MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 38946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
2	NC_017545	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
3	NC_017545	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
4	NC_017545	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
5	NC_017545	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045635
6	NC_017545	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045635
7	NC_017545	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
8	NC_017545	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
9	NC_017545	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
10	NC_017545	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
11	NC_017545	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
12	NC_017545	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
13	NC_017545	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
14	NC_017545	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
15	NC_017545	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045635
16	NC_017545	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
17	NC_017545	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045635
18	NC_017545	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
19	NC_017545	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045635
20	NC_017545	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
21	NC_017545	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
22	NC_017545	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
23	NC_017545	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
24	NC_017545	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045635
25	NC_017545	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
26	NC_017545	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045635
27	NC_017545	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
28	NC_017545	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
29	NC_017545	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
30	NC_017545	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045636
31	NC_017545	TCG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045636
32	NC_017545	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045636
33	NC_017545	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045636
34	NC_017545	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
35	NC_017545	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
36	NC_017545	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
37	NC_017545	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045636
38	NC_017545	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045636
39	NC_017545	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045636
40	NC_017545	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045636
41	NC_017545	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045636
42	NC_017545	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
43	NC_017545	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
44	NC_017545	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
45	NC_017545	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045637
46	NC_017545	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
47	NC_017545	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
48	NC_017545	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045637
49	NC_017545	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
50	NC_017545	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045637
51	NC_017545	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
52	NC_017545	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045637
53	NC_017545	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
54	NC_017545	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045637
55	NC_017545	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045637
56	NC_017545	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
57	NC_017545	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045637
58	NC_017545	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045637
59	NC_017545	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045637
60	NC_017545	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045637
61	NC_017545	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045637
62	NC_017545	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
63	NC_017545	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
64	NC_017545	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
65	NC_017545	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045637
66	NC_017545	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045637
67	NC_017545	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045638
68	NC_017545	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045638
69	NC_017545	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045639
70	NC_017545	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045639
71	NC_017545	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
72	NC_017545	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045639
73	NC_017545	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045639
74	NC_017545	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045639
75	NC_017545	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045639
76	NC_017545	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045639
77	NC_017545	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045639
78	NC_017545	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045639
79	NC_017545	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045639
80	NC_017545	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
81	NC_017545	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
82	NC_017545	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
83	NC_017545	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045640
84	NC_017545	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
85	NC_017545	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045640
86	NC_017545	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045640
87	NC_017545	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045640
88	NC_017545	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045640
89	NC_017545	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
90	NC_017545	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
91	NC_017545	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045640
92	NC_017545	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
93	NC_017545	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045640
94	NC_017545	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
95	NC_017545	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045640
96	NC_017545	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045640
97	NC_017545	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045640
98	NC_017545	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045640
99	NC_017545	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
100	NC_017545	ATT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045640
101	NC_017545	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
102	NC_017545	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045640
103	NC_017545	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045640
104	NC_017545	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045640
105	NC_017545	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
106	NC_017545	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045640
107	NC_017545	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045640
108	NC_017545	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045640
109	NC_017545	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
110	NC_017545	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045640
111	NC_017545	ACA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045640
112	NC_017545	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045640
113	NC_017545	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045640
114	NC_017545	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045640
115	NC_017545	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045641
116	NC_017545	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045641
117	NC_017545	CGT	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045641
118	NC_017545	GCA	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045641
119	NC_017545	ACT	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045641
120	NC_017545	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045641
121	NC_017545	TTA	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045641
122	NC_017545	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045641
123	NC_017545	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045641
124	NC_017545	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045641
125	NC_017545	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045641
126	NC_017545	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045641
127	NC_017545	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045641
128	NC_017545	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045641
129	NC_017545	ATG	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045641
130	NC_017545	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045641
131	NC_017545	AAT	2	6	9016	9021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045641
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255	NC_017545	TGT	2	6	18495	18500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045648
256	NC_017545	TGG	2	6	18501	18506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045648
257	NC_017545	CTT	2	6	18564	18569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045648
258	NC_017545	TTC	2	6	18688	18693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045648
259	NC_017545	GTT	2	6	18703	18708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045648
260	NC_017545	CGT	2	6	18763	18768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045648
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286	NC_017545	ATA	2	6	20426	20431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045651
287	NC_017545	CAA	2	6	20601	20606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045651
288	NC_017545	ATC	2	6	20623	20628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045651
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377	NC_017545	ATT	2	6	27435	27440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045658
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