MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma haemofelis Ohio2 chromosome

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017520	TAGTTT	2	12	66958	66969	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017520	CTCAAA	2	12	73596	73607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017520	ATTCTT	2	12	88158	88169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017520	TCAGAC	2	12	116241	116252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017520	TAAGGA	2	12	118773	118784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017520	CTCATC	2	12	119013	119024	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017520	CTATGT	2	12	119088	119099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017520	GATTCT	2	12	119260	119271	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017520	AAGCAA	2	12	119290	119301	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017520	TGATGC	2	12	119472	119483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017520	CGTCAA	2	12	119499	119510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017520	TCCTAT	2	12	119519	119530	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017520	TTCAAC	2	12	119653	119664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017520	TAGCTA	2	12	119682	119693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017520	GTCTAT	2	12	119695	119706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017520	TGACAC	2	12	119796	119807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017520	CATCTT	4	24	119822	119845	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017520	TTTCAT	2	12	161249	161260	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017520	ATATCA	2	12	185423	185434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017520	TCACCA	2	12	223439	223450	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017520	CGATCA	2	12	223615	223626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017520	TCTGGA	2	12	224818	224829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017520	GAGTCT	2	12	224939	224950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017520	ATCACA	2	12	225214	225225	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017520	TTCCTG	2	12	228169	228180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017520	CACTGT	2	12	230673	230684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017520	GATGCT	2	12	261819	261830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017520	TCCTTT	2	12	332576	332587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017520	AAATAG	2	12	333276	333287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017520	TAAGGA	2	12	403653	403664	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017520	TCTAAA	2	12	521035	521046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017520	AGGTAG	2	12	527338	527349	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017520	TATTAA	2	12	539889	539900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017520	AAATCC	2	12	553141	553152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017520	TAGAGA	2	12	567888	567899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017520	TTTGAT	2	12	568007	568018	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017520	CTAAAG	2	12	572518	572529	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017520	GGATTC	2	12	681754	681765	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017520	TGTTCC	2	12	825316	825327	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017520	AGTGGA	4	24	825379	825402	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017520	GTGCTT	2	12	825463	825474	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017520	GAGGAA	6	36	828276	828311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017520	AAGTTG	2	12	828384	828395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017520	AGTTTG	2	12	828455	828466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017520	CTGTAA	2	12	849310	849321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017520	GTTGCA	2	12	849423	849434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017520	TCCATT	2	12	905647	905658	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017520	GGGGAA	2	12	938097	938108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017520	GGGAGT	2	12	940143	940154	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017520	TTTTGA	2	12	1004851	1004862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017520	TTTTAA	2	12	1025982	1025993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017520	TTTTAA	2	12	1027452	1027463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017520	AGAGAA	2	12	1054497	1054508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017520	TTTCTT	2	12	1099764	1099775	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.