MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 46180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017527	TCC	2	6	71	76	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
2	NC_017527	GAC	2	6	230	235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
3	NC_017527	TGC	2	6	291	296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
4	NC_017527	GCG	2	6	331	336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
5	NC_017527	ATC	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000718
6	NC_017527	GAC	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
7	NC_017527	CCG	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000718
8	NC_017527	GCA	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
9	NC_017527	GCC	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000718
10	NC_017527	CCA	2	6	697	702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000718
11	NC_017527	CGA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
12	NC_017527	CGG	2	6	797	802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
13	NC_017527	GCG	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
14	NC_017527	CGT	2	6	844	849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
15	NC_017527	TCT	2	6	886	891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000718
16	NC_017527	CGA	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
17	NC_017527	AGT	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000718
18	NC_017527	TCG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
19	NC_017527	TCC	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
20	NC_017527	ACC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000718
21	NC_017527	CTC	2	6	1175	1180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
22	NC_017527	CCT	2	6	1219	1224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
23	NC_017527	CGA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
24	NC_017527	GTC	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
25	NC_017527	CTC	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
26	NC_017527	ACG	3	9	1404	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
27	NC_017527	GCC	2	6	1428	1433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000718
28	NC_017527	CGA	2	6	1439	1444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
29	NC_017527	TCG	2	6	1461	1466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
30	NC_017527	GAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
31	NC_017527	TCG	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
32	NC_017527	AGG	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000718
33	NC_017527	TTC	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000718
34	NC_017527	CCT	2	6	1711	1716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
35	NC_017527	GTT	2	6	1748	1753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000718
36	NC_017527	GTC	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
37	NC_017527	TCA	2	6	1798	1803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000718
38	NC_017527	TCC	2	6	1899	1904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
39	NC_017527	GAT	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000718
40	NC_017527	GAG	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000718
41	NC_017527	CTG	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
42	NC_017527	CAC	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000718
43	NC_017527	GGC	2	6	2337	2342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
44	NC_017527	TCT	2	6	2382	2387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000718
45	NC_017527	CCT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
46	NC_017527	TAA	2	6	2496	2501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386000718
47	NC_017527	CTC	2	6	2524	2529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000718
48	NC_017527	CAG	2	6	2535	2540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000718
49	NC_017527	GTC	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000718
50	NC_017527	GAG	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000718
51	NC_017527	GGC	2	6	2688	2693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
52	NC_017527	ACC	2	6	2712	2717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000718
53	NC_017527	GGA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000718
54	NC_017527	TGA	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000718
55	NC_017527	GGC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
56	NC_017527	GTT	2	6	3119	3124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000718
57	NC_017527	CTT	2	6	3139	3144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000718
58	NC_017527	CGG	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
59	NC_017527	CGG	2	6	3197	3202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000718
60	NC_017527	GAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000719
61	NC_017527	CCG	2	6	3813	3818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000719
62	NC_017527	ATC	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000719
63	NC_017527	GCT	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000719
64	NC_017527	ATG	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000719
65	NC_017527	TGT	2	6	4415	4420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000719
66	NC_017527	AAG	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000719
67	NC_017527	CAT	2	6	4481	4486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000719
68	NC_017527	GAG	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000719
69	NC_017527	GAA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000719
70	NC_017527	CCA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000719
71	NC_017527	TTG	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000719
72	NC_017527	CCA	2	6	4709	4714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000719
73	NC_017527	ATC	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000719
74	NC_017527	CCG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000719
75	NC_017527	AAT	2	6	4827	4832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386000719
76	NC_017527	TAG	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000720
77	NC_017527	CGT	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000720
78	NC_017527	GCT	2	6	5189	5194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000720
79	NC_017527	GGC	2	6	5238	5243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000720
80	NC_017527	CTT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000720
81	NC_017527	TCG	2	6	5351	5356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000720
82	NC_017527	TCG	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000720
83	NC_017527	GAT	3	9	5415	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000720
84	NC_017527	CGG	2	6	5453	5458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000720
85	NC_017527	TCT	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000720
86	NC_017527	TCA	2	6	5567	5572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000720
87	NC_017527	CCA	2	6	5651	5656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000720
88	NC_017527	CGC	2	6	5690	5695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000720
89	NC_017527	GAT	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000720
90	NC_017527	ATG	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000720
91	NC_017527	GGC	2	6	5772	5777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000720
92	NC_017527	CTC	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000720
93	NC_017527	GGA	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000720
94	NC_017527	TCT	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000720
95	NC_017527	GAC	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000720
96	NC_017527	AGG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000720
97	NC_017527	TCA	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000720
98	NC_017527	TCC	2	6	5956	5961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000720
99	NC_017527	ATC	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000720
100	NC_017527	GGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000720
101	NC_017527	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000720
102	NC_017527	GGA	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000720
103	NC_017527	GCC	2	6	6412	6417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000721
104	NC_017527	CGG	2	6	6425	6430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000721
105	NC_017527	GAG	2	6	6441	6446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000721
106	NC_017527	GCA	2	6	6470	6475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000721
107	NC_017527	AGG	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000721
108	NC_017527	CAT	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000721
109	NC_017527	CAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000721
110	NC_017527	CCG	2	6	6602	6607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000721
111	NC_017527	AAG	2	6	6616	6621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000721
112	NC_017527	CCA	2	6	6641	6646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000721
113	NC_017527	TGG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000721
114	NC_017527	GGA	2	6	6843	6848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000721
115	NC_017527	ACC	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000721
116	NC_017527	CGC	2	6	6912	6917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000721
117	NC_017527	GCG	2	6	7010	7015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000721
118	NC_017527	TCG	3	9	7231	7239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000721
119	NC_017527	GCC	2	6	7266	7271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000721
120	NC_017527	TCC	2	6	7309	7314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000721
121	NC_017527	ACG	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000721
122	NC_017527	TCC	2	6	7468	7473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000721
123	NC_017527	TCG	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000721
124	NC_017527	GGC	2	6	7497	7502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000721
125	NC_017527	GCC	2	6	7507	7512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000721
126	NC_017527	GGC	2	6	7518	7523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000721
127	NC_017527	GGA	2	6	7672	7677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000722
128	NC_017527	GGC	2	6	7717	7722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000722
129	NC_017527	TGT	2	6	7836	7841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386000722
130	NC_017527	GCC	2	6	7871	7876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000722
131	NC_017527	TCT	2	6	7914	7919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000722
132	NC_017527	GGC	3	9	7942	7950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000722
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135	NC_017527	CGT	2	6	8080	8085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000722
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