017546	ATTTC	2	10	281888	281897	20 %	60 %	0 %	20 %	386049190
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224	NC_017546	AAACA	2	10	286145	286154	80 %	0 %	0 %	20 %	386049193
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229	NC_017546	ATTGC	2	10	289182	289191	20 %	40 %	20 %	20 %	386049195
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232	NC_017546	AAAGA	2	10	296250	296259	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
233	NC_017546	ATTGT	2	10	297417	297426	20 %	60 %	20 %	0 %	386049203
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237	NC_017546	CTTCT	2	10	299149	299158	0 %	60 %	0 %	40 %	386049205
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246	NC_017546	ATTCG	2	10	318669	318678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
247	NC_017546	GGTTA	2	10	320470	320479	20 %	40 %	40 %	0 %	386049224
248	NC_017546	ATTTG	2	10	321297	321306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
249	NC_017546	TAGAT	2	10	321337	321346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_017546	TTTGA	2	10	322455	322464	20 %	60 %	20 %	0 %	386049226
251	NC_017546	GTTTT	2	10	322466	322475	0 %	80 %	20 %	0 %	386049226
252	NC_017546	TCGTT	2	10	326060	326069	0 %	60 %	20 %	20 %	386049229
253	NC_017546	ACTTT	2	10	326110	326119	20 %	60 %	0 %	20 %	386049229
254	NC_017546	TTTCG	2	10	326376	326385	0 %	60 %	20 %	20 %	386049229
255	NC_017546	GATAT	2	10	329586	329595	40 %	40 %	20 %	0 %	386049233
256	NC_017546	TATTT	2	10	331002	331011	20 %	80 %	0 %	0 %	386049235
257	NC_017546	ATGAA	2	10	332503	332512	60 %	20 %	20 %	0 %	386049236
258	NC_017546	AGGAA	2	10	335546	335555	60 %	0 %	40 %	0 %	386049239
259	NC_017546	ATATT	2	10	335669	335678	40 %	60 %	0 %	0 %	386049239
260	NC_017546	AAGAT	2	10	336340	336349	60 %	20 %	20 %	0 %	386049239
261	NC_017546	AAATA	2	10	336357	336366	80 %	20 %	0 %	0 %	386049239
262	NC_017546	GATAT	2	10	337833	337842	40 %	40 %	20 %	0 %	386049241
263	NC_017546	ACGAA	2	10	337866	337875	60 %	0 %	20 %	20 %	386049241
264	NC_017546	TGCGA	2	10	341876	341885	20 %	20 %	40 %	20 %	386049246
265	NC_017546	GAAAT	2	10	343671	343680	60 %	20 %	20 %	0 %	386049248
266	NC_017546	AAGTG	2	10	344169	344178	40 %	20 %	40 %	0 %	386049248
267	NC_017546	TTTGA	2	10	347407	347416	20 %	60 %	20 %	0 %	386049251
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