MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB423 chromosome

Total Repeats: 56023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017528	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
2	NC_017528	GCC	2	6	261	266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
3	NC_017528	CCG	2	6	305	310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
4	NC_017528	CGA	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
5	NC_017528	GCC	2	6	340	345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
6	NC_017528	ACG	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
7	NC_017528	TGA	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003091
8	NC_017528	CGC	3	9	562	570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
9	NC_017528	GTT	2	6	682	687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003091
10	NC_017528	CGA	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
11	NC_017528	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003091
12	NC_017528	CAA	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003091
13	NC_017528	AGC	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
14	NC_017528	ACC	2	6	994	999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003091
15	NC_017528	CGA	2	6	1063	1068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
16	NC_017528	CAG	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003091
17	NC_017528	GCG	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003091
18	NC_017528	CCG	2	6	1260	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003091
19	NC_017528	CAC	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003091
20	NC_017528	GTG	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003092
21	NC_017528	ACG	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003092
22	NC_017528	CAA	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003092
23	NC_017528	ATC	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003092
24	NC_017528	TGT	2	6	3626	3631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003092
25	NC_017528	CGG	2	6	3676	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003092
26	NC_017528	GAT	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003092
27	NC_017528	TGG	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003092
28	NC_017528	GAA	2	6	3918	3923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003092
29	NC_017528	AGC	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003092
30	NC_017528	GGC	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003092
31	NC_017528	GGC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003092
32	NC_017528	GAC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003092
33	NC_017528	GGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003093
34	NC_017528	TGG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003093
35	NC_017528	GTT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003093
36	NC_017528	CGA	2	6	4255	4260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003093
37	NC_017528	CGG	2	6	4305	4310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003093
38	NC_017528	CCG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003093
39	NC_017528	CCG	2	6	4362	4367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003093
40	NC_017528	GGT	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003093
41	NC_017528	TGC	3	9	4536	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003094
42	NC_017528	CGA	2	6	4615	4620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003094
43	NC_017528	GGT	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003094
44	NC_017528	CCA	2	6	4758	4763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003094
45	NC_017528	ACG	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003094
46	NC_017528	CGC	2	6	4881	4886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003094
47	NC_017528	CGG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003094
48	NC_017528	AAG	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003095
49	NC_017528	GGT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
50	NC_017528	CGA	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
51	NC_017528	TGC	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003095
52	NC_017528	CGA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
53	NC_017528	GTG	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
54	NC_017528	CGG	2	6	5558	5563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003095
55	NC_017528	TGG	2	6	5594	5599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
56	NC_017528	GGT	2	6	5621	5626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
57	NC_017528	AAG	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003095
58	NC_017528	CAA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003095
59	NC_017528	CGA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
60	NC_017528	GTC	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003095
61	NC_017528	TGG	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
62	NC_017528	AGC	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
63	NC_017528	GGC	2	6	6180	6185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003095
64	NC_017528	GGT	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003095
65	NC_017528	GCG	2	6	6524	6529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003095
66	NC_017528	ATC	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003095
67	NC_017528	ATC	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003095
68	NC_017528	ACG	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
69	NC_017528	TGT	2	6	6871	6876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003095
70	NC_017528	GTT	3	9	6881	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003095
71	NC_017528	CCG	2	6	6939	6944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003095
72	NC_017528	CTG	2	6	7011	7016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003095
73	NC_017528	GAA	2	6	7037	7042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386003095
74	NC_017528	CAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003095
75	NC_017528	ACC	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003095
76	NC_017528	GAC	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003095
77	NC_017528	GCC	4	12	7164	7175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003095
78	NC_017528	GTT	2	6	7181	7186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003095
79	NC_017528	CGC	2	6	10046	10051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
80	NC_017528	TGC	2	6	10062	10067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003096
81	NC_017528	GCC	3	9	10098	10106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
82	NC_017528	CCG	4	12	10142	10153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
83	NC_017528	GCC	2	6	10207	10212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
84	NC_017528	CCG	2	6	10271	10276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
85	NC_017528	GCC	2	6	10390	10395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003096
86	NC_017528	GCG	2	6	10403	10408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
87	NC_017528	TGT	3	9	10535	10543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003096
88	NC_017528	TTC	2	6	10555	10560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003096
89	NC_017528	GAT	2	6	10566	10571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003096
90	NC_017528	CGG	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
91	NC_017528	AAC	2	6	10651	10656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003096
92	NC_017528	GCA	2	6	10664	10669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003096
93	NC_017528	CGG	2	6	10701	10706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
94	NC_017528	TGA	2	6	10739	10744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386003096
95	NC_017528	CCA	2	6	10754	10759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003096
96	NC_017528	CGG	2	6	10797	10802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003096
97	NC_017528	CGG	2	6	11325	11330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003097
98	NC_017528	ACG	2	6	11387	11392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003097
99	NC_017528	CCG	2	6	11642	11647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003098
100	NC_017528	GGT	2	6	11907	11912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003099
101	NC_017528	CGA	2	6	11933	11938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003099
102	NC_017528	CCG	2	6	11967	11972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003099
103	NC_017528	GCC	2	6	11982	11987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003099
104	NC_017528	GGT	2	6	12010	12015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003099
105	NC_017528	TGC	2	6	12019	12024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003099
106	NC_017528	CCA	2	6	12067	12072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003099
107	NC_017528	GGC	2	6	12113	12118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003099
108	NC_017528	CGG	2	6	12153	12158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003099
109	NC_017528	GAG	2	6	12215	12220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386003099
110	NC_017528	ACG	2	6	12669	12674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003100
111	NC_017528	CGG	2	6	12742	12747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003100
112	NC_017528	CGA	2	6	12766	12771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003100
113	NC_017528	TCA	2	6	12855	12860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003100
114	NC_017528	GGT	2	6	12991	12996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003100
115	NC_017528	CAG	2	6	13228	13233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003101
116	NC_017528	GGC	2	6	13272	13277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003101
117	NC_017528	TCG	2	6	13292	13297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003101
118	NC_017528	TGC	2	6	13556	13561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003101
119	NC_017528	CAA	2	6	13740	13745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003102
120	NC_017528	AAC	2	6	13891	13896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386003102
121	NC_017528	TTC	2	6	13972	13977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386003102
122	NC_017528	GAC	2	6	14037	14042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003103
123	NC_017528	GCT	3	9	14201	14209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003104
124	NC_017528	GCC	2	6	14211	14216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003104
125	NC_017528	GGC	2	6	14232	14237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003104
126	NC_017528	CCG	2	6	14246	14251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003104
127	NC_017528	ACC	2	6	14334	14339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003104
128	NC_017528	GGC	2	6	14381	14386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003104
129	NC_017528	GCG	2	6	14393	14398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003104
130	NC_017528	CCG	2	6	14401	14406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003104
131	NC_017528	GGC	2	6	14420	14425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003104
132	NC_017528	TGG	2	6	14452	14457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003104
133	NC_017528	CAT	2	6	14609	14614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386003104
134	NC_017528	TGC	2	6	14650	14655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003104
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137	NC_017528	GCT	2	6	14721	14726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003104
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142	NC_017528	GCC	2	6	15039	15044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003105
143	NC_017528	GCA	2	6	15138	15143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386003105
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152	NC_017528	GGT	3	9	17634	17642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386003106
153	NC_017528	CTG	2	6	17661	17666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003106
154	NC_017528	TGT	2	6	17672	17677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386003106
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160	NC_017528	ACC	2	6	17796	17801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386003106
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162	NC_017528	GCC	2	6	17884	17889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003106
163	NC_017528	CGG	2	6	17935	17940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386003106
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174	NC_017528	CTG	2	6	19007	19012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003107
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499	NC_017528	CCG	2	6	43948	43953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386003128
500	NC_017528	CGT	2	6	44006	44011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386003128

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