MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	CAAAAT	2	12	4149	4160	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017519	ATTCTA	2	12	4298	4309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017519	AATTTT	2	12	4555	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017519	AAATTT	2	12	4865	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017519	ATAAAA	2	12	5515	5526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017519	ATTTAA	2	12	42073	42084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017519	ATTTAA	2	12	43370	43381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017519	TACAAA	2	12	43976	43987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017519	AAATTA	2	12	47499	47510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017519	ATTTAG	2	12	55317	55328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017519	TAGTGT	2	12	109264	109275	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017519	TATTTT	2	12	123281	123292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017519	ATTTTA	2	12	125052	125063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017519	AGCAAA	2	12	136230	136241	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017519	AATTAC	2	12	136540	136551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017519	TTTATA	2	12	154273	154284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017519	TATTTT	2	12	178262	178273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017519	AAATAA	2	12	182221	182232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017519	CAAAAG	2	12	184754	184765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017519	ACTAAA	2	12	200493	200504	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017519	ATGAAA	2	12	212868	212879	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017519	ATTACA	2	12	232973	232984	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017519	CAAAAA	2	12	250519	250530	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017519	ATTTGA	2	12	259768	259779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017519	ATTTGA	2	12	266062	266073	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017519	AATCAT	2	12	267059	267070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017519	ATTTTG	2	12	267312	267323	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017519	TTTGAA	2	12	267550	267561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017519	TTAATT	2	12	268933	268944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017519	TAAAAA	2	12	294908	294919	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017519	ATTTTT	2	12	329344	329355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017519	TAAAAA	2	12	336232	336243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017519	TCTTTA	2	12	369625	369636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017519	AGCTGT	2	12	370103	370114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017519	TTAAAA	2	12	379012	379023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017519	CTTTAA	2	12	380987	380998	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017519	TATCTG	2	12	381041	381052	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017519	TTTTCA	2	12	382269	382280	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017519	AACAAA	2	12	396844	396855	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017519	AAATAA	2	12	397954	397965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017519	ATATTT	2	12	415294	415305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017519	TATAAT	2	12	416825	416836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017519	TATTTT	2	12	418258	418269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017519	CAATTT	2	12	418358	418369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017519	TACCAT	2	12	420838	420849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017519	TCTATC	2	12	424068	424079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017519	TAAATT	2	12	424385	424396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017519	ATCAAA	2	12	424980	424991	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017519	TGTAAT	2	12	427196	427207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017519	CTCCAG	2	12	452500	452511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017519	CTTTCG	2	12	454770	454781	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017519	TTTATA	2	12	457101	457112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017519	TAATTT	2	12	467410	467421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017519	CAATAA	2	12	473762	473773	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017519	ATTATA	2	12	475295	475306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017519	CATATA	2	12	483613	483624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017519	CTACAT	2	12	485794	485805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017519	TTTTCT	2	12	491690	491701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017519	ATTTTT	2	12	514412	514423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017519	TAATTT	2	12	524699	524710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017519	TTATGA	2	12	528202	528213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017519	TGATAA	2	12	528797	528808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017519	CCAATT	2	12	531002	531013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017519	ATTTAA	2	12	555707	555718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017519	AACATT	2	12	560822	560833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017519	TTTTCT	2	12	562379	562390	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017519	ATAAGA	2	12	562435	562446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017519	TTAAAA	2	12	566782	566793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017519	TTTTTA	2	12	567494	567505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017519	AAAGTA	2	12	567536	567547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017519	GATTTT	2	12	572882	572893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017519	GTTTTT	2	12	593619	593630	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017519	ATTTTT	2	12	595841	595852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017519	ATTTTA	2	12	601369	601380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017519	TATTTT	2	12	601473	601484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017519	ATAAGC	2	12	603544	603555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017519	TTATAA	2	12	614547	614558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017519	TTAAAA	2	12	626325	626336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017519	ATTTTT	2	12	647228	647239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017519	TTTTAT	2	12	676693	676704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017519	ATTACA	2	12	698533	698544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017519	TTTAAA	2	12	705987	705998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017519	TCAAAA	2	12	727912	727923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017519	AAATTA	2	12	728399	728410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017519	ATTTTT	2	12	730304	730315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017519	TGTAAT	2	12	733917	733928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017519	TATTTT	3	18	737145	737162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017519	TTTGTT	2	12	749781	749792	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017519	TTAAAA	2	12	749952	749963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017519	TTGGCT	2	12	750775	750786	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017519	TTTTAT	2	12	750793	750804	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017519	AATTTT	2	12	757891	757902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017519	ATTTTT	2	12	758297	758308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017519	TTAGAT	2	12	758919	758930	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017519	ATTAAT	2	12	763322	763333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017519	ATTGAA	2	12	763819	763830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017519	ATTTTA	2	12	764338	764349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017519	AAAAAT	2	12	770168	770179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017519	TTTTTA	2	12	793336	793347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017519	ATCAGT	2	12	828158	828169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017519	CCAATA	2	12	829307	829318	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.