MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 1700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	CAT	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017519	GAA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017519	TGT	2	6	1617	1622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017519	GTT	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017519	TTA	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017519	CTT	2	6	1891	1896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017519	TCA	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017519	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017519	TGG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017519	ATT	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017519	GGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017519	ATA	2	6	2352	2357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017519	AAG	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017519	TTA	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017519	AGA	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017519	TTA	2	6	4284	4289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017519	CTG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017519	TTA	3	9	4456	4464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017519	ACA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017519	ATT	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017519	TAG	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017519	TAT	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017519	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017519	ATT	2	6	4781	4786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017519	AAT	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017519	GTG	2	6	4897	4902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017519	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017519	ATG	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017519	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017519	TTG	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017519	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017519	TTC	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017519	ATG	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017519	ATA	2	6	5434	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017519	GAA	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017519	AAG	2	6	5536	5541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017519	ATG	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017519	TAA	2	6	5617	5622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017519	TAT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017519	CAT	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017519	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017519	TTA	2	6	6737	6742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017519	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017519	GAA	2	6	6835	6840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017519	ATT	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017519	GAA	2	6	7076	7081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017519	AGA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017519	GAA	2	6	7097	7102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017519	ATA	2	6	7138	7143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017519	TAA	2	6	8865	8870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017519	TCA	2	6	9136	9141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017519	CTA	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017519	TAC	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017519	ATT	2	6	9271	9276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017519	TTC	2	6	9344	9349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017519	ATT	2	6	9970	9975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017519	ATT	2	6	10809	10814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017519	TAA	2	6	13560	13565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017519	TAA	2	6	13647	13652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017519	TAA	2	6	13666	13671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017519	TAA	2	6	15619	15624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017519	TAT	2	6	31555	31560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017519	TTA	2	6	33479	33484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017519	TCC	2	6	34414	34419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017519	GAA	2	6	34451	34456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017519	ATT	2	6	34479	34484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017519	TTA	2	6	35884	35889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017519	TAA	2	6	35910	35915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017519	TGT	3	9	35940	35948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017519	TAT	2	6	38524	38529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017519	CAA	2	6	39693	39698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017519	TAA	2	6	40351	40356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017519	ATT	2	6	40384	40389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017519	TTG	2	6	40418	40423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017519	TTA	2	6	40535	40540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017519	ATT	2	6	40548	40553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017519	TAA	2	6	40607	40612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017519	TTG	2	6	40626	40631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017519	TAA	2	6	41250	41255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017519	ATT	2	6	41283	41288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017519	AAT	2	6	41405	41410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017519	AAT	3	9	41499	41507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017519	TAA	2	6	41518	41523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017519	ATT	2	6	42066	42071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017519	ATT	2	6	42113	42118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017519	TTA	2	6	42129	42134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017519	TGT	2	6	42135	42140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017519	TAA	2	6	42223	42228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017519	AAT	2	6	42236	42241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017519	GAA	2	6	42320	42325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017519	CAA	2	6	42352	42357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017519	TTG	2	6	42360	42365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017519	TAT	2	6	42372	42377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017519	ATT	2	6	43363	43368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017519	ATT	2	6	43593	43598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017519	TAG	3	9	43710	43718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017519	TTA	2	6	43724	43729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017519	ATT	2	6	43862	43867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017519	TTA	2	6	43912	43917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017519	ATT	2	6	47392	47397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017519	ATA	2	6	47454	47459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017519	AGA	2	6	47470	47475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017519	ATT	2	6	47484	47489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017519	ATA	2	6	47511	47516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017519	TAG	2	6	47601	47606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017519	ATA	2	6	47637	47642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017519	AGA	2	6	47647	47652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017519	TAA	2	6	47659	47664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017519	ATT	2	6	47794	47799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017519	ATT	2	6	47814	47819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017519	ATA	2	6	47961	47966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017519	GAA	2	6	48059	48064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017519	AAG	2	6	48271	48276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017519	TTA	2	6	48339	48344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017519	TAA	2	6	48395	48400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017519	AGA	2	6	48983	48988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017519	CTA	2	6	48997	49002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017519	CAA	2	6	49014	49019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017519	CAG	2	6	49075	49080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017519	ATC	2	6	49227	49232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017519	CTA	2	6	49265	49270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017519	TAA	2	6	49283	49288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017519	TAA	2	6	49304	49309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017519	AAC	2	6	49352	49357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017519	CAA	2	6	49378	49383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017519	CAA	2	6	49554	49559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017519	TAT	2	6	50331	50336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017519	AAG	2	6	55047	55052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017519	ATT	2	6	55087	55092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017519	GAA	2	6	55124	55129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017519	TCT	2	6	55271	55276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017519	TAA	2	6	55297	55302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017519	TAA	2	6	57146	57151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017519	GAA	2	6	57166	57171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017519	ATC	2	6	57174	57179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017519	ACC	2	6	57207	57212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017519	CTT	2	6	57287	57292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017519	TAT	2	6	57349	57354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017519	AAC	2	6	58761	58766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017519	ATT	2	6	73043	73048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017519	TGT	2	6	73116	73121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_017519	AAT	2	6	73215	73220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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