MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 80382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017530	TCC	2	6	67	72	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009640
2	NC_017530	ACC	2	6	73	78	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009640
3	NC_017530	CGG	3	9	225	233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009640
4	NC_017530	GGC	2	6	235	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009640
5	NC_017530	GAA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009640
6	NC_017530	TGA	2	6	647	652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009641
7	NC_017530	CAG	2	6	666	671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009641
8	NC_017530	CAC	2	6	672	677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009641
9	NC_017530	GCC	2	6	741	746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009641
10	NC_017530	CAA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009641
11	NC_017530	CAG	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009641
12	NC_017530	TGA	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009641
13	NC_017530	CAG	2	6	834	839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009641
14	NC_017530	GTG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009642
15	NC_017530	CCA	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009642
16	NC_017530	GAA	2	6	1335	1340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009642
17	NC_017530	CCA	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009642
18	NC_017530	CAG	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009642
19	NC_017530	CAC	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009642
20	NC_017530	TCT	2	6	1603	1608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009642
21	NC_017530	GCA	2	6	1616	1621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009642
22	NC_017530	CGT	2	6	1637	1642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009642
23	NC_017530	GCG	2	6	1693	1698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009642
24	NC_017530	TCG	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009642
25	NC_017530	GGT	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009642
26	NC_017530	GCC	2	6	2046	2051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009642
27	NC_017530	CGC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009643
28	NC_017530	ACA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009643
29	NC_017530	CGA	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009643
30	NC_017530	GGC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009643
31	NC_017530	GAT	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009643
32	NC_017530	CCT	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009643
33	NC_017530	CAG	2	6	2437	2442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009643
34	NC_017530	ACC	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009643
35	NC_017530	CGG	2	6	2508	2513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009643
36	NC_017530	TCG	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009643
37	NC_017530	CTT	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009644
38	NC_017530	CGG	2	6	2911	2916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009644
39	NC_017530	ACG	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009644
40	NC_017530	ACG	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009644
41	NC_017530	CTT	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009644
42	NC_017530	TGC	2	6	3287	3292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009644
43	NC_017530	GAC	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009645
44	NC_017530	CCG	2	6	3586	3591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009645
45	NC_017530	GGT	2	6	3711	3716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009645
46	NC_017530	CGG	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009645
47	NC_017530	CAA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009645
48	NC_017530	AAC	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009645
49	NC_017530	GCA	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009645
50	NC_017530	GTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009645
51	NC_017530	GCC	2	6	3954	3959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009645
52	NC_017530	CGT	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009645
53	NC_017530	GAA	2	6	4056	4061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009645
54	NC_017530	CAC	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009645
55	NC_017530	ACA	2	6	4159	4164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009645
56	NC_017530	CGC	2	6	4248	4253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009645
57	NC_017530	CGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009645
58	NC_017530	GAT	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009646
59	NC_017530	CAT	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009646
60	NC_017530	CTG	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
61	NC_017530	TTG	2	6	4598	4603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009646
62	NC_017530	CTA	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009646
63	NC_017530	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009646
64	NC_017530	GCG	2	6	4863	4868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009646
65	NC_017530	CCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009646
66	NC_017530	AAC	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009646
67	NC_017530	ACG	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009646
68	NC_017530	ACG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009646
69	NC_017530	GCT	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
70	NC_017530	CCA	3	9	5187	5195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009646
71	NC_017530	CTG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
72	NC_017530	CCA	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009646
73	NC_017530	CTG	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
74	NC_017530	CAT	2	6	5593	5598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009646
75	NC_017530	CGC	2	6	5623	5628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009646
76	NC_017530	GGT	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009646
77	NC_017530	CTG	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
78	NC_017530	TGC	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
79	NC_017530	TCG	2	6	5739	5744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
80	NC_017530	GCT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009646
81	NC_017530	GAC	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009646
82	NC_017530	CGA	2	6	5926	5931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009646
83	NC_017530	TGC	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009647
84	NC_017530	ACC	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009647
85	NC_017530	CAC	2	6	6357	6362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009647
86	NC_017530	CAG	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009647
87	NC_017530	GCT	2	6	6471	6476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009647
88	NC_017530	CTG	2	6	6529	6534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009647
89	NC_017530	CGA	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009647
90	NC_017530	GAC	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009647
91	NC_017530	GCT	2	6	6693	6698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009647
92	NC_017530	CGC	2	6	6774	6779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009647
93	NC_017530	GCT	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009647
94	NC_017530	GCA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009647
95	NC_017530	GCA	2	6	7031	7036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009647
96	NC_017530	GCT	2	6	7047	7052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009647
97	NC_017530	ACC	2	6	7528	7533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009648
98	NC_017530	CAC	2	6	7539	7544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009648
99	NC_017530	TTC	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009648
100	NC_017530	CTG	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009648
101	NC_017530	TAC	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009648
102	NC_017530	TGC	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009648
103	NC_017530	CAC	2	6	7977	7982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009648
104	NC_017530	GGC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009648
105	NC_017530	CGC	2	6	8024	8029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009648
106	NC_017530	ACC	2	6	8092	8097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009648
107	NC_017530	TCT	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009648
108	NC_017530	TTC	2	6	8142	8147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009648
109	NC_017530	TTC	2	6	8184	8189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009648
110	NC_017530	ACA	2	6	8233	8238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009648
111	NC_017530	CCG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009648
112	NC_017530	GGA	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009648
113	NC_017530	GAC	2	6	8367	8372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009648
114	NC_017530	GGC	2	6	8466	8471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009648
115	NC_017530	GGA	2	6	8480	8485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009648
116	NC_017530	AGC	2	6	8625	8630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009649
117	NC_017530	GCG	2	6	8700	8705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009649
118	NC_017530	GCT	2	6	8755	8760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009649
119	NC_017530	GTG	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009649
120	NC_017530	GCA	2	6	8850	8855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009649
121	NC_017530	TGA	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009649
122	NC_017530	CAA	2	6	8920	8925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009649
123	NC_017530	GCG	2	6	9066	9071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009649
124	NC_017530	GCC	2	6	9130	9135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009649
125	NC_017530	AAG	2	6	9161	9166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009649
126	NC_017530	GAG	2	6	9170	9175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009649
127	NC_017530	CTC	2	6	9214	9219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009649
128	NC_017530	AAC	2	6	9314	9319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009649
129	NC_017530	GTG	3	9	9323	9331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009649
130	NC_017530	GCA	2	6	9395	9400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009649
131	NC_017530	GGA	2	6	9406	9411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009649
132	NC_017530	TCA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009649
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250	NC_017530	ACT	2	6	19164	19169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009658
251	NC_017530	GCC	2	6	19203	19208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009658
252	NC_017530	CGG	2	6	19231	19236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009658
253	NC_017530	TCT	2	6	19248	19253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009658
254	NC_017530	ACC	2	6	19293	19298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009658
255	NC_017530	GAA	2	6	19409	19414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009658
256	NC_017530	CTG	2	6	19493	19498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009658
257	NC_017530	CAA	2	6	19513	19518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009658
258	NC_017530	CTA	2	6	19579	19584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009658
259	NC_017530	TGC	2	6	19611	19616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009658
260	NC_017530	ACC	2	6	19620	19625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009658
261	NC_017530	TGC	2	6	19626	19631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009658
262	NC_017530	CTG	2	6	19634	19639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009658
263	NC_017530	TGG	2	6	19644	19649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009658
264	NC_017530	CGA	2	6	19690	19695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009658
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267	NC_017530	GCG	2	6	19989	19994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009658
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270	NC_017530	CTG	3	9	20159	20167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009658
271	NC_017530	AGC	2	6	20218	20223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009658
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275	NC_017530	CGC	2	6	20740	20745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009659
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283	NC_017530	GCT	3	9	21155	21163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009659
284	NC_017530	ACC	2	6	21187	21192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009659
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