MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 13431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	GTT	2	6	20	25	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858115
2	NC_017519	GGA	3	9	36	44	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385858115
3	NC_017519	AAT	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
4	NC_017519	ACC	2	6	105	110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385858115
5	NC_017519	AAT	2	6	111	116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
6	NC_017519	ACC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385858115
7	NC_017519	TTA	2	6	237	242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858115
8	NC_017519	ATG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858115
9	NC_017519	AAG	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
10	NC_017519	TAA	2	6	383	388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
11	NC_017519	AAC	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858115
12	NC_017519	ATA	2	6	499	504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
13	NC_017519	GAA	2	6	522	527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
14	NC_017519	AGA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
15	NC_017519	TAA	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
16	NC_017519	TGA	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858115
17	NC_017519	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
18	NC_017519	TCT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858115
19	NC_017519	AGA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
20	NC_017519	GGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385858115
21	NC_017519	AAC	3	9	1036	1044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858115
22	NC_017519	TTC	2	6	1049	1054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858115
23	NC_017519	GAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
24	NC_017519	TCA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858115
25	NC_017519	CAT	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017519	GAA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017519	TGT	2	6	1617	1622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017519	ATT	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858116
29	NC_017519	TTA	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858116
30	NC_017519	TAT	2	6	1729	1734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858116
31	NC_017519	GTT	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017519	TTA	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017519	CTT	2	6	1891	1896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017519	TCA	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017519	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017519	TGG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017519	ATT	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017519	GGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017519	ATT	2	6	2183	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858117
40	NC_017519	TCC	3	9	2213	2221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385858117
41	NC_017519	AAC	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858117
42	NC_017519	TGT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858117
43	NC_017519	ATA	2	6	2352	2357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017519	ATA	2	6	2378	2383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858118
45	NC_017519	ATA	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858118
46	NC_017519	ATT	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
47	NC_017519	TGA	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858119
48	NC_017519	ATT	2	6	2704	2709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
49	NC_017519	TAA	2	6	2739	2744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
50	NC_017519	CAA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858119
51	NC_017519	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858119
52	NC_017519	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
53	NC_017519	AAT	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
54	NC_017519	AAT	2	6	3019	3024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
55	NC_017519	ATA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
56	NC_017519	ATT	2	6	3062	3067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
57	NC_017519	GAA	2	6	3110	3115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858119
58	NC_017519	ATT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
59	NC_017519	CTT	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858119
60	NC_017519	TAA	2	6	3169	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
61	NC_017519	TAA	2	6	3187	3192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
62	NC_017519	TTG	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858119
63	NC_017519	TAA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
64	NC_017519	TAA	2	6	3381	3386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
65	NC_017519	TTA	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
66	NC_017519	AAC	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858119
67	NC_017519	AAT	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
68	NC_017519	TGA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858119
69	NC_017519	AAT	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
70	NC_017519	ATA	2	6	3996	4001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
71	NC_017519	CAA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858119
72	NC_017519	ATT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
73	NC_017519	TCA	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858119
74	NC_017519	AAG	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017519	TTA	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017519	AGA	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017519	TTA	2	6	4284	4289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017519	CTG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017519	TTA	3	9	4456	4464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017519	ACA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017519	ATT	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017519	TAG	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017519	TAT	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017519	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017519	ATT	2	6	4781	4786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017519	AAT	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017519	GTG	2	6	4897	4902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017519	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017519	ATG	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017519	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017519	TTG	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017519	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017519	TTC	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017519	ATG	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017519	ATA	2	6	5434	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017519	GAA	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017519	AAG	2	6	5536	5541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017519	ATG	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017519	TAA	2	6	5617	5622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017519	TAT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017519	CAT	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017519	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017519	ATC	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858120
104	NC_017519	CAA	2	6	6074	6079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858120
105	NC_017519	CTT	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858120
106	NC_017519	AAC	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858120
107	NC_017519	TTG	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858120
108	NC_017519	AAT	2	6	6615	6620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858120
109	NC_017519	TTA	2	6	6737	6742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017519	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017519	GAA	2	6	6835	6840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017519	ATT	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017519	GAA	2	6	7076	7081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017519	AGA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017519	GAA	2	6	7097	7102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017519	ATA	2	6	7138	7143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017519	TTA	2	6	7280	7285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858122
118	NC_017519	TCT	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858122
119	NC_017519	CAT	2	6	7725	7730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858122
120	NC_017519	ATT	2	6	8101	8106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858123
121	NC_017519	TGT	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858123
122	NC_017519	ATT	2	6	8203	8208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858123
123	NC_017519	CCT	2	6	8209	8214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385858123
124	NC_017519	TAT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858123
125	NC_017519	CTT	3	9	8275	8283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858123
126	NC_017519	TAC	2	6	8326	8331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858123
127	NC_017519	TAA	2	6	8388	8393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858123
128	NC_017519	TGG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385858123
129	NC_017519	ATT	2	6	8454	8459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858123
130	NC_017519	ATA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858123
131	NC_017519	TGT	2	6	8535	8540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858123
132	NC_017519	TAC	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858123
133	NC_017519	AAT	2	6	8652	8657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858123
134	NC_017519	TAA	2	6	8865	8870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017519	AAT	2	6	8979	8984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858124
136	NC_017519	TAA	2	6	9002	9007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858124
137	NC_017519	AGC	2	6	9038	9043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385858124
138	NC_017519	AAT	2	6	9086	9091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858124
139	NC_017519	ATT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858124
140	NC_017519	TCA	2	6	9136	9141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017519	CTA	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017519	TAC	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017519	ATT	2	6	9271	9276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017519	TTC	2	6	9344	9349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_017519	ATT	2	6	9835	9840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858126
148	NC_017519	ATT	2	6	9970	9975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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