MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae KCTC 2242 plasmid pKCTC2242

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017541	TAACG	2	10	273	282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017541	TTTGA	2	10	652	661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017541	ACAGC	2	10	5839	5848	40 %	0 %	20 %	40 %	386037714
4	NC_017541	TTCTT	2	10	5849	5858	0 %	80 %	0 %	20 %	386037714
5	NC_017541	AAAAC	2	10	6026	6035	80 %	0 %	0 %	20 %	386037714
6	NC_017541	TTTTA	2	10	6434	6443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017541	TTTCG	2	10	6729	6738	0 %	60 %	20 %	20 %	386037715
8	NC_017541	GGGCT	2	10	7656	7665	0 %	20 %	60 %	20 %	386037717
9	NC_017541	ACAGA	2	10	7668	7677	60 %	0 %	20 %	20 %	386037717
10	NC_017541	CGCAG	2	10	13441	13450	20 %	0 %	40 %	40 %	386037723
11	NC_017541	CGTCC	2	10	14305	14314	0 %	20 %	20 %	60 %	386037725
12	NC_017541	TTTCC	2	10	15041	15050	0 %	60 %	0 %	40 %	386037727
13	NC_017541	GTTCT	2	10	15164	15173	0 %	60 %	20 %	20 %	386037727
14	NC_017541	TAATC	2	10	15644	15653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017541	AGAAA	2	10	16153	16162	80 %	0 %	20 %	0 %	386037728
16	NC_017541	TATTT	2	10	16691	16700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017541	CAGCG	2	10	19245	19254	20 %	0 %	40 %	40 %	386037733
18	NC_017541	ATTCT	2	10	19956	19965	20 %	60 %	0 %	20 %	386037734
19	NC_017541	TTCTT	2	10	21348	21357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017541	CCAGC	2	10	22091	22100	20 %	0 %	20 %	60 %	386037737
21	NC_017541	CGCAG	2	10	26620	26629	20 %	0 %	40 %	40 %	386037739
22	NC_017541	TGCGG	2	10	27596	27605	0 %	20 %	60 %	20 %	386037740
23	NC_017541	GGGAA	2	10	30056	30065	40 %	0 %	60 %	0 %	386037742
24	NC_017541	GTGGC	2	10	30400	30409	0 %	20 %	60 %	20 %	386037742
25	NC_017541	CCAGA	2	10	31256	31265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017541	TGTGG	2	10	31690	31699	0 %	40 %	60 %	0 %	386037744
27	NC_017541	TAGAA	2	10	32552	32561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017541	TTGGC	2	10	32735	32744	0 %	40 %	40 %	20 %	386037746
29	NC_017541	AGTGA	2	10	33266	33275	40 %	20 %	40 %	0 %	386037747
30	NC_017541	CCAAT	2	10	34343	34352	40 %	20 %	0 %	40 %	386037749
31	NC_017541	GTCAT	2	10	34616	34625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017541	ATTTT	2	10	34985	34994	20 %	80 %	0 %	0 %	386037750
33	NC_017541	CGGTA	2	10	39727	39736	20 %	20 %	40 %	20 %	386037755
34	NC_017541	TAACA	2	10	40946	40955	60 %	20 %	0 %	20 %	386037756
35	NC_017541	GATCA	2	10	41206	41215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017541	GCAAA	2	10	41248	41257	60 %	0 %	20 %	20 %	386037757
37	NC_017541	GCTGC	2	10	44559	44568	0 %	20 %	40 %	40 %	386037759
38	NC_017541	TTCCA	2	10	45600	45609	20 %	40 %	0 %	40 %	386037761
39	NC_017541	GCAGG	2	10	46045	46054	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017541	TGGGT	2	10	48180	48189	0 %	40 %	60 %	0 %	386037763
41	NC_017541	ATATC	2	10	48701	48710	40 %	40 %	0 %	20 %	386037763
42	NC_017541	GCATG	2	10	48984	48993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017541	AAATT	2	10	49104	49113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017541	AGAAA	2	10	49135	49144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017541	GGATT	2	10	49429	49438	20 %	40 %	40 %	0 %	386037764
46	NC_017541	GATAA	2	10	50473	50482	60 %	20 %	20 %	0 %	386037766
47	NC_017541	CTGAG	2	10	51597	51606	20 %	20 %	40 %	20 %	386037766
48	NC_017541	TGCGC	2	10	53913	53922	0 %	20 %	40 %	40 %	386037769
49	NC_017541	GACAG	2	10	57908	57917	40 %	0 %	40 %	20 %	386037772
50	NC_017541	CGACG	2	10	58039	58048	20 %	0 %	40 %	40 %	386037772
51	NC_017541	CGAAT	2	10	59623	59632	40 %	20 %	20 %	20 %	386037773
52	NC_017541	CAACA	2	10	59782	59791	60 %	0 %	0 %	40 %	386037774
53	NC_017541	CTGTC	2	10	60144	60153	0 %	40 %	20 %	40 %	386037774
54	NC_017541	TGTGG	2	10	60368	60377	0 %	40 %	60 %	0 %	386037774
55	NC_017541	TGCGT	2	10	62172	62181	0 %	40 %	40 %	20 %	386037774
56	NC_017541	ATACG	2	10	62988	62997	40 %	20 %	20 %	20 %	386037776
57	NC_017541	TTCAT	2	10	64098	64107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017541	TAATT	2	10	64126	64135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017541	TGACC	2	10	64329	64338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017541	TGAAA	2	10	64874	64883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017541	TAACT	2	10	67997	68006	40 %	40 %	0 %	20 %	386037781
62	NC_017541	CGATG	2	10	69012	69021	20 %	20 %	40 %	20 %	386037783
63	NC_017541	GGTCT	2	10	69319	69328	0 %	40 %	40 %	20 %	386037783
64	NC_017541	CGCTG	2	10	72800	72809	0 %	20 %	40 %	40 %	386037785
65	NC_017541	GCCGC	2	10	75171	75180	0 %	0 %	40 %	60 %	386037788
66	NC_017541	GCATC	2	10	76305	76314	20 %	20 %	20 %	40 %	386037788
67	NC_017541	AGGCG	2	10	77814	77823	20 %	0 %	60 %	20 %	386037788
68	NC_017541	AGACG	2	10	78003	78012	40 %	0 %	40 %	20 %	386037788
69	NC_017541	GTGTT	2	10	78621	78630	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017541	TCAAC	2	10	78682	78691	40 %	20 %	0 %	40 %	386037790
71	NC_017541	GCGTC	2	10	81371	81380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017541	ACTGG	2	10	81561	81570	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017541	ACCGC	2	10	82792	82801	20 %	0 %	20 %	60 %	386037797
74	NC_017541	GACTG	2	10	84769	84778	20 %	20 %	40 %	20 %	386037798
75	NC_017541	ATCGA	2	10	85332	85341	40 %	20 %	20 %	20 %	386037799
76	NC_017541	TCGCG	2	10	85394	85403	0 %	20 %	40 %	40 %	386037799
77	NC_017541	TAACA	2	10	90166	90175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017541	TAAAA	2	10	91104	91113	80 %	20 %	0 %	0 %	386037805
79	NC_017541	TTGCT	2	10	93840	93849	0 %	60 %	20 %	20 %	386037809
80	NC_017541	GAATG	2	10	94376	94385	40 %	20 %	40 %	0 %	386037809
81	NC_017541	TTCCA	2	10	96679	96688	20 %	40 %	0 %	40 %	386037812
82	NC_017541	CAACG	2	10	99448	99457	40 %	0 %	20 %	40 %	386037815
83	NC_017541	GCCCT	2	10	100621	100630	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_017541	GTTAT	2	10	102380	102389	20 %	60 %	20 %	0 %	386037821
85	NC_017541	CAAAT	2	10	103816	103825	60 %	20 %	0 %	20 %	386037822
86	NC_017541	CCAAA	2	10	105716	105725	60 %	0 %	0 %	40 %	386037824
87	NC_017541	CGTGA	2	10	106207	106216	20 %	20 %	40 %	20 %	386037824
88	NC_017541	TCGTT	2	10	107338	107347	0 %	60 %	20 %	20 %	386037826
89	NC_017541	GCAGT	2	10	107684	107693	20 %	20 %	40 %	20 %	386037826
90	NC_017541	GCGTT	2	10	107945	107954	0 %	40 %	40 %	20 %	386037826
91	NC_017541	ATGCT	2	10	108440	108449	20 %	40 %	20 %	20 %	386037826
92	NC_017541	TTCGG	2	10	109797	109806	0 %	40 %	40 %	20 %	386037828
93	NC_017541	CTGGT	2	10	110041	110050	0 %	40 %	40 %	20 %	386037828
94	NC_017541	TGGTG	2	10	110595	110604	0 %	40 %	60 %	0 %	386037829
95	NC_017541	ATTAA	2	10	111734	111743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017541	ATAAA	2	10	113978	113987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017541	AAACC	2	10	116042	116051	60 %	0 %	0 %	40 %	386037834
98	NC_017541	ACGGA	2	10	118452	118461	40 %	0 %	40 %	20 %	386037837
99	NC_017541	ATGTC	2	10	118767	118776	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017541	GATCA	2	10	118847	118856	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017541	GCAAA	2	10	118889	118898	60 %	0 %	20 %	20 %	386037838
102	NC_017541	TTTAT	2	10	121068	121077	20 %	80 %	0 %	0 %	386037840
103	NC_017541	CGTTA	2	10	121762	121771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017541	TTTTC	2	10	122145	122154	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017541	TTTTG	2	10	122735	122744	0 %	80 %	20 %	0 %	386037841
106	NC_017541	CAAAC	2	10	122774	122783	60 %	0 %	0 %	40 %	386037841
107	NC_017541	ATGTT	2	10	124274	124283	20 %	60 %	20 %	0 %	386037844
108	NC_017541	GCTTC	2	10	124899	124908	0 %	40 %	20 %	40 %	386037846
109	NC_017541	GCCAG	2	10	125172	125181	20 %	0 %	40 %	40 %	386037847
110	NC_017541	CAGGC	2	10	125987	125996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017541	CGGCG	2	10	128031	128040	0 %	0 %	60 %	40 %	386037850
112	NC_017541	CCGTG	2	10	131866	131875	0 %	20 %	40 %	40 %	386037854
113	NC_017541	CGGCT	2	10	133579	133588	0 %	20 %	40 %	40 %	386037856
114	NC_017541	GTCAT	2	10	138471	138480	20 %	40 %	20 %	20 %	386037860
115	NC_017541	CTGTG	2	10	141328	141337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017541	GATCA	2	10	141540	141549	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017541	GCAAA	2	10	141582	141591	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017541	GTCTG	2	10	143211	143220	0 %	40 %	40 %	20 %	386037864
119	NC_017541	TGGGT	2	10	143547	143556	0 %	40 %	60 %	0 %	386037864
120	NC_017541	GGACA	2	10	144040	144049	40 %	0 %	40 %	20 %	386037864
121	NC_017541	CGTAT	2	10	146803	146812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017541	TTGCA	2	10	147337	147346	20 %	40 %	20 %	20 %	386037871
123	NC_017541	TCCAT	2	10	149424	149433	20 %	40 %	0 %	40 %	386037874
124	NC_017541	TTTGC	2	10	150643	150652	0 %	60 %	20 %	20 %	386037876
125	NC_017541	CCCGG	2	10	151265	151274	0 %	0 %	40 %	60 %	386037876
126	NC_017541	CAGCG	2	10	151813	151822	20 %	0 %	40 %	40 %	386037876
127	NC_017541	GCTGA	2	10	152887	152896	20 %	20 %	40 %	20 %	386037879
128	NC_017541	AGGCC	2	10	155860	155869	20 %	0 %	40 %	40 %	386037882
129	NC_017541	GACAA	2	10	157206	157215	60 %	0 %	20 %	20 %	386037883
130	NC_017541	CCAGT	2	10	160858	160867	20 %	20 %	20 %	40 %	386037885
131	NC_017541	CAGTG	2	10	161223	161232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017541	GTCAT	2	10	161284	161293	20 %	40 %	20 %	20 %	386037887
133	NC_017541	TCTGC	2	10	161979	161988	0 %	40 %	20 %	40 %	386037888
134	NC_017541	CAGGT	2	10	164657	164666	20 %	20 %	40 %	20 %	386037892
135	NC_017541	ACTCG	2	10	165939	165948	20 %	20 %	20 %	40 %	386037895
136	NC_017541	AGAGA	2	10	166304	166313	60 %	0 %	40 %	0 %	386037895
137	NC_017541	TCATC	2	10	166417	166426	20 %	40 %	0 %	40 %	386037895
138	NC_017541	TTCTT	2	10	167938	167947	0 %	80 %	0 %	20 %	386037898
139	NC_017541	TCGCC	2	10	169004	169013	0 %	20 %	20 %	60 %	386037899
140	NC_017541	GTCCA	2	10	169096	169105	20 %	20 %	20 %	40 %	386037899
141	NC_017541	AATTT	2	10	170280	170289	40 %	60 %	0 %	0 %	386037902
142	NC_017541	TGGTT	2	10	170318	170327	0 %	60 %	40 %	0 %	386037902
143	NC_017541	GATCA	2	10	171920	171929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017541	GCAAA	2	10	171962	171971	60 %	0 %	20 %	20 %	386037903
145	NC_017541	AGGGG	2	10	174610	174619	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017541	CGAGG	2	10	177475	177484	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017541	CCTTA	2	10	178771	178780	20 %	40 %	0 %	40 %	386037913
148	NC_017541	GGGGA	2	10	180436	180445	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017541	TCCTT	2	10	182561	182570	0 %	60 %	0 %	40 %	386037918
150	NC_017541	ACTCC	2	10	183782	183791	20 %	20 %	0 %	60 %	386037919
151	NC_017541	AATTT	2	10	184162	184171	40 %	60 %	0 %	0 %	386037919
152	NC_017541	CTTAA	2	10	184953	184962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017541	GTCAA	2	10	185387	185396	40 %	20 %	20 %	20 %	386037920
154	NC_017541	GCGCC	2	10	185427	185436	0 %	0 %	40 %	60 %	386037920
155	NC_017541	CAGCC	2	10	187138	187147	20 %	0 %	20 %	60 %	386037921
156	NC_017541	CCACG	2	10	188434	188443	20 %	0 %	20 %	60 %	386037921
157	NC_017541	CCGTC	2	10	189378	189387	0 %	20 %	20 %	60 %	386037921
158	NC_017541	TCCTT	2	10	192631	192640	0 %	60 %	0 %	40 %	386037924
159	NC_017541	TCAGT	2	10	195177	195186	20 %	40 %	20 %	20 %	386037927
160	NC_017541	GGTGC	2	10	196782	196791	0 %	20 %	60 %	20 %	386037929
161	NC_017541	GTACA	2	10	197739	197748	40 %	20 %	20 %	20 %	386037929
162	NC_017541	TCCAG	2	10	198151	198160	20 %	20 %	20 %	40 %	386037929

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.