MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae KCTC 2242 plasmid pKCTC2242

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017541	AATA	2	8	39	46	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017541	GCTG	2	8	309	316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017541	GTTT	2	8	536	543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017541	CACC	2	8	930	937	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017541	ATCA	2	8	988	995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017541	CTGG	2	8	1203	1210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017541	TCAA	2	8	1343	1350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017541	TGGC	2	8	1764	1771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017541	CAGT	2	8	1796	1803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017541	AGCA	2	8	2146	2153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017541	GCCA	2	8	4075	4082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017541	CTCA	2	8	5259	5266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017541	TAGG	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017541	AATT	2	8	6389	6396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017541	AATT	2	8	6955	6962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017541	ATTT	2	8	11847	11854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017541	GGCA	2	8	14124	14131	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017541	CATG	2	8	14158	14165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017541	TAAA	2	8	15728	15735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017541	TTTA	2	8	15784	15791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017541	TAAA	2	8	16589	16596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017541	ATCC	2	8	16661	16668	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017541	AATA	2	8	16814	16821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017541	ACTT	2	8	16919	16926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017541	TACC	2	8	17002	17009	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017541	TTTA	2	8	17141	17148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017541	ATTC	2	8	19477	19484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017541	AGGG	2	8	19518	19525	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017541	TATG	2	8	20569	20576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017541	CCTA	2	8	20893	20900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017541	ATAG	3	12	20904	20915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017541	GTCA	2	8	21040	21047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017541	TGGA	2	8	21069	21076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017541	ATTT	2	8	21319	21326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017541	ATTT	2	8	29580	29587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017541	CAAT	2	8	29600	29607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017541	GGCA	2	8	31160	31167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017541	TCCA	2	8	33526	33533	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017541	GGGC	2	8	34009	34016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017541	CAGA	2	8	37442	37449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017541	TTAC	2	8	37592	37599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017541	TTTA	2	8	40975	40982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017541	TTCT	2	8	41013	41020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017541	CCAG	2	8	42173	42180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017541	TTAT	2	8	42205	42212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017541	ATGA	2	8	42347	42354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017541	CGCT	2	8	42470	42477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017541	TACC	2	8	43728	43735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017541	GACA	2	8	43781	43788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017541	TCTG	2	8	45830	45837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017541	TGTC	2	8	45850	45857	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017541	GAAT	2	8	45862	45869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017541	CTGA	2	8	47375	47382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017541	CTTT	2	8	47719	47726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017541	TACA	2	8	47893	47900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017541	ATGC	2	8	48879	48886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017541	AATG	2	8	48905	48912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017541	GGCT	2	8	52589	52596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017541	CATT	2	8	54582	54589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017541	TGAA	2	8	54602	54609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017541	TGAA	2	8	62212	62219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017541	CAAT	2	8	64388	64395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017541	ATGG	2	8	64516	64523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017541	AACC	2	8	64795	64802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017541	GACG	2	8	65637	65644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017541	TAAA	2	8	66933	66940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017541	ATTG	2	8	70363	70370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017541	TATT	2	8	74543	74550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017541	AAAT	2	8	82690	82697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017541	CCTG	2	8	89650	89657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017541	GCCA	2	8	91621	91628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017541	AACA	2	8	92059	92066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017541	ATCG	2	8	93460	93467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017541	ATTG	2	8	98975	98982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017541	AATA	2	8	99004	99011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017541	TACC	2	8	99036	99043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017541	ATTT	3	12	99102	99113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017541	ATGC	2	8	99141	99148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017541	TATT	2	8	100321	100328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017541	CACT	2	8	100426	100433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017541	CAGC	2	8	100668	100675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017541	CAGG	2	8	101356	101363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017541	CTGC	2	8	101477	101484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017541	AAAT	2	8	102372	102379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017541	GCTG	2	8	109026	109033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017541	ATAC	2	8	113270	113277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017541	AAAG	2	8	113530	113537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017541	TGTT	2	8	113858	113865	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017541	CCAA	2	8	114058	114065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017541	AGGA	2	8	114696	114703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017541	CCAG	2	8	119814	119821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017541	TTAT	2	8	119846	119853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017541	AACG	2	8	119881	119888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017541	TAAG	2	8	120206	120213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017541	ACTG	2	8	122101	122108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017541	GTAA	2	8	122119	122126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017541	CCTA	2	8	122852	122859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017541	TCCG	2	8	125883	125890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017541	CGCT	2	8	131092	131099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017541	CAAT	2	8	133782	133789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017541	CAAT	2	8	133941	133948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017541	CAAT	2	8	133953	133960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017541	TTCA	2	8	135571	135578	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017541	GGAA	2	8	137468	137475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017541	GTCA	2	8	137569	137576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017541	TGCC	2	8	137651	137658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017541	CTGG	2	8	141656	141663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017541	TGAT	2	8	141934	141941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017541	GCGT	2	8	142486	142493	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017541	AGGC	2	8	144669	144676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017541	CCTT	2	8	148779	148786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017541	TTAT	2	8	150197	150204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017541	CGAA	2	8	153441	153448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017541	CATG	2	8	153549	153556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017541	CTGG	2	8	156891	156898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017541	GTAT	2	8	157094	157101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017541	TCCT	2	8	158263	158270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017541	TGAA	2	8	158437	158444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017541	CAGC	2	8	158532	158539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017541	GACT	3	12	158907	158918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017541	GCCG	2	8	158996	159003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017541	GTAT	2	8	162541	162548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017541	TGTT	2	8	163177	163184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017541	CATT	2	8	165893	165900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017541	TAGA	2	8	166556	166563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017541	ATCT	2	8	170018	170025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017541	TTAG	2	8	170146	170153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017541	CCAG	2	8	172887	172894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017541	TTAT	2	8	172919	172926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017541	TTTG	2	8	173016	173023	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017541	GTGG	2	8	173105	173112	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017541	TGAG	2	8	174683	174690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017541	TAAT	2	8	177521	177528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017541	CACC	2	8	179185	179192	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_017541	ATTG	2	8	179252	179259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017541	ACAG	2	8	179462	179469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017541	TATT	2	8	179500	179507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017541	AATT	2	8	179618	179625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017541	TGAT	2	8	179663	179670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017541	TATT	3	12	180462	180473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017541	CAGA	2	8	180522	180529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017541	TGCA	2	8	180685	180692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017541	AAAG	2	8	180779	180786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017541	ATTT	2	8	182383	182390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017541	AATG	2	8	184945	184952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017541	GTAA	2	8	185027	185034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017541	GAGT	2	8	190355	190362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017541	ATCT	2	8	201551	201558	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017541	GTAA	2	8	202225	202232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017541	GAAA	2	8	202292	202299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017541	AGAA	2	8	202742	202749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017541	AACC	2	8	202779	202786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.