MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	CGTCGG	3	18	22689	22706	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017518	CGGCGT	2	12	23088	23099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017518	TGTCGG	2	12	24104	24115	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017518	TGGCGG	2	12	24632	24643	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017518	GGCTTG	2	12	30711	30722	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017518	TTGCCG	2	12	38973	38984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017518	GCAAAC	3	18	45697	45714	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017518	CCCAAT	2	12	46670	46681	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017518	TGTATG	2	12	47766	47777	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017518	ACAAAG	2	12	59226	59237	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017518	CAGGAG	2	12	85185	85196	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017518	AAATTT	2	12	105379	105390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017518	TACGCA	2	12	119582	119593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017518	GGAAAA	2	12	132976	132987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017518	CAAAAA	2	12	191264	191275	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017518	CAAAAA	2	12	191580	191591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017518	TTCGGT	2	12	197621	197632	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017518	TTCGGT	2	12	197792	197803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017518	CAAAAA	2	12	220522	220533	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017518	TCCCTT	2	12	237335	237346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017518	ACAAAG	2	12	313059	313070	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017518	AAGCCG	2	12	332834	332845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017518	TTTTGT	2	12	341490	341501	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017518	CGGAAG	2	12	359141	359152	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017518	CAAAAA	2	12	380189	380200	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017518	TTTGCA	2	12	385948	385959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017518	TGCAGT	2	12	386995	387006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017518	CCGTCT	2	12	387997	388008	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017518	TTGCCA	2	12	422712	422723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017518	ATTTAA	2	12	428737	428748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017518	CAAAAA	2	12	431859	431870	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017518	GGGGCG	2	12	441303	441314	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017518	ATTTAA	2	12	450125	450136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017518	ACGGCG	2	12	456011	456022	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017518	GTCCAA	2	12	456899	456910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017518	CAACCC	2	12	497811	497822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017518	CATACA	2	12	503995	504006	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017518	GGGCTT	2	12	505084	505095	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017518	TGCGCC	2	12	505998	506009	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017518	TTTTGT	2	12	509309	509320	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017518	TTTTAC	2	12	534772	534783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017518	ATTTAA	2	12	541858	541869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017518	ACCGAA	2	12	551132	551143	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017518	ACCGAA	2	12	551332	551343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017518	AACCGG	2	12	553765	553776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017518	TTAAAT	2	12	582534	582545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017518	GAATTT	2	12	585744	585755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017518	ATTTAA	2	12	587520	587531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017518	CAAAAT	2	12	603767	603778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017518	TTAAAT	2	12	636403	636414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017518	CAAATC	2	12	636605	636616	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017518	CTTGGG	2	12	649212	649223	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017518	AATTTA	2	12	651816	651827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017518	CGAAAA	2	12	666748	666759	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017518	TCGGTT	2	12	677890	677901	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017518	AAAAAC	2	12	679238	679249	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017518	TTTTAA	2	12	681263	681274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017518	GACGGC	2	12	686021	686032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017518	AAAAAT	2	12	686169	686180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017518	CTAGAC	2	12	687502	687513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017518	AACGGC	2	12	687571	687582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017518	AACGGC	2	12	687640	687651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017518	CGGTAA	2	12	687915	687926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017518	TAAAGC	2	12	688350	688361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017518	TGGCAA	2	12	689379	689390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017518	TTCAAA	2	12	690185	690196	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017518	ATCCGC	2	12	699914	699925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017518	CGGACA	2	12	720455	720466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017518	TTATGT	2	12	755139	755150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017518	TTCGGT	2	12	789254	789265	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017518	CATCTT	2	12	802452	802463	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017518	GCTTGG	2	12	803312	803323	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017518	CTTCGG	2	12	803553	803564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017518	CTGCTT	2	12	803772	803783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017518	TTTTTG	2	12	807127	807138	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017518	TTTTTG	2	12	808958	808969	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017518	ATTTAA	2	12	809133	809144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017518	CCTTAA	2	12	814585	814596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017518	ATTTAA	2	12	814910	814921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017518	CCGAAC	2	12	814963	814974	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017518	ATGCCG	2	12	823069	823080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017518	TTAAAT	2	12	825051	825062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017518	CGTTTG	2	12	841071	841082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017518	CGCCTG	2	12	853397	853408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017518	AAAATA	2	12	856930	856941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017518	TTCGGA	2	12	866871	866882	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017518	GTTGGT	2	12	921355	921366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017518	GGAAAG	2	12	930917	930928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017518	TTAAAT	2	12	932405	932416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017518	ACGGAT	2	12	946892	946903	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017518	AAGGAA	2	12	983265	983276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017518	ATTTAT	2	12	984165	984176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017518	TTCAAT	2	12	984177	984188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017518	TAATCA	2	12	1010055	1010066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017518	TTTAAA	2	12	1012593	1012604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017518	ATTTAA	2	12	1012671	1012682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017518	ATTTAA	2	12	1016229	1016240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017518	ATTTAA	2	12	1049210	1049221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017518	TTGCCT	2	12	1056696	1056707	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017518	AGCCTA	2	12	1056886	1056897	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017518	TCTTTG	2	12	1060884	1060895	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017518	GTTGAT	2	12	1063420	1063431	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017518	ATTTTT	2	12	1068317	1068328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017518	TTAAAT	2	12	1073834	1073845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017518	CGTTTG	2	12	1073989	1074000	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017518	AAAACC	2	12	1078605	1078616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017518	CCACAC	2	12	1079078	1079089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017518	GCCGAT	2	12	1088517	1088528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017518	TTGTTT	2	12	1089307	1089318	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017518	ATTTAA	2	12	1090577	1090588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017518	TTAAAT	2	12	1098178	1098189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017518	TGGCGG	2	12	1100425	1100436	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017518	GTGTTT	2	12	1103162	1103173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017518	TTCGGC	2	12	1108925	1108936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017518	AATTTG	2	12	1130447	1130458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017518	GAAACC	2	12	1224947	1224958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017518	TTAAAT	2	12	1270965	1270976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017518	TGCCGA	2	12	1276986	1276997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017518	CAAACC	2	12	1292168	1292179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017518	GCTGTG	2	12	1305780	1305791	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017518	TTTCAG	2	12	1333231	1333242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017518	CCGGCT	2	12	1333344	1333355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017518	ATTTAA	2	12	1424939	1424950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017518	GCGTTG	2	12	1426488	1426499	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017518	AACAAA	2	12	1427144	1427155	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017518	TAAAAA	2	12	1434481	1434492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017518	TAAATA	2	12	1451990	1452001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017518	GACAAA	2	12	1453242	1453253	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017518	CTAGAC	2	12	1465270	1465281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017518	AACGGC	2	12	1465339	1465350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017518	AACGGC	2	12	1465408	1465419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017518	CGGTAA	2	12	1465683	1465694	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017518	TAAAGC	2	12	1466118	1466129	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017518	TGGCAA	2	12	1467147	1467158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017518	ATTTAA	2	12	1472077	1472088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017518	TTAAAT	2	12	1477149	1477160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017518	ACAGGC	2	12	1527468	1527479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_017518	GAATCT	2	12	1556575	1556586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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141	NC_017518	TTATTT	2	12	1561957	1561968	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.