MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 3610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017545	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	386045635
3	NC_017545	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	386045635
4	NC_017545	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	386045635
5	NC_017545	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017545	CG	3	6	6953	6958	0 %	0 %	50 %	50 %	386045640
7	NC_017545	GC	4	8	7223	7230	0 %	0 %	50 %	50 %	386045640
8	NC_017545	AT	3	6	8697	8702	50 %	50 %	0 %	0 %	386045641
9	NC_017545	AC	3	6	11538	11543	50 %	0 %	0 %	50 %	386045642
10	NC_017545	TA	3	6	13246	13251	50 %	50 %	0 %	0 %	386045644
11	NC_017545	TA	3	6	13492	13497	50 %	50 %	0 %	0 %	386045644
12	NC_017545	CA	3	6	13862	13867	50 %	0 %	0 %	50 %	386045644
13	NC_017545	AT	3	6	14214	14219	50 %	50 %	0 %	0 %	386045645
14	NC_017545	TA	3	6	14909	14914	50 %	50 %	0 %	0 %	386045646
15	NC_017545	AT	3	6	15976	15981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017545	GC	3	6	17390	17395	0 %	0 %	50 %	50 %	386045648
17	NC_017545	TA	3	6	18182	18187	50 %	50 %	0 %	0 %	386045648
18	NC_017545	GC	3	6	19273	19278	0 %	0 %	50 %	50 %	386045648
19	NC_017545	CA	3	6	22561	22566	50 %	0 %	0 %	50 %	386045652
20	NC_017545	AT	3	6	23085	23090	50 %	50 %	0 %	0 %	386045652
21	NC_017545	CG	3	6	23144	23149	0 %	0 %	50 %	50 %	386045653
22	NC_017545	CG	3	6	24165	24170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017545	AG	3	6	24745	24750	50 %	0 %	50 %	0 %	386045654
24	NC_017545	AT	3	6	24871	24876	50 %	50 %	0 %	0 %	386045654
25	NC_017545	CG	4	8	26310	26317	0 %	0 %	50 %	50 %	386045657
26	NC_017545	AT	3	6	27047	27052	50 %	50 %	0 %	0 %	386045658
27	NC_017545	AT	3	6	27784	27789	50 %	50 %	0 %	0 %	386045659
28	NC_017545	AT	3	6	28763	28768	50 %	50 %	0 %	0 %	386045660
29	NC_017545	AT	3	6	28951	28956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017545	AT	3	6	30344	30349	50 %	50 %	0 %	0 %	386045661
31	NC_017545	GT	3	6	31744	31749	0 %	50 %	50 %	0 %	386045662
32	NC_017545	AT	3	6	34344	34349	50 %	50 %	0 %	0 %	386045666
33	NC_017545	TG	3	6	34735	34740	0 %	50 %	50 %	0 %	386045666
34	NC_017545	TC	3	6	35899	35904	0 %	50 %	0 %	50 %	386045668
35	NC_017545	AT	3	6	36110	36115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017545	AG	3	6	37711	37716	50 %	0 %	50 %	0 %	386045671
37	NC_017545	TA	3	6	38113	38118	50 %	50 %	0 %	0 %	386045671
38	NC_017545	GT	3	6	38409	38414	0 %	50 %	50 %	0 %	386045671
39	NC_017545	AC	3	6	38918	38923	50 %	0 %	0 %	50 %	386045672
40	NC_017545	TG	3	6	39304	39309	0 %	50 %	50 %	0 %	386045672
41	NC_017545	AT	4	8	40144	40151	50 %	50 %	0 %	0 %	386045673
42	NC_017545	CG	3	6	40228	40233	0 %	0 %	50 %	50 %	386045673
43	NC_017545	GC	3	6	41025	41030	0 %	0 %	50 %	50 %	386045673
44	NC_017545	AT	3	6	41295	41300	50 %	50 %	0 %	0 %	386045673
45	NC_017545	CA	3	6	41413	41418	50 %	0 %	0 %	50 %	386045673
46	NC_017545	AG	3	6	42140	42145	50 %	0 %	50 %	0 %	386045674
47	NC_017545	CG	3	6	43419	43424	0 %	0 %	50 %	50 %	386045674
48	NC_017545	AG	3	6	44571	44576	50 %	0 %	50 %	0 %	386045675
49	NC_017545	AT	3	6	45104	45109	50 %	50 %	0 %	0 %	386045676
50	NC_017545	TG	3	6	46284	46289	0 %	50 %	50 %	0 %	386045677
51	NC_017545	AG	3	6	46467	46472	50 %	0 %	50 %	0 %	386045677
52	NC_017545	AT	3	6	46992	46997	50 %	50 %	0 %	0 %	386045677
53	NC_017545	GA	3	6	47264	47269	50 %	0 %	50 %	0 %	386045677
54	NC_017545	AT	3	6	47494	47499	50 %	50 %	0 %	0 %	386045678
55	NC_017545	GT	3	6	48613	48618	0 %	50 %	50 %	0 %	386045679
56	NC_017545	AT	3	6	49159	49164	50 %	50 %	0 %	0 %	386045679
57	NC_017545	AG	3	6	50262	50267	50 %	0 %	50 %	0 %	386045680
58	NC_017545	TA	3	6	51210	51215	50 %	50 %	0 %	0 %	386045681
59	NC_017545	TC	3	6	52126	52131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017545	GA	3	6	52357	52362	50 %	0 %	50 %	0 %	386045683
61	NC_017545	AT	6	12	53067	53078	50 %	50 %	0 %	0 %	386045683
62	NC_017545	AG	3	6	54325	54330	50 %	0 %	50 %	0 %	386045685
63	NC_017545	TA	3	6	54971	54976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017545	AT	3	6	57489	57494	50 %	50 %	0 %	0 %	386045690
65	NC_017545	AT	3	6	58101	58106	50 %	50 %	0 %	0 %	386045691
66	NC_017545	CA	3	6	60829	60834	50 %	0 %	0 %	50 %	386045692
67	NC_017545	CG	3	6	61778	61783	0 %	0 %	50 %	50 %	386045694
68	NC_017545	GT	3	6	63644	63649	0 %	50 %	50 %	0 %	386045696
69	NC_017545	TA	3	6	64357	64362	50 %	50 %	0 %	0 %	386045697
70	NC_017545	TA	3	6	64459	64464	50 %	50 %	0 %	0 %	386045697
71	NC_017545	CG	3	6	64649	64654	0 %	0 %	50 %	50 %	386045698
72	NC_017545	TA	3	6	65015	65020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017545	CA	3	6	65173	65178	50 %	0 %	0 %	50 %	386045699
74	NC_017545	AG	3	6	65693	65698	50 %	0 %	50 %	0 %	386045699
75	NC_017545	TC	4	8	65747	65754	0 %	50 %	0 %	50 %	386045699
76	NC_017545	TA	3	6	65994	65999	50 %	50 %	0 %	0 %	386045699
77	NC_017545	CT	3	6	66282	66287	0 %	50 %	0 %	50 %	386045699
78	NC_017545	TA	3	6	67597	67602	50 %	50 %	0 %	0 %	386045699
79	NC_017545	GC	3	6	68740	68745	0 %	0 %	50 %	50 %	386045700
80	NC_017545	AC	3	6	68788	68793	50 %	0 %	0 %	50 %	386045701
81	NC_017545	GC	3	6	69305	69310	0 %	0 %	50 %	50 %	386045702
82	NC_017545	AT	3	6	69433	69438	50 %	50 %	0 %	0 %	386045702
83	NC_017545	AG	3	6	70267	70272	50 %	0 %	50 %	0 %	386045703
84	NC_017545	GC	3	6	72431	72436	0 %	0 %	50 %	50 %	386045703
85	NC_017545	AC	4	8	74175	74182	50 %	0 %	0 %	50 %	386045703
86	NC_017545	GA	3	6	74399	74404	50 %	0 %	50 %	0 %	386045703
87	NC_017545	AT	3	6	75925	75930	50 %	50 %	0 %	0 %	386045706
88	NC_017545	AG	3	6	75950	75955	50 %	0 %	50 %	0 %	386045706
89	NC_017545	AT	3	6	76119	76124	50 %	50 %	0 %	0 %	386045707
90	NC_017545	AT	3	6	76565	76570	50 %	50 %	0 %	0 %	386045707
91	NC_017545	AT	4	8	79262	79269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017545	GA	3	6	79274	79279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017545	AG	3	6	79501	79506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017545	GA	3	6	79551	79556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017545	TA	3	6	80692	80697	50 %	50 %	0 %	0 %	386045712
96	NC_017545	TC	3	6	81059	81064	0 %	50 %	0 %	50 %	386045713
97	NC_017545	AT	3	6	81431	81436	50 %	50 %	0 %	0 %	386045713
98	NC_017545	AG	4	8	81706	81713	50 %	0 %	50 %	0 %	386045713
99	NC_017545	TA	5	10	83112	83121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017545	AT	3	6	84335	84340	50 %	50 %	0 %	0 %	386045717
101	NC_017545	AT	3	6	84484	84489	50 %	50 %	0 %	0 %	386045717
102	NC_017545	AT	3	6	84751	84756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017545	TA	3	6	84780	84785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017545	CG	3	6	86074	86079	0 %	0 %	50 %	50 %	386045719
105	NC_017545	GC	3	6	86894	86899	0 %	0 %	50 %	50 %	386045720
106	NC_017545	CT	3	6	89011	89016	0 %	50 %	0 %	50 %	386045722
107	NC_017545	TA	3	6	89790	89795	50 %	50 %	0 %	0 %	386045722
108	NC_017545	TA	3	6	89929	89934	50 %	50 %	0 %	0 %	386045722
109	NC_017545	GA	3	6	90952	90957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017545	AT	3	6	90959	90964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017545	GA	3	6	90981	90986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017545	GA	3	6	91160	91165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017545	GA	3	6	91282	91287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017545	AT	3	6	91673	91678	50 %	50 %	0 %	0 %	386045725
115	NC_017545	GA	3	6	93037	93042	50 %	0 %	50 %	0 %	386045727
116	NC_017545	AT	3	6	93615	93620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017545	GA	3	6	94598	94603	50 %	0 %	50 %	0 %	386045729
118	NC_017545	AG	3	6	94859	94864	50 %	0 %	50 %	0 %	386045729
119	NC_017545	AT	3	6	94952	94957	50 %	50 %	0 %	0 %	386045729
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121	NC_017545	TA	3	6	96628	96633	50 %	50 %	0 %	0 %	386045729
122	NC_017545	AC	3	6	96976	96981	50 %	0 %	0 %	50 %	386045729
123	NC_017545	AC	3	6	97318	97323	50 %	0 %	0 %	50 %	386045729
124	NC_017545	TA	3	6	98256	98261	50 %	50 %	0 %	0 %	386045729
125	NC_017545	TA	4	8	99038	99045	50 %	50 %	0 %	0 %	386045729
126	NC_017545	TC	4	8	100500	100507	0 %	50 %	0 %	50 %	386045730
127	NC_017545	TA	3	6	103042	103047	50 %	50 %	0 %	0 %	386045732
128	NC_017545	GT	3	6	105105	105110	0 %	50 %	50 %	0 %	386045733
129	NC_017545	TG	3	6	106073	106078	0 %	50 %	50 %	0 %	386045734
130	NC_017545	TG	3	6	106196	106201	0 %	50 %	50 %	0 %	386045734
131	NC_017545	CA	3	6	106414	106419	50 %	0 %	0 %	50 %	386045735
132	NC_017545	AG	3	6	106960	106965	50 %	0 %	50 %	0 %	386045735
133	NC_017545	GT	4	8	107295	107302	0 %	50 %	50 %	0 %	386045735
134	NC_017545	AG	3	6	108084	108089	50 %	0 %	50 %	0 %	386045736
135	NC_017545	AT	3	6	108732	108737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017545	AC	3	6	110303	110308	50 %	0 %	0 %	50 %	386045739
137	NC_017545	AT	3	6	111545	111550	50 %	50 %	0 %	0 %	386045740
138	NC_017545	AG	3	6	111611	111616	50 %	0 %	50 %	0 %	386045741
139	NC_017545	TA	3	6	111725	111730	50 %	50 %	0 %	0 %	386045741
140	NC_017545	AT	3	6	111792	111797	50 %	50 %	0 %	0 %	386045741
141	NC_017545	AT	3	6	112555	112560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017545	AG	3	6	115537	115542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017545	CA	3	6	115560	115565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017545	AG	3	6	115577	115582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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