MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	ATGTA	2	10	1519	1528	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017519	ATTTA	2	10	5099	5108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017519	AAATT	2	10	5493	5502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017519	TTTTA	2	10	6776	6785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017519	AATTA	2	10	9115	9124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017519	TCTAA	2	10	9936	9945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017519	TTTAA	2	10	9987	9996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017519	ATAAA	2	10	40582	40591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017519	GGTTT	2	10	43689	43698	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017519	TTATT	2	10	43746	43755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017519	TTAAT	2	10	43830	43839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017519	TTATT	2	10	44021	44030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017519	CTATA	2	10	48029	48038	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017519	TAAAA	2	10	48905	48914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017519	AAAAT	2	10	73064	73073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017519	TAAAA	2	10	74707	74716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017519	TTTTC	2	10	76457	76466	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017519	ATAAA	2	10	88754	88763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017519	AAAAT	2	10	97805	97814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017519	ATTTT	2	10	103646	103655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017519	TTAAA	2	10	109385	109394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017519	ATTTA	2	10	119179	119188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017519	TAATT	2	10	121562	121571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017519	TTTAA	2	10	121731	121740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017519	ATTTG	2	10	121787	121796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017519	TCAAA	2	10	122971	122980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017519	TAATT	2	10	123139	123148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017519	TTAAT	2	10	123319	123328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017519	TAAAT	2	10	128239	128248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017519	TTTTA	2	10	134995	135004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017519	ATAAA	2	10	143328	143337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017519	TAAAA	2	10	143352	143361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017519	ATATT	2	10	156940	156949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017519	ATTTT	2	10	163678	163687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017519	TAAAA	2	10	163787	163796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017519	GTGTT	2	10	164193	164202	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017519	AAATT	2	10	164472	164481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017519	TAATT	2	10	164843	164852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017519	ATTAT	2	10	182355	182364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017519	TTTTA	2	10	184869	184878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017519	TAAAA	2	10	187966	187975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017519	TAAAA	2	10	206580	206589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017519	CAAAA	2	10	209750	209759	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017519	AGATT	2	10	210537	210546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017519	TACAT	2	10	211298	211307	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017519	AACTA	2	10	213042	213051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017519	ATAAA	2	10	232997	233006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017519	ATTTT	2	10	246028	246037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017519	TTGAA	2	10	246092	246101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017519	AATTT	2	10	249480	249489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017519	AAATT	2	10	250916	250925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017519	TTTTG	2	10	251671	251680	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017519	TTTAA	2	10	258112	258121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017519	TAGTT	2	10	259523	259532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017519	ATTTA	2	10	264239	264248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017519	TAAAA	2	10	264311	264320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017519	TAGTT	2	10	264377	264386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017519	ATTTA	2	10	266187	266196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017519	AATCA	2	10	266458	266467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017519	TGCAT	2	10	267787	267796	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017519	TAATT	2	10	268883	268892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017519	AATTT	2	10	269239	269248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017519	ATTAT	2	10	294885	294894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017519	TTAAA	2	10	310186	310195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017519	AATTA	2	10	314421	314430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017519	ATTTA	2	10	324523	324532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017519	ATTAA	2	10	338163	338172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017519	ATTTT	2	10	348070	348079	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017519	TTTAA	2	10	356526	356535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017519	GGTAA	2	10	370233	370242	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017519	ATTAT	2	10	373222	373231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017519	ATTTT	2	10	381027	381036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017519	TAAAT	2	10	381752	381761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017519	CTTTG	2	10	383484	383493	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017519	ATTAA	2	10	410001	410010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017519	TGTGT	2	10	415389	415398	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017519	CTTTT	2	10	416367	416376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017519	TAAAT	2	10	416546	416555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017519	AAATT	2	10	416747	416756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017519	CAATG	2	10	417667	417676	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017519	TTTGT	2	10	418038	418047	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017519	ATTTT	2	10	418823	418832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017519	TTTGA	2	10	419024	419033	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017519	ATTTA	2	10	419277	419286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017519	ATTTT	2	10	419927	419936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017519	ATTTT	2	10	420110	420119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017519	TTAAA	2	10	420479	420488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017519	ACTTC	2	10	420560	420569	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017519	AAAAC	2	10	420726	420735	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017519	TAATT	2	10	421205	421214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017519	TATTT	2	10	421415	421424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017519	AATTA	2	10	427115	427124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017519	TAAAA	2	10	432591	432600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017519	AATTT	2	10	452009	452018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017519	TTTTC	2	10	454811	454820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017519	ATTTA	2	10	455119	455128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017519	CGTAG	2	10	455468	455477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017519	CTTAA	2	10	455694	455703	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017519	CACGA	2	10	455758	455767	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017519	CTATT	2	10	456363	456372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017519	GTTTT	2	10	456842	456851	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017519	GTTTC	2	10	456887	456896	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017519	ATTTT	2	10	465978	465987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017519	TTTAT	2	10	468051	468060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017519	TATTT	2	10	478000	478009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017519	TCAAC	2	10	482538	482547	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017519	ATTTT	2	10	482598	482607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017519	TAAAA	2	10	491152	491161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017519	TAAAT	2	10	492894	492903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017519	TTTTA	2	10	493095	493104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017519	ATTTT	2	10	497492	497501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017519	ATTTT	2	10	513208	513217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017519	ATTTT	2	10	514529	514538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017519	ACAAA	2	10	520403	520412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017519	GTGTT	2	10	524620	524629	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017519	TTTTG	2	10	528280	528289	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017519	ACTTT	2	10	529964	529973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017519	ATTTT	2	10	537282	537291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017519	ATAAA	2	10	559297	559306	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017519	CAAAA	2	10	559430	559439	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017519	CTTTT	2	10	563878	563887	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017519	ATTGT	2	10	563992	564001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017519	ATTTT	2	10	564791	564800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017519	TAATT	2	10	564810	564819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017519	TAAAA	2	10	579723	579732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017519	TTGTT	2	10	601494	601503	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017519	AAAAG	2	10	602394	602403	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017519	ATGAT	2	10	602437	602446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017519	AAATA	2	10	603484	603493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017519	ATTGA	2	10	603778	603787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017519	AATAA	2	10	611408	611417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017519	ATTAA	2	10	614280	614289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017519	ATTTT	2	10	614525	614534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017519	TAAAA	2	10	614568	614577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017519	TTTAA	2	10	621519	621528	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017519	TAATT	2	10	631630	631639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017519	AAATT	2	10	632741	632750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017519	AAATT	2	10	633524	633533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017519	ATTTT	2	10	639798	639807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017519	AAAAC	2	10	653896	653905	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017519	AAAAT	2	10	658166	658175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017519	TTTTA	2	10	663967	663976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017519	AGGAA	2	10	663997	664006	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017519	AAATT	2	10	676633	676642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017519	TTTTG	2	10	676864	676873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017519	ATTTT	2	10	678415	678424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017519	ATATT	2	10	693897	693906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017519	CTTTT	2	10	697095	697104	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017519	ATAAA	2	10	698557	698566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017519	ATTTT	2	10	829528	829537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.