MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 1539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017522	CCGA	2	8	3083	3090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017522	CCCG	2	8	11490	11497	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_017522	GCAC	2	8	12966	12973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017522	GCCC	2	8	13811	13818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017522	ATTC	2	8	15049	15056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017522	ACCC	2	8	15456	15463	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017522	TCAA	2	8	26853	26860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017522	GAGC	2	8	26881	26888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017522	GGCC	2	8	26895	26902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017522	ACCA	2	8	32462	32469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017522	GCTA	2	8	35193	35200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017522	ACCG	2	8	37987	37994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017522	GTTG	2	8	40412	40419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017522	CTAC	2	8	48725	48732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017522	CAGC	2	8	51392	51399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017522	CTGG	2	8	54220	54227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017522	AGCG	2	8	60761	60768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017522	CGGC	2	8	61503	61510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017522	GCGG	2	8	61515	61522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017522	CGGA	2	8	66545	66552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017522	GCAC	2	8	76721	76728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017522	CGGT	2	8	80721	80728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017522	CGGT	2	8	80906	80913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017522	CAGA	2	8	83370	83377	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017522	CTTC	2	8	83625	83632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017522	CTGG	2	8	85303	85310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017522	CGCA	2	8	87604	87611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017522	CGCT	2	8	95734	95741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017522	CCTG	2	8	95781	95788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017522	GCGA	2	8	95825	95832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017522	ACCG	2	8	97539	97546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017522	TGCG	2	8	98754	98761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017522	CGGG	2	8	101446	101453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017522	CTGG	2	8	101482	101489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017522	GTTG	2	8	103019	103026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017522	TCGA	2	8	121579	121586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017522	TCGC	2	8	121877	121884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017522	GCGG	2	8	122351	122358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017522	ATCC	2	8	123678	123685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017522	GCGA	2	8	128766	128773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017522	CGGG	2	8	128809	128816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017522	GCTC	2	8	129321	129328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017522	CGGG	2	8	132033	132040	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017522	TACG	2	8	136122	136129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017522	TTCT	2	8	137949	137956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017522	ACGC	2	8	138021	138028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017522	GGGC	2	8	138113	138120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017522	AGCA	2	8	139193	139200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017522	GCCG	2	8	141999	142006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017522	GCGT	2	8	146543	146550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017522	GCGG	2	8	147609	147616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017522	GCCG	2	8	150498	150505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017522	CCGG	2	8	153864	153871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017522	GCGT	3	12	153892	153903	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017522	GGCT	2	8	156038	156045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017522	CGCA	2	8	156064	156071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017522	TCGT	2	8	159755	159762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017522	CCGG	2	8	159763	159770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017522	CCCG	2	8	159975	159982	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_017522	GGTA	2	8	168709	168716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017522	ACTT	2	8	169451	169458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017522	ACCC	2	8	177488	177495	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017522	GAGC	2	8	179089	179096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017522	GCCG	2	8	179159	179166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017522	TTGA	2	8	184983	184990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017522	CTGG	2	8	194970	194977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017522	CTGT	2	8	210522	210529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017522	GGCC	2	8	216610	216617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017522	CGGT	2	8	216946	216953	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017522	GATG	2	8	217693	217700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017522	CGGT	2	8	220290	220297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017522	GTTC	2	8	220413	220420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017522	AACT	2	8	228889	228896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017522	GGAA	2	8	229064	229071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017522	ACGT	2	8	229816	229823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017522	ACAT	2	8	229883	229890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017522	GTGC	2	8	239596	239603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017522	AGCA	2	8	241325	241332	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017522	GCGG	2	8	241458	241465	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017522	GCAT	2	8	247148	247155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017522	GAAC	2	8	247283	247290	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017522	CGCA	2	8	251892	251899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017522	GACG	2	8	254301	254308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017522	GCGG	2	8	271182	271189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017522	CGGC	2	8	272548	272555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017522	TGGG	2	8	279261	279268	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017522	GCTA	2	8	285164	285171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017522	ACCA	2	8	285294	285301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017522	TAGA	2	8	286657	286664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017522	TCGT	2	8	287459	287466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017522	ACTT	2	8	290362	290369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017522	TCGT	2	8	291990	291997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017522	AACT	2	8	294040	294047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017522	AACC	2	8	294048	294055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017522	ATGC	2	8	295038	295045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017522	GACG	2	8	300356	300363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017522	TTGC	2	8	307997	308004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017522	GGTC	2	8	308169	308176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017522	TCGG	2	8	308394	308401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017522	CTCG	2	8	321098	321105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017522	CTGC	2	8	331764	331771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017522	GGTA	2	8	333402	333409	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017522	GCCG	2	8	333489	333496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017522	TGGC	2	8	333501	333508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017522	GGCG	2	8	337994	338001	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017522	GGCA	2	8	347871	347878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017522	TCGG	2	8	359198	359205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017522	CTGT	2	8	360380	360387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017522	AATC	2	8	371620	371627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017522	CGGC	2	8	379567	379574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017522	GGCC	2	8	381982	381989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017522	AAGG	2	8	382998	383005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017522	AGCA	2	8	387071	387078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017522	TGAC	2	8	391967	391974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017522	GTCA	2	8	391978	391985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017522	CGGC	2	8	395812	395819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017522	CGAG	2	8	406747	406754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017522	GCCG	2	8	410587	410594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017522	ATCG	2	8	412948	412955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017522	GCCA	2	8	413039	413046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017522	GTCC	2	8	413065	413072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017522	ACGG	2	8	413151	413158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017522	GAGC	2	8	419933	419940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017522	GAGC	2	8	419984	419991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017522	GAGC	2	8	420035	420042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017522	GAGC	2	8	420086	420093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017522	TGCG	2	8	451313	451320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017522	GCTC	2	8	451693	451700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017522	GGAT	2	8	463986	463993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017522	CGAG	2	8	464129	464136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017522	GCAC	2	8	472209	472216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017522	CAAC	2	8	476078	476085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017522	GTCC	2	8	482318	482325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017522	GGGT	2	8	482454	482461	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017522	ACCT	2	8	486179	486186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017522	CGAG	2	8	486414	486421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017522	GAGC	2	8	486472	486479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017522	AGAA	2	8	486584	486591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017522	GCGG	2	8	498960	498967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017522	ACCG	2	8	500840	500847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017522	CGGG	2	8	500877	500884	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017522	GAGG	2	8	502833	502840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017522	GCGT	2	8	502918	502925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017522	ACGG	2	8	506168	506175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017522	GATG	2	8	511142	511149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017522	CTGA	2	8	511766	511773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017522	GCAA	2	8	514402	514409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017522	TGCC	2	8	516136	516143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017522	GCTG	2	8	517275	517282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017522	CCGT	2	8	524320	524327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017522	CGGC	2	8	529632	529639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017522	CGGC	2	8	534375	534382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017522	GACG	2	8	534385	534392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_017522	TGGG	2	8	564615	564622	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017522	GTCC	2	8	606796	606803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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185	NC_017522	GCCC	2	8	621296	621303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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188	NC_017522	TGCC	2	8	635702	635709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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192	NC_017522	TGGC	2	8	650534	650541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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230	NC_017522	AGGT	2	8	727637	727644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
231	NC_017522	TGCC	2	8	729232	729239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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233	NC_017522	CGCA	2	8	731978	731985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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251	NC_017522	CTGC	3	12	763772	763783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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253	NC_017522	CGGG	2	8	774693	774700	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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257	NC_017522	GCGG	2	8	776940	776947	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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259	NC_017522	AGCC	2	8	778675	778682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
260	NC_017522	CGCA	2	8	785511	785518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
261	NC_017522	GCCA	2	8	785624	785631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
262	NC_017522	GCTG	2	8	785867	785874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
263	NC_017522	CAGC	2	8	786028	786035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
264	NC_017522	GGCG	2	8	790890	790897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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267	NC_017522	CCGC	2	8	795189	795196	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
268	NC_017522	GCAA	2	8	795342	795349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
269	NC_017522	AGCT	2	8	796103	796110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
270	NC_017522	GACG	2	8	796163	796170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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273	NC_017522	CTGG	2	8	806111	806118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
274	NC_017522	GGCG	2	8	807254	807261	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
275	NC_017522	CGGC	2	8	807612	807619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
276	NC_017522	CTGG	2	8	807690	807697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
277	NC_017522	GGGC	2	8	826071	826078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
278	NC_017522	GGCC	2	8	826218	826225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
279	NC_017522	GTGG	2	8	828743	828750	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017522	GAGC	2	8	828823	828830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
281	NC_017522	GGGC	2	8	829902	829909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
282	NC_017522	AACG	2	8	830096	830103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_017522	AGCT	2	8	831425	831432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_017522	GGTG	2	8	831848	831855	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017522	AATT	2	8	834614	834621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017522	CGCC	2	8	837223	837230	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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289	NC_017522	CGCT	2	8	846812	846819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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294	NC_017522	GGTG	2	8	884939	884946	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017522	CCGG	2	8	885072	885079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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463	NC_017522	TCGG	2	8	1414712	1414719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
464	NC_017522	GGGC	2	8	1418432	1418439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
465	NC_017522	TAGG	2	8	1422256	1422263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017522	TCGC	2	8	1441436	1441443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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490	NC_017522	GGCC	2	8	1484918	1484925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
491	NC_017522	ACCC	2	8	1492171	1492178	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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494	NC_017522	TGAG	2	8	1506978	1506985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_017522	CCGC	2	8	1510499	1510506	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_017522	GGCA	2	8	1516428	1516435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_017522	CCCA	2	8	1522905	1522912	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
499	NC_017522	TGCG	2	8	1522920	1522927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_017522	ATCC	2	8	1523907	1523914	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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