MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 1152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017545	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017545	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017545	AAAT	2	8	28904	28911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017545	AGGA	2	8	29082	29089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017545	TAAA	2	8	31011	31018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017545	CCTT	2	8	37487	37494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017545	AAAT	2	8	44782	44789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017545	ATAA	2	8	51345	51352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017545	TAAA	2	8	51407	51414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017545	AGTG	2	8	51424	51431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017545	TTAG	2	8	52158	52165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017545	GCTC	2	8	53578	53585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017545	TATT	2	8	54952	54959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017545	TAAA	2	8	55684	55691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017545	GTTA	2	8	58863	58870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017545	CATA	2	8	64919	64926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017545	CTTA	2	8	79075	79082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017545	ATGG	2	8	79307	79314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017545	ACTA	2	8	79514	79521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017545	TACA	2	8	79595	79602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017545	AAAG	2	8	79862	79869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017545	AGCG	2	8	82782	82789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017545	TAAT	2	8	84729	84736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017545	AATG	2	8	87491	87498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017545	TAAA	2	8	90705	90712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017545	AAAG	2	8	91043	91050	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017545	AATT	2	8	91108	91115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017545	CCAA	2	8	91204	91211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017545	AACC	2	8	91519	91526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017545	ATTT	2	8	93462	93469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017545	ATTG	2	8	93517	93524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017545	AATA	2	8	109718	109725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017545	AAAT	2	8	109738	109745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017545	CTTT	2	8	115466	115473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017545	GAAT	2	8	115507	115514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017545	GGAG	2	8	115523	115530	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017545	ACTT	2	8	126224	126231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017545	CCAA	2	8	126252	126259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017545	ATAG	2	8	126273	126280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017545	TAAA	2	8	140353	140360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017545	TTGG	2	8	140364	140371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017545	ACCA	2	8	140400	140407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017545	TGCG	2	8	146607	146614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017545	TGGT	2	8	150948	150955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017545	TGGT	2	8	151809	151816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017545	GATA	2	8	163107	163114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017545	TTGT	2	8	172917	172924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017545	ACTA	2	8	172962	172969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017545	ATTA	2	8	173026	173033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017545	AAAG	2	8	176064	176071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017545	ACCT	2	8	176344	176351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017545	GAAG	2	8	176485	176492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017545	TACT	2	8	181414	181421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017545	AAGT	2	8	181436	181443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017545	GCTA	2	8	197467	197474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017545	GAAT	2	8	200266	200273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017545	TTGC	2	8	203527	203534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017545	GGCT	2	8	204394	204401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017545	TAAT	2	8	204479	204486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017545	AAAT	2	8	204592	204599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017545	CAAA	2	8	204626	204633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017545	TCAT	2	8	204722	204729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017545	GAAA	2	8	207984	207991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017545	CATA	2	8	208060	208067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017545	ATTT	2	8	208079	208086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017545	AGCA	2	8	209238	209245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017545	AATT	2	8	212839	212846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017545	TAAC	2	8	212910	212917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017545	GAAA	2	8	214949	214956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017545	AGTA	2	8	217980	217987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017545	AATA	2	8	219898	219905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017545	TTTG	2	8	219923	219930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017545	TCTT	2	8	221275	221282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017545	GAAT	2	8	221313	221320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017545	GAAG	2	8	224899	224906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017545	GGGA	2	8	227024	227031	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017545	AATT	2	8	228012	228019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017545	GAAG	2	8	228092	228099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017545	ATTA	2	8	230058	230065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017545	ATAG	2	8	230096	230103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017545	AATA	2	8	230213	230220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017545	AATT	2	8	234338	234345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017545	ATAG	2	8	234367	234374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017545	CTTT	2	8	235405	235412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017545	GGAA	2	8	236887	236894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017545	AAAC	2	8	240710	240717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017545	TAGA	2	8	240775	240782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017545	CGAA	2	8	241079	241086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017545	CCTG	2	8	241146	241153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017545	AGCC	2	8	242480	242487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017545	TGTT	2	8	242641	242648	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017545	AGAA	2	8	243033	243040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017545	AAAG	2	8	243136	243143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017545	TACT	2	8	243575	243582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017545	CACG	2	8	243596	243603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017545	AGTG	2	8	244335	244342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017545	GGAA	2	8	244389	244396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017545	TAGG	2	8	244963	244970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017545	ATGG	2	8	245146	245153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017545	ATCG	2	8	245724	245731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017545	ATAA	2	8	245985	245992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017545	CCTT	2	8	250591	250598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017545	AAAT	2	8	252102	252109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017545	TGAA	2	8	255990	255997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017545	ACAA	2	8	264484	264491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017545	TTTA	2	8	264939	264946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017545	TTTC	2	8	267830	267837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017545	TCTT	2	8	268708	268715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017545	TTCG	2	8	277907	277914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017545	AATT	2	8	278415	278422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017545	CGAA	2	8	286448	286455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017545	ATTT	2	8	288236	288243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017545	TACA	2	8	290090	290097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017545	CAAT	2	8	293554	293561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017545	TAAA	2	8	294870	294877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017545	TTTG	2	8	294887	294894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017545	GAAC	2	8	294965	294972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017545	ACAT	2	8	297137	297144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017545	ATCC	2	8	311961	311968	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017545	ATTA	2	8	312763	312770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017545	TAAA	2	8	316405	316412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017545	GTTA	2	8	316485	316492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017545	TAAT	2	8	317844	317851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017545	AGGC	2	8	317904	317911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017545	TAAA	2	8	317947	317954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017545	CTTA	2	8	318787	318794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017545	TAAA	2	8	318808	318815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017545	ATTT	2	8	325676	325683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017545	GATT	2	8	325823	325830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017545	TTAT	2	8	326052	326059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017545	AGAT	2	8	327570	327577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017545	TTTA	2	8	327583	327590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017545	TAAT	2	8	328503	328510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017545	AAAT	2	8	328540	328547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017545	ATTT	2	8	335624	335631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017545	TGTT	2	8	339538	339545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017545	TTGT	2	8	345633	345640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017545	ATTT	2	8	357305	357312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017545	AAAT	2	8	358275	358282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017545	AATT	2	8	358376	358383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017545	CAAG	2	8	358849	358856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017545	AAAG	2	8	358870	358877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017545	ATAA	2	8	359030	359037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017545	TTGT	2	8	359231	359238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017545	GTTA	2	8	359262	359269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017545	GTCA	2	8	368938	368945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017545	AGTA	2	8	369064	369071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017545	TATT	2	8	374469	374476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017545	AATT	2	8	375416	375423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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