MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma haemofelis Ohio2 chromosome

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017520	AGCTA	2	10	17684	17693	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017520	TTCAC	2	10	17839	17848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017520	TAACT	2	10	70141	70150	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017520	ACCTT	2	10	112631	112640	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017520	TCTTA	2	10	112652	112661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017520	CCAGC	2	10	113451	113460	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017520	AAATG	2	10	116012	116021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017520	GTACA	2	10	117154	117163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017520	CTAGA	2	10	118028	118037	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017520	AACAC	2	10	118978	118987	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017520	TAACT	2	10	120339	120348	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017520	CAATT	2	10	120686	120695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017520	TCTCA	2	10	155792	155801	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017520	CATAA	2	10	157315	157324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017520	TAAAT	2	10	157437	157446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017520	CGCTT	2	10	166851	166860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017520	CCTCC	2	10	167125	167134	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_017520	GATCA	2	10	167218	167227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017520	GCAAA	2	10	176225	176234	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017520	AGCTA	2	10	188059	188068	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017520	TGATT	2	10	190210	190219	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017520	AGCAC	2	10	199600	199609	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017520	AGTAA	2	10	211643	211652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017520	ACTTA	2	10	211926	211935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017520	AATCA	2	10	212219	212228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017520	TCCCT	2	10	212867	212876	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017520	TAAAG	2	10	223963	223972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017520	TAGCT	2	10	230268	230277	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017520	TAGTG	2	10	230650	230659	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017520	GATTT	2	10	248460	248469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017520	CATCT	2	10	261779	261788	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017520	TACAG	2	10	289317	289326	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017520	CATTT	2	10	350917	350926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017520	GATAA	2	10	372173	372182	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017520	TAAGT	2	10	408484	408493	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017520	AGCTT	2	10	415793	415802	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017520	ATTTT	2	10	447470	447479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017520	TTTGT	2	10	450592	450601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017520	AAGGG	2	10	459767	459776	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017520	ACCTT	2	10	467207	467216	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017520	GAAAT	2	10	491698	491707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017520	TGAAG	2	10	509825	509834	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017520	TAATC	2	10	516079	516088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017520	TGAGA	2	10	520470	520479	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017520	ATTCG	2	10	523836	523845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017520	AATTC	2	10	567528	567537	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017520	GAAGA	2	10	567734	567743	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017520	ACTAG	2	10	570594	570603	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017520	TCGGT	2	10	570910	570919	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017520	TTCAC	2	10	571481	571490	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017520	TACTT	2	10	580234	580243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017520	AATAA	2	10	594509	594518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017520	CCCAA	2	10	595979	595988	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017520	ATCTA	2	10	605920	605929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017520	AGAGA	2	10	657031	657040	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017520	TTCTC	2	10	681449	681458	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017520	GAATT	2	10	713759	713768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017520	TTAAA	2	10	733329	733338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017520	TCTAC	2	10	783276	783285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017520	AGAAT	2	10	792214	792223	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017520	TCAAA	2	10	796933	796942	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017520	TTAAT	2	10	828126	828135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017520	TTTGT	2	10	852488	852497	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017520	TGGGT	2	10	906208	906217	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017520	ATTTT	2	10	964284	964293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017520	ATAAG	2	10	1067171	1067180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.