MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 12553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017530	GCAG	2	8	385	392	25 %	0 %	50 %	25 %	386009640
2	NC_017530	CCAG	2	8	509	516	25 %	0 %	25 %	50 %	386009640
3	NC_017530	GAAT	2	8	606	613	50 %	25 %	25 %	0 %	386009640
4	NC_017530	CGGC	2	8	1145	1152	0 %	0 %	50 %	50 %	386009642
5	NC_017530	GGCC	2	8	1214	1221	0 %	0 %	50 %	50 %	386009642
6	NC_017530	CGGC	2	8	1667	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	386009642
7	NC_017530	CAGC	2	8	3125	3132	25 %	0 %	25 %	50 %	386009644
8	NC_017530	CATC	2	8	3902	3909	25 %	25 %	0 %	50 %	386009645
9	NC_017530	GGCC	2	8	6679	6686	0 %	0 %	50 %	50 %	386009647
10	NC_017530	GAGC	2	8	6861	6868	25 %	0 %	50 %	25 %	386009647
11	NC_017530	CGAC	2	8	7657	7664	25 %	0 %	25 %	50 %	386009648
12	NC_017530	GGCC	2	8	7780	7787	0 %	0 %	50 %	50 %	386009648
13	NC_017530	CCAG	2	8	8531	8538	25 %	0 %	25 %	50 %	386009648
14	NC_017530	GCAG	2	8	9286	9293	25 %	0 %	50 %	25 %	386009649
15	NC_017530	AAGG	2	8	9347	9354	50 %	0 %	50 %	0 %	386009649
16	NC_017530	CGAC	2	8	9501	9508	25 %	0 %	25 %	50 %	386009649
17	NC_017530	CCCG	2	8	10193	10200	0 %	0 %	25 %	75 %	386009650
18	NC_017530	AGTC	2	8	10374	10381	25 %	25 %	25 %	25 %	386009650
19	NC_017530	TTCA	2	8	10425	10432	25 %	50 %	0 %	25 %	386009650
20	NC_017530	CCGC	2	8	10453	10460	0 %	0 %	25 %	75 %	386009650
21	NC_017530	CAAG	2	8	11574	11581	50 %	0 %	25 %	25 %	386009651
22	NC_017530	GACC	2	8	11692	11699	25 %	0 %	25 %	50 %	386009651
23	NC_017530	CAGG	2	8	11842	11849	25 %	0 %	50 %	25 %	386009651
24	NC_017530	CAAC	2	8	11899	11906	50 %	0 %	0 %	50 %	386009651
25	NC_017530	GCTG	2	8	12597	12604	0 %	25 %	50 %	25 %	386009653
26	NC_017530	ATGG	2	8	13247	13254	25 %	25 %	50 %	0 %	386009654
27	NC_017530	GGCC	2	8	13327	13334	0 %	0 %	50 %	50 %	386009654
28	NC_017530	CCTT	2	8	13347	13354	0 %	50 %	0 %	50 %	386009654
29	NC_017530	GTCG	2	8	13406	13413	0 %	25 %	50 %	25 %	386009654
30	NC_017530	CTTG	2	8	13414	13421	0 %	50 %	25 %	25 %	386009654
31	NC_017530	TCGA	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	386009654
32	NC_017530	TCGG	2	8	13584	13591	0 %	25 %	50 %	25 %	386009654
33	NC_017530	TGAA	2	8	14388	14395	50 %	25 %	25 %	0 %	386009654
34	NC_017530	ACGA	2	8	15502	15509	50 %	0 %	25 %	25 %	386009655
35	NC_017530	CGCA	2	8	15643	15650	25 %	0 %	25 %	50 %	386009655
36	NC_017530	GCAC	2	8	16367	16374	25 %	0 %	25 %	50 %	386009655
37	NC_017530	GCCA	2	8	16766	16773	25 %	0 %	25 %	50 %	386009656
38	NC_017530	CTGG	2	8	18178	18185	0 %	25 %	50 %	25 %	386009657
39	NC_017530	GATG	2	8	19174	19181	25 %	25 %	50 %	0 %	386009658
40	NC_017530	GGGC	2	8	19890	19897	0 %	0 %	75 %	25 %	386009658
41	NC_017530	GGCA	2	8	20339	20346	25 %	0 %	50 %	25 %	386009658
42	NC_017530	GGCA	2	8	20828	20835	25 %	0 %	50 %	25 %	386009659
43	NC_017530	CAGC	2	8	21878	21885	25 %	0 %	25 %	50 %	386009659
44	NC_017530	CCTT	2	8	22180	22187	0 %	50 %	0 %	50 %	386009659
45	NC_017530	CGTG	2	8	22478	22485	0 %	25 %	50 %	25 %	386009659
46	NC_017530	GGCC	2	8	23107	23114	0 %	0 %	50 %	50 %	386009660
47	NC_017530	CTAC	2	8	23544	23551	25 %	25 %	0 %	50 %	386009660
48	NC_017530	ACCT	2	8	24064	24071	25 %	25 %	0 %	50 %	386009661
49	NC_017530	GGCG	2	8	25004	25011	0 %	0 %	75 %	25 %	386009662
50	NC_017530	CAGA	2	8	25968	25975	50 %	0 %	25 %	25 %	386009662
51	NC_017530	GCAT	2	8	26179	26186	25 %	25 %	25 %	25 %	386009662
52	NC_017530	ATGC	2	8	26641	26648	25 %	25 %	25 %	25 %	386009663
53	NC_017530	GTCG	2	8	26684	26691	0 %	25 %	50 %	25 %	386009663
54	NC_017530	CCTT	2	8	26737	26744	0 %	50 %	0 %	50 %	386009663
55	NC_017530	ACCC	2	8	27209	27216	25 %	0 %	0 %	75 %	386009664
56	NC_017530	GCCC	2	8	27306	27313	0 %	0 %	25 %	75 %	386009664
57	NC_017530	TCGC	2	8	27598	27605	0 %	25 %	25 %	50 %	386009664
58	NC_017530	GCCA	2	8	28642	28649	25 %	0 %	25 %	50 %	386009666
59	NC_017530	TGGG	2	8	29343	29350	0 %	25 %	75 %	0 %	386009666
60	NC_017530	GCCA	2	8	29410	29417	25 %	0 %	25 %	50 %	386009667
61	NC_017530	AACG	2	8	29766	29773	50 %	0 %	25 %	25 %	386009667
62	NC_017530	GCAT	2	8	30122	30129	25 %	25 %	25 %	25 %	386009668
63	NC_017530	GCCA	2	8	30287	30294	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
64	NC_017530	CAGC	2	8	30518	30525	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
65	NC_017530	AATA	2	8	30948	30955	75 %	25 %	0 %	0 %	386009668
66	NC_017530	TGCC	2	8	31391	31398	0 %	25 %	25 %	50 %	386009669
67	NC_017530	TGGG	2	8	31624	31631	0 %	25 %	75 %	0 %	386009669
68	NC_017530	GCCT	2	8	31803	31810	0 %	25 %	25 %	50 %	386009670
69	NC_017530	CGGT	2	8	32199	32206	0 %	25 %	50 %	25 %	386009671
70	NC_017530	CCGC	2	8	32943	32950	0 %	0 %	25 %	75 %	386009672
71	NC_017530	GCCT	2	8	33461	33468	0 %	25 %	25 %	50 %	386009672
72	NC_017530	ATTC	2	8	33626	33633	25 %	50 %	0 %	25 %	386009672
73	NC_017530	CGAT	2	8	34510	34517	25 %	25 %	25 %	25 %	386009673
74	NC_017530	GCCC	2	8	34850	34857	0 %	0 %	25 %	75 %	386009673
75	NC_017530	TGGG	2	8	35217	35224	0 %	25 %	75 %	0 %	386009673
76	NC_017530	AGCA	2	8	35358	35365	50 %	0 %	25 %	25 %	386009673
77	NC_017530	CCTG	2	8	35695	35702	0 %	25 %	25 %	50 %	386009674
78	NC_017530	CAAG	2	8	36251	36258	50 %	0 %	25 %	25 %	386009674
79	NC_017530	CCCG	2	8	36631	36638	0 %	0 %	25 %	75 %	386009674
80	NC_017530	ATCA	2	8	36738	36745	50 %	25 %	0 %	25 %	386009674
81	NC_017530	AGCG	2	8	37367	37374	25 %	0 %	50 %	25 %	386009675
82	NC_017530	TGCG	2	8	38207	38214	0 %	25 %	50 %	25 %	386009676
83	NC_017530	CAGG	2	8	38490	38497	25 %	0 %	50 %	25 %	386009676
84	NC_017530	ACCG	2	8	38499	38506	25 %	0 %	25 %	50 %	386009676
85	NC_017530	AGGC	2	8	39339	39346	25 %	0 %	50 %	25 %	386009677
86	NC_017530	GCCC	2	8	39669	39676	0 %	0 %	25 %	75 %	386009677
87	NC_017530	AGGT	2	8	40331	40338	25 %	25 %	50 %	0 %	386009678
88	NC_017530	GTCA	2	8	41355	41362	25 %	25 %	25 %	25 %	386009679
89	NC_017530	GGCC	2	8	41845	41852	0 %	0 %	50 %	50 %	386009679
90	NC_017530	CGCC	2	8	41873	41880	0 %	0 %	25 %	75 %	386009679
91	NC_017530	TGGA	2	8	42108	42115	25 %	25 %	50 %	0 %	386009679
92	NC_017530	GCGT	2	8	42547	42554	0 %	25 %	50 %	25 %	386009680
93	NC_017530	GGCT	2	8	43332	43339	0 %	25 %	50 %	25 %	386009680
94	NC_017530	CGCC	2	8	43775	43782	0 %	0 %	25 %	75 %	386009681
95	NC_017530	CGCT	2	8	44899	44906	0 %	25 %	25 %	50 %	386009682
96	NC_017530	GGGC	2	8	45448	45455	0 %	0 %	75 %	25 %	386009683
97	NC_017530	GCTC	2	8	45834	45841	0 %	25 %	25 %	50 %	386009683
98	NC_017530	GCCT	2	8	48791	48798	0 %	25 %	25 %	50 %	386009685
99	NC_017530	CAGC	2	8	50373	50380	25 %	0 %	25 %	50 %	386009686
100	NC_017530	CAAA	2	8	50891	50898	75 %	0 %	0 %	25 %	386009687
101	NC_017530	ATAC	2	8	50945	50952	50 %	25 %	0 %	25 %	386009687
102	NC_017530	AGCG	2	8	51415	51422	25 %	0 %	50 %	25 %	386009687
103	NC_017530	CCAA	2	8	51587	51594	50 %	0 %	0 %	50 %	386009687
104	NC_017530	AGCC	2	8	51958	51965	25 %	0 %	25 %	50 %	386009687
105	NC_017530	AGCC	2	8	54556	54563	25 %	0 %	25 %	50 %	386009689
106	NC_017530	TTCA	2	8	55153	55160	25 %	50 %	0 %	25 %	386009689
107	NC_017530	CAAT	2	8	56287	56294	50 %	25 %	0 %	25 %	386009690
108	NC_017530	TTCC	2	8	56302	56309	0 %	50 %	0 %	50 %	386009690
109	NC_017530	CAAG	2	8	56608	56615	50 %	0 %	25 %	25 %	386009690
110	NC_017530	GGCA	2	8	57173	57180	25 %	0 %	50 %	25 %	386009691
111	NC_017530	TGCG	2	8	57294	57301	0 %	25 %	50 %	25 %	386009691
112	NC_017530	ATGT	2	8	57513	57520	25 %	50 %	25 %	0 %	386009691
113	NC_017530	AAGC	2	8	58255	58262	50 %	0 %	25 %	25 %	386009692
114	NC_017530	GCAC	2	8	58992	58999	25 %	0 %	25 %	50 %	386009693
115	NC_017530	CCAG	2	8	59665	59672	25 %	0 %	25 %	50 %	386009693
116	NC_017530	TGCG	2	8	60088	60095	0 %	25 %	50 %	25 %	386009693
117	NC_017530	CTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	50 %	25 %	386009694
118	NC_017530	AGGT	2	8	61867	61874	25 %	25 %	50 %	0 %	386009695
119	NC_017530	GGTG	2	8	61904	61911	0 %	25 %	75 %	0 %	386009695
120	NC_017530	GTCA	2	8	62367	62374	25 %	25 %	25 %	25 %	386009695
121	NC_017530	CCTT	2	8	62464	62471	0 %	50 %	0 %	50 %	386009695
122	NC_017530	CACG	2	8	62537	62544	25 %	0 %	25 %	50 %	386009695
123	NC_017530	GCCA	2	8	62871	62878	25 %	0 %	25 %	50 %	386009695
124	NC_017530	CCTT	2	8	64056	64063	0 %	50 %	0 %	50 %	386009697
125	NC_017530	CGAA	2	8	64570	64577	50 %	0 %	25 %	25 %	386009697
126	NC_017530	GCTG	2	8	64581	64588	0 %	25 %	50 %	25 %	386009697
127	NC_017530	CGAT	2	8	65304	65311	25 %	25 %	25 %	25 %	386009698
128	NC_017530	GAAC	2	8	66370	66377	50 %	0 %	25 %	25 %	386009699
129	NC_017530	ATCG	2	8	67046	67053	25 %	25 %	25 %	25 %	386009699
130	NC_017530	ATGA	2	8	67718	67725	50 %	25 %	25 %	0 %	386009700
131	NC_017530	TGCC	2	8	69931	69938	0 %	25 %	25 %	50 %	386009703
132	NC_017530	GACC	2	8	70067	70074	25 %	0 %	25 %	50 %	386009703
133	NC_017530	AGGC	2	8	70160	70167	25 %	0 %	50 %	25 %	386009703
134	NC_017530	GCGT	2	8	70174	70181	0 %	25 %	50 %	25 %	386009703
135	NC_017530	GAGC	2	8	70350	70357	25 %	0 %	50 %	25 %	386009704
136	NC_017530	GGCC	2	8	70905	70912	0 %	0 %	50 %	50 %	386009704
137	NC_017530	TTCT	2	8	71107	71114	0 %	75 %	0 %	25 %	386009704
138	NC_017530	GGCA	2	8	71752	71759	25 %	0 %	50 %	25 %	386009705
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