MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 2141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017544	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	386042349
3	NC_017544	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	386042349
4	NC_017544	TTTAT	2	10	4207	4216	20 %	80 %	0 %	0 %	386042350
5	NC_017544	TTTGT	2	10	4328	4337	0 %	80 %	20 %	0 %	386042350
6	NC_017544	CAAAA	2	10	7074	7083	80 %	0 %	0 %	20 %	386042353
7	NC_017544	TTGAT	2	10	11756	11765	20 %	60 %	20 %	0 %	386042355
8	NC_017544	TTTTA	2	10	12429	12438	20 %	80 %	0 %	0 %	386042356
9	NC_017544	GTATG	2	10	13372	13381	20 %	40 %	40 %	0 %	386042357
10	NC_017544	AAAGA	2	10	14387	14396	80 %	0 %	20 %	0 %	386042358
11	NC_017544	ATGAA	2	10	17250	17259	60 %	20 %	20 %	0 %	386042360
12	NC_017544	GAATG	2	10	18992	19001	40 %	20 %	40 %	0 %	386042361
13	NC_017544	TAATT	2	10	20370	20379	40 %	60 %	0 %	0 %	386042364
14	NC_017544	ATTAA	2	10	21887	21896	60 %	40 %	0 %	0 %	386042365
15	NC_017544	AAATC	2	10	22348	22357	60 %	20 %	0 %	20 %	386042365
16	NC_017544	AACAT	2	10	22509	22518	60 %	20 %	0 %	20 %	386042365
17	NC_017544	TTTTA	2	10	23126	23135	20 %	80 %	0 %	0 %	386042366
18	NC_017544	GACCA	2	10	23210	23219	40 %	0 %	20 %	40 %	386042366
19	NC_017544	TGGAT	2	10	23469	23478	20 %	40 %	40 %	0 %	386042366
20	NC_017544	CAAAA	2	10	24470	24479	80 %	0 %	0 %	20 %	386042367
21	NC_017544	ATTAT	2	10	24955	24964	40 %	60 %	0 %	0 %	386042368
22	NC_017544	TCAGG	2	10	26124	26133	20 %	20 %	40 %	20 %	386042370
23	NC_017544	TTTAC	2	10	27124	27133	20 %	60 %	0 %	20 %	386042371
24	NC_017544	GAAAA	2	10	33066	33075	80 %	0 %	20 %	0 %	386042377
25	NC_017544	TGAAA	2	10	34221	34230	60 %	20 %	20 %	0 %	386042378
26	NC_017544	GAATG	2	10	36092	36101	40 %	20 %	40 %	0 %	386042380
27	NC_017544	AAATT	2	10	36219	36228	60 %	40 %	0 %	0 %	386042380
28	NC_017544	ATGGA	2	10	38340	38349	40 %	20 %	40 %	0 %	386042381
29	NC_017544	AAAAC	2	10	40446	40455	80 %	0 %	0 %	20 %	386042382
30	NC_017544	TTATT	2	10	41935	41944	20 %	80 %	0 %	0 %	386042384
31	NC_017544	AAAAG	2	10	43149	43158	80 %	0 %	20 %	0 %	386042384
32	NC_017544	ATAAA	2	10	43973	43982	80 %	20 %	0 %	0 %	386042385
33	NC_017544	ATTTT	2	10	45778	45787	20 %	80 %	0 %	0 %	386042387
34	NC_017544	GAAAC	2	10	47036	47045	60 %	0 %	20 %	20 %	386042388
35	NC_017544	GACTT	2	10	47275	47284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017544	ATTTT	2	10	47362	47371	20 %	80 %	0 %	0 %	386042389
37	NC_017544	AAATG	2	10	48492	48501	60 %	20 %	20 %	0 %	386042390
38	NC_017544	ATGGT	2	10	49529	49538	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017544	GTAGA	2	10	49578	49587	40 %	20 %	40 %	0 %	386042391
40	NC_017544	TTACT	2	10	50560	50569	20 %	60 %	0 %	20 %	386042393
41	NC_017544	GAAAT	2	10	51218	51227	60 %	20 %	20 %	0 %	386042394
42	NC_017544	CTTAG	2	10	51317	51326	20 %	40 %	20 %	20 %	386042394
43	NC_017544	TAAAA	2	10	52567	52576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017544	TGCTA	2	10	52741	52750	20 %	40 %	20 %	20 %	386042397
45	NC_017544	TTTTA	2	10	52909	52918	20 %	80 %	0 %	0 %	386042397
46	NC_017544	AGTTA	2	10	54225	54234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017544	TTATG	2	10	54773	54782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017544	AGTCT	2	10	55689	55698	20 %	40 %	20 %	20 %	386042398
49	NC_017544	CGCAA	2	10	57737	57746	40 %	0 %	20 %	40 %	386042400
50	NC_017544	TTTTA	2	10	58685	58694	20 %	80 %	0 %	0 %	386042401
51	NC_017544	AAACG	2	10	63068	63077	60 %	0 %	20 %	20 %	386042405
52	NC_017544	ATTAT	2	10	64036	64045	40 %	60 %	0 %	0 %	386042405
53	NC_017544	CGAAA	2	10	64554	64563	60 %	0 %	20 %	20 %	386042406
54	NC_017544	AAAAC	2	10	64564	64573	80 %	0 %	0 %	20 %	386042406
55	NC_017544	AACAA	2	10	65987	65996	80 %	0 %	0 %	20 %	386042408
56	NC_017544	ATGGA	2	10	72677	72686	40 %	20 %	40 %	0 %	386042414
57	NC_017544	AAAAT	2	10	72705	72714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017544	ATGGA	2	10	73222	73231	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017544	GTATA	2	10	74093	74102	40 %	40 %	20 %	0 %	386042415
60	NC_017544	TATTT	2	10	74233	74242	20 %	80 %	0 %	0 %	386042416
61	NC_017544	ATATA	2	10	74488	74497	60 %	40 %	0 %	0 %	386042416
62	NC_017544	TTTTA	2	10	76112	76121	20 %	80 %	0 %	0 %	386042418
63	NC_017544	TCCAA	2	10	77752	77761	40 %	20 %	0 %	40 %	386042420
64	NC_017544	GCTTG	2	10	78088	78097	0 %	40 %	40 %	20 %	386042420
65	NC_017544	AAACT	2	10	78098	78107	60 %	20 %	0 %	20 %	386042420
66	NC_017544	TCAAG	2	10	78763	78772	40 %	20 %	20 %	20 %	386042421
67	NC_017544	GCGCT	2	10	80144	80153	0 %	20 %	40 %	40 %	386042422
68	NC_017544	TGATT	2	10	80887	80896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017544	AATAA	2	10	82658	82667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017544	TCATT	2	10	84424	84433	20 %	60 %	0 %	20 %	386042427
71	NC_017544	ATTTT	2	10	84676	84685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017544	CTAAA	2	10	86789	86798	60 %	20 %	0 %	20 %	386042429
73	NC_017544	AAGTT	2	10	87215	87224	40 %	40 %	20 %	0 %	386042429
74	NC_017544	GAAAA	2	10	88132	88141	80 %	0 %	20 %	0 %	386042429
75	NC_017544	TGAAA	2	10	88374	88383	60 %	20 %	20 %	0 %	386042429
76	NC_017544	AAATT	2	10	88718	88727	60 %	40 %	0 %	0 %	386042429
77	NC_017544	AGCGG	2	10	89302	89311	20 %	0 %	60 %	20 %	386042429
78	NC_017544	AGTTA	2	10	90711	90720	40 %	40 %	20 %	0 %	386042429
79	NC_017544	GAAAT	2	10	91798	91807	60 %	20 %	20 %	0 %	386042430
80	NC_017544	AAAAG	2	10	92110	92119	80 %	0 %	20 %	0 %	386042430
81	NC_017544	TGAAA	2	10	93107	93116	60 %	20 %	20 %	0 %	386042430
82	NC_017544	TGCAT	2	10	95767	95776	20 %	40 %	20 %	20 %	386042433
83	NC_017544	TTACT	2	10	96013	96022	20 %	60 %	0 %	20 %	386042433
84	NC_017544	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	386042435
85	NC_017544	GAAGT	2	10	97892	97901	40 %	20 %	40 %	0 %	386042435
86	NC_017544	AGCGG	2	10	99211	99220	20 %	0 %	60 %	20 %	386042436
87	NC_017544	ATATC	2	10	105016	105025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017544	TTCCA	2	10	105801	105810	20 %	40 %	0 %	40 %	386042446
89	NC_017544	AAAAG	2	10	107703	107712	80 %	0 %	20 %	0 %	386042448
90	NC_017544	ACGGT	2	10	109247	109256	20 %	20 %	40 %	20 %	386042449
91	NC_017544	GAAAT	2	10	110486	110495	60 %	20 %	20 %	0 %	386042450
92	NC_017544	GAATT	2	10	111127	111136	40 %	40 %	20 %	0 %	386042450
93	NC_017544	AACCA	2	10	115002	115011	60 %	0 %	0 %	40 %	386042453
94	NC_017544	CTTTA	2	10	115331	115340	20 %	60 %	0 %	20 %	386042453
95	NC_017544	CTCGA	2	10	116682	116691	20 %	20 %	20 %	40 %	386042455
96	NC_017544	TTCCA	2	10	117016	117025	20 %	40 %	0 %	40 %	386042455
97	NC_017544	TACTG	2	10	117281	117290	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017544	TCTCT	2	10	117854	117863	0 %	60 %	0 %	40 %	386042456
99	NC_017544	TTTTA	2	10	118214	118223	20 %	80 %	0 %	0 %	386042457
100	NC_017544	AAAAG	2	10	118483	118492	80 %	0 %	20 %	0 %	386042458
101	NC_017544	AAAGT	2	10	119520	119529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017544	TTAGT	2	10	120641	120650	20 %	60 %	20 %	0 %	386042462
103	NC_017544	TGAAC	2	10	121323	121332	40 %	20 %	20 %	20 %	386042464
104	NC_017544	AGATG	2	10	121365	121374	40 %	20 %	40 %	0 %	386042464
105	NC_017544	TTTAT	2	10	123641	123650	20 %	80 %	0 %	0 %	386042465
106	NC_017544	AAGTG	2	10	125663	125672	40 %	20 %	40 %	0 %	386042468
107	NC_017544	GTCAG	2	10	126124	126133	20 %	20 %	40 %	20 %	386042469
108	NC_017544	AATTT	2	10	127405	127414	40 %	60 %	0 %	0 %	386042471
109	NC_017544	TTGTT	2	10	129772	129781	0 %	80 %	20 %	0 %	386042473
110	NC_017544	ATTTT	2	10	131574	131583	20 %	80 %	0 %	0 %	386042475
111	NC_017544	AAAAT	2	10	133076	133085	80 %	20 %	0 %	0 %	386042475
112	NC_017544	AACTT	2	10	134401	134410	40 %	40 %	0 %	20 %	386042478
113	NC_017544	ACAAA	2	10	134503	134512	80 %	0 %	0 %	20 %	386042478
114	NC_017544	TTGGT	2	10	136093	136102	0 %	60 %	40 %	0 %	386042479
115	NC_017544	TTGGT	2	10	136144	136153	0 %	60 %	40 %	0 %	386042479
116	NC_017544	TATGA	2	10	139073	139082	40 %	40 %	20 %	0 %	386042483
117	NC_017544	TTTAT	2	10	139865	139874	20 %	80 %	0 %	0 %	386042484
118	NC_017544	ATTAG	2	10	141096	141105	40 %	40 %	20 %	0 %	386042487
119	NC_017544	ATTTA	2	10	141140	141149	40 %	60 %	0 %	0 %	386042487
120	NC_017544	ATAAA	2	10	142628	142637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017544	ACGGC	2	10	144387	144396	20 %	0 %	40 %	40 %	386042491
122	NC_017544	TTTAA	2	10	144459	144468	40 %	60 %	0 %	0 %	386042491
123	NC_017544	AATTT	2	10	144645	144654	40 %	60 %	0 %	0 %	386042491
124	NC_017544	GATAA	2	10	144812	144821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017544	AATAA	2	10	145914	145923	80 %	20 %	0 %	0 %	386042492
126	NC_017544	GAATA	2	10	147875	147884	60 %	20 %	20 %	0 %	386042495
127	NC_017544	TTTAC	2	10	149074	149083	20 %	60 %	0 %	20 %	386042496
128	NC_017544	AGATG	2	10	149123	149132	40 %	20 %	40 %	0 %	386042496
129	NC_017544	ATATG	2	10	151790	151799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017544	TCTAA	2	10	154141	154150	40 %	40 %	0 %	20 %	386042499
131	NC_017544	AAATC	2	10	154656	154665	60 %	20 %	0 %	20 %	386042499
132	NC_017544	GGCTG	2	10	154693	154702	0 %	20 %	60 %	20 %	386042499
133	NC_017544	CGAAA	2	10	155271	155280	60 %	0 %	20 %	20 %	386042499
134	NC_017544	AAGAT	2	10	157660	157669	60 %	20 %	20 %	0 %	386042501
135	NC_017544	TGCGC	2	10	157781	157790	0 %	20 %	40 %	40 %	386042501
136	NC_017544	GAATT	2	10	158031	158040	40 %	40 %	20 %	0 %	386042502
137	NC_017544	AAATA	2	10	161086	161095	80 %	20 %	0 %	0 %	386042506
138	NC_017544	TTCTT	2	10	162291	162300	0 %	80 %	0 %	20 %	386042508
139	NC_017544	CTAAA	2	10	162439	162448	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017544	TTCCA	2	10	162842	162851	20 %	40 %	0 %	40 %	386042509
141	NC_017544	AACCT	2	10	164613	164622	40 %	20 %	0 %	40 %	386042510
142	NC_017544	ACAAA	2	10	167337	167346	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017544	ACTTT	2	10	168624	168633	20 %	60 %	0 %	20 %	386042512
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156	NC_017544	AATTT	2	10	188643	188652	40 %	60 %	0 %	0 %	386042527
157	NC_017544	ATTTG	2	10	189470	189479	20 %	60 %	20 %	0 %	386042528
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159	NC_017544	ACAAA	2	10	194296	194305	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017544	AAAGT	2	10	196625	196634	60 %	20 %	20 %	0 %	386042535
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176	NC_017544	CATTT	2	10	206932	206941	20 %	60 %	0 %	20 %	386042543
177	NC_017544	AAAAG	2	10	207556	207565	80 %	0 %	20 %	0 %	386042544
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193	NC_017544	GAAAA	2	10	226669	226678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017544	GAAAA	2	10	226872	226881	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017544	AAACA	2	10	226965	226974	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_017544	TGATA	2	10	227442	227451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017544	GAATA	2	10	229961	229970	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017544	AAATT	2	10	231647	231656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017544	TAATT	2	10	231848	231857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_017544	TAATT	2	10	237870	237879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_017544	TCGTG	2	10	239029	239038	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
204	NC_017544	AAGGT	2	10	240497	240506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_017544	ATTGT	2	10	291321	291330	20 %	60 %	20 %	0 %	386042608
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243	NC_017544	ATAAA	2	10	301447	301456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_017544	ACGAA	2	10	316780	316789	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
252	NC_017544	CTATT	2	10	317879	317888	20 %	60 %	0 %	20 %	386042634
253	NC_017544	ATCTT	2	10	319579	319588	20 %	60 %	0 %	20 %	386042635
254	NC_017544	CTAGA	2	10	320648	320657	40 %	20 %	20 %	20 %	386042636
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259	NC_017544	TGTTA	2	10	324124	324133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017544	TTGAA	2	10	324565	324574	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017544	AAATT	2	10	325667	325676	60 %	40 %	0 %	0 %	386042638
262	NC_017544	TGGTT	2	10	326005	326014	0 %	60 %	40 %	0 %	386042638
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268	NC_017544	TTTCG	2	10	331522	331531	0 %	60 %	20 %	20 %	386042643
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270	NC_017544	TATTT	2	10	336149	336158	20 %	80 %	0 %	0 %	386042649
271	NC_017544	ATGAA	2	10	337670	337679	60 %	20 %	20 %	0 %	386042650
272	NC_017544	AGTCT	2	10	338258	338267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_017544	ATCAA	2	10	659262	659271	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

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