MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes L99

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017529	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017529	AAATG	2	10	22798	22807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017529	AAATA	2	10	43686	43695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017529	TAAAA	2	10	44668	44677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017529	CCATG	2	10	46803	46812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017529	TTTTG	2	10	52519	52528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017529	AAATT	2	10	65659	65668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017529	CTCAT	2	10	73786	73795	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017529	TGGAA	2	10	74830	74839	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017529	ATTAA	2	10	82521	82530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017529	CTATC	2	10	89529	89538	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017529	ATGAC	2	10	89666	89675	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017529	AAAAT	2	10	98257	98266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017529	TAAAA	2	10	109464	109473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017529	GGTAG	2	10	133821	133830	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017529	AGGAA	2	10	133938	133947	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017529	ATATC	2	10	140591	140600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017529	AGAGA	2	10	151419	151428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017529	TACTG	2	10	152859	152868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017529	AAAGT	2	10	155097	155106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017529	AGTAG	2	10	170513	170522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017529	GATAA	2	10	172967	172976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017529	TTGTA	2	10	192483	192492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017529	ATAGA	2	10	213156	213165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017529	TTGTC	2	10	218679	218688	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017529	AAAAT	2	10	218758	218767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017529	ACAAA	2	10	219044	219053	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017529	ATATA	2	10	226777	226786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017529	GTGAG	2	10	230508	230517	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017529	GAGTG	2	10	234795	234804	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017529	AGCCG	2	10	242974	242983	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017529	TTTTC	2	10	250947	250956	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017529	GAAAA	2	10	251097	251106	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017529	GAAAA	2	10	251301	251310	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017529	GAAAA	2	10	251505	251514	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017529	GAAAA	2	10	251709	251718	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017529	GAATA	2	10	254796	254805	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017529	AAATT	2	10	256481	256490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017529	TAATT	2	10	256682	256691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017529	TCGTG	2	10	257841	257850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017529	AAGGT	2	10	259309	259318	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017529	GGCAG	2	10	262656	262665	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017529	TAATT	2	10	262700	262709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017529	TCGTG	2	10	263859	263868	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017529	AAGGT	2	10	265327	265336	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017529	GGCAT	2	10	282623	282632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017529	GTAGT	2	10	288326	288335	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017529	AGTGA	2	10	308275	308284	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017529	ACTAA	2	10	311772	311781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017529	TATAA	2	10	316997	317006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017529	AAAGA	2	10	320226	320235	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017529	AGTAT	2	10	330197	330206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017529	TTACT	2	10	330272	330281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017529	ATAAA	2	10	331011	331020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017529	TTATT	2	10	345098	345107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017529	AGTCT	2	10	356548	356557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017529	ATTGT	2	10	369194	369203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017529	GGAGA	2	10	383921	383930	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017529	CACAC	2	10	387769	387778	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_017529	TGAAA	2	10	389250	389259	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017529	GTGAT	2	10	404283	404292	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017529	GAAAC	2	10	409413	409422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017529	AGGTG	2	10	450678	450687	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017529	TAAAA	2	10	467664	467673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017529	TAAGT	2	10	474533	474542	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017529	AACAT	2	10	481129	481138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017529	AAGAA	2	10	485795	485804	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017529	CTTAT	2	10	487579	487588	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017529	ATCAA	2	10	488618	488627	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017529	CAAAT	2	10	489920	489929	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017529	ATACA	2	10	520505	520514	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017529	CAATC	2	10	524372	524381	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017529	GGGAA	2	10	543224	543233	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017529	AGAGG	2	10	546832	546841	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017529	ATGGA	2	10	552285	552294	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017529	TGATA	2	10	559809	559818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017529	TATAG	2	10	565719	565728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017529	TAGAC	2	10	586737	586746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017529	TAAAA	2	10	592664	592673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017529	TTAGT	2	10	594137	594146	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017529	AAAGA	2	10	605661	605670	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017529	ATAAA	2	10	620621	620630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017529	AATCA	2	10	624597	624606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017529	ATTGA	2	10	632557	632566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017529	ATTAA	2	10	646582	646591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017529	AAATT	2	10	661834	661843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017529	TAAAA	2	10	671033	671042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017529	ATATA	2	10	678934	678943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017529	ATCAA	2	10	682554	682563	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017529	ATTTT	2	10	682573	682582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017529	GAAAT	2	10	705563	705572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017529	ATAGA	2	10	709363	709372	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017529	TTACT	2	10	711672	711681	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017529	AAACA	2	10	716659	716668	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017529	TATTT	2	10	735433	735442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017529	AGAGA	2	10	735583	735592	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017529	CTTTT	2	10	736558	736567	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017529	TAAAA	2	10	783246	783255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017529	CTTTT	2	10	789969	789978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017529	TAGTT	2	10	789982	789991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017529	ATTAG	2	10	841544	841553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017529	GTATA	2	10	843866	843875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017529	AATTA	2	10	844487	844496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017529	AATAA	2	10	847849	847858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017529	ATTTT	2	10	851435	851444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017529	GTTTT	2	10	864372	864381	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017529	TTTTA	2	10	866478	866487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017529	ATAGA	2	10	881057	881066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017529	TTTTA	2	10	885157	885166	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017529	AATGT	2	10	892557	892566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017529	TTATA	2	10	917790	917799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017529	CATAA	2	10	933785	933794	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017529	GAAAG	2	10	935409	935418	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017529	TTTTA	2	10	935863	935872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017529	ATAGA	2	10	939774	939783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017529	TATAA	2	10	954036	954045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017529	TGAAA	2	10	963531	963540	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017529	TTTTA	2	10	969866	969875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017529	TTTAT	2	10	970158	970167	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017529	ATGAG	2	10	990952	990961	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017529	TTTTA	2	10	998084	998093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017529	TAAAA	2	10	998149	998158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017529	TATAA	2	10	1012610	1012619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017529	TCTAT	2	10	1025383	1025392	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017529	AGATA	2	10	1029080	1029089	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017529	GAGAG	2	10	1038009	1038018	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017529	TTCTA	2	10	1042681	1042690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017529	CAAAC	2	10	1042847	1042856	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017529	TTTTC	2	10	1046566	1046575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017529	GTTTT	2	10	1056463	1056472	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017529	TAGGA	2	10	1064290	1064299	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017529	GTTTT	2	10	1064300	1064309	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017529	ATAAA	2	10	1068501	1068510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017529	CTTTT	2	10	1068797	1068806	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017529	TTATT	2	10	1074771	1074780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017529	AAGTT	2	10	1078473	1078482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017529	ATAAA	2	10	1078527	1078536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017529	GCTAT	2	10	1079399	1079408	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017529	AATAA	2	10	1081460	1081469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017529	AGTAA	2	10	1089397	1089406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017529	GGGAT	2	10	1114167	1114176	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017529	AATAA	2	10	1114369	1114378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017529	GAAAA	2	10	1118351	1118360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017529	GTATA	2	10	1126996	1127005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017529	TAAAA	2	10	1192777	1192786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017529	ATTTA	2	10	1192805	1192814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017529	TCTTT	2	10	1212303	1212312	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_017529	ATATA	2	10	2360596	2360605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017529	TAACA	2	10	2372435	2372444	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_017529	CTATA	2	10	2398009	2398018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_017529	TTATA	2	10	2652950	2652959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_017529	TCATA	2	10	2907243	2907252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
372	NC_017529	TAAAA	2	10	2909286	2909295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_017529	TATCA	2	10	2978498	2978507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.