MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 1161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	ATTA	3	12	1746	1757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017546	AATA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017546	AAAG	2	8	5942	5949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017546	ACTT	2	8	19373	19380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017546	GGCT	2	8	19393	19400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017546	TATT	2	8	19770	19777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017546	AAAT	2	8	28840	28847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017546	AGGA	2	8	29018	29025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017546	TAAA	2	8	30947	30954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017546	GAAA	2	8	32099	32106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017546	CCTT	2	8	33322	33329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017546	AAAT	2	8	40617	40624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017546	ATAA	2	8	47180	47187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017546	TAAA	2	8	47242	47249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017546	AGTG	2	8	47259	47266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017546	TTAG	2	8	47993	48000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017546	GCTC	2	8	49413	49420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017546	TATT	2	8	50787	50794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017546	TAAA	2	8	51519	51526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017546	GTTA	2	8	54698	54705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017546	CATA	2	8	60754	60761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017546	TAGT	2	8	77009	77016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017546	TTTA	2	8	77033	77040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017546	AATG	2	8	81556	81563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017546	AACC	2	8	85810	85817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017546	ATTT	2	8	87765	87772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017546	ATTG	2	8	87820	87827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017546	AATA	2	8	104019	104026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017546	AAAT	2	8	104039	104046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017546	CTTT	2	8	109765	109772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017546	GAAT	2	8	109806	109813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017546	GGAG	2	8	109822	109829	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017546	ACTT	2	8	120523	120530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017546	CCAA	2	8	120551	120558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017546	ATAG	2	8	120572	120579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017546	AAAT	2	8	121514	121521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017546	TTGG	2	8	134665	134672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017546	ACCA	2	8	134701	134708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017546	TGCG	2	8	140924	140931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017546	AAAT	2	8	143259	143266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017546	GAAT	2	8	143290	143297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017546	AAAT	2	8	144235	144242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017546	AAGT	2	8	145251	145258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017546	GATA	2	8	159485	159492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017546	TTGT	2	8	169294	169301	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017546	ACTA	2	8	169339	169346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017546	ATTA	2	8	169403	169410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017546	TACT	2	8	177784	177791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017546	AAGT	2	8	177806	177813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017546	GCTA	2	8	193836	193843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017546	GAAT	2	8	196635	196642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017546	TTGC	2	8	199896	199903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017546	GGCT	2	8	200763	200770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017546	TAAT	2	8	200848	200855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017546	AAAT	2	8	200961	200968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017546	CAAA	2	8	200995	201002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017546	TCAT	2	8	201091	201098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017546	GAAA	2	8	204353	204360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017546	CATA	2	8	204429	204436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017546	ATTT	2	8	204448	204455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017546	AGCA	2	8	205607	205614	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017546	AATT	2	8	209208	209215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017546	TAAC	2	8	209279	209286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017546	GAAA	2	8	211318	211325	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017546	TCAA	2	8	212635	212642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017546	AGTA	2	8	214349	214356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017546	TTTG	2	8	216292	216299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017546	TCTT	2	8	217644	217651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017546	GAAT	2	8	217682	217689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017546	GAAG	2	8	221268	221275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017546	GGGA	2	8	223393	223400	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017546	AATT	2	8	224381	224388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017546	GAAG	2	8	224461	224468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017546	ATTA	2	8	226427	226434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017546	ATAG	2	8	226465	226472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017546	AATA	2	8	226582	226589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017546	AATT	2	8	230707	230714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017546	ATAG	2	8	230736	230743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017546	CTTT	2	8	231774	231781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017546	AAAC	2	8	237077	237084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017546	TAGA	2	8	237142	237149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017546	CGAA	2	8	237446	237453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017546	CCTG	2	8	237513	237520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017546	AGCC	2	8	238847	238854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017546	TGTT	2	8	239008	239015	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017546	AGAA	2	8	239400	239407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017546	AAAG	2	8	239503	239510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017546	TACT	2	8	239942	239949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017546	CACG	2	8	239963	239970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017546	AGTG	2	8	240702	240709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017546	GGAA	2	8	240756	240763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017546	TAGG	2	8	241330	241337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017546	ATGG	2	8	241513	241520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017546	ATCG	2	8	242091	242098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017546	CGAA	2	8	243468	243475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017546	CCTG	2	8	243535	243542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017546	AGCC	2	8	244869	244876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017546	TGTT	2	8	245030	245037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017546	AGAA	2	8	245422	245429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017546	AAAG	2	8	245525	245532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017546	TACT	2	8	245964	245971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017546	CACG	2	8	245985	245992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017546	AGTG	2	8	246724	246731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017546	GGAA	2	8	246778	246785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017546	TAGG	2	8	247352	247359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017546	ATGG	2	8	247535	247542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017546	ATCG	2	8	248113	248120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017546	ATAA	2	8	248373	248380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017546	CCTT	2	8	252979	252986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017546	AAAT	2	8	254490	254497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017546	TGAA	2	8	258378	258385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017546	CGCT	2	8	261804	261811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017546	ACAA	2	8	266874	266881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017546	TTTA	2	8	267329	267336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017546	TTTC	2	8	270215	270222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017546	TCTT	2	8	271093	271100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017546	AAAT	2	8	271127	271134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017546	TAAA	2	8	272602	272609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017546	CTTT	2	8	272647	272654	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017546	AATT	2	8	272898	272905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017546	CGAA	2	8	280931	280938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017546	AATT	2	8	282491	282498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017546	TAAA	2	8	284263	284270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017546	CAAT	2	8	287639	287646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017546	TTTG	2	8	288972	288979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017546	GAAC	2	8	289050	289057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017546	ACAT	2	8	291223	291230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017546	ATCC	2	8	304819	304826	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017546	ATTA	2	8	305621	305628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017546	TAAA	2	8	309263	309270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017546	GTTA	2	8	309343	309350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017546	TAAT	2	8	310702	310709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017546	AGGC	2	8	310762	310769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017546	TAAA	2	8	310805	310812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017546	CTTA	2	8	311645	311652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017546	TAAA	2	8	311666	311673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017546	ATTT	2	8	318535	318542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017546	GATT	2	8	318682	318689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017546	TTAT	2	8	318911	318918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017546	AGAT	2	8	320429	320436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017546	TTTA	2	8	320442	320449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017546	TAAT	2	8	321362	321369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017546	TAAA	2	8	321398	321405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017546	CGTT	2	8	322153	322160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017546	ATTT	2	8	328482	328489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017546	TAAA	2	8	333442	333449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017546	CATA	2	8	333507	333514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017546	TAAT	2	8	335191	335198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017546	TTTA	2	8	335217	335224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017546	TTGT	2	8	346216	346223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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