MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 3098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	385996773
2	NC_017524	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	385996774
3	NC_017524	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	385996774
4	NC_017524	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	385996776
5	NC_017524	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	385996778
6	NC_017524	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	385996778
7	NC_017524	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	385996778
8	NC_017524	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	385996779
9	NC_017524	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	385996779
10	NC_017524	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	385996784
11	NC_017524	GGGCC	2	10	14437	14446	0 %	0 %	60 %	40 %	385996784
12	NC_017524	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	385996785
13	NC_017524	CCAGC	2	10	15722	15731	20 %	0 %	20 %	60 %	385996786
14	NC_017524	ACCGA	2	10	16485	16494	40 %	0 %	20 %	40 %	385996786
15	NC_017524	ATCGG	2	10	16877	16886	20 %	20 %	40 %	20 %	385996786
16	NC_017524	CGGCC	2	10	17886	17895	0 %	0 %	40 %	60 %	385996787
17	NC_017524	TTAGC	2	10	19037	19046	20 %	40 %	20 %	20 %	385996788
18	NC_017524	GGTCC	2	10	19109	19118	0 %	20 %	40 %	40 %	385996788
19	NC_017524	GTCGT	2	10	21628	21637	0 %	40 %	40 %	20 %	385996789
20	NC_017524	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	385996792
21	NC_017524	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	385996792
22	NC_017524	GGCAA	2	10	29301	29310	40 %	0 %	40 %	20 %	385996797
23	NC_017524	CGATC	2	10	30127	30136	20 %	20 %	20 %	40 %	385996798
24	NC_017524	CGACG	2	10	32310	32319	20 %	0 %	40 %	40 %	385996801
25	NC_017524	GCGTC	2	10	32365	32374	0 %	20 %	40 %	40 %	385996801
26	NC_017524	GACAC	2	10	32462	32471	40 %	0 %	20 %	40 %	385996801
27	NC_017524	TCCTG	2	10	37468	37477	0 %	40 %	20 %	40 %	385996806
28	NC_017524	CTCGG	2	10	37561	37570	0 %	20 %	40 %	40 %	385996806
29	NC_017524	GGCGC	2	10	38104	38113	0 %	0 %	60 %	40 %	385996806
30	NC_017524	TGGCC	2	10	38252	38261	0 %	20 %	40 %	40 %	385996806
31	NC_017524	CGGCG	2	10	38784	38793	0 %	0 %	60 %	40 %	385996806
32	NC_017524	GTCCA	2	10	39396	39405	20 %	20 %	20 %	40 %	385996807
33	NC_017524	GCCAA	2	10	41530	41539	40 %	0 %	20 %	40 %	385996809
34	NC_017524	GCACA	2	10	42329	42338	40 %	0 %	20 %	40 %	385996810
35	NC_017524	GGTAC	2	10	44863	44872	20 %	20 %	40 %	20 %	385996812
36	NC_017524	TCGAA	2	10	45095	45104	40 %	20 %	20 %	20 %	385996812
37	NC_017524	GCACC	2	10	46025	46034	20 %	0 %	20 %	60 %	385996812
38	NC_017524	CGGTG	2	10	47059	47068	0 %	20 %	60 %	20 %	385996813
39	NC_017524	TCATG	2	10	47205	47214	20 %	40 %	20 %	20 %	385996813
40	NC_017524	GCAGC	2	10	48599	48608	20 %	0 %	40 %	40 %	385996815
41	NC_017524	CCCGA	2	10	48682	48691	20 %	0 %	20 %	60 %	385996815
42	NC_017524	CAGCG	2	10	49807	49816	20 %	0 %	40 %	40 %	385996816
43	NC_017524	CTCCC	2	10	56241	56250	0 %	20 %	0 %	80 %	385996822
44	NC_017524	CGGCG	2	10	56690	56699	0 %	0 %	60 %	40 %	385996822
45	NC_017524	CGACC	2	10	58222	58231	20 %	0 %	20 %	60 %	385996824
46	NC_017524	CTTCG	2	10	58909	58918	0 %	40 %	20 %	40 %	385996825
47	NC_017524	CGGTG	2	10	59965	59974	0 %	20 %	60 %	20 %	385996828
48	NC_017524	TCAGG	2	10	62451	62460	20 %	20 %	40 %	20 %	385996829
49	NC_017524	GGCGA	2	10	66414	66423	20 %	0 %	60 %	20 %	385996833
50	NC_017524	GGTGT	2	10	68990	68999	0 %	40 %	60 %	0 %	385996835
51	NC_017524	ATCGG	2	10	69627	69636	20 %	20 %	40 %	20 %	385996835
52	NC_017524	CCGCG	2	10	70164	70173	0 %	0 %	40 %	60 %	385996835
53	NC_017524	GGCAA	2	10	70515	70524	40 %	0 %	40 %	20 %	385996835
54	NC_017524	CGACC	2	10	70804	70813	20 %	0 %	20 %	60 %	385996835
55	NC_017524	CGGGT	2	10	71258	71267	0 %	20 %	60 %	20 %	385996835
56	NC_017524	GGTCG	2	10	71318	71327	0 %	20 %	60 %	20 %	385996835
57	NC_017524	TGCCT	2	10	72059	72068	0 %	40 %	20 %	40 %	385996836
58	NC_017524	GTCCA	2	10	72930	72939	20 %	20 %	20 %	40 %	385996837
59	NC_017524	TGACC	2	10	75554	75563	20 %	20 %	20 %	40 %	385996839
60	NC_017524	GCCAA	2	10	75868	75877	40 %	0 %	20 %	40 %	385996839
61	NC_017524	GTCGC	2	10	75945	75954	0 %	20 %	40 %	40 %	385996839
62	NC_017524	GCGCG	2	10	77033	77042	0 %	0 %	60 %	40 %	385996840
63	NC_017524	CACGA	2	10	79881	79890	40 %	0 %	20 %	40 %	385996842
64	NC_017524	GAGCA	2	10	82419	82428	40 %	0 %	40 %	20 %	385996844
65	NC_017524	GCCGG	2	10	82518	82527	0 %	0 %	60 %	40 %	385996844
66	NC_017524	GCGAC	2	10	82594	82603	20 %	0 %	40 %	40 %	385996844
67	NC_017524	ATCCG	2	10	83364	83373	20 %	20 %	20 %	40 %	385996845
68	NC_017524	CACCG	2	10	84144	84153	20 %	0 %	20 %	60 %	385996846
69	NC_017524	TGGTC	2	10	86279	86288	0 %	40 %	40 %	20 %	385996848
70	NC_017524	GCTGG	2	10	86916	86925	0 %	20 %	60 %	20 %	385996849
71	NC_017524	TGGGT	2	10	89954	89963	0 %	40 %	60 %	0 %	385996854
72	NC_017524	TCGCC	2	10	90161	90170	0 %	20 %	20 %	60 %	385996854
73	NC_017524	GGGCC	2	10	91134	91143	0 %	0 %	60 %	40 %	385996855
74	NC_017524	GGCCG	2	10	92453	92462	0 %	0 %	60 %	40 %	385996856
75	NC_017524	GCGCC	2	10	93105	93114	0 %	0 %	40 %	60 %	385996856
76	NC_017524	GCTTG	2	10	95137	95146	0 %	40 %	40 %	20 %	385996858
77	NC_017524	CGTGT	2	10	95569	95578	0 %	40 %	40 %	20 %	385996859
78	NC_017524	AGATC	2	10	95648	95657	40 %	20 %	20 %	20 %	385996859
79	NC_017524	CGGCG	2	10	99229	99238	0 %	0 %	60 %	40 %	385996862
80	NC_017524	GCGGT	2	10	100305	100314	0 %	20 %	60 %	20 %	385996863
81	NC_017524	GCGCC	2	10	103137	103146	0 %	0 %	40 %	60 %	385996865
82	NC_017524	GGTGG	2	10	103825	103834	0 %	20 %	80 %	0 %	385996866
83	NC_017524	GGCTT	2	10	104838	104847	0 %	40 %	40 %	20 %	385996867
84	NC_017524	CTGGC	2	10	105560	105569	0 %	20 %	40 %	40 %	385996868
85	NC_017524	GCACA	2	10	106681	106690	40 %	0 %	20 %	40 %	385996868
86	NC_017524	CTGAA	2	10	109011	109020	40 %	20 %	20 %	20 %	385996871
87	NC_017524	ATCGC	2	10	109506	109515	20 %	20 %	20 %	40 %	385996871
88	NC_017524	TCTGA	2	10	110840	110849	20 %	40 %	20 %	20 %	385996873
89	NC_017524	CGGTC	2	10	111115	111124	0 %	20 %	40 %	40 %	385996873
90	NC_017524	GACCA	2	10	112253	112262	40 %	0 %	20 %	40 %	385996873
91	NC_017524	GGCTG	2	10	114817	114826	0 %	20 %	60 %	20 %	385996873
92	NC_017524	CCGCG	2	10	118737	118746	0 %	0 %	40 %	60 %	385996874
93	NC_017524	TCGTG	2	10	122690	122699	0 %	40 %	40 %	20 %	385996876
94	NC_017524	CCGGA	2	10	124471	124480	20 %	0 %	40 %	40 %	385996878
95	NC_017524	TGCGC	2	10	126944	126953	0 %	20 %	40 %	40 %	385996879
96	NC_017524	GCGAG	2	10	127455	127464	20 %	0 %	60 %	20 %	385996879
97	NC_017524	GGGGT	2	10	128464	128473	0 %	20 %	80 %	0 %	385996879
98	NC_017524	CCCAC	2	10	129026	129035	20 %	0 %	0 %	80 %	385996879
99	NC_017524	CCGGC	2	10	129536	129545	0 %	0 %	40 %	60 %	385996879
100	NC_017524	TGCGG	2	10	129946	129955	0 %	20 %	60 %	20 %	385996879
101	NC_017524	ATCAC	2	10	131425	131434	40 %	20 %	0 %	40 %	385996881
102	NC_017524	ATCGG	2	10	131473	131482	20 %	20 %	40 %	20 %	385996881
103	NC_017524	CGGGC	2	10	132564	132573	0 %	0 %	60 %	40 %	385996881
104	NC_017524	GCGAT	2	10	134369	134378	20 %	20 %	40 %	20 %	385996883
105	NC_017524	GTTCG	2	10	134590	134599	0 %	40 %	40 %	20 %	385996883
106	NC_017524	CCTGG	2	10	134982	134991	0 %	20 %	40 %	40 %	385996883
107	NC_017524	GGCCC	2	10	135088	135097	0 %	0 %	40 %	60 %	385996883
108	NC_017524	CGTTG	2	10	135600	135609	0 %	40 %	40 %	20 %	385996883
109	NC_017524	CGACC	2	10	135672	135681	20 %	0 %	20 %	60 %	385996883
110	NC_017524	GAGAT	2	10	138692	138701	40 %	20 %	40 %	0 %	385996887
111	NC_017524	CGGCG	2	10	140846	140855	0 %	0 %	60 %	40 %	385996888
112	NC_017524	TGCGG	2	10	141479	141488	0 %	20 %	60 %	20 %	385996889
113	NC_017524	CGCTG	2	10	142186	142195	0 %	20 %	40 %	40 %	385996890
114	NC_017524	GTTGC	2	10	142732	142741	0 %	40 %	40 %	20 %	385996890
115	NC_017524	CCGAT	2	10	143480	143489	20 %	20 %	20 %	40 %	385996890
116	NC_017524	ATCGC	2	10	144171	144180	20 %	20 %	20 %	40 %	385996891
117	NC_017524	AACCG	2	10	144910	144919	40 %	0 %	20 %	40 %	385996891
118	NC_017524	CCGCC	2	10	145497	145506	0 %	0 %	20 %	80 %	385996891
119	NC_017524	CCGCC	2	10	146140	146149	0 %	0 %	20 %	80 %	385996892
120	NC_017524	ATCGG	2	10	149624	149633	20 %	20 %	40 %	20 %	385996896
121	NC_017524	TCGTC	2	10	154629	154638	0 %	40 %	20 %	40 %	385996899
122	NC_017524	CACGC	2	10	155093	155102	20 %	0 %	20 %	60 %	385996899
123	NC_017524	ATTCT	2	10	155937	155946	20 %	60 %	0 %	20 %	385996900
124	NC_017524	AGGCG	2	10	156465	156474	20 %	0 %	60 %	20 %	385996900
125	NC_017524	TGACC	2	10	159469	159478	20 %	20 %	20 %	40 %	385996903
126	NC_017524	CGGCG	2	10	159715	159724	0 %	0 %	60 %	40 %	385996903
127	NC_017524	GCACC	2	10	159885	159894	20 %	0 %	20 %	60 %	385996904
128	NC_017524	CCGCA	2	10	161063	161072	20 %	0 %	20 %	60 %	385996905
129	NC_017524	CGCGG	2	10	161142	161151	0 %	0 %	60 %	40 %	385996905
130	NC_017524	CGGTT	2	10	161469	161478	0 %	40 %	40 %	20 %	385996905
131	NC_017524	GCCGG	2	10	161930	161939	0 %	0 %	60 %	40 %	385996906
132	NC_017524	GCGCG	2	10	162052	162061	0 %	0 %	60 %	40 %	385996906
133	NC_017524	CTGGG	2	10	164266	164275	0 %	20 %	60 %	20 %	385996908
134	NC_017524	GCCGG	2	10	164859	164868	0 %	0 %	60 %	40 %	385996909
135	NC_017524	GTTGG	2	10	166828	166837	0 %	40 %	60 %	0 %	385996911
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262	NC_017524	ATGGG	2	10	378702	378711	20 %	20 %	60 %	0 %	385997080
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