MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	AAAAC	2	10	734	743	80 %	0 %	0 %	20 %	385858115
2	NC_017519	TATTT	2	10	761	770	20 %	80 %	0 %	0 %	385858115
3	NC_017519	TTTTG	2	10	855	864	0 %	80 %	20 %	0 %	385858115
4	NC_017519	ATTTA	2	10	977	986	40 %	60 %	0 %	0 %	385858115
5	NC_017519	TTTTG	2	10	1276	1285	0 %	80 %	20 %	0 %	385858115
6	NC_017519	ATAAA	2	10	1397	1406	80 %	20 %	0 %	0 %	385858115
7	NC_017519	ATGTA	2	10	1519	1528	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017519	GATAA	2	10	2458	2467	60 %	20 %	20 %	0 %	385858118
9	NC_017519	AAATT	2	10	2676	2685	60 %	40 %	0 %	0 %	385858119
10	NC_017519	ATTTA	2	10	5099	5108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017519	AAATT	2	10	5493	5502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017519	TGATT	2	10	6173	6182	20 %	60 %	20 %	0 %	385858120
13	NC_017519	ATCTA	2	10	6669	6678	40 %	40 %	0 %	20 %	385858120
14	NC_017519	TTTTA	2	10	6776	6785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017519	TGCTT	2	10	7700	7709	0 %	60 %	20 %	20 %	385858122
16	NC_017519	AATTA	2	10	9115	9124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017519	TCTAA	2	10	9936	9945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017519	TTTAA	2	10	9987	9996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017519	AAATT	2	10	11038	11047	60 %	40 %	0 %	0 %	385858129
20	NC_017519	ATAAA	2	10	12481	12490	80 %	20 %	0 %	0 %	385858129
21	NC_017519	TTTTG	2	10	13421	13430	0 %	80 %	20 %	0 %	385858131
22	NC_017519	GATTT	2	10	13777	13786	20 %	60 %	20 %	0 %	385858132
23	NC_017519	TTCAA	2	10	14057	14066	40 %	40 %	0 %	20 %	385858132
24	NC_017519	GTTGA	2	10	14770	14779	20 %	40 %	40 %	0 %	385858132
25	NC_017519	CAATT	2	10	16802	16811	40 %	40 %	0 %	20 %	385858134
26	NC_017519	TTACT	2	10	17087	17096	20 %	60 %	0 %	20 %	385858134
27	NC_017519	AATTA	2	10	18319	18328	60 %	40 %	0 %	0 %	385858135
28	NC_017519	GGATA	2	10	20237	20246	40 %	20 %	40 %	0 %	385858136
29	NC_017519	AATTA	2	10	20593	20602	60 %	40 %	0 %	0 %	385858137
30	NC_017519	AGAAA	2	10	21077	21086	80 %	0 %	20 %	0 %	385858137
31	NC_017519	CAAAA	2	10	21375	21384	80 %	0 %	0 %	20 %	385858137
32	NC_017519	CAACA	2	10	21387	21396	60 %	0 %	0 %	40 %	385858137
33	NC_017519	CATTT	2	10	21544	21553	20 %	60 %	0 %	20 %	385858137
34	NC_017519	TTAAA	2	10	21594	21603	60 %	40 %	0 %	0 %	385858137
35	NC_017519	AGTTT	2	10	22457	22466	20 %	60 %	20 %	0 %	385858137
36	NC_017519	CAAAT	2	10	24004	24013	60 %	20 %	0 %	20 %	385858137
37	NC_017519	CAAAC	2	10	24170	24179	60 %	0 %	0 %	40 %	385858137
38	NC_017519	TTCAA	2	10	24522	24531	40 %	40 %	0 %	20 %	385858137
39	NC_017519	ATTTA	2	10	26839	26848	40 %	60 %	0 %	0 %	385858137
40	NC_017519	TCAAC	2	10	28064	28073	40 %	20 %	0 %	40 %	385858137
41	NC_017519	GAATT	2	10	29867	29876	40 %	40 %	20 %	0 %	385858138
42	NC_017519	AATTT	2	10	30293	30302	40 %	60 %	0 %	0 %	385858138
43	NC_017519	GTTTA	2	10	30947	30956	20 %	60 %	20 %	0 %	385858138
44	NC_017519	GTAAT	2	10	31184	31193	40 %	40 %	20 %	0 %	385858138
45	NC_017519	TGAAA	2	10	35509	35518	60 %	20 %	20 %	0 %	385858141
46	NC_017519	CTAAG	2	10	38392	38401	40 %	20 %	20 %	20 %	385858144
47	NC_017519	ATAAA	2	10	40582	40591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017519	TGGAT	2	10	41588	41597	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
49	NC_017519	TGGAT	2	10	41627	41636	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
50	NC_017519	TGGAT	2	10	41666	41675	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
51	NC_017519	TGGAT	2	10	41705	41714	20 %	40 %	40 %	0 %	385858148
52	NC_017519	GGTTT	2	10	43689	43698	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017519	TTATT	2	10	43746	43755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017519	TTAAT	2	10	43830	43839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017519	TTATT	2	10	44021	44030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017519	TATCT	2	10	45578	45587	20 %	60 %	0 %	20 %	385858152
57	NC_017519	CAAAA	2	10	45771	45780	80 %	0 %	0 %	20 %	385858152
58	NC_017519	GAAAA	2	10	46373	46382	80 %	0 %	20 %	0 %	385858153
59	NC_017519	AATTA	2	10	46785	46794	60 %	40 %	0 %	0 %	385858153
60	NC_017519	TTTAT	2	10	46887	46896	20 %	80 %	0 %	0 %	385858153
61	NC_017519	TAATT	2	10	46923	46932	40 %	60 %	0 %	0 %	385858153
62	NC_017519	CTATA	2	10	48029	48038	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017519	ATTTT	2	10	48652	48661	20 %	80 %	0 %	0 %	385858154
64	NC_017519	TAAAA	2	10	48905	48914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017519	ATTAT	2	10	49801	49810	40 %	60 %	0 %	0 %	385858155
66	NC_017519	AAATA	2	10	50301	50310	80 %	20 %	0 %	0 %	385858157
67	NC_017519	AATTT	2	10	51225	51234	40 %	60 %	0 %	0 %	385858158
68	NC_017519	TGATA	2	10	52466	52475	40 %	40 %	20 %	0 %	385858158
69	NC_017519	TCATA	2	10	53693	53702	40 %	40 %	0 %	20 %	385858159
70	NC_017519	AATTA	2	10	54669	54678	60 %	40 %	0 %	0 %	385858159
71	NC_017519	GAGCA	2	10	56124	56133	40 %	0 %	40 %	20 %	385858160
72	NC_017519	AATAA	2	10	57647	57656	80 %	20 %	0 %	0 %	385858162
73	NC_017519	GCTAA	2	10	57678	57687	40 %	20 %	20 %	20 %	385858162
74	NC_017519	AATTT	2	10	59550	59559	40 %	60 %	0 %	0 %	385858164
75	NC_017519	TTGTT	2	10	60633	60642	0 %	80 %	20 %	0 %	385858167
76	NC_017519	TTTGC	2	10	62121	62130	0 %	60 %	20 %	20 %	385858168
77	NC_017519	ATTTT	2	10	63760	63769	20 %	80 %	0 %	0 %	385858169
78	NC_017519	TTTTG	2	10	69518	69527	0 %	80 %	20 %	0 %	385858171
79	NC_017519	TAAAT	2	10	69721	69730	60 %	40 %	0 %	0 %	385858171
80	NC_017519	TTGTC	2	10	71705	71714	0 %	60 %	20 %	20 %	385858171
81	NC_017519	AAAAT	2	10	71999	72008	80 %	20 %	0 %	0 %	385858171
82	NC_017519	AAAAT	2	10	73064	73073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017519	TAAAA	2	10	74707	74716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017519	GTAGA	2	10	75048	75057	40 %	20 %	40 %	0 %	385858175
85	NC_017519	TCAAT	2	10	75058	75067	40 %	40 %	0 %	20 %	385858175
86	NC_017519	TTTTC	2	10	76457	76466	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017519	ATTTT	2	10	77125	77134	20 %	80 %	0 %	0 %	385858177
88	NC_017519	ATTAA	2	10	78237	78246	60 %	40 %	0 %	0 %	385858179
89	NC_017519	TTTTC	2	10	79037	79046	0 %	80 %	0 %	20 %	385858181
90	NC_017519	AATAC	2	10	79813	79822	60 %	20 %	0 %	20 %	385858181
91	NC_017519	AATAA	2	10	82114	82123	80 %	20 %	0 %	0 %	385858183
92	NC_017519	ATAAA	2	10	82409	82418	80 %	20 %	0 %	0 %	385858183
93	NC_017519	AATCT	2	10	82590	82599	40 %	40 %	0 %	20 %	385858184
94	NC_017519	AAAAT	2	10	83219	83228	80 %	20 %	0 %	0 %	385858185
95	NC_017519	TAATT	2	10	83919	83928	40 %	60 %	0 %	0 %	385858186
96	NC_017519	AATTA	2	10	85602	85611	60 %	40 %	0 %	0 %	385858188
97	NC_017519	TTTGA	2	10	88633	88642	20 %	60 %	20 %	0 %	385858191
98	NC_017519	ATAAA	2	10	88754	88763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017519	AATTA	2	10	89521	89530	60 %	40 %	0 %	0 %	385858192
100	NC_017519	CAAAA	2	10	90608	90617	80 %	0 %	0 %	20 %	385858192
101	NC_017519	TAAAC	2	10	91658	91667	60 %	20 %	0 %	20 %	385858193
102	NC_017519	ATTCT	2	10	92222	92231	20 %	60 %	0 %	20 %	385858193
103	NC_017519	TCAAA	2	10	92613	92622	60 %	20 %	0 %	20 %	385858193
104	NC_017519	GAAAA	2	10	93173	93182	80 %	0 %	20 %	0 %	385858194
105	NC_017519	ATTTT	2	10	93537	93546	20 %	80 %	0 %	0 %	385858194
106	NC_017519	TATTT	2	10	95632	95641	20 %	80 %	0 %	0 %	385858197
107	NC_017519	TTGTT	2	10	97043	97052	0 %	80 %	20 %	0 %	385858198
108	NC_017519	AAAAT	2	10	97805	97814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017519	AATTA	2	10	99856	99865	60 %	40 %	0 %	0 %	385858199
110	NC_017519	AAATT	2	10	99948	99957	60 %	40 %	0 %	0 %	385858199
111	NC_017519	CTAAA	2	10	100431	100440	60 %	20 %	0 %	20 %	385858199
112	NC_017519	TAAAT	2	10	101644	101653	60 %	40 %	0 %	0 %	385858199
113	NC_017519	TTTCA	2	10	102234	102243	20 %	60 %	0 %	20 %	385858199
114	NC_017519	GTTTT	2	10	102277	102286	0 %	80 %	20 %	0 %	385858199
115	NC_017519	ATTTT	2	10	103646	103655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017519	TGTTT	2	10	104486	104495	0 %	80 %	20 %	0 %	385858200
117	NC_017519	TTAAA	2	10	109385	109394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017519	TTCAA	2	10	110416	110425	40 %	40 %	0 %	20 %	385858207
119	NC_017519	TGATT	2	10	111478	111487	20 %	60 %	20 %	0 %	385858207
120	NC_017519	CTCAT	2	10	112376	112385	20 %	40 %	0 %	40 %	385858208
121	NC_017519	ATATT	2	10	113013	113022	40 %	60 %	0 %	0 %	385858209
122	NC_017519	CTTTT	2	10	113222	113231	0 %	80 %	0 %	20 %	385858210
123	NC_017519	ACTTA	2	10	113345	113354	40 %	40 %	0 %	20 %	385858210
124	NC_017519	AACTA	2	10	113444	113453	60 %	20 %	0 %	20 %	385858210
125	NC_017519	ATTAA	2	10	116215	116224	60 %	40 %	0 %	0 %	385858213
126	NC_017519	AGCTC	2	10	116519	116528	20 %	20 %	20 %	40 %	385858214
127	NC_017519	TTTTC	2	10	117688	117697	0 %	80 %	0 %	20 %	385858215
128	NC_017519	TATGA	2	10	118642	118651	40 %	40 %	20 %	0 %	385858215
129	NC_017519	ATTTA	2	10	119179	119188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017519	AGAAA	2	10	120051	120060	80 %	0 %	20 %	0 %	385858216
131	NC_017519	TAATT	2	10	121562	121571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017519	TTTAA	2	10	121731	121740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017519	ATTTG	2	10	121787	121796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017519	TCAAA	2	10	122971	122980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017519	TAATT	2	10	123139	123148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017519	TTAAT	2	10	123319	123328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017519	AATTA	2	10	123545	123554	60 %	40 %	0 %	0 %	385858217
138	NC_017519	ACTAA	2	10	125414	125423	60 %	20 %	0 %	20 %	385858219
139	NC_017519	AATTG	2	10	125450	125459	40 %	40 %	20 %	0 %	385858219
140	NC_017519	TAATT	2	10	125575	125584	40 %	60 %	0 %	0 %	385858219
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