MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 1701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017527	GCAGG	2	10	57	66	20 %	0 %	60 %	20 %	386000718
2	NC_017527	GCCCG	2	10	1089	1098	0 %	0 %	40 %	60 %	386000718
3	NC_017527	AATCC	2	10	2581	2590	40 %	20 %	0 %	40 %	386000718
4	NC_017527	TTTTA	2	10	2843	2852	20 %	80 %	0 %	0 %	386000718
5	NC_017527	ACCTC	2	10	6680	6689	20 %	20 %	0 %	60 %	386000721
6	NC_017527	TCCCC	2	10	6740	6749	0 %	20 %	0 %	80 %	386000721
7	NC_017527	CGTCT	2	10	11799	11808	0 %	40 %	20 %	40 %	386000725
8	NC_017527	GAGGG	2	10	12690	12699	20 %	0 %	80 %	0 %	386000727
9	NC_017527	CCGGG	2	10	12929	12938	0 %	0 %	60 %	40 %	386000727
10	NC_017527	CCTTC	2	10	13857	13866	0 %	40 %	0 %	60 %	386000729
11	NC_017527	CCTGG	2	10	17837	17846	0 %	20 %	40 %	40 %	386000733
12	NC_017527	GCCCC	2	10	19019	19028	0 %	0 %	20 %	80 %	386000734
13	NC_017527	CCCCG	2	10	19927	19936	0 %	0 %	20 %	80 %	386000735
14	NC_017527	CCTCA	2	10	21471	21480	20 %	20 %	0 %	60 %	386000736
15	NC_017527	GGGCC	2	10	21956	21965	0 %	0 %	60 %	40 %	386000736
16	NC_017527	CCCCG	2	10	23195	23204	0 %	0 %	20 %	80 %	386000737
17	NC_017527	CCGGG	2	10	25649	25658	0 %	0 %	60 %	40 %	386000739
18	NC_017527	CCCCG	2	10	27616	27625	0 %	0 %	20 %	80 %	386000740
19	NC_017527	TCGTC	2	10	29634	29643	0 %	40 %	20 %	40 %	386000742
20	NC_017527	TCGGA	2	10	31801	31810	20 %	20 %	40 %	20 %	386000744
21	NC_017527	GGTCA	2	10	32941	32950	20 %	20 %	40 %	20 %	386000745
22	NC_017527	TCGAC	2	10	33150	33159	20 %	20 %	20 %	40 %	386000745
23	NC_017527	ATTTT	2	10	33417	33426	20 %	80 %	0 %	0 %	386000745
24	NC_017527	CTTCC	2	10	39493	39502	0 %	40 %	0 %	60 %	386000751
25	NC_017527	GCGGA	2	10	40082	40091	20 %	0 %	60 %	20 %	386000752
26	NC_017527	AGGAG	2	10	40131	40140	40 %	0 %	60 %	0 %	386000752
27	NC_017527	CGTCC	2	10	41010	41019	0 %	20 %	20 %	60 %	386000753
28	NC_017527	CGACC	2	10	43223	43232	20 %	0 %	20 %	60 %	386000754
29	NC_017527	AGACG	2	10	45143	45152	40 %	0 %	40 %	20 %	386000754
30	NC_017527	TCCGA	2	10	46752	46761	20 %	20 %	20 %	40 %	386000755
31	NC_017527	GAAGA	2	10	48347	48356	60 %	0 %	40 %	0 %	386000755
32	NC_017527	GCCGA	2	10	49007	49016	20 %	0 %	40 %	40 %	386000756
33	NC_017527	GTCCG	2	10	49657	49666	0 %	20 %	40 %	40 %	386000757
34	NC_017527	CGTTT	2	10	50118	50127	0 %	60 %	20 %	20 %	386000759
35	NC_017527	TCCGA	2	10	53224	53233	20 %	20 %	20 %	40 %	386000760
36	NC_017527	TCGTC	2	10	53830	53839	0 %	40 %	20 %	40 %	386000761
37	NC_017527	CCCGG	2	10	56552	56561	0 %	0 %	40 %	60 %	386000764
38	NC_017527	TGAGG	2	10	59302	59311	20 %	20 %	60 %	0 %	386000765
39	NC_017527	CCGGG	2	10	59623	59632	0 %	0 %	60 %	40 %	386000765
40	NC_017527	TGTCG	2	10	62001	62010	0 %	40 %	40 %	20 %	386000768
41	NC_017527	GGTTT	2	10	62094	62103	0 %	60 %	40 %	0 %	386000768
42	NC_017527	CCGAG	2	10	62728	62737	20 %	0 %	40 %	40 %	386000769
43	NC_017527	GGAGG	2	10	64102	64111	20 %	0 %	80 %	0 %	386000770
44	NC_017527	CCGTC	2	10	65419	65428	0 %	20 %	20 %	60 %	386000771
45	NC_017527	ACCTC	2	10	65912	65921	20 %	20 %	0 %	60 %	386000773
46	NC_017527	GGGGC	2	10	65992	66001	0 %	0 %	80 %	20 %	386000773
47	NC_017527	GGCCC	2	10	69067	69076	0 %	0 %	40 %	60 %	386000778
48	NC_017527	TTCTC	2	10	69629	69638	0 %	60 %	0 %	40 %	386000778
49	NC_017527	AGGAG	2	10	70769	70778	40 %	0 %	60 %	0 %	386000781
50	NC_017527	GAGGT	2	10	70962	70971	20 %	20 %	60 %	0 %	386000781
51	NC_017527	AGGTC	2	10	71624	71633	20 %	20 %	40 %	20 %	386000782
52	NC_017527	GGCGG	2	10	72597	72606	0 %	0 %	80 %	20 %	386000783
53	NC_017527	GCTCG	2	10	74839	74848	0 %	20 %	40 %	40 %	386000785
54	NC_017527	AGGGA	2	10	75257	75266	40 %	0 %	60 %	0 %	386000785
55	NC_017527	CTCGA	2	10	77244	77253	20 %	20 %	20 %	40 %	386000786
56	NC_017527	GGAGA	2	10	83898	83907	40 %	0 %	60 %	0 %	386000791
57	NC_017527	GAGGG	2	10	85952	85961	20 %	0 %	80 %	0 %	386000795
58	NC_017527	CGATC	2	10	86991	87000	20 %	20 %	20 %	40 %	386000796
59	NC_017527	CGGGG	2	10	87028	87037	0 %	0 %	80 %	20 %	386000796
60	NC_017527	AGGGG	2	10	87461	87470	20 %	0 %	80 %	0 %	386000796
61	NC_017527	CGATC	2	10	87530	87539	20 %	20 %	20 %	40 %	386000797
62	NC_017527	CATGC	2	10	89070	89079	20 %	20 %	20 %	40 %	386000799
63	NC_017527	GATCG	2	10	91884	91893	20 %	20 %	40 %	20 %	386000801
64	NC_017527	AGGAG	2	10	92414	92423	40 %	0 %	60 %	0 %	386000802
65	NC_017527	GTCCG	2	10	94629	94638	0 %	20 %	40 %	40 %	386000804
66	NC_017527	ATCGA	2	10	101536	101545	40 %	20 %	20 %	20 %	386000811
67	NC_017527	ATCCT	2	10	102686	102695	20 %	40 %	0 %	40 %	386000811
68	NC_017527	GCCAC	2	10	104022	104031	20 %	0 %	20 %	60 %	386000814
69	NC_017527	GGCGA	2	10	105279	105288	20 %	0 %	60 %	20 %	386000816
70	NC_017527	TCTCC	2	10	108098	108107	0 %	40 %	0 %	60 %	386000818
71	NC_017527	GTATC	2	10	109750	109759	20 %	40 %	20 %	20 %	386000819
72	NC_017527	CCCCG	2	10	112530	112539	0 %	0 %	20 %	80 %	386000822
73	NC_017527	CCCCG	2	10	112689	112698	0 %	0 %	20 %	80 %	386000822
74	NC_017527	CGCCC	2	10	113989	113998	0 %	0 %	20 %	80 %	386000823
75	NC_017527	GTCCG	2	10	117225	117234	0 %	20 %	40 %	40 %	386000824
76	NC_017527	GGGGA	2	10	117821	117830	20 %	0 %	80 %	0 %	386000824
77	NC_017527	CCAGG	2	10	120926	120935	20 %	0 %	40 %	40 %	386000828
78	NC_017527	AGGCG	2	10	121306	121315	20 %	0 %	60 %	20 %	386000828
79	NC_017527	TGATC	2	10	121696	121705	20 %	40 %	20 %	20 %	386000828
80	NC_017527	GAGGT	2	10	121866	121875	20 %	20 %	60 %	0 %	386000828
81	NC_017527	CCCCG	2	10	122023	122032	0 %	0 %	20 %	80 %	386000828
82	NC_017527	CCGGT	2	10	122688	122697	0 %	20 %	40 %	40 %	386000828
83	NC_017527	CTGAT	2	10	122741	122750	20 %	40 %	20 %	20 %	386000828
84	NC_017527	GACCA	2	10	123081	123090	40 %	0 %	20 %	40 %	386000828
85	NC_017527	GCCAC	2	10	123205	123214	20 %	0 %	20 %	60 %	386000828
86	NC_017527	GACCA	2	10	123327	123336	40 %	0 %	20 %	40 %	386000828
87	NC_017527	GACGC	2	10	123921	123930	20 %	0 %	40 %	40 %	386000828
88	NC_017527	CCCCT	2	10	124874	124883	0 %	20 %	0 %	80 %	386000829
89	NC_017527	ACCGT	2	10	127037	127046	20 %	20 %	20 %	40 %	386000833
90	NC_017527	TGGCG	2	10	127551	127560	0 %	20 %	60 %	20 %	386000833
91	NC_017527	GCCGG	2	10	127849	127858	0 %	0 %	60 %	40 %	386000834
92	NC_017527	GTATG	2	10	128387	128396	20 %	40 %	40 %	0 %	386000834
93	NC_017527	GATCC	2	10	129660	129669	20 %	20 %	20 %	40 %	386000835
94	NC_017527	CGGGG	2	10	130461	130470	0 %	0 %	80 %	20 %	386000836
95	NC_017527	AGGAG	2	10	132168	132177	40 %	0 %	60 %	0 %	386000838
96	NC_017527	GGACG	2	10	132637	132646	20 %	0 %	60 %	20 %	386000838
97	NC_017527	ACGGG	2	10	133039	133048	20 %	0 %	60 %	20 %	386000839
98	NC_017527	TCGAG	2	10	133992	134001	20 %	20 %	40 %	20 %	386000841
99	NC_017527	CGGGG	2	10	136110	136119	0 %	0 %	80 %	20 %	386000843
100	NC_017527	AATAA	2	10	140035	140044	80 %	20 %	0 %	0 %	386000846
101	NC_017527	GATCT	2	10	142285	142294	20 %	40 %	20 %	20 %	386000847
102	NC_017527	CGAGG	2	10	145128	145137	20 %	0 %	60 %	20 %	386000850
103	NC_017527	AGGGA	2	10	146894	146903	40 %	0 %	60 %	0 %	386000851
104	NC_017527	CGGAC	2	10	150870	150879	20 %	0 %	40 %	40 %	386000855
105	NC_017527	CGAGG	2	10	151330	151339	20 %	0 %	60 %	20 %	386000855
106	NC_017527	GTAGG	2	10	160165	160174	20 %	20 %	60 %	0 %	386000862
107	NC_017527	GTCCC	2	10	161051	161060	0 %	20 %	20 %	60 %	386000862
108	NC_017527	CCTCG	2	10	164921	164930	0 %	20 %	20 %	60 %	386000867
109	NC_017527	TAGGC	2	10	166212	166221	20 %	20 %	40 %	20 %	386000867
110	NC_017527	GAAGA	2	10	169333	169342	60 %	0 %	40 %	0 %	386000869
111	NC_017527	AGGAG	2	10	170217	170226	40 %	0 %	60 %	0 %	386000869
112	NC_017527	CCGGC	2	10	173097	173106	0 %	0 %	40 %	60 %	386000872
113	NC_017527	GAAGA	2	10	174962	174971	60 %	0 %	40 %	0 %	386000874
114	NC_017527	CTTCG	2	10	177467	177476	0 %	40 %	20 %	40 %	386000877
115	NC_017527	ATATC	2	10	177625	177634	40 %	40 %	0 %	20 %	386000878
116	NC_017527	CCCCG	2	10	179241	179250	0 %	0 %	20 %	80 %	386000879
117	NC_017527	CGAGG	2	10	179499	179508	20 %	0 %	60 %	20 %	386000879
118	NC_017527	GCCCC	2	10	180210	180219	0 %	0 %	20 %	80 %	386000881
119	NC_017527	GGACC	2	10	180995	181004	20 %	0 %	40 %	40 %	386000883
120	NC_017527	CCTTC	2	10	181212	181221	0 %	40 %	0 %	60 %	386000883
121	NC_017527	GCCGA	2	10	182723	182732	20 %	0 %	40 %	40 %	386000883
122	NC_017527	CGAGG	2	10	184063	184072	20 %	0 %	60 %	20 %	386000884
123	NC_017527	CAATC	2	10	186076	186085	40 %	20 %	0 %	40 %	386000886
124	NC_017527	TCTCC	2	10	187946	187955	0 %	40 %	0 %	60 %	386000887
125	NC_017527	GGGCG	2	10	190015	190024	0 %	0 %	80 %	20 %	386000891
126	NC_017527	GAGCT	2	10	191352	191361	20 %	20 %	40 %	20 %	386000892
127	NC_017527	CGTCG	2	10	195135	195144	0 %	20 %	40 %	40 %	386000896
128	NC_017527	AGGAG	2	10	197073	197082	40 %	0 %	60 %	0 %	386000899
129	NC_017527	CGGCC	2	10	197329	197338	0 %	0 %	40 %	60 %	386000899
130	NC_017527	GATCG	2	10	199733	199742	20 %	20 %	40 %	20 %	386000902
131	NC_017527	CCGAG	2	10	206426	206435	20 %	0 %	40 %	40 %	386000908
132	NC_017527	ACGCC	2	10	207960	207969	20 %	0 %	20 %	60 %	386000910
133	NC_017527	GGAGG	2	10	208771	208780	20 %	0 %	80 %	0 %	386000911
134	NC_017527	GGCCC	2	10	210812	210821	0 %	0 %	40 %	60 %	386000913
135	NC_017527	CCGGA	2	10	211199	211208	20 %	0 %	40 %	40 %	386000914
136	NC_017527	GCGGG	2	10	212919	212928	0 %	0 %	80 %	20 %	386000915
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