MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 1102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017527	GCCA	2	8	3466	3473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017527	CCGG	2	8	7626	7633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017527	CCGG	2	8	15659	15666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017527	AGGG	2	8	23474	23481	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017527	GGGC	2	8	23514	23521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017527	GCTG	2	8	41989	41996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017527	TCCC	2	8	42268	42275	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_017527	CGAT	2	8	42411	42418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017527	GCCC	2	8	48579	48586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017527	GCCC	2	8	54095	54102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017527	GGCA	2	8	56821	56828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017527	GATC	2	8	60994	61001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017527	ATCT	2	8	61271	61278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017527	CGGC	2	8	71786	71793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017527	CTGG	2	8	71903	71910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017527	CGGC	2	8	72829	72836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017527	GGCT	2	8	72875	72882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017527	TATC	2	8	78323	78330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017527	GAAT	2	8	78385	78392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017527	GCGG	2	8	80109	80116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017527	GGGC	2	8	80137	80144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017527	TCCA	2	8	80174	80181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017527	GCGG	2	8	80187	80194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017527	GCCT	2	8	80281	80288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017527	CAGC	2	8	80309	80316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017527	AATA	2	8	81044	81051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017527	TGGA	2	8	84588	84595	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017527	GACG	2	8	85230	85237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017527	GATG	2	8	85248	85255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017527	CGGG	2	8	96841	96848	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017527	ATTT	2	8	98614	98621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017527	TTAT	2	8	100349	100356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017527	AATA	2	8	101358	101365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017527	CGTA	2	8	101396	101403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017527	CCTC	2	8	103445	103452	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_017527	CCGG	2	8	103748	103755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017527	CCCG	2	8	111093	111100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017527	CGCC	2	8	111917	111924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017527	CCGC	2	8	116812	116819	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017527	GGCC	2	8	116926	116933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017527	AATA	2	8	120262	120269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017527	TAAT	3	12	137241	137252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017527	GACC	2	8	137679	137686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017527	TGAA	2	8	138982	138989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017527	TCAA	2	8	139147	139154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017527	GCAA	2	8	139333	139340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017527	ATCA	2	8	140910	140917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017527	TGAG	2	8	141192	141199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017527	CTGA	2	8	142723	142730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017527	GATG	2	8	142884	142891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017527	GCGG	2	8	142980	142987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017527	AGCC	2	8	143601	143608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017527	CGGA	2	8	143667	143674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017527	CCCG	2	8	146475	146482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_017527	CTTC	2	8	146501	146508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017527	GATG	2	8	146754	146761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017527	CCCG	2	8	147065	147072	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017527	CCGA	2	8	153669	153676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017527	TCGC	2	8	153714	153721	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017527	ACTA	2	8	155790	155797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017527	GAAC	2	8	156053	156060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017527	GGAT	2	8	156083	156090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017527	TTGA	2	8	159685	159692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017527	CATT	2	8	159887	159894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017527	AGGG	2	8	167610	167617	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017527	GATC	2	8	172358	172365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017527	GATC	2	8	173575	173582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017527	ACGA	2	8	174694	174701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017527	GCTG	2	8	175527	175534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017527	CCTT	2	8	180332	180339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017527	GATA	2	8	183187	183194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017527	CGGC	2	8	184971	184978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017527	ATCG	2	8	188753	188760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017527	CAGG	2	8	190371	190378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017527	GATC	2	8	190906	190913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017527	CCAG	2	8	191083	191090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017527	TGGG	2	8	191325	191332	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017527	ATGA	2	8	191646	191653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017527	GATG	2	8	193615	193622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017527	GAGG	2	8	201375	201382	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017527	CTCC	2	8	204441	204448	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017527	CCAC	2	8	204489	204496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017527	GAGG	2	8	204664	204671	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017527	GAGG	2	8	205706	205713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017527	TCGA	2	8	205918	205925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017527	CTTC	2	8	207734	207741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017527	CCCT	2	8	207748	207755	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_017527	AACC	2	8	207814	207821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017527	GAGG	2	8	213583	213590	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017527	AGGA	2	8	216062	216069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017527	TGAT	2	8	216090	216097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017527	AAAG	2	8	216410	216417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017527	TCAT	2	8	217128	217135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017527	ATAA	2	8	217521	217528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017527	TAAA	2	8	217849	217856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017527	CCGG	2	8	220616	220623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017527	TCGC	2	8	226025	226032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017527	CGCC	2	8	232981	232988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017527	TATC	2	8	236113	236120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017527	GGAG	2	8	238511	238518	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017527	ATTC	2	8	239665	239672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017527	TTTC	2	8	239819	239826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017527	ATTA	2	8	240376	240383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017527	GATC	2	8	242535	242542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017527	GATC	2	8	244808	244815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017527	AGGT	2	8	247041	247048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017527	GTTC	2	8	247377	247384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017527	TAAA	2	8	249155	249162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017527	CTAC	2	8	249241	249248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017527	TAAA	2	8	249333	249340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017527	TGGC	2	8	252327	252334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017527	CCCG	2	8	257919	257926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_017527	GAGG	2	8	259987	259994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017527	AAGA	2	8	260260	260267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017527	AACC	2	8	260298	260305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017527	GGTT	2	8	260901	260908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017527	GAAA	2	8	261743	261750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017527	TATT	2	8	262838	262845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017527	GGAG	2	8	263356	263363	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017527	AGAA	2	8	263438	263445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017527	CCAA	2	8	272229	272236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017527	CTCC	2	8	272609	272616	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_017527	CCTT	2	8	276303	276310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017527	CATC	2	8	276430	276437	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017527	GGAG	2	8	276808	276815	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017527	TTGC	2	8	276931	276938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017527	CCCG	2	8	280049	280056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_017527	TTTC	2	8	281839	281846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017527	CCCG	2	8	281871	281878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017527	AAAG	2	8	281925	281932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017527	CAAG	2	8	286532	286539	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017527	TCAC	2	8	288536	288543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017527	TGGA	2	8	291289	291296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017527	GGAA	2	8	291379	291386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017527	TGGT	2	8	292079	292086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017527	TTCA	2	8	292108	292115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017527	GCTG	2	8	292360	292367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017527	CGGA	2	8	298790	298797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017527	ATCT	2	8	298822	298829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017527	AGGT	2	8	300112	300119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017527	GGCG	2	8	302976	302983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017527	GGGA	2	8	310722	310729	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017527	CGAT	2	8	322064	322071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017527	CACC	2	8	325834	325841	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_017527	GATC	2	8	332619	332626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017527	TAAA	2	8	334185	334192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017527	TATT	2	8	334452	334459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017527	TACA	2	8	335437	335444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017527	TCCC	2	8	335798	335805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_017527	GTCC	2	8	335809	335816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017527	CCGC	2	8	335855	335862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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