MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 1599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017523	CGTT	2	8	526	533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017523	CCGA	2	8	1724	1731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017523	CGTC	2	8	3284	3291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017523	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017523	CCCG	2	8	10571	10578	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017523	CCCG	2	8	11010	11017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017523	GCAC	2	8	12486	12493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017523	GCCC	2	8	13331	13338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_017523	ATTC	2	8	14569	14576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017523	ACCC	2	8	14976	14983	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017523	TCAA	2	8	26374	26381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017523	GAGC	2	8	26402	26409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017523	GGCC	2	8	26416	26423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017523	CGGC	2	8	28468	28475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017523	ACCA	2	8	31983	31990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017523	GCTA	2	8	34715	34722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017523	ACCG	2	8	37508	37515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017523	GTTG	2	8	39933	39940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017523	GTTG	2	8	39989	39996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017523	CTAC	2	8	48245	48252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017523	CAGC	2	8	50912	50919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017523	CTGG	2	8	53740	53747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017523	AGCG	2	8	60282	60289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017523	CGGC	2	8	61024	61031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017523	GCGG	2	8	61036	61043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017523	CGGA	2	8	66066	66073	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017523	CGGT	2	8	80242	80249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017523	CGGT	2	8	80427	80434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017523	CAGA	2	8	82891	82898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017523	CTTC	2	8	83146	83153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017523	CTGG	2	8	84824	84831	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017523	CGCA	2	8	87125	87132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017523	CGCT	2	8	95255	95262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017523	GCGA	2	8	95346	95353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017523	ACCG	2	8	97060	97067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017523	TGCG	2	8	98275	98282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017523	CGGG	2	8	100967	100974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017523	CTGG	2	8	101003	101010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017523	GTTG	2	8	102541	102548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017523	TCGA	2	8	121100	121107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017523	TCGC	2	8	121398	121405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017523	GCGG	2	8	121872	121879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017523	ATCC	2	8	123199	123206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017523	GCGA	2	8	128287	128294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017523	CGGG	2	8	128330	128337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017523	GCTC	2	8	128842	128849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017523	CGGG	2	8	131554	131561	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017523	TACG	2	8	135643	135650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017523	TTCT	2	8	137470	137477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017523	ACGC	2	8	137542	137549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017523	GGGC	2	8	137634	137641	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017523	AGCA	2	8	138714	138721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017523	GCCG	2	8	141520	141527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017523	GCGT	2	8	146065	146072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017523	GCGG	2	8	147131	147138	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017523	GCCG	2	8	149858	149865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017523	CCGG	2	8	153224	153231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017523	GCGT	3	12	153252	153263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017523	GGCT	2	8	155398	155405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017523	CGCA	2	8	155424	155431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017523	ACCG	2	8	157460	157467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017523	TCGT	2	8	159116	159123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017523	CCGG	2	8	159124	159131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017523	CCCG	2	8	159336	159343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_017523	GGTA	2	8	168070	168077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017523	ACTT	2	8	168812	168819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017523	ACCC	2	8	176850	176857	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_017523	GAGC	2	8	178451	178458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017523	GCCG	2	8	178521	178528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017523	TTGA	2	8	184346	184353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017523	CTGG	2	8	194333	194340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017523	CTGT	2	8	209885	209892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017523	GGCC	2	8	215973	215980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017523	CGGT	2	8	216309	216316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017523	TGGC	2	8	216559	216566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017523	AGCG	2	8	216647	216654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017523	GATG	2	8	217057	217064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017523	CGGT	2	8	219654	219661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017523	GTTC	2	8	219777	219784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017523	AACT	2	8	228253	228260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017523	GGAA	2	8	228428	228435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017523	ACGT	2	8	229180	229187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017523	ACAT	2	8	229247	229254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017523	GTGC	2	8	238959	238966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017523	AGCA	2	8	240688	240695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017523	GCGG	2	8	240820	240827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017523	GCAT	2	8	246510	246517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017523	GAAC	2	8	246646	246653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017523	CGCA	2	8	251255	251262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017523	GACG	2	8	253664	253671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017523	GCGG	2	8	270546	270553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017523	GCCG	2	8	272046	272053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017523	TGCG	2	8	272207	272214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017523	TGCG	2	8	272242	272249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017523	CCGC	2	8	272282	272289	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_017523	TGGG	2	8	278626	278633	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017523	GCTA	2	8	284529	284536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017523	ACCA	2	8	284659	284666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017523	TAGA	2	8	286022	286029	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017523	TCGT	2	8	286824	286831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017523	ACTT	2	8	289727	289734	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017523	TCGT	2	8	291355	291362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017523	AACT	2	8	293405	293412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017523	AACC	2	8	293413	293420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017523	ATGC	2	8	294403	294410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017523	GACG	2	8	299721	299728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017523	TTGC	2	8	307361	307368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017523	GGTC	2	8	307533	307540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017523	TCGG	2	8	307758	307765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017523	CTCG	2	8	320462	320469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017523	CGCT	2	8	330335	330342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017523	GGCG	2	8	330348	330355	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017523	TCGA	2	8	330684	330691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017523	CAGC	2	8	330737	330744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017523	GGTA	2	8	334071	334078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017523	GCCG	2	8	334158	334165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017523	TGGC	2	8	334170	334177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017523	GGCG	2	8	339784	339791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017523	GGCA	2	8	349659	349666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017523	TCGG	2	8	360986	360993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017523	CTGT	2	8	362169	362176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017523	AATC	2	8	373396	373403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017523	GGCC	2	8	383756	383763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017523	AAGG	2	8	384772	384779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017523	AGCA	2	8	388845	388852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017523	TGAC	2	8	393741	393748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017523	GTCA	2	8	393752	393759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017523	CGGC	2	8	397585	397592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017523	CGAG	2	8	408520	408527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017523	GCCG	2	8	412360	412367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017523	ATCG	2	8	414721	414728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017523	GCCA	2	8	414812	414819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017523	GTCC	2	8	414838	414845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017523	ACGG	2	8	414924	414931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017523	GAGC	2	8	421706	421713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017523	GAGC	2	8	421757	421764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017523	GAGC	2	8	421808	421815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017523	GAGC	2	8	421859	421866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017523	GATC	2	8	434111	434118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017523	CCCA	2	8	434267	434274	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_017523	TGCG	2	8	453074	453081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017523	GCTC	2	8	453454	453461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017523	GGAT	2	8	465748	465755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017523	CGAG	2	8	465891	465898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017523	GCAC	2	8	473980	473987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017523	CAAC	2	8	477849	477856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017523	GTCC	2	8	484088	484095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017523	GGGT	2	8	484224	484231	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017523	ACCT	2	8	487949	487956	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017523	CGAG	2	8	488184	488191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017523	GAGC	2	8	488242	488249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_017523	CAGC	2	8	777539	777546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
273	NC_017523	TTGA	2	8	778042	778049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_017523	CTGA	2	8	1230389	1230396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_017523	CGAG	2	8	1239123	1239130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
445	NC_017523	TCGA	2	8	1257586	1257593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_017523	CCGC	2	8	1257605	1257612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
447	NC_017523	GGTG	2	8	1257757	1257764	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017523	CGGC	2	8	1257980	1257987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
450	NC_017523	GCTG	2	8	1261778	1261785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
451	NC_017523	AGCC	2	8	1262155	1262162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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460	NC_017523	TTGA	2	8	1284071	1284078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_017523	TCGA	2	8	1296329	1296336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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466	NC_017523	CGTG	2	8	1323229	1323236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_017523	GGCG	2	8	1329719	1329726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_017523	TGCG	2	8	1348784	1348791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
472	NC_017523	GGAG	2	8	1351885	1351892	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017523	GCCG	2	8	1354796	1354803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
474	NC_017523	CAGC	2	8	1355332	1355339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
475	NC_017523	ACGT	2	8	1360972	1360979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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477	NC_017523	CGGC	2	8	1365464	1365471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_017523	TCGC	2	8	1374474	1374481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
482	NC_017523	GTCC	2	8	1380748	1380755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_017523	CCGG	2	8	1391997	1392004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_017523	TGGG	2	8	1397298	1397305	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017523	CGGC	2	8	1410763	1410770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_017523	TCGG	2	8	1416146	1416153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_017523	GGGC	2	8	1419866	1419873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
490	NC_017523	TAGG	2	8	1423690	1423697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
491	NC_017523	GCCT	2	8	1438916	1438923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_017523	TCGC	2	8	1442926	1442933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_017523	CGGT	2	8	1442941	1442948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_017523	CCCG	2	8	1443125	1443132	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
495	NC_017523	TGCT	2	8	1450515	1450522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_017523	CGCA	2	8	1452588	1452595	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_017523	GCAC	2	8	1455770	1455777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_017523	CGAC	2	8	1457191	1457198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_017523	GCGG	2	8	1469217	1469224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_017523	CAAG	2	8	1469228	1469235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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