MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes L99

Total Repeats: 2182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017529	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017529	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	386006715
3	NC_017529	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	386006715
4	NC_017529	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	386006716
5	NC_017529	TCATT	2	10	6863	6872	20 %	60 %	0 %	20 %	386006719
6	NC_017529	TTGAT	2	10	11756	11765	20 %	60 %	20 %	0 %	386006721
7	NC_017529	TTTTA	2	10	12429	12438	20 %	80 %	0 %	0 %	386006722
8	NC_017529	GTATG	2	10	13372	13381	20 %	40 %	40 %	0 %	386006723
9	NC_017529	AAAGA	2	10	14387	14396	80 %	0 %	20 %	0 %	386006724
10	NC_017529	ATGAA	2	10	17251	17260	60 %	20 %	20 %	0 %	386006726
11	NC_017529	GAATG	2	10	18993	19002	40 %	20 %	40 %	0 %	386006727
12	NC_017529	ATTAA	2	10	20660	20669	60 %	40 %	0 %	0 %	386006730
13	NC_017529	AAATC	2	10	21121	21130	60 %	20 %	0 %	20 %	386006730
14	NC_017529	TTTTA	2	10	21898	21907	20 %	80 %	0 %	0 %	386006731
15	NC_017529	GACCA	2	10	21982	21991	40 %	0 %	20 %	40 %	386006731
16	NC_017529	TTGGA	2	10	22240	22249	20 %	40 %	40 %	0 %	386006731
17	NC_017529	AAATG	2	10	22798	22807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017529	CAAAA	2	10	23243	23252	80 %	0 %	0 %	20 %	386006732
19	NC_017529	TCAGG	2	10	24897	24906	20 %	20 %	40 %	20 %	386006735
20	NC_017529	ATGGA	2	10	27602	27611	40 %	20 %	40 %	0 %	386006738
21	NC_017529	GAAAA	2	10	31838	31847	80 %	0 %	20 %	0 %	386006742
22	NC_017529	TGAAA	2	10	32993	33002	60 %	20 %	20 %	0 %	386006743
23	NC_017529	AACCC	2	10	33704	33713	40 %	0 %	0 %	60 %	386006744
24	NC_017529	GAATG	2	10	34864	34873	40 %	20 %	40 %	0 %	386006745
25	NC_017529	AAATT	2	10	34991	35000	60 %	40 %	0 %	0 %	386006745
26	NC_017529	ATTTT	2	10	35345	35354	20 %	80 %	0 %	0 %	386006745
27	NC_017529	ATTTT	2	10	35597	35606	20 %	80 %	0 %	0 %	386006745
28	NC_017529	AAAAC	2	10	39224	39233	80 %	0 %	0 %	20 %	386006747
29	NC_017529	AAATG	2	10	40592	40601	60 %	20 %	20 %	0 %	386006749
30	NC_017529	GTAGA	2	10	41678	41687	40 %	20 %	40 %	0 %	386006750
31	NC_017529	TTACT	2	10	42660	42669	20 %	60 %	0 %	20 %	386006752
32	NC_017529	CAAAA	2	10	43167	43176	80 %	0 %	0 %	20 %	386006753
33	NC_017529	AAATA	2	10	43686	43695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017529	TAAAA	2	10	44668	44677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017529	TGCTA	2	10	44842	44851	20 %	40 %	20 %	20 %	386006756
36	NC_017529	TTTTA	2	10	45010	45019	20 %	80 %	0 %	0 %	386006756
37	NC_017529	AGTTA	2	10	46326	46335	40 %	40 %	20 %	0 %	386006757
38	NC_017529	CCATG	2	10	46803	46812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017529	AGTCT	2	10	47790	47799	20 %	40 %	20 %	20 %	386006758
40	NC_017529	TTTTA	2	10	50786	50795	20 %	80 %	0 %	0 %	386006761
41	NC_017529	TTTTG	2	10	52519	52528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017529	TCAAC	2	10	55957	55966	40 %	20 %	0 %	40 %	386006764
43	NC_017529	ATTAT	2	10	56133	56142	40 %	60 %	0 %	0 %	386006764
44	NC_017529	ACAAA	2	10	56667	56676	80 %	0 %	0 %	20 %	386006765
45	NC_017529	TTACT	2	10	57991	58000	20 %	60 %	0 %	20 %	386006767
46	NC_017529	AACAA	2	10	58086	58095	80 %	0 %	0 %	20 %	386006767
47	NC_017529	CAATT	2	10	63076	63085	40 %	40 %	0 %	20 %	386006769
48	NC_017529	ATGGA	2	10	64608	64617	40 %	20 %	40 %	0 %	386006770
49	NC_017529	AAATT	2	10	65659	65668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017529	CCCCA	2	10	67642	67651	20 %	0 %	0 %	80 %	386006773
51	NC_017529	GCTTG	2	10	68929	68938	0 %	40 %	40 %	20 %	386006774
52	NC_017529	AAACT	2	10	68939	68948	60 %	20 %	0 %	20 %	386006774
53	NC_017529	GAATG	2	10	70769	70778	40 %	20 %	40 %	0 %	386006776
54	NC_017529	GCGCT	2	10	70983	70992	0 %	20 %	40 %	40 %	386006776
55	NC_017529	GTATT	2	10	71756	71765	20 %	60 %	20 %	0 %	386006777
56	NC_017529	GAACT	2	10	72124	72133	40 %	20 %	20 %	20 %	386006777
57	NC_017529	GGAAG	2	10	73627	73636	40 %	0 %	60 %	0 %	386006779
58	NC_017529	CTCAT	2	10	73786	73795	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017529	TGGAA	2	10	74830	74839	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017529	GGGTA	2	10	76020	76029	20 %	20 %	60 %	0 %	386006785
61	NC_017529	CAGAA	2	10	77225	77234	60 %	0 %	20 %	20 %	386006787
62	NC_017529	CTGAA	2	10	77951	77960	40 %	20 %	20 %	20 %	386006787
63	NC_017529	CTTAT	2	10	81824	81833	20 %	60 %	0 %	20 %	386006792
64	NC_017529	ATTAA	2	10	82521	82530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017529	GCTTG	2	10	84424	84433	0 %	40 %	40 %	20 %	386006795
66	NC_017529	ACAAT	2	10	86885	86894	60 %	20 %	0 %	20 %	386006797
67	NC_017529	CTATC	2	10	89529	89538	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017529	ATGAC	2	10	89666	89675	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017529	TTTGA	2	10	93084	93093	20 %	60 %	20 %	0 %	386006802
70	NC_017529	ACATC	2	10	93378	93387	40 %	20 %	0 %	40 %	386006803
71	NC_017529	ATGGC	2	10	93534	93543	20 %	20 %	40 %	20 %	386006803
72	NC_017529	AAGAG	2	10	93895	93904	60 %	0 %	40 %	0 %	386006803
73	NC_017529	CAAAA	2	10	95907	95916	80 %	0 %	0 %	20 %	386006807
74	NC_017529	ATTGA	2	10	97774	97783	40 %	40 %	20 %	0 %	386006811
75	NC_017529	AGATA	2	10	97875	97884	60 %	20 %	20 %	0 %	386006811
76	NC_017529	AAAAT	2	10	98257	98266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017529	GAAAA	2	10	98331	98340	80 %	0 %	20 %	0 %	386006812
78	NC_017529	GCGAA	2	10	98718	98727	40 %	0 %	40 %	20 %	386006812
79	NC_017529	AGCAA	2	10	104373	104382	60 %	0 %	20 %	20 %	386006814
80	NC_017529	ATTCG	2	10	105785	105794	20 %	40 %	20 %	20 %	386006817
81	NC_017529	AGCAG	2	10	105837	105846	40 %	0 %	40 %	20 %	386006817
82	NC_017529	TAAAA	2	10	107952	107961	80 %	20 %	0 %	0 %	386006822
83	NC_017529	ATTCA	2	10	109127	109136	40 %	40 %	0 %	20 %	386006825
84	NC_017529	TAAAA	2	10	109464	109473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017529	AGCTG	2	10	111616	111625	20 %	20 %	40 %	20 %	386006830
86	NC_017529	TCATT	2	10	112286	112295	20 %	60 %	0 %	20 %	386006830
87	NC_017529	TCAAA	2	10	116554	116563	60 %	20 %	0 %	20 %	386006832
88	NC_017529	AGTGA	2	10	116609	116618	40 %	20 %	40 %	0 %	386006832
89	NC_017529	AGTCA	2	10	117697	117706	40 %	20 %	20 %	20 %	386006832
90	NC_017529	AATTT	2	10	118095	118104	40 %	60 %	0 %	0 %	386006832
91	NC_017529	TAGTT	2	10	118711	118720	20 %	60 %	20 %	0 %	386006832
92	NC_017529	AAAAC	2	10	119243	119252	80 %	0 %	0 %	20 %	386006832
93	NC_017529	AAAAG	2	10	120005	120014	80 %	0 %	20 %	0 %	386006833
94	NC_017529	CAGAA	2	10	122276	122285	60 %	0 %	20 %	20 %	386006835
95	NC_017529	TCTAT	2	10	122775	122784	20 %	60 %	0 %	20 %	386006835
96	NC_017529	GTTTT	2	10	125481	125490	0 %	80 %	20 %	0 %	386006838
97	NC_017529	TGAGT	2	10	126592	126601	20 %	40 %	40 %	0 %	386006838
98	NC_017529	CAAAT	2	10	129403	129412	60 %	20 %	0 %	20 %	386006841
99	NC_017529	ATCAA	2	10	129415	129424	60 %	20 %	0 %	20 %	386006841
100	NC_017529	GGTAG	2	10	133821	133830	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017529	AGGAA	2	10	133938	133947	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017529	ATATC	2	10	140591	140600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017529	GCAAT	2	10	141431	141440	40 %	20 %	20 %	20 %	386006851
104	NC_017529	AAAAG	2	10	143281	143290	80 %	0 %	20 %	0 %	386006853
105	NC_017529	ACGGT	2	10	144825	144834	20 %	20 %	40 %	20 %	386006854
106	NC_017529	GAAAT	2	10	146064	146073	60 %	20 %	20 %	0 %	386006855
107	NC_017529	GAATT	2	10	146705	146714	40 %	40 %	20 %	0 %	386006855
108	NC_017529	TTGCG	2	10	146880	146889	0 %	40 %	40 %	20 %	386006855
109	NC_017529	AACCA	2	10	150580	150589	60 %	0 %	0 %	40 %	386006858
110	NC_017529	AGAGA	2	10	151419	151428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017529	TACTG	2	10	152859	152868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017529	TCTCT	2	10	153430	153439	0 %	60 %	0 %	40 %	386006861
113	NC_017529	TTTTA	2	10	153790	153799	20 %	80 %	0 %	0 %	386006862
114	NC_017529	AAAAG	2	10	154059	154068	80 %	0 %	20 %	0 %	386006863
115	NC_017529	AAAGT	2	10	155097	155106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017529	AATTT	2	10	155568	155577	40 %	60 %	0 %	0 %	386006865
117	NC_017529	TTTAC	2	10	156607	156616	20 %	60 %	0 %	20 %	386006867
118	NC_017529	TTGTT	2	10	159056	159065	0 %	80 %	20 %	0 %	386006868
119	NC_017529	ATTTT	2	10	160858	160867	20 %	80 %	0 %	0 %	386006870
120	NC_017529	AAAAT	2	10	162360	162369	80 %	20 %	0 %	0 %	386006870
121	NC_017529	AACTT	2	10	163670	163679	40 %	40 %	0 %	20 %	386006873
122	NC_017529	ACAAA	2	10	163772	163781	80 %	0 %	0 %	20 %	386006873
123	NC_017529	ACTTG	2	10	164566	164575	20 %	40 %	20 %	20 %	386006873
124	NC_017529	CCACA	2	10	164907	164916	40 %	0 %	0 %	60 %	386006873
125	NC_017529	TTGGT	2	10	165362	165371	0 %	60 %	40 %	0 %	386006874
126	NC_017529	TTTGG	2	10	165412	165421	0 %	60 %	40 %	0 %	386006874
127	NC_017529	TATGA	2	10	168342	168351	40 %	40 %	20 %	0 %	386006878
128	NC_017529	TAACG	2	10	170191	170200	40 %	20 %	20 %	20 %	386006881
129	NC_017529	AGTAG	2	10	170513	170522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017529	ATCCG	2	10	171921	171930	20 %	20 %	20 %	40 %	386006885
131	NC_017529	ACGGC	2	10	172542	172551	20 %	0 %	40 %	40 %	386006885
132	NC_017529	TTTAA	2	10	172614	172623	40 %	60 %	0 %	0 %	386006885
133	NC_017529	AATTT	2	10	172800	172809	40 %	60 %	0 %	0 %	386006885
134	NC_017529	GATAA	2	10	172967	172976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017529	AATAA	2	10	174072	174081	80 %	20 %	0 %	0 %	386006886
136	NC_017529	TAAAG	2	10	175838	175847	60 %	20 %	20 %	0 %	386006889
137	NC_017529	GAATA	2	10	176033	176042	60 %	20 %	20 %	0 %	386006889
138	NC_017529	AGATG	2	10	177280	177289	40 %	20 %	40 %	0 %	386006890
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267	NC_017529	TTTGA	2	10	346747	346756	20 %	60 %	20 %	0 %	386007033
268	NC_017529	GTTTT	2	10	346758	346767	0 %	80 %	20 %	0 %	386007033
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