MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 1058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045640
2	NC_017545	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386045640
3	NC_017545	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386045641
4	NC_017545	TTATTT	2	12	10918	10929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386045642
5	NC_017545	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045642
6	NC_017545	GCAAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386045645
7	NC_017545	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386045649
8	NC_017545	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386045651
9	NC_017545	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045651
10	NC_017545	AGTTGC	2	12	23648	23659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386045653
11	NC_017545	TAAAGC	2	12	23701	23712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386045653
12	NC_017545	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045654
13	NC_017545	AATTAT	2	12	35674	35685	50 %	50 %	0 %	0 %	386045668
14	NC_017545	GTTTAA	2	12	35941	35952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386045668
15	NC_017545	TCGATT	2	12	36538	36549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386045669
16	NC_017545	TCACCA	2	12	36820	36831	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386045670
17	NC_017545	CGATTA	2	12	42250	42261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045674
18	NC_017545	TTATGT	2	12	46736	46747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386045677
19	NC_017545	AAAGAT	2	12	50389	50400	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045680
20	NC_017545	TGAAAT	2	12	51226	51237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045681
21	NC_017545	TGGCGG	2	12	54361	54372	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386045685
22	NC_017545	TCAAAA	2	12	54481	54492	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386045685
23	NC_017545	ACAGTG	2	12	56065	56076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386045688
24	NC_017545	AAAAAT	2	12	56929	56940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386045690
25	NC_017545	TTTATA	2	12	59407	59418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045692
26	NC_017545	ATTGGG	2	12	59738	59749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386045692
27	NC_017545	GCAGAA	2	12	60854	60865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386045692
28	NC_017545	AGGTAA	2	12	60945	60956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386045693
29	NC_017545	TGATCG	2	12	62333	62344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386045694
30	NC_017545	TGATTT	2	12	67678	67689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386045699
31	NC_017545	TTTTGC	2	12	68283	68294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386045700
32	NC_017545	AATGCT	2	12	75707	75718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045706
33	NC_017545	ATCACT	2	12	95119	95130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045729
34	NC_017545	AAACAC	2	12	95552	95563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045729
35	NC_017545	AAGATA	2	12	98551	98562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045729
36	NC_017545	TATAAA	2	12	100769	100780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045730
37	NC_017545	TATTAG	2	12	111002	111013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386045740
38	NC_017545	TAAAAT	2	12	120837	120848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045751
39	NC_017545	CAAAAT	2	12	120978	120989	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386045751
40	NC_017545	GTCCGC	2	12	121110	121121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386045751
41	NC_017545	GTTTTA	2	12	127746	127757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386045759
42	NC_017545	AAGTAA	2	12	133731	133742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045766
43	NC_017545	ATCTGT	2	12	137913	137924	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386045773
44	NC_017545	TCGATT	2	12	139852	139863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386045774
45	NC_017545	TAGAAA	2	12	139952	139963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045774
46	NC_017545	GTTGCA	2	12	155893	155904	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386045794
47	NC_017545	GATTGC	2	12	155955	155966	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386045794
48	NC_017545	TTAAAA	2	12	156629	156640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045795
49	NC_017545	GGCGGT	2	12	161606	161617	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386045798
50	NC_017545	CGAATT	2	12	164524	164535	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045799
51	NC_017545	GTAAAA	2	12	167676	167687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045802
52	NC_017545	TTTTAC	2	12	169724	169735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386045806
53	NC_017545	TTTTTA	2	12	170762	170773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386045808
54	NC_017545	AAAGTG	2	12	171974	171985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386045809
55	NC_017545	TACTAG	2	12	176987	176998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045812
56	NC_017545	AAGCGA	2	12	179491	179502	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386045814
57	NC_017545	CAATCC	2	12	182807	182818	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386045816
58	NC_017545	AAAGAT	2	12	184818	184829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045818
59	NC_017545	AAAAGA	2	12	186693	186704	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386045819
60	NC_017545	TGAAGT	2	12	189063	189074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045819
61	NC_017545	CATTGA	2	12	197196	197207	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045826
62	NC_017545	TGCAGC	2	12	197851	197862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386045827
63	NC_017545	TAAAAA	2	12	200089	200100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386045829
64	NC_017545	TTCTTT	2	12	218100	218111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386045848
65	NC_017545	GAAAAA	2	12	220189	220200	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386045850
66	NC_017545	AGGAAA	2	12	220508	220519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045850
67	NC_017545	GAAAAA	2	12	221414	221425	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386045852
68	NC_017545	AAGGAG	2	12	225351	225362	50 %	0 %	50 %	0 %	386045853
69	NC_017545	GCAAGT	2	12	227241	227252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386045855
70	NC_017545	TTAAAG	2	12	229184	229195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045857
71	NC_017545	TGTCGG	2	12	231160	231171	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386045858
72	NC_017545	GCAGAA	2	12	234189	234200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386045860
73	NC_017545	TCTCCA	2	12	235027	235038	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386045861
74	NC_017545	ATTGAT	2	12	237685	237696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386045863
75	NC_017545	CAGAAC	2	12	238710	238721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386045864
76	NC_017545	TTTACC	2	12	246466	246477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386045866
77	NC_017545	AGTAAA	2	12	253723	253734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045872
78	NC_017545	AAAGGA	2	12	256984	256995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045875
79	NC_017545	ACAGTA	2	12	261151	261162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386045882
80	NC_017545	AAAACA	2	12	261525	261536	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386045883
81	NC_017545	GCATGG	2	12	261706	261717	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386045883
82	NC_017545	CTGTAG	2	12	264650	264661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386045888
83	NC_017545	TTTTAG	2	12	267309	267320	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386045892
84	NC_017545	GACAAT	2	12	269024	269035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386045894
85	NC_017545	TAAAAA	2	12	270743	270754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386045895
86	NC_017545	TGAATC	2	12	271528	271539	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045896
87	NC_017545	GCTACT	2	12	273220	273231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386045897
88	NC_017545	TTCTGA	2	12	276294	276305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386045899
89	NC_017545	AAGAAA	2	12	279510	279521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386045902
90	NC_017545	TACACT	2	12	283754	283765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045903
91	NC_017545	TTCGTG	2	12	285266	285277	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386045903
92	NC_017545	CCAAAT	2	12	289741	289752	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386045906
93	NC_017545	GAATTA	2	12	292349	292360	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045908
94	NC_017545	TACAAG	2	12	296593	296604	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386045912
95	NC_017545	CGAAAT	2	12	296647	296658	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386045912
96	NC_017545	CATTAT	2	12	300378	300389	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386045915
97	NC_017545	TCTTTT	2	12	300839	300850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386045915
98	NC_017545	AGTTCA	2	12	303103	303114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045917
99	NC_017545	ATCAAT	2	12	303246	303257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386045917
100	NC_017545	ATGAAA	2	12	303604	303615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045918
101	NC_017545	AATACA	2	12	304648	304659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386045920
102	NC_017545	CTTTTA	2	12	305477	305488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386045921
103	NC_017545	TAGAAA	2	12	306423	306434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386045922
104	NC_017545	ACGTTG	2	12	308353	308364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386045924
105	NC_017545	GAAAAC	2	12	310260	310271	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386045925
106	NC_017545	GCTGCG	2	12	315633	315644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386045931
107	NC_017545	TTTTGA	2	12	316033	316044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386045931
108	NC_017545	AAATAA	2	12	319340	319351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386045934
109	NC_017545	GAAGGG	2	12	321137	321148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045935
110	NC_017545	GATTCA	2	12	324778	324789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045938
111	NC_017545	GCAATT	2	12	324808	324819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045938
112	NC_017545	GAACCA	2	12	331600	331611	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386045944
113	NC_017545	TCCATT	2	12	334208	334219	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386045947
114	NC_017545	CTTTTT	2	12	338404	338415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386045952
115	NC_017545	TGCGGG	2	12	339375	339386	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386045953
116	NC_017545	CTGGTT	2	12	340900	340911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386045955
117	NC_017545	CATAGA	2	12	348617	348628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386045964
118	NC_017545	AGAAAA	2	12	349552	349563	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386045965
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122	NC_017545	TTTAAA	2	12	365523	365534	50 %	50 %	0 %	0 %	386045980
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456	NC_017545	CAGTTG	2	12	1417276	1417287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386047042
457	NC_017545	TGCGTC	2	12	1417589	1417600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047042
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