MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 3520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017522	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	385989535
2	NC_017522	GCTGA	2	10	1862	1871	20 %	20 %	40 %	20 %	385989536
3	NC_017522	GTCGA	2	10	2035	2044	20 %	20 %	40 %	20 %	385989537
4	NC_017522	TCAGA	2	10	2912	2921	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017522	CGTTT	2	10	3450	3459	0 %	60 %	20 %	20 %	385989538
6	NC_017522	CGGTT	2	10	4599	4608	0 %	40 %	40 %	20 %	385989538
7	NC_017522	GTCGG	2	10	5947	5956	0 %	20 %	60 %	20 %	385989540
8	NC_017522	GCAGC	2	10	8731	8740	20 %	0 %	40 %	40 %	385989542
9	NC_017522	CGGTG	2	10	10639	10648	0 %	20 %	60 %	20 %	385989542
10	NC_017522	CAGAC	2	10	11157	11166	40 %	0 %	20 %	40 %	385989542
11	NC_017522	CGCAA	2	10	11681	11690	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017522	CGGCG	2	10	11807	11816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017522	ACCCG	2	10	12637	12646	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017522	CGACC	2	10	15030	15039	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017522	GGCGT	2	10	15512	15521	0 %	20 %	60 %	20 %	385989547
16	NC_017522	GGGCC	2	10	15795	15804	0 %	0 %	60 %	40 %	385989547
17	NC_017522	GCGTT	2	10	16540	16549	0 %	40 %	40 %	20 %	385989548
18	NC_017522	CCAGC	2	10	17080	17089	20 %	0 %	20 %	60 %	385989549
19	NC_017522	ACCGA	2	10	17843	17852	40 %	0 %	20 %	40 %	385989549
20	NC_017522	ATCGG	2	10	18235	18244	20 %	20 %	40 %	20 %	385989549
21	NC_017522	CGGCC	2	10	19244	19253	0 %	0 %	40 %	60 %	385989550
22	NC_017522	TTAGC	2	10	20395	20404	20 %	40 %	20 %	20 %	385989551
23	NC_017522	GGTCC	2	10	20467	20476	0 %	20 %	40 %	40 %	385989551
24	NC_017522	GTCGT	2	10	22986	22995	0 %	40 %	40 %	20 %	385989553
25	NC_017522	ATCAC	2	10	25259	25268	40 %	20 %	0 %	40 %	385989555
26	NC_017522	GCCGG	2	10	25946	25955	0 %	0 %	60 %	40 %	385989555
27	NC_017522	CGAGC	2	10	28307	28316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017522	GGCAA	2	10	30639	30648	40 %	0 %	40 %	20 %	385989559
29	NC_017522	CGATC	2	10	31465	31474	20 %	20 %	20 %	40 %	385989560
30	NC_017522	CGACG	2	10	33648	33657	20 %	0 %	40 %	40 %	385989563
31	NC_017522	GCGTC	2	10	33703	33712	0 %	20 %	40 %	40 %	385989563
32	NC_017522	GACAC	2	10	33800	33809	40 %	0 %	20 %	40 %	385989563
33	NC_017522	CCGCC	2	10	35146	35155	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
34	NC_017522	TCCTG	2	10	38805	38814	0 %	40 %	20 %	40 %	385989567
35	NC_017522	CTCGG	2	10	38898	38907	0 %	20 %	40 %	40 %	385989567
36	NC_017522	GGCGC	2	10	39441	39450	0 %	0 %	60 %	40 %	385989567
37	NC_017522	TGGCC	2	10	39589	39598	0 %	20 %	40 %	40 %	385989567
38	NC_017522	CGGCG	2	10	40121	40130	0 %	0 %	60 %	40 %	385989567
39	NC_017522	GTCCA	2	10	40901	40910	20 %	20 %	20 %	40 %	385989568
40	NC_017522	GCCAA	2	10	43035	43044	40 %	0 %	20 %	40 %	385989570
41	NC_017522	GCGTC	2	10	43450	43459	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017522	GCACA	2	10	43834	43843	40 %	0 %	20 %	40 %	385989571
43	NC_017522	GGTAC	2	10	46368	46377	20 %	20 %	40 %	20 %	385989573
44	NC_017522	TCGAA	2	10	46600	46609	40 %	20 %	20 %	20 %	385989573
45	NC_017522	GCACC	2	10	47530	47539	20 %	0 %	20 %	60 %	385989573
46	NC_017522	CGGTG	2	10	48564	48573	0 %	20 %	60 %	20 %	385989574
47	NC_017522	TCATG	2	10	48710	48719	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017522	ATCGG	2	10	48857	48866	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017522	GCAGC	2	10	50104	50113	20 %	0 %	40 %	40 %	385989576
50	NC_017522	CCCGA	2	10	50187	50196	20 %	0 %	20 %	60 %	385989576
51	NC_017522	CAGCG	2	10	51310	51319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017522	CTCCC	2	10	57753	57762	0 %	20 %	0 %	80 %	385989583
53	NC_017522	CGGCG	2	10	58202	58211	0 %	0 %	60 %	40 %	385989583
54	NC_017522	CGACC	2	10	59734	59743	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017522	CTTCG	2	10	60421	60430	0 %	40 %	20 %	40 %	385989585
56	NC_017522	CGGTG	2	10	61477	61486	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017522	TCAGG	2	10	63963	63972	20 %	20 %	40 %	20 %	385989587
58	NC_017522	TGCCG	2	10	66994	67003	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017522	GGCGA	2	10	67926	67935	20 %	0 %	60 %	20 %	385989590
60	NC_017522	GGTGT	2	10	70503	70512	0 %	40 %	60 %	0 %	385989592
61	NC_017522	ATCGG	2	10	71140	71149	20 %	20 %	40 %	20 %	385989592
62	NC_017522	CCGCG	2	10	71677	71686	0 %	0 %	40 %	60 %	385989592
63	NC_017522	GGCAA	2	10	72028	72037	40 %	0 %	40 %	20 %	385989592
64	NC_017522	CGACC	2	10	72317	72326	20 %	0 %	20 %	60 %	385989592
65	NC_017522	CGGGT	2	10	72771	72780	0 %	20 %	60 %	20 %	385989592
66	NC_017522	GGTCG	2	10	72831	72840	0 %	20 %	60 %	20 %	385989592
67	NC_017522	TGCCT	2	10	73572	73581	0 %	40 %	20 %	40 %	385989593
68	NC_017522	GTCCA	2	10	74443	74452	20 %	20 %	20 %	40 %	385989594
69	NC_017522	TGACC	2	10	77067	77076	20 %	20 %	20 %	40 %	385989596
70	NC_017522	GCCAA	2	10	77381	77390	40 %	0 %	20 %	40 %	385989596
71	NC_017522	GTCGC	2	10	77458	77467	0 %	20 %	40 %	40 %	385989596
72	NC_017522	GCGCG	2	10	78546	78555	0 %	0 %	60 %	40 %	385989597
73	NC_017522	ATCCG	2	10	81438	81447	20 %	20 %	20 %	40 %	385989599
74	NC_017522	CACCG	2	10	82218	82227	20 %	0 %	20 %	60 %	385989600
75	NC_017522	TGGTC	2	10	84353	84362	0 %	40 %	40 %	20 %	385989601
76	NC_017522	GCTGG	2	10	84990	84999	0 %	20 %	60 %	20 %	385989602
77	NC_017522	TGGGT	2	10	88028	88037	0 %	40 %	60 %	0 %	385989607
78	NC_017522	TCGCC	2	10	88235	88244	0 %	20 %	20 %	60 %	385989607
79	NC_017522	GGGCC	2	10	89208	89217	0 %	0 %	60 %	40 %	385989608
80	NC_017522	GGCCG	2	10	90527	90536	0 %	0 %	60 %	40 %	385989609
81	NC_017522	GCGCC	2	10	91179	91188	0 %	0 %	40 %	60 %	385989609
82	NC_017522	GCTTG	2	10	93211	93220	0 %	40 %	40 %	20 %	385989611
83	NC_017522	CGTGT	2	10	93643	93652	0 %	40 %	40 %	20 %	385989612
84	NC_017522	AGATC	2	10	93722	93731	40 %	20 %	20 %	20 %	385989612
85	NC_017522	CGGCG	2	10	97294	97303	0 %	0 %	60 %	40 %	385989615
86	NC_017522	CGGCG	2	10	97421	97430	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017522	GCGGT	2	10	98370	98379	0 %	20 %	60 %	20 %	385989616
88	NC_017522	GGTGA	2	10	98588	98597	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017522	GCGCC	2	10	101202	101211	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017522	GGTGG	2	10	101893	101902	0 %	20 %	80 %	0 %	385989618
91	NC_017522	CTGGC	2	10	103629	103638	0 %	20 %	40 %	40 %	385989619
92	NC_017522	GCACA	2	10	104750	104759	40 %	0 %	20 %	40 %	385989619
93	NC_017522	CTGAA	2	10	107080	107089	40 %	20 %	20 %	20 %	385989622
94	NC_017522	ATCGC	2	10	107575	107584	20 %	20 %	20 %	40 %	385989622
95	NC_017522	TCTGA	2	10	108909	108918	20 %	40 %	20 %	20 %	385989623
96	NC_017522	CGGTC	2	10	109184	109193	0 %	20 %	40 %	40 %	385989623
97	NC_017522	GACCA	2	10	110322	110331	40 %	0 %	20 %	40 %	385989623
98	NC_017522	GGCTG	2	10	112886	112895	0 %	20 %	60 %	20 %	385989623
99	NC_017522	CCGCG	2	10	116806	116815	0 %	0 %	40 %	60 %	385989624
100	NC_017522	TCGTG	2	10	120759	120768	0 %	40 %	40 %	20 %	385989626
101	NC_017522	GCACG	2	10	122414	122423	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017522	CCGGA	2	10	122540	122549	20 %	0 %	40 %	40 %	385989627
103	NC_017522	TGCGC	2	10	125013	125022	0 %	20 %	40 %	40 %	385989628
104	NC_017522	GCGAG	2	10	125524	125533	20 %	0 %	60 %	20 %	385989628
105	NC_017522	GGGGT	2	10	126533	126542	0 %	20 %	80 %	0 %	385989628
106	NC_017522	CCCAC	2	10	127095	127104	20 %	0 %	0 %	80 %	385989628
107	NC_017522	CCGGC	2	10	127605	127614	0 %	0 %	40 %	60 %	385989628
108	NC_017522	TGCGG	2	10	128015	128024	0 %	20 %	60 %	20 %	385989628
109	NC_017522	ATCAC	2	10	129494	129503	40 %	20 %	0 %	40 %	385989629
110	NC_017522	ATCGG	2	10	129542	129551	20 %	20 %	40 %	20 %	385989629
111	NC_017522	CGGGC	2	10	130633	130642	0 %	0 %	60 %	40 %	385989629
112	NC_017522	GCGAT	2	10	132438	132447	20 %	20 %	40 %	20 %	385989631
113	NC_017522	GTTCG	2	10	132659	132668	0 %	40 %	40 %	20 %	385989631
114	NC_017522	CCTGG	2	10	133051	133060	0 %	20 %	40 %	40 %	385989631
115	NC_017522	GGCCC	2	10	133157	133166	0 %	0 %	40 %	60 %	385989631
116	NC_017522	CGTTG	2	10	133669	133678	0 %	40 %	40 %	20 %	385989631
117	NC_017522	CGACC	2	10	133741	133750	20 %	0 %	20 %	60 %	385989631
118	NC_017522	GAGAT	2	10	136761	136770	40 %	20 %	40 %	0 %	385989634
119	NC_017522	CGGCG	2	10	138915	138924	0 %	0 %	60 %	40 %	385989635
120	NC_017522	TGCGG	2	10	139548	139557	0 %	20 %	60 %	20 %	385989636
121	NC_017522	CGCTG	2	10	140255	140264	0 %	20 %	40 %	40 %	385989637
122	NC_017522	GTTGC	2	10	140801	140810	0 %	40 %	40 %	20 %	385989637
123	NC_017522	CCGAT	2	10	141549	141558	20 %	20 %	20 %	40 %	385989637
124	NC_017522	ATCGC	2	10	142240	142249	20 %	20 %	20 %	40 %	385989638
125	NC_017522	AACCG	2	10	142979	142988	40 %	0 %	20 %	40 %	385989638
126	NC_017522	CCGCC	2	10	143566	143575	0 %	0 %	20 %	80 %	385989638
127	NC_017522	CCGCC	2	10	144209	144218	0 %	0 %	20 %	80 %	385989639
128	NC_017522	GGGTC	2	10	145963	145972	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017522	ATCGG	2	10	147693	147702	20 %	20 %	40 %	20 %	385989642
130	NC_017522	ATTGG	2	10	150510	150519	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017522	AGCGA	2	10	152413	152422	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017522	AGCGA	2	10	152466	152475	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017522	TCGTC	2	10	152813	152822	0 %	40 %	20 %	40 %	385989645
134	NC_017522	CACGC	2	10	153277	153286	20 %	0 %	20 %	60 %	385989645
135	NC_017522	ATTCT	2	10	154121	154130	20 %	60 %	0 %	20 %	385989646
136	NC_017522	AGGCG	2	10	154649	154658	20 %	0 %	60 %	20 %	385989646
137	NC_017522	TGACC	2	10	157653	157662	20 %	20 %	20 %	40 %	385989649
138	NC_017522	CGGCG	2	10	157899	157908	0 %	0 %	60 %	40 %	385989649
139	NC_017522	GCACC	2	10	158069	158078	20 %	0 %	20 %	60 %	385989650
140	NC_017522	CCGCA	2	10	159247	159256	20 %	0 %	20 %	60 %	385989651
141	NC_017522	CGCGG	2	10	159326	159335	0 %	0 %	60 %	40 %	385989651
142	NC_017522	CGGTT	2	10	159653	159662	0 %	40 %	40 %	20 %	385989651
143	NC_017522	GTCGC	2	10	159815	159824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017522	GCCGG	2	10	160114	160123	0 %	0 %	60 %	40 %	385989652
145	NC_017522	GCGCG	2	10	160236	160245	0 %	0 %	60 %	40 %	385989652
146	NC_017522	CTGGG	2	10	162449	162458	0 %	20 %	60 %	20 %	385989655
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151	NC_017522	CCGCC	2	10	168101	168110	0 %	0 %	20 %	80 %	385989662
152	NC_017522	GCATG	2	10	169464	169473	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017522	CTACC	2	10	170067	170076	20 %	20 %	0 %	60 %	385989664
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155	NC_017522	ACCAA	2	10	172933	172942	60 %	0 %	0 %	40 %	385989666
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161	NC_017522	GGACA	2	10	176563	176572	40 %	0 %	40 %	20 %	385989669
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172	NC_017522	GGCCG	2	10	194642	194651	0 %	0 %	60 %	40 %	385989684
173	NC_017522	CGGCG	2	10	195396	195405	0 %	0 %	60 %	40 %	385989685
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176	NC_017522	TTGCG	2	10	205303	205312	0 %	40 %	40 %	20 %	385989693
177	NC_017522	TTGCG	2	10	205376	205385	0 %	40 %	40 %	20 %	385989693
178	NC_017522	CCACG	2	10	206961	206970	20 %	0 %	20 %	60 %	385989695
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182	NC_017522	GCCGA	2	10	213191	213200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
183	NC_017522	CCTCG	2	10	213627	213636	0 %	20 %	20 %	60 %	385989702
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191	NC_017522	GCGTC	2	10	220187	220196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_017522	CCGTG	2	10	220340	220349	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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202	NC_017522	CTGCG	2	10	232801	232810	0 %	20 %	40 %	40 %	385989715
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232	NC_017522	GCAGT	2	10	274270	274279	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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244	NC_017522	TGCGC	2	10	300458	300467	0 %	20 %	40 %	40 %	385989766
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249	NC_017522	TGCCA	2	10	309072	309081	20 %	20 %	20 %	40 %	385989774
250	NC_017522	CGCAG	2	10	310228	310237	20 %	0 %	40 %	40 %	385989775
251	NC_017522	CGGCG	2	10	310862	310871	0 %	0 %	60 %	40 %	385989775
252	NC_017522	CGGCC	2	10	311436	311445	0 %	0 %	40 %	60 %	385989776
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258	NC_017522	TCGGC	2	10	314730	314739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
259	NC_017522	CCTGG	2	10	315278	315287	0 %	20 %	40 %	40 %	385989780
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262	NC_017522	GTTGG	2	10	320478	320487	0 %	40 %	60 %	0 %	385989782
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264	NC_017522	GGGAC	2	10	329304	329313	20 %	0 %	60 %	20 %	385989788
265	NC_017522	CCGGC	2	10	330165	330174	0 %	0 %	40 %	60 %	385989789
266	NC_017522	AGTTC	2	10	331440	331449	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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401	NC_017522	GCTTG	2	10	507110	507119	0 %	40 %	40 %	20 %	385989926
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403	NC_017522	ACCGA	2	10	508965	508974	40 %	0 %	20 %	40 %	385989926
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497	NC_017522	GCAGA	2	10	612523	612532	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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