MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017544	AGAAAA	2	12	76621	76632	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017544	AATAAA	2	12	194006	194017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017544	GAAAAC	2	12	221023	221034	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017544	GGTTTT	2	12	227650	227661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017544	ATTCAA	2	12	231910	231921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017544	AAGGAA	2	12	233481	233492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017544	TAGGCG	2	12	235134	235145	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017544	ATTCAA	2	12	237932	237943	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017544	AAGGAA	2	12	239503	239514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017544	TAGGCG	2	12	241156	241167	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017544	AGTCAA	2	12	242971	242982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017544	TTATAT	2	12	257755	257766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017544	AACTTT	2	12	282818	282829	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017544	AATACA	2	12	291409	291420	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017544	TTGGTT	2	12	332622	332633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017544	AAATGA	2	12	389088	389099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017544	ATGATA	2	12	390907	390918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017544	AGTGCT	2	12	402538	402549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017544	TTGTTT	2	12	411217	411228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017544	ACAAAA	2	12	466239	466250	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017544	TTAAAT	2	12	489756	489767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017544	CTATAA	2	12	491525	491536	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017544	AGATTT	2	12	551040	551051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017544	ATCATT	2	12	621175	621186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017544	TATTTT	2	12	660319	660330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017544	ATCATT	2	12	663849	663860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017544	GTTTTA	2	12	691123	691134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017544	TATAGG	2	12	708341	708352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017544	ATCTCA	2	12	738393	738404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017544	TTACTT	2	12	834960	834971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017544	TGAAAT	2	12	844828	844839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017544	ATAAAA	2	12	863950	863961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017544	AAATAG	2	12	871429	871440	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017544	GTAATC	2	12	878232	878243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017544	TTACAA	2	12	878250	878261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017544	ATGAAA	2	12	886856	886867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017544	TTGACT	2	12	1010886	1010897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017544	AGGAAG	2	12	1021079	1021090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017544	CTTTTT	2	12	1080819	1080830	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017544	TTTAGT	2	12	1123019	1123030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017544	TTTTAA	2	12	1157563	1157574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017544	CTTTTT	2	12	1195557	1195568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017544	GAAAAA	2	12	1225541	1225552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017544	TATTAA	2	12	1252022	1252033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017544	TATTAA	2	12	1402772	1402783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017544	ATAAAA	2	12	1436951	1436962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017544	CTCTTC	2	12	1548020	1548031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017544	GGTATA	2	12	1581275	1581286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017544	TAATTA	2	12	1584344	1584355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017544	GGTTGT	2	12	1598671	1598682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017544	GGTTGT	2	12	1600142	1600153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017544	AAGAAT	2	12	1601694	1601705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017544	GTAAAC	2	12	1602847	1602858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017544	AAAATA	2	12	1615790	1615801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017544	TAAAAA	2	12	1616701	1616712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017544	TAAAAA	2	12	1643444	1643455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017544	AAATAA	2	12	1660709	1660720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017544	ATGAAA	2	12	1662399	1662410	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017544	CGCCTA	2	12	1703178	1703189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017544	TTTCCT	2	12	1704830	1704841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017544	AAAAAC	2	12	1776717	1776728	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017544	CGCCTA	2	12	1807151	1807162	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017544	TTTCCT	2	12	1808803	1808814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017544	TTGAAT	2	12	1810375	1810386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017544	GTTTTA	2	12	1818294	1818305	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017544	AAAAAG	2	12	1901370	1901381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017544	CTCTAT	2	12	1919088	1919099	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017544	TCATTT	2	12	1920286	1920297	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017544	GTTTTC	2	12	1947454	1947465	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017544	CAAAAA	2	12	1965180	1965191	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017544	GAAAAA	2	12	1969041	1969052	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017544	AGAAAA	2	12	1975877	1975888	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017544	TTTTAT	2	12	2064739	2064750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017544	ATTCAA	2	12	2122378	2122389	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017544	TTATAT	2	12	2185327	2185338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017544	TAGTAA	2	12	2237684	2237695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017544	AATTTT	2	12	2239406	2239417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017544	AAATTG	2	12	2245581	2245592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017544	CTCTGT	2	12	2252427	2252438	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017544	TAATAC	2	12	2373786	2373797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017544	CGCCTA	2	12	2394531	2394542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017544	TTTCCT	2	12	2396434	2396445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017544	TTGAAT	2	12	2398006	2398017	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017544	TAAAAT	2	12	2473411	2473422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017544	TTCAAA	2	12	2482053	2482064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017544	CTTTTT	2	12	2547282	2547293	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017544	ATCCCA	2	12	2567197	2567208	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017544	AAAAGA	2	12	2573028	2573039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017544	TTTTTA	2	12	2579024	2579035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017544	CGCCTA	2	12	2629038	2629049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017544	TTTCCT	2	12	2630941	2630952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017544	TTGAAT	2	12	2632513	2632524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017544	TTATCA	2	12	2639088	2639099	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017544	TCTAGG	2	12	2639816	2639827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017544	CCTCTT	2	12	2684459	2684470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017544	TAAATC	2	12	2705930	2705941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017544	TTAACT	2	12	2820425	2820436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017544	AAATGA	2	12	2846660	2846671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017544	AAGTAT	2	12	2847597	2847608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017544	CAGAGA	2	12	2850529	2850540	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017544	TCTGAC	2	12	2850591	2850602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.