MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes M7 chromosome

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017537	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017537	AAATG	2	10	22798	22807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017537	AAATA	2	10	43686	43695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017537	TAAAA	2	10	44668	44677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017537	TGCTA	2	10	44842	44851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017537	CCATG	2	10	46803	46812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017537	TTTTG	2	10	52519	52528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017537	AAATT	2	10	65659	65668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017537	GGAAG	2	10	73627	73636	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017537	CTCAT	2	10	73786	73795	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017537	ATGAC	2	10	89666	89675	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017537	CAAAA	2	10	95907	95916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017537	AAAAT	2	10	98257	98266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017537	TAAAA	2	10	109464	109473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017537	GGTAG	2	10	133821	133830	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017537	AGGAA	2	10	133938	133947	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017537	ATATC	2	10	140591	140600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017537	AGAGA	2	10	151418	151427	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017537	TACTG	2	10	152858	152867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017537	AAAGT	2	10	155096	155105	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017537	AGTAG	2	10	170512	170521	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017537	GATAA	2	10	172966	172975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017537	TTGTA	2	10	192482	192491	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017537	ATAGA	2	10	213155	213164	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017537	TTGTC	2	10	218679	218688	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017537	AAAAT	2	10	218758	218767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017537	ACAAA	2	10	219044	219053	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017537	ATATA	2	10	226778	226787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017537	GAGTG	2	10	234796	234805	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017537	AGCCG	2	10	242975	242984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017537	GAAAA	2	10	251098	251107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017537	GAAAA	2	10	251302	251311	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017537	GAAAA	2	10	251506	251515	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017537	GAATA	2	10	254593	254602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017537	AAATT	2	10	256278	256287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017537	TAATT	2	10	256479	256488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017537	TCGTG	2	10	257638	257647	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017537	AAGGT	2	10	259106	259115	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017537	TAATT	2	10	262501	262510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017537	TCGTG	2	10	263660	263669	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017537	AAGGT	2	10	265128	265137	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017537	GGCAT	2	10	282426	282435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017537	GTAGT	2	10	288129	288138	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017537	AGTGA	2	10	308078	308087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017537	ACTAA	2	10	311575	311584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017537	TATAA	2	10	316800	316809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017537	AAAGA	2	10	320029	320038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017537	ATAAA	2	10	330814	330823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017537	TTATT	2	10	344901	344910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017537	AGTCT	2	10	356351	356360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017537	ATTGT	2	10	368997	369006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017537	GGAGA	2	10	382207	382216	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017537	CACAC	2	10	386055	386064	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017537	TGAAA	2	10	387536	387545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017537	GTGAT	2	10	402569	402578	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017537	AAAAG	2	10	408531	408540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017537	AGGTG	2	10	448964	448973	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017537	GGAAA	2	10	455888	455897	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017537	GGATG	2	10	457855	457864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017537	TAAAA	2	10	465951	465960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017537	AACAT	2	10	479416	479425	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017537	AAGAA	2	10	484082	484091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017537	CTTAT	2	10	485866	485875	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017537	ATCAA	2	10	486905	486914	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017537	CAAAT	2	10	488207	488216	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017537	TCGAA	2	10	513050	513059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017537	ATACA	2	10	518793	518802	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017537	CAATC	2	10	522660	522669	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017537	GGGAA	2	10	541512	541521	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017537	AGAGG	2	10	545120	545129	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017537	ATGGA	2	10	550573	550582	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017537	TGATA	2	10	558097	558106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017537	TATAG	2	10	564007	564016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017537	TAGAC	2	10	585025	585034	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017537	TAAAA	2	10	590952	590961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017537	TTAGT	2	10	592425	592434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017537	AAAGA	2	10	603948	603957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017537	ATAAA	2	10	618907	618916	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017537	AATCA	2	10	622883	622892	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017537	ATTGA	2	10	630843	630852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017537	ATTAA	2	10	644778	644787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017537	AAATT	2	10	660030	660039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017537	TAAAA	2	10	669229	669238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017537	ATATA	2	10	677130	677139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017537	ATCAA	2	10	680750	680759	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017537	ATTTT	2	10	680769	680778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017537	GAAAT	2	10	703759	703768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017537	ATAGA	2	10	707319	707328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017537	TTACT	2	10	709628	709637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017537	AAACA	2	10	714615	714624	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017537	TATTT	2	10	733389	733398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017537	AGAGA	2	10	733539	733548	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017537	CTTTT	2	10	734514	734523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017537	TAAAA	2	10	781203	781212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017537	CTTTT	2	10	787926	787935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017537	TAGTT	2	10	787939	787948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017537	ATTAG	2	10	839501	839510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017537	GTATA	2	10	841824	841833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017537	AATTA	2	10	842445	842454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017537	AATAA	2	10	845807	845816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017537	ATTTT	2	10	849393	849402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017537	GTTTT	2	10	862330	862339	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017537	TTTTA	2	10	864436	864445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017537	ATAGA	2	10	879015	879024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017537	TTTTA	2	10	883115	883124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017537	AATGT	2	10	890515	890524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017537	TTATA	2	10	915748	915757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017537	CATAA	2	10	931743	931752	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017537	GAAAG	2	10	933367	933376	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017537	TTTTA	2	10	933821	933830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017537	ATAGA	2	10	937731	937740	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017537	TATAA	2	10	951993	952002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017537	TGAAA	2	10	961488	961497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017537	TTTAT	2	10	968115	968124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017537	ATGAG	2	10	988909	988918	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017537	TTTTA	2	10	996041	996050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017537	TAAAA	2	10	996106	996115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017537	TATAA	2	10	1010567	1010576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017537	TCTAT	2	10	1023340	1023349	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017537	AGATA	2	10	1027037	1027046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017537	GAGAG	2	10	1035966	1035975	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017537	TTCTA	2	10	1040638	1040647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017537	CAAAC	2	10	1040804	1040813	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017537	TTTTC	2	10	1044523	1044532	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017537	GTTTT	2	10	1054420	1054429	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017537	TAGGA	2	10	1062247	1062256	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017537	GTTTT	2	10	1062257	1062266	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017537	ATAAA	2	10	1066458	1066467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017537	CTTTT	2	10	1066754	1066763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017537	TTATT	2	10	1072728	1072737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017537	AAGTT	2	10	1076430	1076439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017537	ATAAA	2	10	1076484	1076493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017537	GCTAT	2	10	1077356	1077365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017537	AATAA	2	10	1079417	1079426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017537	AGTAA	2	10	1087354	1087363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017537	GGGAT	2	10	1112123	1112132	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017537	AATAA	2	10	1112325	1112334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017537	GTATA	2	10	1124952	1124961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017537	AAATA	2	10	1157053	1157062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017537	TAAAA	2	10	1190733	1190742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017537	ATTTA	2	10	1190761	1190770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017537	TCTTT	2	10	1210259	1210268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017537	AAAAT	2	10	1226919	1226928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017537	TGTTT	2	10	1226940	1226949	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017537	ACATA	2	10	1238101	1238110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017537	AATAA	2	10	1240255	1240264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017537	TTAAA	2	10	1263294	1263303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.