MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 10198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	385996773
2	NC_017524	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	385996773
3	NC_017524	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	385996773
4	NC_017524	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	385996773
5	NC_017524	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	385996773
6	NC_017524	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	385996774
7	NC_017524	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	385996774
8	NC_017524	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	385996774
9	NC_017524	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	385996774
10	NC_017524	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	385996774
11	NC_017524	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	385996774
12	NC_017524	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	385996775
13	NC_017524	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	385996775
14	NC_017524	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	385996775
15	NC_017524	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	385996775
16	NC_017524	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	385996777
17	NC_017524	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	385996777
18	NC_017524	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	385996777
19	NC_017524	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	385996777
20	NC_017524	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	385996777
21	NC_017524	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	385996778
22	NC_017524	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	385996778
23	NC_017524	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	385996778
24	NC_017524	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	385996778
25	NC_017524	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	385996778
26	NC_017524	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	385996778
27	NC_017524	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	385996779
28	NC_017524	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	385996780
29	NC_017524	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	385996780
30	NC_017524	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	385996782
31	NC_017524	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	385996782
32	NC_017524	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	385996784
33	NC_017524	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	385996784
34	NC_017524	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	385996784
35	NC_017524	GCCC	2	8	14669	14676	0 %	0 %	25 %	75 %	385996784
36	NC_017524	GGGC	2	8	15450	15457	0 %	0 %	75 %	25 %	385996785
37	NC_017524	CTGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	385996786
38	NC_017524	TGGC	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	385996786
39	NC_017524	GCTT	2	8	16107	16114	0 %	50 %	25 %	25 %	385996786
40	NC_017524	CAGT	2	8	16135	16142	25 %	25 %	25 %	25 %	385996786
41	NC_017524	CGGT	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	385996786
42	NC_017524	GCCG	2	8	16565	16572	0 %	0 %	50 %	50 %	385996786
43	NC_017524	CGGG	2	8	17800	17807	0 %	0 %	75 %	25 %	385996787
44	NC_017524	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	385996787
45	NC_017524	GTGC	2	8	18408	18415	0 %	25 %	50 %	25 %	385996787
46	NC_017524	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	385996787
47	NC_017524	CCGC	2	8	18791	18798	0 %	0 %	25 %	75 %	385996788
48	NC_017524	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	385996789
49	NC_017524	CCAG	2	8	20743	20750	25 %	0 %	25 %	50 %	385996789
50	NC_017524	CACC	2	8	20926	20933	25 %	0 %	0 %	75 %	385996789
51	NC_017524	CGGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	385996790
52	NC_017524	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
53	NC_017524	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	385996790
54	NC_017524	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
55	NC_017524	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
56	NC_017524	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	385996790
57	NC_017524	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	385996792
58	NC_017524	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
59	NC_017524	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
60	NC_017524	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	385996792
61	NC_017524	GCTC	2	8	26505	26512	0 %	25 %	25 %	50 %	385996793
62	NC_017524	CCAA	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	385996793
63	NC_017524	CAGC	2	8	26788	26795	25 %	0 %	25 %	50 %	385996793
64	NC_017524	CGGC	2	8	27608	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
65	NC_017524	CCGG	2	8	28094	28101	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
66	NC_017524	GCTC	2	8	28650	28657	0 %	25 %	25 %	50 %	385996796
67	NC_017524	TGCG	2	8	28789	28796	0 %	25 %	50 %	25 %	385996796
68	NC_017524	CCGG	2	8	29054	29061	0 %	0 %	50 %	50 %	385996796
69	NC_017524	CGTC	2	8	29385	29392	0 %	25 %	25 %	50 %	385996797
70	NC_017524	CACG	2	8	29745	29752	25 %	0 %	25 %	50 %	385996798
71	NC_017524	ACCG	2	8	29826	29833	25 %	0 %	25 %	50 %	385996798
72	NC_017524	CCGG	2	8	30145	30152	0 %	0 %	50 %	50 %	385996798
73	NC_017524	GTCG	2	8	30321	30328	0 %	25 %	50 %	25 %	385996798
74	NC_017524	CCCG	2	8	30943	30950	0 %	0 %	25 %	75 %	385996798
75	NC_017524	CGAG	2	8	31455	31462	25 %	0 %	50 %	25 %	385996799
76	NC_017524	CGAC	2	8	31752	31759	25 %	0 %	25 %	50 %	385996800
77	NC_017524	GCCG	2	8	32479	32486	0 %	0 %	50 %	50 %	385996801
78	NC_017524	CCGA	2	8	33468	33475	25 %	0 %	25 %	50 %	385996802
79	NC_017524	GGCC	2	8	34603	34610	0 %	0 %	50 %	50 %	385996803
80	NC_017524	ATCG	2	8	35096	35103	25 %	25 %	25 %	25 %	385996803
81	NC_017524	GATC	2	8	35434	35441	25 %	25 %	25 %	25 %	385996803
82	NC_017524	CCAC	2	8	36255	36262	25 %	0 %	0 %	75 %	385996803
83	NC_017524	ACCG	2	8	36650	36657	25 %	0 %	25 %	50 %	385996804
84	NC_017524	CTGG	2	8	36994	37001	0 %	25 %	50 %	25 %	385996805
85	NC_017524	GCAT	2	8	37389	37396	25 %	25 %	25 %	25 %	385996806
86	NC_017524	GCTG	2	8	37903	37910	0 %	25 %	50 %	25 %	385996806
87	NC_017524	AACG	2	8	38658	38665	50 %	0 %	25 %	25 %	385996806
88	NC_017524	CCGA	2	8	38719	38726	25 %	0 %	25 %	50 %	385996806
89	NC_017524	CCAC	2	8	38875	38882	25 %	0 %	0 %	75 %	385996806
90	NC_017524	CAGC	2	8	39102	39109	25 %	0 %	25 %	50 %	385996807
91	NC_017524	CCGG	2	8	39598	39605	0 %	0 %	50 %	50 %	385996807
92	NC_017524	GGCC	2	8	40129	40136	0 %	0 %	50 %	50 %	385996808
93	NC_017524	CGAT	2	8	40579	40586	25 %	25 %	25 %	25 %	385996808
94	NC_017524	GCCG	2	8	40879	40886	0 %	0 %	50 %	50 %	385996808
95	NC_017524	CACC	2	8	40904	40911	25 %	0 %	0 %	75 %	385996808
96	NC_017524	ACCG	2	8	41127	41134	25 %	0 %	25 %	50 %	385996808
97	NC_017524	GCGT	2	8	41153	41160	0 %	25 %	50 %	25 %	385996808
98	NC_017524	CCAC	2	8	41882	41889	25 %	0 %	0 %	75 %	385996809
99	NC_017524	CGAT	2	8	41891	41898	25 %	25 %	25 %	25 %	385996809
100	NC_017524	GGCC	2	8	42587	42594	0 %	0 %	50 %	50 %	385996811
101	NC_017524	CCCG	2	8	43178	43185	0 %	0 %	25 %	75 %	385996811
102	NC_017524	CGGG	2	8	43207	43214	0 %	0 %	75 %	25 %	385996811
103	NC_017524	CGAC	2	8	43846	43853	25 %	0 %	25 %	50 %	385996812
104	NC_017524	GAGC	2	8	44226	44233	25 %	0 %	50 %	25 %	385996812
105	NC_017524	GGGC	2	8	45385	45392	0 %	0 %	75 %	25 %	385996812
106	NC_017524	CGGC	2	8	45480	45487	0 %	0 %	50 %	50 %	385996812
107	NC_017524	GCCG	2	8	46443	46450	0 %	0 %	50 %	50 %	385996812
108	NC_017524	TTGC	2	8	46607	46614	0 %	50 %	25 %	25 %	385996813
109	NC_017524	CCGC	2	8	46755	46762	0 %	0 %	25 %	75 %	385996813
110	NC_017524	CCGC	2	8	46788	46795	0 %	0 %	25 %	75 %	385996813
111	NC_017524	GGTC	2	8	46896	46903	0 %	25 %	50 %	25 %	385996813
112	NC_017524	CGGG	2	8	47447	47454	0 %	0 %	75 %	25 %	385996814
113	NC_017524	GCAG	2	8	47520	47527	25 %	0 %	50 %	25 %	385996814
114	NC_017524	GTGC	2	8	48420	48427	0 %	25 %	50 %	25 %	385996815
115	NC_017524	GCCG	2	8	48704	48711	0 %	0 %	50 %	50 %	385996815
116	NC_017524	CAGC	2	8	49889	49896	25 %	0 %	25 %	50 %	385996816
117	NC_017524	CGGG	2	8	50078	50085	0 %	0 %	75 %	25 %	385996817
118	NC_017524	GCCG	2	8	50178	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	385996817
119	NC_017524	GGTG	2	8	50501	50508	0 %	25 %	75 %	0 %	385996817
120	NC_017524	CTCA	2	8	51117	51124	25 %	25 %	0 %	50 %	385996817
121	NC_017524	CGCT	2	8	51256	51263	0 %	25 %	25 %	50 %	385996818
122	NC_017524	GGTA	2	8	52122	52129	25 %	25 %	50 %	0 %	385996819
123	NC_017524	ACCA	2	8	53742	53749	50 %	0 %	0 %	50 %	385996821
124	NC_017524	GTGC	2	8	54627	54634	0 %	25 %	50 %	25 %	385996821
125	NC_017524	ACCG	2	8	55505	55512	25 %	0 %	25 %	50 %	385996821
126	NC_017524	CCCG	2	8	55667	55674	0 %	0 %	25 %	75 %	385996821
127	NC_017524	GGCC	2	8	56341	56348	0 %	0 %	50 %	50 %	385996822
128	NC_017524	CGCT	2	8	57068	57075	0 %	25 %	25 %	50 %	385996822
129	NC_017524	GCGG	2	8	58825	58832	0 %	0 %	75 %	25 %	385996825
130	NC_017524	GTTC	2	8	59044	59051	0 %	50 %	25 %	25 %	385996825
131	NC_017524	AGCG	2	8	59249	59256	25 %	0 %	50 %	25 %	385996826
132	NC_017524	CGGC	2	8	59991	59998	0 %	0 %	50 %	50 %	385996828
133	NC_017524	GCGG	2	8	60003	60010	0 %	0 %	75 %	25 %	385996828
134	NC_017524	CAGC	2	8	61521	61528	25 %	0 %	25 %	50 %	385996829
135	NC_017524	TGGC	3	12	62149	62160	0 %	25 %	50 %	25 %	385996829
136	NC_017524	AAGG	2	8	63892	63899	50 %	0 %	50 %	0 %	385996830
137	NC_017524	AACC	2	8	64669	64676	50 %	0 %	0 %	50 %	385996831
138	NC_017524	CGGA	2	8	65033	65040	25 %	0 %	50 %	25 %	385996832
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