MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 4073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017545	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017545	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017545	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017545	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017545	TAA	2	6	12836	12841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017545	TAT	2	6	12886	12891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017545	AGT	2	6	15881	15886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017545	CTT	2	6	16139	16144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017545	CTC	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017545	ATT	2	6	21574	21579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017545	GAG	2	6	21636	21641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017545	TCA	2	6	23106	23111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017545	AAG	2	6	25845	25850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017545	GGA	2	6	27480	27485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017545	TCA	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017545	GTC	2	6	29091	29096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017545	TCC	2	6	33358	33363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017545	CTT	2	6	36099	36104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017545	ATC	2	6	36180	36185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017545	AAT	2	6	36212	36217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017545	CAA	2	6	38707	38712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017545	AGG	2	6	44603	44608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017545	TCT	2	6	44619	44624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017545	AAT	2	6	44711	44716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017545	ATG	2	6	44729	44734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017545	AGG	2	6	45844	45849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017545	AGA	2	6	45850	45855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017545	AGG	2	6	49411	49416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017545	TTG	2	6	53458	53463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017545	ATA	2	6	53541	53546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017545	ATT	2	6	53568	53573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017545	AGG	2	6	53670	53675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017545	GAG	2	6	54018	54023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017545	AGG	2	6	54601	54606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017545	AAG	2	6	54935	54940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017545	TAT	2	6	55715	55720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017545	TTA	2	6	55830	55835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017545	GGA	2	6	56720	56725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017545	TGA	2	6	58821	58826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017545	ATA	2	6	58847	58852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017545	TGA	2	6	58854	58859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017545	AAT	2	6	64294	64299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017545	ATA	2	6	64585	64590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017545	CAA	2	6	64904	64909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017545	AGG	2	6	75262	75267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017545	AGG	2	6	77333	77338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017545	TAG	2	6	77904	77909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017545	GAA	2	6	77953	77958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017545	GAT	2	6	77959	77964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017545	AAT	2	6	78042	78047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017545	ATT	2	6	79006	79011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017545	ACA	2	6	79038	79043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017545	ATT	2	6	79089	79094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017545	TAT	2	6	79127	79132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017545	GTG	2	6	79148	79153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017545	TAA	2	6	79185	79190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017545	GAG	2	6	79324	79329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017545	AAG	2	6	79376	79381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017545	ACA	2	6	79487	79492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017545	AGT	2	6	79534	79539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017545	TGT	2	6	79646	79651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017545	TAC	2	6	79676	79681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017545	AAT	3	9	79726	79734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017545	AAG	2	6	79790	79795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017545	AGA	2	6	79813	79818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017545	CAG	2	6	79830	79835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017545	TAA	2	6	81830	81835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017545	AGG	2	6	81896	81901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017545	ATT	2	6	82813	82818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017545	AAG	2	6	83143	83148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017545	AGT	2	6	83149	83154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017545	GAA	2	6	83209	83214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017545	TTA	2	6	83886	83891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017545	TTA	2	6	84705	84710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017545	GAG	2	6	87518	87523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017545	TTA	2	6	88530	88535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017545	GTT	2	6	88578	88583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017545	AGC	2	6	88598	88603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017545	TAA	2	6	88713	88718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017545	AAT	2	6	88723	88728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017545	ATT	2	6	88746	88751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017545	TAA	2	6	88791	88796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017545	TAC	2	6	88799	88804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017545	GTT	2	6	88821	88826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017545	TAA	2	6	90587	90592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017545	TAA	2	6	90634	90639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017545	GAG	2	6	90655	90660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017545	AAT	2	6	90901	90906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017545	ATG	2	6	91009	91014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017545	AAT	2	6	91101	91106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017545	TTA	2	6	91188	91193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017545	TGA	2	6	91223	91228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017545	ATA	2	6	91234	91239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017545	ATG	2	6	91301	91306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017545	AAG	2	6	91328	91333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017545	GAA	2	6	91361	91366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017545	TGT	2	6	91912	91917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017545	TAA	2	6	92367	92372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017545	TGT	2	6	93412	93417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017545	TAA	2	6	93489	93494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017545	GAT	2	6	93499	93504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017545	TAG	2	6	93543	93548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017545	TAG	2	6	93595	93600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017545	ATA	2	6	93710	93715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017545	ACA	2	6	102727	102732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017545	ACA	2	6	109570	109575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017545	AAT	2	6	109592	109597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017545	AGG	2	6	109756	109761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017545	AGG	2	6	110746	110751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017545	GGA	2	6	111573	111578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017545	TAA	2	6	112584	112589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017545	ATA	2	6	113072	113077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017545	AGG	2	6	113120	113125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017545	CCT	2	6	113498	113503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017545	TGC	2	6	113887	113892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017545	TAT	2	6	113900	113905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017545	AAT	2	6	113917	113922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017545	GTT	2	6	113945	113950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017545	AGG	2	6	114969	114974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017545	AAG	2	6	115434	115439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017545	CCG	2	6	115450	115455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017545	AGG	2	6	122595	122600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017545	AAT	2	6	124595	124600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017545	CAA	2	6	126195	126200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017545	TTC	2	6	126233	126238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017545	TCC	2	6	127092	127097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017545	CAT	2	6	128181	128186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017545	ATA	2	6	128274	128279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017545	ATG	2	6	128281	128286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017545	GGA	2	6	128366	128371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017545	ATT	2	6	128376	128381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017545	AGG	2	6	129383	129388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017545	GAA	2	6	129734	129739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017545	AGG	2	6	134840	134845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017545	AGG	2	6	135873	135878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017545	GCT	2	6	137037	137042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017545	AGG	2	6	139585	139590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_017545	TAT	2	6	141972	141977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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