MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 83161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017523	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993126
2	NC_017523	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993126
3	NC_017523	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
4	NC_017523	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
5	NC_017523	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993126
6	NC_017523	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
7	NC_017523	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993126
8	NC_017523	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993126
9	NC_017523	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
10	NC_017523	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993126
11	NC_017523	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993126
12	NC_017523	GAT	2	6	396	401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993126
13	NC_017523	CGC	3	9	560	568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017523	GTT	2	6	680	685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993127
15	NC_017523	CGA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
16	NC_017523	TTC	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993127
17	NC_017523	CAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993127
18	NC_017523	AGC	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
19	NC_017523	ACC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993127
20	NC_017523	CGA	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
21	NC_017523	CAG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993127
22	NC_017523	GCG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993127
23	NC_017523	CCG	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993127
24	NC_017523	CAC	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993127
25	NC_017523	TTC	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017523	CGG	2	6	1642	1647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017523	TCG	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017523	TCG	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017523	ATG	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017523	GTT	3	9	1924	1932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017523	CTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017523	CGT	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017523	TCG	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017523	GTT	2	6	2185	2190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
35	NC_017523	CCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993128
36	NC_017523	TTG	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
37	NC_017523	CGA	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993128
38	NC_017523	TTG	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
39	NC_017523	ATT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385993128
40	NC_017523	CGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993128
41	NC_017523	GAC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993128
42	NC_017523	GGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993128
43	NC_017523	CGT	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993128
44	NC_017523	GCC	2	6	2690	2695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993128
45	NC_017523	CGG	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993128
46	NC_017523	GCA	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993128
47	NC_017523	CTT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993128
48	NC_017523	CCA	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993128
49	NC_017523	GAT	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993128
50	NC_017523	TTG	3	9	3015	3023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993128
51	NC_017523	CGG	2	6	3204	3209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993128
52	NC_017523	TTG	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017523	CGA	2	6	3415	3420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017523	GTG	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
55	NC_017523	ACG	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
56	NC_017523	CAA	2	6	3554	3559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993129
57	NC_017523	ATC	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993129
58	NC_017523	TGT	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993129
59	NC_017523	CGG	2	6	3672	3677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
60	NC_017523	GAT	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993129
61	NC_017523	TGG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
62	NC_017523	GAA	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993129
63	NC_017523	AGC	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
64	NC_017523	GGC	2	6	4043	4048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
65	NC_017523	GGC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
66	NC_017523	GAC	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
67	NC_017523	GGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
68	NC_017523	TGG	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
69	NC_017523	GTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993129
70	NC_017523	CGA	2	6	4250	4255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993129
71	NC_017523	CGG	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993129
72	NC_017523	CCG	2	6	4312	4317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993129
73	NC_017523	CCG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993129
74	NC_017523	GGT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993129
75	NC_017523	TGC	3	9	4531	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993130
76	NC_017523	CGA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993130
77	NC_017523	GGT	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993130
78	NC_017523	CCA	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993130
79	NC_017523	ACG	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993130
80	NC_017523	CGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993130
81	NC_017523	CGG	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993130
82	NC_017523	GAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017523	AGA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017523	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017523	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017523	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017523	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993131
88	NC_017523	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
89	NC_017523	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
90	NC_017523	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993131
91	NC_017523	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
92	NC_017523	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
93	NC_017523	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993131
94	NC_017523	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
95	NC_017523	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
96	NC_017523	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993131
97	NC_017523	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993131
98	NC_017523	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
99	NC_017523	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993131
100	NC_017523	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
101	NC_017523	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
102	NC_017523	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993131
103	NC_017523	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993131
104	NC_017523	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993131
105	NC_017523	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993131
106	NC_017523	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993131
107	NC_017523	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
108	NC_017523	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993131
109	NC_017523	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993131
110	NC_017523	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993131
111	NC_017523	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993131
112	NC_017523	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993131
113	NC_017523	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993131
114	NC_017523	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993131
115	NC_017523	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993131
116	NC_017523	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993131
117	NC_017523	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993131
118	NC_017523	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993132
119	NC_017523	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
120	NC_017523	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
121	NC_017523	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
122	NC_017523	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993132
123	NC_017523	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993132
124	NC_017523	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993132
125	NC_017523	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
126	NC_017523	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
127	NC_017523	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
128	NC_017523	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993132
129	NC_017523	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993132
130	NC_017523	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
131	NC_017523	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
132	NC_017523	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993132
133	NC_017523	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
134	NC_017523	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993132
135	NC_017523	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993132
136	NC_017523	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993132
137	NC_017523	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993132
138	NC_017523	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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141	NC_017523	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993132
142	NC_017523	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993132
143	NC_017523	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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145	NC_017523	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993132
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148	NC_017523	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
149	NC_017523	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993132
150	NC_017523	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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153	NC_017523	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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162	NC_017523	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993132
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251	NC_017523	CAA	2	6	14613	14618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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254	NC_017523	GAC	2	6	14910	14915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_017523	ACC	2	6	15207	15212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993137
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261	NC_017523	GCG	2	6	15266	15271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993137
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