MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 3511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017523	TCATC	2	10	901	910	20 %	40 %	0 %	40 %	385993127
2	NC_017523	CGTTT	2	10	2091	2100	0 %	60 %	20 %	20 %	385993128
3	NC_017523	CGGTT	2	10	3240	3249	0 %	40 %	40 %	20 %	385993128
4	NC_017523	GTCGG	2	10	4588	4597	0 %	20 %	60 %	20 %	385993130
5	NC_017523	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	385993132
6	NC_017523	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	385993132
7	NC_017523	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	385993132
8	NC_017523	CAGAC	2	10	10238	10247	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017523	CAGAC	2	10	10677	10686	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017523	CGCAA	2	10	11201	11210	40 %	0 %	20 %	40 %	385993133
11	NC_017523	CGGCG	2	10	11327	11336	0 %	0 %	60 %	40 %	385993133
12	NC_017523	ACCCG	2	10	12157	12166	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017523	CGACC	2	10	14550	14559	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017523	GGCGT	2	10	15032	15041	0 %	20 %	60 %	20 %	385993137
15	NC_017523	GGGCC	2	10	15315	15324	0 %	0 %	60 %	40 %	385993137
16	NC_017523	GCGTT	2	10	16060	16069	0 %	40 %	40 %	20 %	385993138
17	NC_017523	CCAGC	2	10	16600	16609	20 %	0 %	20 %	60 %	385993139
18	NC_017523	ACCGA	2	10	17363	17372	40 %	0 %	20 %	40 %	385993139
19	NC_017523	ATCGG	2	10	17755	17764	20 %	20 %	40 %	20 %	385993139
20	NC_017523	CGGCC	2	10	18764	18773	0 %	0 %	40 %	60 %	385993140
21	NC_017523	TTAGC	2	10	19915	19924	20 %	40 %	20 %	20 %	385993141
22	NC_017523	GGTCC	2	10	19987	19996	0 %	20 %	40 %	40 %	385993141
23	NC_017523	GTCGT	2	10	22506	22515	0 %	40 %	40 %	20 %	385993143
24	NC_017523	ATCAC	2	10	24779	24788	40 %	20 %	0 %	40 %	385993145
25	NC_017523	GCCGG	2	10	25466	25475	0 %	0 %	60 %	40 %	385993145
26	NC_017523	CGAGC	2	10	27828	27837	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017523	GGCAA	2	10	30160	30169	40 %	0 %	40 %	20 %	385993149
28	NC_017523	CGATC	2	10	30986	30995	20 %	20 %	20 %	40 %	385993150
29	NC_017523	CGACG	2	10	33169	33178	20 %	0 %	40 %	40 %	385993153
30	NC_017523	GCGTC	2	10	33224	33233	0 %	20 %	40 %	40 %	385993153
31	NC_017523	GACAC	2	10	33321	33330	40 %	0 %	20 %	40 %	385993153
32	NC_017523	CCGCC	2	10	34668	34677	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_017523	TCCTG	2	10	38326	38335	0 %	40 %	20 %	40 %	385993158
34	NC_017523	CTCGG	2	10	38419	38428	0 %	20 %	40 %	40 %	385993158
35	NC_017523	GGCGC	2	10	38962	38971	0 %	0 %	60 %	40 %	385993158
36	NC_017523	TGGCC	2	10	39110	39119	0 %	20 %	40 %	40 %	385993158
37	NC_017523	CGGCG	2	10	39642	39651	0 %	0 %	60 %	40 %	385993158
38	NC_017523	GTCCA	2	10	40422	40431	20 %	20 %	20 %	40 %	385993159
39	NC_017523	GCCAA	2	10	42556	42565	40 %	0 %	20 %	40 %	385993161
40	NC_017523	GCGTC	2	10	42971	42980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017523	GCACA	2	10	43354	43363	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017523	GGTAC	2	10	45888	45897	20 %	20 %	40 %	20 %	385993163
43	NC_017523	TCGAA	2	10	46120	46129	40 %	20 %	20 %	20 %	385993163
44	NC_017523	GCACC	2	10	47050	47059	20 %	0 %	20 %	60 %	385993163
45	NC_017523	CGGTG	2	10	48084	48093	0 %	20 %	60 %	20 %	385993164
46	NC_017523	TCATG	2	10	48230	48239	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017523	ATCGG	2	10	48377	48386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017523	GCAGC	2	10	49624	49633	20 %	0 %	40 %	40 %	385993166
49	NC_017523	CCCGA	2	10	49707	49716	20 %	0 %	20 %	60 %	385993166
50	NC_017523	CAGCG	2	10	50830	50839	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017523	CTCCC	2	10	57273	57282	0 %	20 %	0 %	80 %	385993173
52	NC_017523	CGGCG	2	10	57722	57731	0 %	0 %	60 %	40 %	385993173
53	NC_017523	CGACC	2	10	59255	59264	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017523	CTTCG	2	10	59942	59951	0 %	40 %	20 %	40 %	385993175
55	NC_017523	CGGTG	2	10	60998	61007	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017523	TCAGG	2	10	63484	63493	20 %	20 %	40 %	20 %	385993177
57	NC_017523	TGCCG	2	10	66515	66524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017523	GGCGA	2	10	67447	67456	20 %	0 %	60 %	20 %	385993180
59	NC_017523	GGTGT	2	10	70024	70033	0 %	40 %	60 %	0 %	385993182
60	NC_017523	ATCGG	2	10	70661	70670	20 %	20 %	40 %	20 %	385993182
61	NC_017523	CCGCG	2	10	71198	71207	0 %	0 %	40 %	60 %	385993182
62	NC_017523	GGCAA	2	10	71549	71558	40 %	0 %	40 %	20 %	385993182
63	NC_017523	CGACC	2	10	71838	71847	20 %	0 %	20 %	60 %	385993182
64	NC_017523	CGGGT	2	10	72292	72301	0 %	20 %	60 %	20 %	385993182
65	NC_017523	GGTCG	2	10	72352	72361	0 %	20 %	60 %	20 %	385993182
66	NC_017523	TGCCT	2	10	73093	73102	0 %	40 %	20 %	40 %	385993183
67	NC_017523	GTCCA	2	10	73964	73973	20 %	20 %	20 %	40 %	385993184
68	NC_017523	TGACC	2	10	76588	76597	20 %	20 %	20 %	40 %	385993186
69	NC_017523	GCCAA	2	10	76902	76911	40 %	0 %	20 %	40 %	385993186
70	NC_017523	GTCGC	2	10	76979	76988	0 %	20 %	40 %	40 %	385993186
71	NC_017523	GCGCG	2	10	78067	78076	0 %	0 %	60 %	40 %	385993187
72	NC_017523	ATCCG	2	10	80959	80968	20 %	20 %	20 %	40 %	385993189
73	NC_017523	CACCG	2	10	81739	81748	20 %	0 %	20 %	60 %	385993190
74	NC_017523	TGGTC	2	10	83874	83883	0 %	40 %	40 %	20 %	385993191
75	NC_017523	GCTGG	2	10	84511	84520	0 %	20 %	60 %	20 %	385993192
76	NC_017523	TGGGT	2	10	87549	87558	0 %	40 %	60 %	0 %	385993197
77	NC_017523	TCGCC	2	10	87756	87765	0 %	20 %	20 %	60 %	385993197
78	NC_017523	GGGCC	2	10	88729	88738	0 %	0 %	60 %	40 %	385993198
79	NC_017523	GGCCG	2	10	90048	90057	0 %	0 %	60 %	40 %	385993199
80	NC_017523	GCGCC	2	10	90700	90709	0 %	0 %	40 %	60 %	385993199
81	NC_017523	GCTTG	2	10	92732	92741	0 %	40 %	40 %	20 %	385993201
82	NC_017523	CGTGT	2	10	93164	93173	0 %	40 %	40 %	20 %	385993202
83	NC_017523	AGATC	2	10	93243	93252	40 %	20 %	20 %	20 %	385993202
84	NC_017523	CGGCG	2	10	96815	96824	0 %	0 %	60 %	40 %	385993205
85	NC_017523	CGGCG	2	10	96942	96951	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017523	GCGGT	2	10	97891	97900	0 %	20 %	60 %	20 %	385993206
87	NC_017523	GGTGA	2	10	98109	98118	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017523	GCGCC	2	10	100723	100732	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017523	GGTGG	2	10	101414	101423	0 %	20 %	80 %	0 %	385993208
90	NC_017523	CTGGC	2	10	103151	103160	0 %	20 %	40 %	40 %	385993209
91	NC_017523	GCACA	2	10	104272	104281	40 %	0 %	20 %	40 %	385993209
92	NC_017523	CTGAA	2	10	106602	106611	40 %	20 %	20 %	20 %	385993212
93	NC_017523	ATCGC	2	10	107097	107106	20 %	20 %	20 %	40 %	385993212
94	NC_017523	TCTGA	2	10	108431	108440	20 %	40 %	20 %	20 %	385993213
95	NC_017523	CGGTC	2	10	108706	108715	0 %	20 %	40 %	40 %	385993213
96	NC_017523	GACCA	2	10	109844	109853	40 %	0 %	20 %	40 %	385993213
97	NC_017523	GGCTG	2	10	112407	112416	0 %	20 %	60 %	20 %	385993214
98	NC_017523	CCGCG	2	10	116327	116336	0 %	0 %	40 %	60 %	385993215
99	NC_017523	TCGTG	2	10	120280	120289	0 %	40 %	40 %	20 %	385993217
100	NC_017523	GCACG	2	10	121935	121944	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017523	CCGGA	2	10	122061	122070	20 %	0 %	40 %	40 %	385993218
102	NC_017523	TGCGC	2	10	124534	124543	0 %	20 %	40 %	40 %	385993219
103	NC_017523	GCGAG	2	10	125045	125054	20 %	0 %	60 %	20 %	385993219
104	NC_017523	GGGGT	2	10	126054	126063	0 %	20 %	80 %	0 %	385993219
105	NC_017523	CCCAC	2	10	126616	126625	20 %	0 %	0 %	80 %	385993219
106	NC_017523	CCGGC	2	10	127126	127135	0 %	0 %	40 %	60 %	385993219
107	NC_017523	TGCGG	2	10	127536	127545	0 %	20 %	60 %	20 %	385993219
108	NC_017523	ATCAC	2	10	129015	129024	40 %	20 %	0 %	40 %	385993220
109	NC_017523	ATCGG	2	10	129063	129072	20 %	20 %	40 %	20 %	385993220
110	NC_017523	CGGGC	2	10	130154	130163	0 %	0 %	60 %	40 %	385993220
111	NC_017523	GCGAT	2	10	131959	131968	20 %	20 %	40 %	20 %	385993222
112	NC_017523	GTTCG	2	10	132180	132189	0 %	40 %	40 %	20 %	385993222
113	NC_017523	CCTGG	2	10	132572	132581	0 %	20 %	40 %	40 %	385993222
114	NC_017523	GGCCC	2	10	132678	132687	0 %	0 %	40 %	60 %	385993222
115	NC_017523	CGTTG	2	10	133190	133199	0 %	40 %	40 %	20 %	385993222
116	NC_017523	CGACC	2	10	133262	133271	20 %	0 %	20 %	60 %	385993222
117	NC_017523	GAGAT	2	10	136282	136291	40 %	20 %	40 %	0 %	385993225
118	NC_017523	CGGCG	2	10	138436	138445	0 %	0 %	60 %	40 %	385993226
119	NC_017523	TGCGG	2	10	139069	139078	0 %	20 %	60 %	20 %	385993227
120	NC_017523	CGCTG	2	10	139776	139785	0 %	20 %	40 %	40 %	385993228
121	NC_017523	GTTGC	2	10	140322	140331	0 %	40 %	40 %	20 %	385993228
122	NC_017523	CCGAT	2	10	141070	141079	20 %	20 %	20 %	40 %	385993228
123	NC_017523	ATCGC	2	10	141761	141770	20 %	20 %	20 %	40 %	385993229
124	NC_017523	AACCG	2	10	142500	142509	40 %	0 %	20 %	40 %	385993229
125	NC_017523	CCGCC	2	10	143087	143096	0 %	0 %	20 %	80 %	385993229
126	NC_017523	CCGCC	2	10	143730	143739	0 %	0 %	20 %	80 %	385993230
127	NC_017523	GGGTC	2	10	145485	145494	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017523	ATCGG	2	10	147215	147224	20 %	20 %	40 %	20 %	385993234
129	NC_017523	ATTGG	2	10	149870	149879	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017523	AGCGA	2	10	151773	151782	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017523	AGCGA	2	10	151826	151835	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017523	TCGTC	2	10	152173	152182	0 %	40 %	20 %	40 %	385993238
133	NC_017523	CACGC	2	10	152637	152646	20 %	0 %	20 %	60 %	385993238
134	NC_017523	ATTCT	2	10	153481	153490	20 %	60 %	0 %	20 %	385993239
135	NC_017523	AGGCG	2	10	154009	154018	20 %	0 %	60 %	20 %	385993239
136	NC_017523	TGACC	2	10	157013	157022	20 %	20 %	20 %	40 %	385993242
137	NC_017523	CGGCG	2	10	157259	157268	0 %	0 %	60 %	40 %	385993242
138	NC_017523	GCACC	2	10	157429	157438	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017523	CCGCA	2	10	158608	158617	20 %	0 %	20 %	60 %	385993244
140	NC_017523	CGCGG	2	10	158687	158696	0 %	0 %	60 %	40 %	385993244
141	NC_017523	CGGTT	2	10	159014	159023	0 %	40 %	40 %	20 %	385993244
142	NC_017523	GTCGC	2	10	159176	159185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017523	GCCGG	2	10	159475	159484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017523	GCGCG	2	10	159597	159606	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017523	CTGGG	2	10	161810	161819	0 %	20 %	60 %	20 %	385993247
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147	NC_017523	GTTGG	2	10	164372	164381	0 %	40 %	60 %	0 %	385993250
148	NC_017523	GCGTG	2	10	165538	165547	0 %	20 %	60 %	20 %	385993253
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152	NC_017523	CTACC	2	10	169428	169437	20 %	20 %	0 %	60 %	385993256
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159	NC_017523	GTTCG	2	10	175715	175724	0 %	40 %	40 %	20 %	385993262
160	NC_017523	GGACA	2	10	175925	175934	40 %	0 %	40 %	20 %	385993262
161	NC_017523	GCCGA	2	10	176748	176757	20 %	0 %	40 %	40 %	385993262
162	NC_017523	TTCAT	2	10	177924	177933	20 %	60 %	0 %	20 %	385993263
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168	NC_017523	ACGGT	2	10	188733	188742	20 %	20 %	40 %	20 %	385993272
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172	NC_017523	CGGCG	2	10	194759	194768	0 %	0 %	60 %	40 %	385993278
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176	NC_017523	TTGCG	2	10	204739	204748	0 %	40 %	40 %	20 %	385993286
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179	NC_017523	ACCGC	2	10	209998	210007	20 %	0 %	20 %	60 %	385993292
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182	NC_017523	CCTCG	2	10	212990	212999	0 %	20 %	20 %	60 %	385993295
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185	NC_017523	CAACC	2	10	216346	216355	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
186	NC_017523	CGGCG	2	10	216800	216809	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_017523	GGTGC	2	10	219828	219837	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_017523	CGCAG	2	10	222506	222515	20 %	0 %	40 %	40 %	385993302
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201	NC_017523	CTGCG	2	10	232165	232174	0 %	20 %	40 %	40 %	385993307
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233	NC_017523	GATCC	2	10	276077	276086	20 %	20 %	20 %	40 %	385993342
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241	NC_017523	GCGGT	2	10	289993	290002	0 %	20 %	60 %	20 %	385993352
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244	NC_017523	TGCGC	2	10	299823	299832	0 %	20 %	40 %	40 %	385993359
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248	NC_017523	TGCGG	2	10	306672	306681	0 %	20 %	60 %	20 %	385993364
249	NC_017523	TGCCA	2	10	308436	308445	20 %	20 %	20 %	40 %	385993366
250	NC_017523	CGCAG	2	10	309592	309601	20 %	0 %	40 %	40 %	385993367
251	NC_017523	CGGCG	2	10	310226	310235	0 %	0 %	60 %	40 %	385993367
252	NC_017523	CGGCC	2	10	310800	310809	0 %	0 %	40 %	60 %	385993368
253	NC_017523	CAGAT	2	10	311707	311716	40 %	20 %	20 %	20 %	385993368
254	NC_017523	AGCGG	2	10	311931	311940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
255	NC_017523	CGCAG	2	10	312253	312262	20 %	0 %	40 %	40 %	385993369
256	NC_017523	GGCCG	2	10	312568	312577	0 %	0 %	60 %	40 %	385993370
257	NC_017523	GCCCG	2	10	313066	313075	0 %	0 %	40 %	60 %	385993370
258	NC_017523	TCGGC	2	10	314094	314103	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
259	NC_017523	CCTGG	2	10	314642	314651	0 %	20 %	40 %	40 %	385993372
260	NC_017523	GGCCG	2	10	317747	317756	0 %	0 %	60 %	40 %	385993373
261	NC_017523	TGCGC	2	10	318244	318253	0 %	20 %	40 %	40 %	385993373
262	NC_017523	GTTGG	2	10	319842	319851	0 %	40 %	60 %	0 %	385993374
263	NC_017523	AGCGC	2	10	327763	327772	20 %	0 %	40 %	40 %	385993379
264	NC_017523	GGGAC	2	10	328668	328677	20 %	0 %	60 %	20 %	385993380
265	NC_017523	CCGGC	2	10	329529	329538	0 %	0 %	40 %	60 %	385993381
266	NC_017523	AGTTC	2	10	330805	330814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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383	NC_017523	GTGCT	2	10	487980	487989	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_017523	TCGCC	2	10	507972	507981	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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403	NC_017523	ACCGA	2	10	510735	510744	40 %	0 %	20 %	40 %	385993522
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