MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 76642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996773
2	NC_017524	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996773
3	NC_017524	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
4	NC_017524	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
5	NC_017524	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996773
6	NC_017524	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
7	NC_017524	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
8	NC_017524	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
9	NC_017524	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
10	NC_017524	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
11	NC_017524	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
12	NC_017524	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996773
13	NC_017524	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
14	NC_017524	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996773
15	NC_017524	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
16	NC_017524	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996773
17	NC_017524	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996773
18	NC_017524	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
19	NC_017524	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996773
20	NC_017524	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
21	NC_017524	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
22	NC_017524	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996773
23	NC_017524	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
24	NC_017524	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996773
25	NC_017524	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
26	NC_017524	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996774
27	NC_017524	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
28	NC_017524	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996774
29	NC_017524	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
30	NC_017524	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385996774
31	NC_017524	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996774
32	NC_017524	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996774
33	NC_017524	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996774
34	NC_017524	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996774
35	NC_017524	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996774
36	NC_017524	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996774
37	NC_017524	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996774
38	NC_017524	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996774
39	NC_017524	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996774
40	NC_017524	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996774
41	NC_017524	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
42	NC_017524	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996774
43	NC_017524	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996775
44	NC_017524	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
45	NC_017524	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
46	NC_017524	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
47	NC_017524	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996775
48	NC_017524	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996775
49	NC_017524	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996775
50	NC_017524	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
51	NC_017524	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996775
52	NC_017524	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
53	NC_017524	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996775
54	NC_017524	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
55	NC_017524	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
56	NC_017524	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
57	NC_017524	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
58	NC_017524	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
59	NC_017524	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
60	NC_017524	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996775
61	NC_017524	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
62	NC_017524	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
63	NC_017524	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996775
64	NC_017524	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996775
65	NC_017524	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
66	NC_017524	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996776
67	NC_017524	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996776
68	NC_017524	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996776
69	NC_017524	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996776
70	NC_017524	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996776
71	NC_017524	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996776
72	NC_017524	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996776
73	NC_017524	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996777
74	NC_017524	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
75	NC_017524	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
76	NC_017524	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996777
77	NC_017524	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996777
78	NC_017524	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
79	NC_017524	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
80	NC_017524	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996777
81	NC_017524	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
82	NC_017524	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
83	NC_017524	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
84	NC_017524	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
85	NC_017524	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
86	NC_017524	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996777
87	NC_017524	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996777
88	NC_017524	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
89	NC_017524	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996777
90	NC_017524	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
91	NC_017524	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
92	NC_017524	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
93	NC_017524	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
94	NC_017524	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
95	NC_017524	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996777
96	NC_017524	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996777
97	NC_017524	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
98	NC_017524	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996777
99	NC_017524	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996777
100	NC_017524	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996777
101	NC_017524	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996777
102	NC_017524	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996777
103	NC_017524	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996777
104	NC_017524	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996777
105	NC_017524	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
106	NC_017524	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996777
107	NC_017524	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996777
108	NC_017524	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996778
109	NC_017524	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
110	NC_017524	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
111	NC_017524	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996778
112	NC_017524	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996778
113	NC_017524	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996778
114	NC_017524	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996778
115	NC_017524	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
116	NC_017524	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
117	NC_017524	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996778
118	NC_017524	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996778
119	NC_017524	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996778
120	NC_017524	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
121	NC_017524	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
122	NC_017524	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996778
123	NC_017524	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996778
124	NC_017524	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996778
125	NC_017524	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996778
126	NC_017524	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996778
127	NC_017524	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996778
128	NC_017524	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996778
129	NC_017524	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996778
130	NC_017524	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996778
131	NC_017524	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996778
132	NC_017524	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996778
133	NC_017524	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
134	NC_017524	GCG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996778
135	NC_017524	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996778
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137	NC_017524	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
138	NC_017524	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
139	NC_017524	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996778
140	NC_017524	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
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143	NC_017524	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
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151	NC_017524	CTG	3	9	9312	9320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996778
152	NC_017524	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996778
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155	NC_017524	CTG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996778
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159	NC_017524	CGG	2	6	9638	9643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996778
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163	NC_017524	CGC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996779
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249	NC_017524	ACG	2	6	16719	16724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996786
250	NC_017524	CGG	2	6	16735	16740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996786
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252	NC_017524	ATG	2	6	17037	17042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996786
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500	NC_017524	GCC	3	9	32534	32542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996801

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