MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes M7 chromosome

Total Repeats: 42582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017537	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025289
2	NC_017537	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
3	NC_017537	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025289
4	NC_017537	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
5	NC_017537	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025289
6	NC_017537	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386025289
7	NC_017537	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025289
8	NC_017537	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
9	NC_017537	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025289
10	NC_017537	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
11	NC_017537	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
12	NC_017537	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
13	NC_017537	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
14	NC_017537	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
15	NC_017537	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025289
16	NC_017537	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
17	NC_017537	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025289
18	NC_017537	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025289
19	NC_017537	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025289
20	NC_017537	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
21	NC_017537	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
22	NC_017537	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
23	NC_017537	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
24	NC_017537	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025289
25	NC_017537	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025289
26	NC_017537	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025290
27	NC_017537	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
28	NC_017537	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
29	NC_017537	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025290
30	NC_017537	TTC	2	6	2094	2099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025290
31	NC_017537	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025290
32	NC_017537	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025290
33	NC_017537	ATT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025290
34	NC_017537	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025290
35	NC_017537	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
36	NC_017537	AAT	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025290
37	NC_017537	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025290
38	NC_017537	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025290
39	NC_017537	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025290
40	NC_017537	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025290
41	NC_017537	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
42	NC_017537	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
43	NC_017537	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
44	NC_017537	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025291
45	NC_017537	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
46	NC_017537	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025291
47	NC_017537	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
48	NC_017537	CGT	2	6	3339	3344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025291
49	NC_017537	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
50	NC_017537	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025291
51	NC_017537	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
52	NC_017537	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025291
53	NC_017537	GGC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386025291
54	NC_017537	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025291
55	NC_017537	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025291
56	NC_017537	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025291
57	NC_017537	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025291
58	NC_017537	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025291
59	NC_017537	TCA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025291
60	NC_017537	CAG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025291
61	NC_017537	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025291
62	NC_017537	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386025291
63	NC_017537	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
64	NC_017537	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
65	NC_017537	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
66	NC_017537	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025291
67	NC_017537	TAA	2	6	4471	4476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017537	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017537	TGG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025292
70	NC_017537	TAT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025293
71	NC_017537	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025293
72	NC_017537	GGA	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386025293
73	NC_017537	GCG	2	6	5488	5493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386025293
74	NC_017537	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025293
75	NC_017537	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025293
76	NC_017537	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025293
77	NC_017537	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025293
78	NC_017537	TTC	3	9	5801	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025293
79	NC_017537	GAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025293
80	NC_017537	CGA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025293
81	NC_017537	ACA	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025293
82	NC_017537	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025293
83	NC_017537	TGA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017537	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017537	AGA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025294
86	NC_017537	TTG	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025294
87	NC_017537	TGA	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025294
88	NC_017537	GTC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025294
89	NC_017537	TGG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025294
90	NC_017537	GGC	3	9	6373	6381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386025294
91	NC_017537	TGG	2	6	6396	6401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025294
92	NC_017537	GTG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025294
93	NC_017537	GTA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025294
94	NC_017537	GAA	2	6	6523	6528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025294
95	NC_017537	AAC	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025294
96	NC_017537	CCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025294
97	NC_017537	ATA	2	6	6839	6844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025294
98	NC_017537	TTA	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025294
99	NC_017537	CGT	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025294
100	NC_017537	TGA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025294
101	NC_017537	ATG	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025294
102	NC_017537	GCT	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025294
103	NC_017537	TTC	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025294
104	NC_017537	GAA	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025294
105	NC_017537	TGG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025294
106	NC_017537	TTA	3	9	7541	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025294
107	NC_017537	ACT	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025294
108	NC_017537	ACC	2	6	7656	7661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025294
109	NC_017537	AGA	2	6	7719	7724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025294
110	NC_017537	AAC	2	6	7799	7804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025294
111	NC_017537	ACT	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025294
112	NC_017537	TCG	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025294
113	NC_017537	TAA	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025294
114	NC_017537	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017537	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017537	CAT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025295
117	NC_017537	TTG	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025295
118	NC_017537	GGC	2	6	8416	8421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386025295
119	NC_017537	CTT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025295
120	NC_017537	CAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025295
121	NC_017537	CAC	2	6	8621	8626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025295
122	NC_017537	CTG	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025295
123	NC_017537	GAT	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025295
124	NC_017537	CGT	2	6	8756	8761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025295
125	NC_017537	GAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025295
126	NC_017537	TAG	2	6	8883	8888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025295
127	NC_017537	ATG	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025295
128	NC_017537	TCG	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025295
129	NC_017537	AAT	2	6	9017	9022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025295
130	NC_017537	ACT	2	6	9047	9052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025295
131	NC_017537	ATC	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025295
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140	NC_017537	TGA	3	9	9442	9450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025295
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251	NC_017537	CTT	2	6	18326	18331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025303
252	NC_017537	CTT	2	6	18362	18367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025303
253	NC_017537	GAT	3	9	18380	18388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025303
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256	NC_017537	CTT	2	6	18566	18571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025303
257	NC_017537	TTC	2	6	18690	18695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025303
258	NC_017537	GTT	2	6	18705	18710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025303
259	NC_017537	CGT	2	6	18765	18770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025303
260	NC_017537	ACA	2	6	18868	18873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025303
261	NC_017537	CTA	2	6	18875	18880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025303
262	NC_017537	TCC	2	6	18962	18967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386025303
263	NC_017537	GAT	2	6	19008	19013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025303
264	NC_017537	TTC	3	9	19116	19124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025303
265	NC_017537	TCT	2	6	19144	19149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025303
266	NC_017537	ATT	2	6	19167	19172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025303
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269	NC_017537	CAG	2	6	19485	19490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025304
270	NC_017537	TAA	2	6	19515	19520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025304
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272	NC_017537	TTG	2	6	19641	19646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025304
273	NC_017537	TTC	2	6	19721	19726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025304
274	NC_017537	CTA	2	6	19730	19735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025304
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276	NC_017537	ATA	2	6	19936	19941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025305
277	NC_017537	TTG	2	6	19987	19992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025305
278	NC_017537	AAC	2	6	20054	20059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025305
279	NC_017537	TTA	2	6	20074	20079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025305
280	NC_017537	CGC	2	6	20180	20185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386025305
281	NC_017537	ATT	2	6	20347	20352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017537	GAG	2	6	20410	20415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017537	CTT	2	6	20452	20457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025306
284	NC_017537	TGC	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025306
285	NC_017537	TTG	2	6	20526	20531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025306
286	NC_017537	ATC	2	6	20640	20645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025306
287	NC_017537	AGA	2	6	20653	20658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025306
288	NC_017537	ATG	2	6	20772	20777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025306
289	NC_017537	TGA	2	6	20785	20790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025306
290	NC_017537	GTT	2	6	20816	20821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025306
291	NC_017537	TTC	2	6	20982	20987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025306
292	NC_017537	TGG	2	6	21001	21006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025306
293	NC_017537	AAG	2	6	21024	21029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025306
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314	NC_017537	TTG	2	6	22611	22616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025307
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317	NC_017537	TTA	2	6	22847	22852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_017537	TAT	2	6	22964	22969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025308
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320	NC_017537	AGA	2	6	23057	23062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025308
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322	NC_017537	ATT	2	6	23181	23186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025308
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324	NC_017537	TGA	2	6	23372	23377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025308
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339	NC_017537	AAT	2	6	24341	24346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025310
340	NC_017537	ATT	2	6	24525	24530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025310
341	NC_017537	TAA	2	6	24615	24620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_017537	TAA	2	6	24733	24738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025311
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365	NC_017537	GGA	2	6	26254	26259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
366	NC_017537	GGA	2	6	26307	26312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386025313
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379	NC_017537	ACC	2	6	26880	26885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025313
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