MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 74233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017522	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989535
2	NC_017522	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989535
3	NC_017522	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
4	NC_017522	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
5	NC_017522	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989535
6	NC_017522	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
7	NC_017522	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
8	NC_017522	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
9	NC_017522	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
10	NC_017522	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
11	NC_017522	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
12	NC_017522	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989535
13	NC_017522	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
14	NC_017522	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989535
15	NC_017522	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
16	NC_017522	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989535
17	NC_017522	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989535
18	NC_017522	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
19	NC_017522	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989535
20	NC_017522	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
21	NC_017522	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
22	NC_017522	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989535
23	NC_017522	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
24	NC_017522	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989535
25	NC_017522	GGT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989536
26	NC_017522	GAG	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989536
27	NC_017522	CCG	2	6	1673	1678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989536
28	NC_017522	GAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989536
29	NC_017522	GCG	2	6	1879	1884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989536
30	NC_017522	TTC	2	6	1937	1942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989536
31	NC_017522	CTA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989537
32	NC_017522	GCC	2	6	2120	2125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
33	NC_017522	CGC	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
34	NC_017522	TGA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989537
35	NC_017522	ACC	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989537
36	NC_017522	CCG	2	6	2345	2350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
37	NC_017522	ACC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989537
38	NC_017522	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989537
39	NC_017522	CCA	2	6	2589	2594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989537
40	NC_017522	CGC	2	6	2818	2823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
41	NC_017522	GCG	2	6	2837	2842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989537
42	NC_017522	CCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
43	NC_017522	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989537
44	NC_017522	GCC	2	6	2896	2901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
45	NC_017522	GTT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
46	NC_017522	CCG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989538
47	NC_017522	TTG	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
48	NC_017522	CGA	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989538
49	NC_017522	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
50	NC_017522	ATT	2	6	3835	3840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385989538
51	NC_017522	CGC	2	6	3868	3873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989538
52	NC_017522	GAC	2	6	3881	3886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989538
53	NC_017522	GGT	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989538
54	NC_017522	CGT	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989538
55	NC_017522	GCC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989538
56	NC_017522	CGG	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989538
57	NC_017522	GCA	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989538
58	NC_017522	CTT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989538
59	NC_017522	CCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989538
60	NC_017522	GAT	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989538
61	NC_017522	TTG	3	9	4374	4382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
62	NC_017522	CGG	2	6	4563	4568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989538
63	NC_017522	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989539
64	NC_017522	CGA	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
65	NC_017522	GTG	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
66	NC_017522	ACG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
67	NC_017522	CAA	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989539
68	NC_017522	ATC	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989539
69	NC_017522	TGT	2	6	4981	4986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989539
70	NC_017522	CGG	2	6	5031	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
71	NC_017522	GAT	2	6	5046	5051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989539
72	NC_017522	TGG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
73	NC_017522	GAA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989539
74	NC_017522	AGC	2	6	5387	5392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
75	NC_017522	GGC	2	6	5402	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
76	NC_017522	GGC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
77	NC_017522	GAC	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
78	NC_017522	GGC	2	6	5558	5563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
79	NC_017522	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
80	NC_017522	GTT	2	6	5600	5605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989539
81	NC_017522	CGA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
82	NC_017522	CGG	2	6	5659	5664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
83	NC_017522	CCG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989539
84	NC_017522	CCG	2	6	5716	5721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989539
85	NC_017522	GGT	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
86	NC_017522	TGC	3	9	5890	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989540
87	NC_017522	CGA	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989540
88	NC_017522	GGT	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989540
89	NC_017522	CCA	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989540
90	NC_017522	ACG	2	6	6150	6155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989540
91	NC_017522	CGC	2	6	6235	6240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989540
92	NC_017522	CGG	2	6	6285	6290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989540
93	NC_017522	AAG	2	6	6613	6618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989541
94	NC_017522	GGT	2	6	6741	6746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
95	NC_017522	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
96	NC_017522	TGC	2	6	6800	6805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989541
97	NC_017522	CGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
98	NC_017522	GTG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
99	NC_017522	CGG	2	6	6912	6917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989541
100	NC_017522	TGG	2	6	6948	6953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
101	NC_017522	GGT	2	6	6975	6980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
102	NC_017522	AAG	2	6	7090	7095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989541
103	NC_017522	CAA	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989541
104	NC_017522	CGA	2	6	7224	7229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
105	NC_017522	GTC	2	6	7249	7254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989541
106	NC_017522	TGG	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
107	NC_017522	AGC	2	6	7414	7419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
108	NC_017522	GGC	2	6	7534	7539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989541
109	NC_017522	GGT	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
110	NC_017522	GCG	2	6	7878	7883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989541
111	NC_017522	ATC	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989541
112	NC_017522	ATC	2	6	8110	8115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989541
113	NC_017522	ACG	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
114	NC_017522	TGT	2	6	8225	8230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989541
115	NC_017522	GTT	3	9	8235	8243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989541
116	NC_017522	CCG	2	6	8293	8298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989541
117	NC_017522	CTG	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989541
118	NC_017522	GAA	2	6	8391	8396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989541
119	NC_017522	CAA	2	6	8400	8405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989541
120	NC_017522	ACC	2	6	8467	8472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989541
121	NC_017522	GAC	2	6	8512	8517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
122	NC_017522	GCC	4	12	8518	8529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989541
123	NC_017522	GTT	2	6	8535	8540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989541
124	NC_017522	GCC	2	6	8677	8682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989542
125	NC_017522	GAC	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989542
126	NC_017522	CAG	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989542
127	NC_017522	TCG	2	6	8766	8771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989542
128	NC_017522	ACC	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989542
129	NC_017522	TGG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989542
130	NC_017522	CGG	2	6	9030	9035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989542
131	NC_017522	CGA	2	6	9094	9099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989542
132	NC_017522	ACG	2	6	9126	9131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989542
133	NC_017522	CTG	2	6	9176	9181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989542
134	NC_017522	GGC	2	6	9194	9199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989542
135	NC_017522	CGC	2	6	9228	9233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989542
136	NC_017522	ACG	2	6	9282	9287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989542
137	NC_017522	CGA	2	6	9289	9294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989542
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139	NC_017522	TCG	2	6	9360	9365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989542
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252	NC_017522	CCG	2	6	18027	18032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989549
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254	NC_017522	CGG	2	6	18093	18098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989549
255	NC_017522	CTG	2	6	18303	18308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989549
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496	NC_017522	CCT	2	6	33907	33912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385989563
497	NC_017522	ACG	2	6	33974	33979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989563
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499	NC_017522	ACG	2	6	34097	34102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989563
500	NC_017522	ACG	2	6	34239	34244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989563

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