MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae KCTC 2242 plasmid pKCTC2242

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017541	GCACCG	2	12	19578	19589	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386037734
2	NC_017541	ACCACT	2	12	25605	25616	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386037739
3	NC_017541	CTGCCA	2	12	26144	26155	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386037739
4	NC_017541	TGGGTG	2	12	33896	33907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037748
5	NC_017541	TGTCAG	2	12	39853	39864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386037755
6	NC_017541	GCAATC	2	12	51331	51342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386037766
7	NC_017541	AAATTA	2	12	52774	52785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037768
8	NC_017541	TATGGA	2	12	54864	54875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037771
9	NC_017541	GTATGT	2	12	56233	56244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386037772
10	NC_017541	ATCGAT	2	12	58130	58141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386037772
11	NC_017541	CCTGAA	2	12	59103	59114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386037772
12	NC_017541	CATCAC	2	12	60007	60018	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386037774
13	NC_017541	TCAGTC	2	12	61313	61324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386037774
14	NC_017541	CCACGG	2	12	62383	62394	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386037775
15	NC_017541	GCCTGA	2	12	68813	68824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386037783
16	NC_017541	CGCAAG	2	12	80274	80285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037793
17	NC_017541	GTTGAT	2	12	81629	81640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386037796
18	NC_017541	CGTTAT	2	12	87610	87621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386037801
19	NC_017541	TCAGAG	2	12	89233	89244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386037803
20	NC_017541	ATCGAA	2	12	97057	97068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386037812
21	NC_017541	CAGCAT	2	12	100155	100166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386037817
22	NC_017541	GCTGAT	2	12	107253	107264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386037826
23	NC_017541	ACTGAA	2	12	118216	118227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386037836
24	NC_017541	TTTCAT	2	12	121129	121140	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386037840
25	NC_017541	CTGCCG	2	12	124877	124888	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386037846
26	NC_017541	CCAGGC	2	12	129121	129132	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386037850
27	NC_017541	CGTTTG	2	12	132331	132342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386037855
28	NC_017541	GTTGAG	2	12	139631	139642	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386037861
29	NC_017541	AAGGAG	2	12	144927	144938	50 %	0 %	50 %	0 %	386037866
30	NC_017541	GCTTGC	2	12	148484	148495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037872
31	NC_017541	ACCGGA	2	12	151049	151060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037876
32	NC_017541	GGCTTC	2	12	151603	151614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037876
33	NC_017541	CATCAG	2	12	152043	152054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386037877
34	NC_017541	CAGTAC	2	12	157244	157255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386037883
35	NC_017541	CAGCTG	2	12	163823	163834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386037891
36	NC_017541	CAGCAA	2	12	165814	165825	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386037894
37	NC_017541	CATCCT	3	18	169779	169796	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386037901
38	NC_017541	CATCTT	3	18	169803	169820	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386037901
39	NC_017541	TATGAT	2	12	170445	170456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386037902
40	NC_017541	CTGGCA	2	12	173282	173293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386037904
41	NC_017541	ACTTAT	2	12	177686	177697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386037911
42	NC_017541	TATATT	2	12	181445	181456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037917
43	NC_017541	CTTTGA	2	12	183520	183531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386037919
44	NC_017541	AATTAA	2	12	184610	184621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037919
45	NC_017541	CAGCTC	2	12	188267	188278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386037921
46	NC_017541	ATCGCC	2	12	188623	188634	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386037921
47	NC_017541	ATGCTC	2	12	191109	191120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386037922
48	NC_017541	ACCTCC	2	12	192592	192603	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386037923
49	NC_017541	TTCATA	2	12	194330	194341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386037926
50	NC_017541	GTTATC	2	12	196364	196375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386037929
51	NC_017541	AGGCAA	2	12	199490	199501	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386037933
52	NC_017541	TGATGT	2	12	201132	201143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386037936

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.