MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 11360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017522	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	385989535
2	NC_017522	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	385989535
3	NC_017522	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	385989535
4	NC_017522	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	385989535
5	NC_017522	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	385989535
6	NC_017522	GCGG	2	8	1690	1697	0 %	0 %	75 %	25 %	385989536
7	NC_017522	AGCG	2	8	2632	2639	25 %	0 %	50 %	25 %	385989537
8	NC_017522	AGGC	2	8	2648	2655	25 %	0 %	50 %	25 %	385989537
9	NC_017522	GTCG	2	8	2664	2671	0 %	25 %	50 %	25 %	385989537
10	NC_017522	CCGA	2	8	3083	3090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017522	GTGG	2	8	3490	3497	0 %	25 %	75 %	0 %	385989538
12	NC_017522	GCCA	2	8	3508	3515	25 %	0 %	25 %	50 %	385989538
13	NC_017522	TCAG	2	8	3852	3859	25 %	25 %	25 %	25 %	385989538
14	NC_017522	CGTT	2	8	4078	4085	0 %	50 %	25 %	25 %	385989538
15	NC_017522	ACGG	2	8	4430	4437	25 %	0 %	50 %	25 %	385989538
16	NC_017522	GCCT	2	8	4492	4499	0 %	25 %	25 %	50 %	385989538
17	NC_017522	CGTC	2	8	4643	4650	0 %	25 %	25 %	50 %	385989539
18	NC_017522	GGTA	2	8	4823	4830	25 %	25 %	50 %	0 %	385989539
19	NC_017522	GGTT	2	8	5005	5012	0 %	50 %	50 %	0 %	385989539
20	NC_017522	CCGC	2	8	5233	5240	0 %	0 %	25 %	75 %	385989539
21	NC_017522	CCAC	2	8	6857	6864	25 %	0 %	0 %	75 %	385989541
22	NC_017522	ACCG	2	8	6876	6883	25 %	0 %	25 %	50 %	385989541
23	NC_017522	CAAG	2	8	7071	7078	50 %	0 %	25 %	25 %	385989541
24	NC_017522	CGCC	2	8	7167	7174	0 %	0 %	25 %	75 %	385989541
25	NC_017522	CGGC	2	8	7982	7989	0 %	0 %	50 %	50 %	385989541
26	NC_017522	GACA	2	8	8662	8669	50 %	0 %	25 %	25 %	385989542
27	NC_017522	CGGT	2	8	8882	8889	0 %	25 %	50 %	25 %	385989542
28	NC_017522	CGAG	2	8	9814	9821	25 %	0 %	50 %	25 %	385989542
29	NC_017522	CCAC	2	8	10344	10351	25 %	0 %	0 %	75 %	385989542
30	NC_017522	CGAC	2	8	10713	10720	25 %	0 %	25 %	50 %	385989542
31	NC_017522	GGTT	2	8	10941	10948	0 %	50 %	50 %	0 %	385989542
32	NC_017522	CCCG	2	8	11490	11497	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017522	GCAC	2	8	12966	12973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017522	GAGC	2	8	13450	13457	25 %	0 %	50 %	25 %	385989544
35	NC_017522	CTCA	2	8	13661	13668	25 %	25 %	0 %	50 %	385989544
36	NC_017522	GCCC	2	8	13811	13818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017522	AACC	2	8	14696	14703	50 %	0 %	0 %	50 %	385989546
38	NC_017522	CCCG	2	8	14805	14812	0 %	0 %	25 %	75 %	385989546
39	NC_017522	ATTC	2	8	15049	15056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017522	ACCC	2	8	15456	15463	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017522	TGAT	2	8	15493	15500	25 %	50 %	25 %	0 %	385989547
42	NC_017522	TGCT	2	8	15540	15547	0 %	50 %	25 %	25 %	385989547
43	NC_017522	GCCC	2	8	16027	16034	0 %	0 %	25 %	75 %	385989547
44	NC_017522	GGGC	2	8	16808	16815	0 %	0 %	75 %	25 %	385989548
45	NC_017522	CTGA	2	8	17263	17270	25 %	25 %	25 %	25 %	385989549
46	NC_017522	TGGC	2	8	17406	17413	0 %	25 %	50 %	25 %	385989549
47	NC_017522	GCTT	2	8	17465	17472	0 %	50 %	25 %	25 %	385989549
48	NC_017522	CAGT	2	8	17493	17500	25 %	25 %	25 %	25 %	385989549
49	NC_017522	CGGT	2	8	17864	17871	0 %	25 %	50 %	25 %	385989549
50	NC_017522	GCCG	2	8	17923	17930	0 %	0 %	50 %	50 %	385989549
51	NC_017522	GCCG	2	8	19009	19016	0 %	0 %	50 %	50 %	385989550
52	NC_017522	CGGG	2	8	19158	19165	0 %	0 %	75 %	25 %	385989550
53	NC_017522	CTGG	2	8	19266	19273	0 %	25 %	50 %	25 %	385989550
54	NC_017522	GTGC	2	8	19766	19773	0 %	25 %	50 %	25 %	385989550
55	NC_017522	GCCG	2	8	19784	19791	0 %	0 %	50 %	50 %	385989550
56	NC_017522	CCGC	2	8	20149	20156	0 %	0 %	25 %	75 %	385989551
57	NC_017522	GCCG	2	8	21613	21620	0 %	0 %	50 %	50 %	385989552
58	NC_017522	CCAG	2	8	22101	22108	25 %	0 %	25 %	50 %	385989552
59	NC_017522	CACC	2	8	22284	22291	25 %	0 %	0 %	75 %	385989552
60	NC_017522	CGGG	2	8	23240	23247	0 %	0 %	75 %	25 %	385989553
61	NC_017522	GCCG	2	8	23331	23338	0 %	0 %	50 %	50 %	385989553
62	NC_017522	GCTG	2	8	23711	23718	0 %	25 %	50 %	25 %	385989553
63	NC_017522	CGGC	2	8	23731	23738	0 %	0 %	50 %	50 %	385989553
64	NC_017522	GCCG	2	8	24402	24409	0 %	0 %	50 %	50 %	385989553
65	NC_017522	CCCA	2	8	24414	24421	25 %	0 %	0 %	75 %	385989553
66	NC_017522	GCTG	2	8	25553	25560	0 %	25 %	50 %	25 %	385989555
67	NC_017522	CGGC	2	8	25601	25608	0 %	0 %	50 %	50 %	385989555
68	NC_017522	GCCG	2	8	25701	25708	0 %	0 %	50 %	50 %	385989555
69	NC_017522	CGGG	2	8	25776	25783	0 %	0 %	75 %	25 %	385989555
70	NC_017522	TCAA	2	8	26853	26860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017522	GAGC	2	8	26881	26888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017522	GGCC	2	8	26895	26902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017522	GCTC	2	8	27844	27851	0 %	25 %	25 %	50 %	385989556
74	NC_017522	CCAA	2	8	28061	28068	50 %	0 %	0 %	50 %	385989556
75	NC_017522	CAGC	2	8	28127	28134	25 %	0 %	25 %	50 %	385989556
76	NC_017522	CGGC	2	8	28947	28954	0 %	0 %	50 %	50 %	385989557
77	NC_017522	CCGG	2	8	29433	29440	0 %	0 %	50 %	50 %	385989557
78	NC_017522	GCTC	2	8	29988	29995	0 %	25 %	25 %	50 %	385989558
79	NC_017522	TGCG	2	8	30127	30134	0 %	25 %	50 %	25 %	385989558
80	NC_017522	CCGG	2	8	30392	30399	0 %	0 %	50 %	50 %	385989558
81	NC_017522	CGTC	2	8	30723	30730	0 %	25 %	25 %	50 %	385989559
82	NC_017522	CACG	2	8	31083	31090	25 %	0 %	25 %	50 %	385989560
83	NC_017522	ACCG	2	8	31164	31171	25 %	0 %	25 %	50 %	385989560
84	NC_017522	CCGG	2	8	31483	31490	0 %	0 %	50 %	50 %	385989560
85	NC_017522	GTCG	2	8	31659	31666	0 %	25 %	50 %	25 %	385989560
86	NC_017522	CCCG	2	8	32281	32288	0 %	0 %	25 %	75 %	385989560
87	NC_017522	ACCA	2	8	32462	32469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017522	CGAG	2	8	32793	32800	25 %	0 %	50 %	25 %	385989561
89	NC_017522	CGAC	2	8	33090	33097	25 %	0 %	25 %	50 %	385989562
90	NC_017522	GCCG	2	8	33817	33824	0 %	0 %	50 %	50 %	385989563
91	NC_017522	CCGA	2	8	34806	34813	25 %	0 %	25 %	50 %	385989564
92	NC_017522	GCTA	2	8	35193	35200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017522	GGCC	2	8	35941	35948	0 %	0 %	50 %	50 %	385989565
94	NC_017522	ATCG	2	8	36434	36441	25 %	25 %	25 %	25 %	385989565
95	NC_017522	GATC	2	8	36772	36779	25 %	25 %	25 %	25 %	385989565
96	NC_017522	CCAC	2	8	37593	37600	25 %	0 %	0 %	75 %	385989565
97	NC_017522	ACCG	2	8	37987	37994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017522	CTGG	2	8	38331	38338	0 %	25 %	50 %	25 %	385989566
99	NC_017522	GCAT	2	8	38726	38733	25 %	25 %	25 %	25 %	385989567
100	NC_017522	GCTG	2	8	39240	39247	0 %	25 %	50 %	25 %	385989567
101	NC_017522	AACG	2	8	39995	40002	50 %	0 %	25 %	25 %	385989567
102	NC_017522	CCGA	2	8	40056	40063	25 %	0 %	25 %	50 %	385989567
103	NC_017522	CCAC	2	8	40212	40219	25 %	0 %	0 %	75 %	385989567
104	NC_017522	GTTG	2	8	40412	40419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017522	CAGC	2	8	40607	40614	25 %	0 %	25 %	50 %	385989568
106	NC_017522	CCGG	2	8	41103	41110	0 %	0 %	50 %	50 %	385989568
107	NC_017522	GGCC	2	8	41634	41641	0 %	0 %	50 %	50 %	385989569
108	NC_017522	CGAT	2	8	42084	42091	25 %	25 %	25 %	25 %	385989569
109	NC_017522	GCCG	2	8	42384	42391	0 %	0 %	50 %	50 %	385989569
110	NC_017522	CACC	2	8	42409	42416	25 %	0 %	0 %	75 %	385989569
111	NC_017522	ACCG	2	8	42632	42639	25 %	0 %	25 %	50 %	385989569
112	NC_017522	GCGT	2	8	42658	42665	0 %	25 %	50 %	25 %	385989569
113	NC_017522	CCAC	2	8	43387	43394	25 %	0 %	0 %	75 %	385989570
114	NC_017522	CGAT	2	8	43396	43403	25 %	25 %	25 %	25 %	385989570
115	NC_017522	GGCC	2	8	44092	44099	0 %	0 %	50 %	50 %	385989572
116	NC_017522	CCCG	2	8	44683	44690	0 %	0 %	25 %	75 %	385989572
117	NC_017522	CGGG	2	8	44712	44719	0 %	0 %	75 %	25 %	385989572
118	NC_017522	CGAC	2	8	45351	45358	25 %	0 %	25 %	50 %	385989573
119	NC_017522	GAGC	2	8	45731	45738	25 %	0 %	50 %	25 %	385989573
120	NC_017522	GGGC	2	8	46890	46897	0 %	0 %	75 %	25 %	385989573
121	NC_017522	CGGC	2	8	46985	46992	0 %	0 %	50 %	50 %	385989573
122	NC_017522	GCCG	2	8	47948	47955	0 %	0 %	50 %	50 %	385989573
123	NC_017522	TTGC	2	8	48112	48119	0 %	50 %	25 %	25 %	385989574
124	NC_017522	CCGC	2	8	48260	48267	0 %	0 %	25 %	75 %	385989574
125	NC_017522	CCGC	2	8	48293	48300	0 %	0 %	25 %	75 %	385989574
126	NC_017522	GGTC	2	8	48401	48408	0 %	25 %	50 %	25 %	385989574
127	NC_017522	CTAC	2	8	48725	48732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017522	CGGG	2	8	48952	48959	0 %	0 %	75 %	25 %	385989575
129	NC_017522	GCAG	2	8	49025	49032	25 %	0 %	50 %	25 %	385989575
130	NC_017522	GTGC	2	8	49925	49932	0 %	25 %	50 %	25 %	385989576
131	NC_017522	GCCG	2	8	50209	50216	0 %	0 %	50 %	50 %	385989576
132	NC_017522	CAGC	2	8	51392	51399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017522	CGGG	2	8	51581	51588	0 %	0 %	75 %	25 %	385989578
134	NC_017522	GCCG	2	8	51681	51688	0 %	0 %	50 %	50 %	385989578
135	NC_017522	GGTG	2	8	52004	52011	0 %	25 %	75 %	0 %	385989578
136	NC_017522	CTCA	2	8	52620	52627	25 %	25 %	0 %	50 %	385989578
137	NC_017522	CGCT	2	8	52759	52766	0 %	25 %	25 %	50 %	385989579
138	NC_017522	GGTA	2	8	53625	53632	25 %	25 %	50 %	0 %	385989580
139	NC_017522	CTGG	2	8	54220	54227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017522	GCCG	2	8	55074	55081	0 %	0 %	50 %	50 %	385989582
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