MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 5457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017527	CCGG	2	8	281	288	0 %	0 %	50 %	50 %	386000718
2	NC_017527	CGTC	2	8	1108	1115	0 %	25 %	25 %	50 %	386000718
3	NC_017527	CGAT	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	386000718
4	NC_017527	CCAG	2	8	2409	2416	25 %	0 %	25 %	50 %	386000718
5	NC_017527	GGAT	2	8	2661	2668	25 %	25 %	50 %	0 %	386000718
6	NC_017527	TCGG	2	8	2724	2731	0 %	25 %	50 %	25 %	386000718
7	NC_017527	AGGA	2	8	2799	2806	50 %	0 %	50 %	0 %	386000718
8	NC_017527	GCCA	2	8	3466	3473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017527	TGAG	2	8	4735	4742	25 %	25 %	50 %	0 %	386000719
10	NC_017527	GAGG	2	8	5505	5512	25 %	0 %	75 %	0 %	386000720
11	NC_017527	CCGG	2	8	7626	7633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017527	CCCG	2	8	7811	7818	0 %	0 %	25 %	75 %	386000722
13	NC_017527	TCGG	2	8	9177	9184	0 %	25 %	50 %	25 %	386000723
14	NC_017527	TGGA	2	8	10205	10212	25 %	25 %	50 %	0 %	386000724
15	NC_017527	TCCA	2	8	10303	10310	25 %	25 %	0 %	50 %	386000724
16	NC_017527	GACG	2	8	10487	10494	25 %	0 %	50 %	25 %	386000724
17	NC_017527	CCGG	2	8	11222	11229	0 %	0 %	50 %	50 %	386000725
18	NC_017527	CCTC	2	8	13272	13279	0 %	25 %	0 %	75 %	386000728
19	NC_017527	CCGG	2	8	15659	15666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017527	CCGG	2	8	15767	15774	0 %	0 %	50 %	50 %	386000731
21	NC_017527	CGGG	2	8	15778	15785	0 %	0 %	75 %	25 %	386000731
22	NC_017527	CCCT	2	8	17997	18004	0 %	25 %	0 %	75 %	386000733
23	NC_017527	CCCT	2	8	18551	18558	0 %	25 %	0 %	75 %	386000734
24	NC_017527	CGGT	2	8	18869	18876	0 %	25 %	50 %	25 %	386000734
25	NC_017527	GACC	2	8	19225	19232	25 %	0 %	25 %	50 %	386000734
26	NC_017527	TCGA	2	8	19803	19810	25 %	25 %	25 %	25 %	386000735
27	NC_017527	CCTC	2	8	19841	19848	0 %	25 %	0 %	75 %	386000735
28	NC_017527	GAAG	2	8	20368	20375	50 %	0 %	50 %	0 %	386000735
29	NC_017527	GGAG	2	8	20517	20524	25 %	0 %	75 %	0 %	386000735
30	NC_017527	TCCA	2	8	20709	20716	25 %	25 %	0 %	50 %	386000735
31	NC_017527	AGGC	2	8	20814	20821	25 %	0 %	50 %	25 %	386000735
32	NC_017527	GGGC	2	8	20955	20962	0 %	0 %	75 %	25 %	386000735
33	NC_017527	GGGT	2	8	21724	21731	0 %	25 %	75 %	0 %	386000736
34	NC_017527	AGGG	2	8	23474	23481	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017527	GGGC	2	8	23514	23521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017527	CCCG	2	8	25515	25522	0 %	0 %	25 %	75 %	386000739
37	NC_017527	AGGG	2	8	27442	27449	25 %	0 %	75 %	0 %	386000740
38	NC_017527	GGGA	2	8	27559	27566	25 %	0 %	75 %	0 %	386000740
39	NC_017527	GGGA	2	8	28572	28579	25 %	0 %	75 %	0 %	386000741
40	NC_017527	GATC	2	8	28906	28913	25 %	25 %	25 %	25 %	386000741
41	NC_017527	GATC	2	8	29715	29722	25 %	25 %	25 %	25 %	386000742
42	NC_017527	CCTT	2	8	30356	30363	0 %	50 %	0 %	50 %	386000743
43	NC_017527	CCTC	2	8	33842	33849	0 %	25 %	0 %	75 %	386000746
44	NC_017527	TCCA	2	8	37779	37786	25 %	25 %	0 %	50 %	386000750
45	NC_017527	GGAA	2	8	39289	39296	50 %	0 %	50 %	0 %	386000751
46	NC_017527	TATC	2	8	39721	39728	25 %	50 %	0 %	25 %	386000751
47	NC_017527	GGAT	2	8	40026	40033	25 %	25 %	50 %	0 %	386000752
48	NC_017527	CCTC	2	8	40203	40210	0 %	25 %	0 %	75 %	386000752
49	NC_017527	GGGA	2	8	40879	40886	25 %	0 %	75 %	0 %	386000753
50	NC_017527	GCCC	2	8	41097	41104	0 %	0 %	25 %	75 %	386000753
51	NC_017527	GGGA	2	8	41314	41321	25 %	0 %	75 %	0 %	386000753
52	NC_017527	CCGG	2	8	41475	41482	0 %	0 %	50 %	50 %	386000753
53	NC_017527	GCTG	2	8	41989	41996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017527	TCCC	2	8	42268	42275	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_017527	CGAT	2	8	42411	42418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017527	TGGC	2	8	42901	42908	0 %	25 %	50 %	25 %	386000754
57	NC_017527	GCCG	2	8	43471	43478	0 %	0 %	50 %	50 %	386000754
58	NC_017527	GATT	2	8	43871	43878	25 %	50 %	25 %	0 %	386000754
59	NC_017527	AACC	2	8	44030	44037	50 %	0 %	0 %	50 %	386000754
60	NC_017527	GGAA	2	8	44898	44905	50 %	0 %	50 %	0 %	386000754
61	NC_017527	ATCC	2	8	45775	45782	25 %	25 %	0 %	50 %	386000755
62	NC_017527	ATGA	2	8	46334	46341	50 %	25 %	25 %	0 %	386000755
63	NC_017527	TCGA	2	8	46703	46710	25 %	25 %	25 %	25 %	386000755
64	NC_017527	GCCA	2	8	47063	47070	25 %	0 %	25 %	50 %	386000755
65	NC_017527	GCCA	2	8	47198	47205	25 %	0 %	25 %	50 %	386000755
66	NC_017527	AAAT	2	8	48009	48016	75 %	25 %	0 %	0 %	386000755
67	NC_017527	AAGG	2	8	48152	48159	50 %	0 %	50 %	0 %	386000755
68	NC_017527	TGGC	2	8	48410	48417	0 %	25 %	50 %	25 %	386000755
69	NC_017527	ACCC	2	8	48490	48497	25 %	0 %	0 %	75 %	386000755
70	NC_017527	GCCC	2	8	48579	48586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_017527	ATCG	2	8	51612	51619	25 %	25 %	25 %	25 %	386000759
72	NC_017527	GATC	2	8	53146	53153	25 %	25 %	25 %	25 %	386000760
73	NC_017527	GCCC	2	8	54095	54102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_017527	TTTA	2	8	54563	54570	25 %	75 %	0 %	0 %	386000763
75	NC_017527	AGGA	2	8	54778	54785	50 %	0 %	50 %	0 %	386000763
76	NC_017527	GAAG	2	8	54815	54822	50 %	0 %	50 %	0 %	386000763
77	NC_017527	CGGG	2	8	54891	54898	0 %	0 %	75 %	25 %	386000763
78	NC_017527	CGGC	2	8	56454	56461	0 %	0 %	50 %	50 %	386000764
79	NC_017527	GGCA	2	8	56821	56828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017527	GAAT	2	8	58675	58682	50 %	25 %	25 %	0 %	386000765
81	NC_017527	AGGG	2	8	58956	58963	25 %	0 %	75 %	0 %	386000765
82	NC_017527	GCGA	2	8	59171	59178	25 %	0 %	50 %	25 %	386000765
83	NC_017527	GGCT	2	8	59877	59884	0 %	25 %	50 %	25 %	386000766
84	NC_017527	GGCG	2	8	59894	59901	0 %	0 %	75 %	25 %	386000766
85	NC_017527	CGCC	2	8	59937	59944	0 %	0 %	25 %	75 %	386000766
86	NC_017527	GGTC	2	8	60455	60462	0 %	25 %	50 %	25 %	386000766
87	NC_017527	CAGG	2	8	60513	60520	25 %	0 %	50 %	25 %	386000766
88	NC_017527	CCGG	2	8	60762	60769	0 %	0 %	50 %	50 %	386000766
89	NC_017527	GATC	2	8	60994	61001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017527	ATCT	2	8	61271	61278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017527	AAAT	2	8	61805	61812	75 %	25 %	0 %	0 %	386000768
92	NC_017527	GCAA	2	8	61926	61933	50 %	0 %	25 %	25 %	386000768
93	NC_017527	TGGA	2	8	62303	62310	25 %	25 %	50 %	0 %	386000768
94	NC_017527	GTCG	2	8	62654	62661	0 %	25 %	50 %	25 %	386000769
95	NC_017527	CCCG	2	8	62679	62686	0 %	0 %	25 %	75 %	386000769
96	NC_017527	GACC	2	8	63065	63072	25 %	0 %	25 %	50 %	386000769
97	NC_017527	AGGA	2	8	63114	63121	50 %	0 %	50 %	0 %	386000769
98	NC_017527	GGCG	2	8	63184	63191	0 %	0 %	75 %	25 %	386000769
99	NC_017527	CTTC	2	8	63221	63228	0 %	50 %	0 %	50 %	386000769
100	NC_017527	GGTC	2	8	63573	63580	0 %	25 %	50 %	25 %	386000770
101	NC_017527	CCGG	2	8	63840	63847	0 %	0 %	50 %	50 %	386000770
102	NC_017527	CTCG	2	8	64699	64706	0 %	25 %	25 %	50 %	386000770
103	NC_017527	CGGG	2	8	65672	65679	0 %	0 %	75 %	25 %	386000772
104	NC_017527	CTGG	2	8	65686	65693	0 %	25 %	50 %	25 %	386000772
105	NC_017527	TGCC	2	8	65772	65779	0 %	25 %	25 %	50 %	386000772
106	NC_017527	GTCG	2	8	66882	66889	0 %	25 %	50 %	25 %	386000775
107	NC_017527	AACG	2	8	67115	67122	50 %	0 %	25 %	25 %	386000776
108	NC_017527	GCCC	2	8	67331	67338	0 %	0 %	25 %	75 %	386000776
109	NC_017527	GAGG	2	8	68783	68790	25 %	0 %	75 %	0 %	386000777
110	NC_017527	TCCA	2	8	69433	69440	25 %	25 %	0 %	50 %	386000778
111	NC_017527	GAGG	2	8	69496	69503	25 %	0 %	75 %	0 %	386000778
112	NC_017527	TCCT	2	8	69901	69908	0 %	50 %	0 %	50 %	386000779
113	NC_017527	GAAG	2	8	70135	70142	50 %	0 %	50 %	0 %	386000780
114	NC_017527	CCCT	2	8	70405	70412	0 %	25 %	0 %	75 %	386000781
115	NC_017527	GCCG	2	8	70569	70576	0 %	0 %	50 %	50 %	386000781
116	NC_017527	CTTC	2	8	70890	70897	0 %	50 %	0 %	50 %	386000781
117	NC_017527	CCGG	2	8	70972	70979	0 %	0 %	50 %	50 %	386000781
118	NC_017527	ACCC	2	8	71518	71525	25 %	0 %	0 %	75 %	386000782
119	NC_017527	CGGC	2	8	71786	71793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017527	CTGG	2	8	71903	71910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017527	CGGC	2	8	72829	72836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017527	GGCT	2	8	72875	72882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017527	GATC	2	8	73827	73834	25 %	25 %	25 %	25 %	386000785
124	NC_017527	AGGA	2	8	73964	73971	50 %	0 %	50 %	0 %	386000785
125	NC_017527	CTGC	2	8	75082	75089	0 %	25 %	25 %	50 %	386000785
126	NC_017527	AGGA	2	8	75146	75153	50 %	0 %	50 %	0 %	386000785
127	NC_017527	AGGG	2	8	76133	76140	25 %	0 %	75 %	0 %	386000785
128	NC_017527	TATC	2	8	78323	78330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017527	GAAT	2	8	78385	78392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017527	GCGG	2	8	80109	80116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017527	GGGC	2	8	80137	80144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017527	TCCA	2	8	80174	80181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017527	GCGG	2	8	80187	80194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017527	GCCT	2	8	80281	80288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017527	CAGC	2	8	80309	80316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017527	AATA	2	8	81044	81051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017527	GACC	2	8	81415	81422	25 %	0 %	25 %	50 %	386000790
138	NC_017527	TGGG	2	8	81747	81754	0 %	25 %	75 %	0 %	386000790
139	NC_017527	CCAC	2	8	83317	83324	25 %	0 %	0 %	75 %	386000791
140	NC_017527	TCGG	2	8	83924	83931	0 %	25 %	50 %	25 %	386000791
141	NC_017527	CGGG	2	8	83940	83947	0 %	0 %	75 %	25 %	386000791
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143	NC_017527	TGGA	2	8	84588	84595	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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