MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	TAAAAA	2	12	1009	1020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385858115
2	NC_017519	TTAAAG	2	12	7005	7016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385858121
3	NC_017519	TCTTTA	2	12	7711	7722	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385858122
4	NC_017519	ATTTAG	2	12	11113	11124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385858129
5	NC_017519	TCAATT	2	12	11706	11717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385858129
6	NC_017519	TTTTGA	2	12	18049	18060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385858135
7	NC_017519	ATCTGG	2	12	18241	18252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385858135
8	NC_017519	AAGCAA	3	18	18504	18521	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385858135
9	NC_017519	GATTTT	2	12	22190	22201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385858137
10	NC_017519	AAGCTA	2	12	22737	22748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385858137
11	NC_017519	ATTTAT	2	12	23583	23594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858137
12	NC_017519	TTTGAT	2	12	23603	23614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385858137
13	NC_017519	ACAAAA	2	12	24697	24708	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385858137
14	NC_017519	TATTAC	2	12	25415	25426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385858137
15	NC_017519	AAAAGA	2	12	25699	25710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385858137
16	NC_017519	TAAAAT	2	12	26169	26180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858137
17	NC_017519	AAAATT	2	12	26740	26751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858137
18	NC_017519	AAAATC	2	12	33926	33937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858140
19	NC_017519	TTTTAG	2	12	34265	34276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385858140
20	NC_017519	ATCCAT	2	12	34727	34738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858141
21	NC_017519	TTTTTG	2	12	35216	35227	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385858141
22	NC_017519	AAAATC	2	12	36331	36342	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858142
23	NC_017519	TCAAAA	2	12	36683	36694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858142
24	NC_017519	TCCTGA	2	12	40130	40141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385858146
25	NC_017519	TGATCC	2	12	40984	40995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385858147
26	NC_017519	TTCCTG	2	12	41908	41919	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385858148
27	NC_017519	TCTAAA	2	12	46756	46767	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385858153
28	NC_017519	AACAAT	2	12	46938	46949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858153
29	NC_017519	AAAATA	2	12	49714	49725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385858155
30	NC_017519	TAAAGA	2	12	49787	49798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385858155
31	NC_017519	ATATTT	2	12	49840	49851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858155
32	NC_017519	GGTTCT	2	12	51105	51116	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385858158
33	NC_017519	ATCTAA	2	12	52886	52897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385858158
34	NC_017519	ATGAAA	2	12	53760	53771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385858159
35	NC_017519	GATAAA	2	12	55580	55591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385858160
36	NC_017519	TTTTCA	2	12	56581	56592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385858161
37	NC_017519	ACTTTT	2	12	57037	57048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385858161
38	NC_017519	AAAATT	2	12	58216	58227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858163
39	NC_017519	AATGAT	2	12	59623	59634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385858165
40	NC_017519	CTTGTT	2	12	61547	61558	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858167
41	NC_017519	TAGCAA	2	12	62367	62378	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385858168
42	NC_017519	TTTTAA	2	12	63840	63851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858170
43	NC_017519	GTCTTT	2	12	64197	64208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858170
44	NC_017519	ACCTGA	2	12	64413	64424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385858170
45	NC_017519	TTGTCT	2	12	66338	66349	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858171
46	NC_017519	TAAAAC	2	12	67366	67377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858171
47	NC_017519	TTTATC	2	12	68695	68706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385858171
48	NC_017519	TCTGTA	2	12	70106	70117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385858171
49	NC_017519	ATCAAA	2	12	70309	70320	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858171
50	NC_017519	TAAAAA	2	12	74548	74559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385858174
51	NC_017519	ATATAA	2	12	75786	75797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858176
52	NC_017519	AAAATT	2	12	76054	76065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858176
53	NC_017519	ATTTTC	2	12	80731	80742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385858181
54	NC_017519	GCAAAA	2	12	85846	85857	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385858188
55	NC_017519	CTGCTT	2	12	88051	88062	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385858191
56	NC_017519	ACCTGA	2	12	88073	88084	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385858191
57	NC_017519	CTTTTC	2	12	88423	88434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858191
58	NC_017519	TGTCTT	2	12	89878	89889	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858192
59	NC_017519	ACAACC	2	12	91760	91771	50 %	0 %	0 %	50 %	385858193
60	NC_017519	AGAAAA	2	12	91790	91801	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385858193
61	NC_017519	TGAGAA	2	12	92574	92585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385858193
62	NC_017519	TGATTT	2	12	95983	95994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385858197
63	NC_017519	TAAATT	2	12	97762	97773	50 %	50 %	0 %	0 %	385858198
64	NC_017519	AATTTT	2	12	98503	98514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858199
65	NC_017519	TCTGTT	2	12	99398	99409	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858199
66	NC_017519	TTGAAA	2	12	100536	100547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385858199
67	NC_017519	TTTTGA	2	12	100775	100786	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385858199
68	NC_017519	TTGCAA	2	12	104054	104065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385858200
69	NC_017519	TGATTC	2	12	104355	104366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385858200
70	NC_017519	AAAGAA	2	12	105199	105210	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385858202
71	NC_017519	GTGAAG	2	12	106215	106226	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385858204
72	NC_017519	GAAAAT	2	12	106592	106603	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385858204
73	NC_017519	TAAAAA	2	12	108532	108543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385858205
74	NC_017519	TTTTAT	2	12	109029	109040	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385858206
75	NC_017519	TTTGTT	2	12	111092	111103	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385858207
76	NC_017519	TATCAA	2	12	112703	112714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385858209
77	NC_017519	TAAAAA	2	12	115291	115302	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385858212
78	NC_017519	ATTTGG	2	12	116581	116592	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385858214
79	NC_017519	TTTAGC	2	12	117148	117159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385858214
80	NC_017519	TTTATT	2	12	117854	117865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385858215
81	NC_017519	TTTTTC	2	12	118988	118999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385858215
82	NC_017519	AATTAA	2	12	119855	119866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858216
83	NC_017519	ACTTCA	2	12	120759	120770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858216
84	NC_017519	ATGTTG	2	12	123825	123836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385858217
85	NC_017519	ATCAAA	2	12	128646	128657	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858222
86	NC_017519	GCTTTT	2	12	128719	128730	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858222
87	NC_017519	ACAAAA	2	12	131202	131213	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385858225
88	NC_017519	CAAAAT	2	12	132250	132261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858227
89	NC_017519	ACAAAG	2	12	138040	138051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385858233
90	NC_017519	TGGAAT	2	12	138948	138959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858234
91	NC_017519	ATTTCA	2	12	140251	140262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385858236
92	NC_017519	ATTGAA	2	12	145854	145865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385858239
93	NC_017519	GATTTT	2	12	146843	146854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385858240
94	NC_017519	TTTGCT	2	12	149989	150000	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858243
95	NC_017519	AATTTA	2	12	151180	151191	50 %	50 %	0 %	0 %	385858244
96	NC_017519	TAATGT	2	12	151895	151906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385858246
97	NC_017519	ATGTTG	2	12	152093	152104	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385858246
98	NC_017519	AAGTAG	2	12	152384	152395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385858246
99	NC_017519	AAAAGA	2	12	153775	153786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385858247
100	NC_017519	AAAATC	2	12	158474	158485	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385858249
101	NC_017519	ATGTGT	2	12	161975	161986	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385858251
102	NC_017519	TTTCTT	2	12	166739	166750	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385858256
103	NC_017519	TTTAAA	2	12	166754	166765	50 %	50 %	0 %	0 %	385858256
104	NC_017519	TTTTAC	2	12	166884	166895	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385858257
105	NC_017519	TTCAAA	2	12	167199	167210	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385858258
106	NC_017519	TTTAAA	2	12	168108	168119	50 %	50 %	0 %	0 %	385858259
107	NC_017519	CATTTT	2	12	168800	168811	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385858260
108	NC_017519	TTTTTG	2	12	171167	171178	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385858263
109	NC_017519	AAAGCA	2	12	172764	172775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385858264
110	NC_017519	TACTTC	2	12	177786	177797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385858267
111	NC_017519	ACACAA	2	12	178501	178512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858268
112	NC_017519	GCCTTT	2	12	179335	179346	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385858268
113	NC_017519	TGTAAT	2	12	180630	180641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385858269
114	NC_017519	AGATTA	2	12	181708	181719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385858271
115	NC_017519	AAAAGT	2	12	183502	183513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385858274
116	NC_017519	GTTGCA	2	12	185504	185515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385858276
117	NC_017519	CTTTGT	2	12	185850	185861	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385858276
118	NC_017519	TCTGAT	2	12	186572	186583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385858276
119	NC_017519	CAAAAA	2	12	186588	186599	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385858276
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