MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes M7 chromosome

Total Repeats: 1123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017537	CTTGCA	2	12	5005	5016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386025293
2	NC_017537	GAAATT	2	12	6232	6243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386025294
3	NC_017537	TCGTAC	2	12	6621	6632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386025294
4	NC_017537	TGAAGA	2	12	9550	9561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386025295
5	NC_017537	TTATTT	2	12	10919	10930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386025296
6	NC_017537	AAAAGC	2	12	11271	11282	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386025296
7	NC_017537	GGGCTG	2	12	11618	11629	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386025296
8	NC_017537	AGCAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386025300
9	NC_017537	TGAAAA	2	12	14713	14724	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386025300
10	NC_017537	GTTTTG	2	12	17074	17085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025302
11	NC_017537	ATTTTC	2	12	19880	19891	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386025304
12	NC_017537	ATTGAA	2	12	23682	23693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386025308
13	NC_017537	TCACCA	2	12	31493	31504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386025318
14	NC_017537	GGAAAC	2	12	33173	33184	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025319
15	NC_017537	GCTGTG	2	12	33954	33965	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386025320
16	NC_017537	CGATTA	2	12	36923	36934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386025322
17	NC_017537	ATATTT	2	12	41068	41079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025325
18	NC_017537	TGGCGG	2	12	42362	42373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386025327
19	NC_017537	TCAAAA	2	12	42482	42493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386025327
20	NC_017537	AGAAAA	2	12	43397	43408	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386025329
21	NC_017537	ACAGTG	2	12	44066	44077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386025330
22	NC_017537	ATAGTG	2	12	45320	45331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025332
23	NC_017537	GCAGAA	2	12	48854	48865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025334
24	NC_017537	AGGTAA	2	12	48945	48956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386025335
25	NC_017537	GGATCC	2	12	54739	54750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386025340
26	NC_017537	TAGAGC	2	12	75271	75282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386025358
27	NC_017537	AGCAAG	2	12	76570	76581	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025363
28	NC_017537	AGCAAG	2	12	76621	76632	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025363
29	NC_017537	AGGAAG	2	12	76633	76644	50 %	0 %	50 %	0 %	386025363
30	NC_017537	AGGAAG	4	24	76663	76686	50 %	0 %	50 %	0 %	386025363
31	NC_017537	ATGCAG	2	12	78065	78076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386025364
32	NC_017537	GGCTTC	2	12	80233	80244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025366
33	NC_017537	AAAATT	2	12	82392	82403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025371
34	NC_017537	ATGGCC	2	12	84847	84858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386025376
35	NC_017537	TGAGCT	2	12	90660	90671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386025383
36	NC_017537	AGATTG	2	12	94596	94607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025386
37	NC_017537	ACAGGT	2	12	94739	94750	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386025386
38	NC_017537	AAATAT	2	12	96843	96854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025389
39	NC_017537	CGTGGG	2	12	97485	97496	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386025390
40	NC_017537	ACTTAA	2	12	97920	97931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386025391
41	NC_017537	AGAGCA	2	12	98429	98440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025392
42	NC_017537	AAGAGC	2	12	98500	98511	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025392
43	NC_017537	CCGTCC	2	12	99130	99141	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386025392
44	NC_017537	GCCGCA	2	12	102495	102506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386025392
45	NC_017537	CACGCA	2	12	104181	104192	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386025394
46	NC_017537	GTAGGA	2	12	106324	106335	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386025398
47	NC_017537	GATTGT	2	12	109172	109183	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386025404
48	NC_017537	AGTTTG	2	12	110552	110563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386025405
49	NC_017537	ACAGAA	2	12	114422	114433	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386025409
50	NC_017537	TGTAGA	2	12	114643	114654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025409
51	NC_017537	AAGATA	2	12	117615	117626	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386025409
52	NC_017537	TACAGA	2	12	120624	120635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386025410
53	NC_017537	GAGGAA	2	12	122482	122493	50 %	0 %	50 %	0 %	386025412
54	NC_017537	GCAATT	2	12	125609	125620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386025415
55	NC_017537	AAGATA	2	12	128134	128145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386025418
56	NC_017537	ATTCCG	2	12	130560	130571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386025418
57	NC_017537	ACAATC	2	12	131649	131660	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386025418
58	NC_017537	AGAAGT	2	12	131987	131998	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386025418
59	NC_017537	TCACAG	2	12	132442	132453	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386025418
60	NC_017537	GTAGAA	2	12	132804	132815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386025418
61	NC_017537	TATTAG	2	12	136125	136136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386025421
62	NC_017537	GCAATT	2	12	136172	136183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386025421
63	NC_017537	TTATTT	2	12	139662	139673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386025425
64	NC_017537	ATTACA	2	12	143858	143869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386025430
65	NC_017537	TAAAAT	2	12	147582	147593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025433
66	NC_017537	CAAAAT	2	12	147723	147734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386025433
67	NC_017537	CAAGCG	2	12	148724	148735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025433
68	NC_017537	ATAAGT	2	12	150950	150961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386025436
69	NC_017537	GTTTTA	2	12	154487	154498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386025442
70	NC_017537	AATTTG	2	12	156487	156498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386025445
71	NC_017537	CCGTTA	2	12	157688	157699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386025446
72	NC_017537	CCATTA	2	12	157742	157753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025446
73	NC_017537	ATCTGT	2	12	158362	158373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386025446
74	NC_017537	CAACTG	2	12	167436	167447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386025457
75	NC_017537	TCTGAA	2	12	170418	170429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386025462
76	NC_017537	GTTGCA	2	12	175229	175240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386025468
77	NC_017537	GATTGC	2	12	175291	175302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386025468
78	NC_017537	TTAAAA	2	12	175965	175976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025469
79	NC_017537	TTCCTT	2	12	176020	176031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025469
80	NC_017537	AGGCGG	2	12	180941	180952	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386025472
81	NC_017537	ATTTTC	2	12	185276	185287	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386025474
82	NC_017537	GTAAAA	2	12	187255	187266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386025476
83	NC_017537	TTTTAC	2	12	189303	189314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386025480
84	NC_017537	TTTTTA	2	12	190340	190351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386025482
85	NC_017537	GCATTA	2	12	190570	190581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386025482
86	NC_017537	AAAGTG	2	12	191552	191563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386025483
87	NC_017537	TTAAAA	2	12	193756	193767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025484
88	NC_017537	TTGCAC	2	12	194414	194425	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386025485
89	NC_017537	GGAAGT	2	12	196562	196573	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386025486
90	NC_017537	CAATCC	2	12	198478	198489	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386025488
91	NC_017537	AAAGAT	2	12	200489	200500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386025490
92	NC_017537	AAAAGA	2	12	202364	202375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386025491
93	NC_017537	TGAAGT	2	12	204734	204745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025491
94	NC_017537	CTCCAA	2	12	209470	209481	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386025494
95	NC_017537	CTTCAT	2	12	210799	210810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386025495
96	NC_017537	CATTGA	2	12	212856	212867	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386025498
97	NC_017537	TCCGGT	2	12	216846	216857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025503
98	NC_017537	AAAGCA	2	12	228951	228962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386025513
99	NC_017537	TTCTTT	2	12	233644	233655	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386025519
100	NC_017537	GAAAAA	2	12	235733	235744	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386025521
101	NC_017537	GAAAAA	2	12	236958	236969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386025523
102	NC_017537	AGCAGA	2	12	240678	240689	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025524
103	NC_017537	AAGGAG	2	12	240896	240907	50 %	0 %	50 %	0 %	386025524
104	NC_017537	GCGCTC	2	12	241360	241371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386025524
105	NC_017537	GCAAGT	2	12	242786	242797	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386025526
106	NC_017537	TGTCGG	2	12	246706	246717	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386025529
107	NC_017537	AAAAAC	2	12	248188	248199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386025530
108	NC_017537	GCAGAA	2	12	249732	249743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025531
109	NC_017537	TAAAAT	2	12	253040	253051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025536
110	NC_017537	ATTGAT	2	12	253230	253241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386025536
111	NC_017537	CCAGAA	2	12	254253	254264	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386025537
112	NC_017537	CGGTGG	2	12	267830	267841	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386025539
113	NC_017537	TTTACC	2	12	268034	268045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386025539
114	NC_017537	GAGACA	2	12	271161	271172	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386025542
115	NC_017537	AGTAAA	2	12	275292	275303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386025545
116	NC_017537	AAAGGT	2	12	277418	277429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386025547
117	NC_017537	ACAGTA	2	12	282721	282732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386025556
118	NC_017537	AAAACA	2	12	283095	283106	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386025557
119	NC_017537	GCATGG	2	12	283276	283287	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386025557
120	NC_017537	CTGTAG	2	12	286219	286230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386025562
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229	NC_017537	TTTTTC	2	12	586717	586728	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386025859
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452	NC_017537	GAGTTC	2	12	1244139	1244150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386026568
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454	NC_017537	AAAATG	2	12	1251451	1251462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386026579
455	NC_017537	AAAGGT	2	12	1251817	1251828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386026579
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