MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 1618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385856167
2	NC_017518	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385856168
3	NC_017518	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385856168
4	NC_017518	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385856170
5	NC_017518	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385856174
6	NC_017518	TGCTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385856175
7	NC_017518	GGTGC	2	10	8363	8372	0 %	20 %	60 %	20 %	385856176
8	NC_017518	TACCG	2	10	9641	9650	20 %	20 %	20 %	40 %	385856177
9	NC_017518	TCAAT	2	10	10707	10716	40 %	40 %	0 %	20 %	385856178
10	NC_017518	CGCGC	2	10	11720	11729	0 %	0 %	40 %	60 %	385856179
11	NC_017518	CACGC	2	10	12036	12045	20 %	0 %	20 %	60 %	385856180
12	NC_017518	TCCCG	2	10	12890	12899	0 %	20 %	20 %	60 %	385856180
13	NC_017518	TGTCG	2	10	14346	14355	0 %	40 %	40 %	20 %	385856181
14	NC_017518	ATTTA	2	10	14693	14702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017518	CTTGC	2	10	17308	17317	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017518	GGAAA	2	10	17929	17938	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017518	AATTT	2	10	18308	18317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017518	CCGCT	2	10	20078	20087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_017518	ATTTC	2	10	23605	23614	20 %	60 %	0 %	20 %	385856191
20	NC_017518	AGGCG	2	10	26481	26490	20 %	0 %	60 %	20 %	385856194
21	NC_017518	AGGGC	2	10	28603	28612	20 %	0 %	60 %	20 %	385856195
22	NC_017518	AAACC	2	10	29306	29315	60 %	0 %	0 %	40 %	385856196
23	NC_017518	TCCGC	2	10	32606	32615	0 %	20 %	20 %	60 %	385856198
24	NC_017518	GCCTT	3	15	35437	35451	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017518	GGGCT	2	10	40303	40312	0 %	20 %	60 %	20 %	385856203
26	NC_017518	TGCGG	2	10	42842	42851	0 %	20 %	60 %	20 %	385856206
27	NC_017518	GGCGG	2	10	43801	43810	0 %	0 %	80 %	20 %	385856206
28	NC_017518	GCGGT	2	10	44277	44286	0 %	20 %	60 %	20 %	385856207
29	NC_017518	GCGCG	2	10	44674	44683	0 %	0 %	60 %	40 %	385856207
30	NC_017518	ACGGC	2	10	45219	45228	20 %	0 %	40 %	40 %	385856207
31	NC_017518	CCCGT	2	10	45569	45578	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017518	CGGCG	2	10	45910	45919	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017518	TTTGA	2	10	47924	47933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017518	GAAAA	2	10	48575	48584	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017518	CAATT	2	10	48918	48927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017518	GTTGG	2	10	50194	50203	0 %	40 %	60 %	0 %	385856208
37	NC_017518	AAACC	2	10	52584	52593	60 %	0 %	0 %	40 %	385856209
38	NC_017518	CCCGC	2	10	53081	53090	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
39	NC_017518	GTGCG	2	10	54935	54944	0 %	20 %	60 %	20 %	385856211
40	NC_017518	GTAGC	2	10	58110	58119	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017518	TCGTG	2	10	58327	58336	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017518	AGAAA	2	10	59289	59298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017518	GGGAG	2	10	59955	59964	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017518	AGGTT	2	10	60897	60906	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017518	AAGGG	2	10	63078	63087	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017518	ACGGC	2	10	63774	63783	20 %	0 %	40 %	40 %	385856215
47	NC_017518	TGCCG	2	10	66256	66265	0 %	20 %	40 %	40 %	385856217
48	NC_017518	TGGCT	2	10	66585	66594	0 %	40 %	40 %	20 %	385856217
49	NC_017518	TGCCC	2	10	67192	67201	0 %	20 %	20 %	60 %	385856217
50	NC_017518	TCTTT	2	10	69085	69094	0 %	80 %	0 %	20 %	385856219
51	NC_017518	GCGTA	2	10	69311	69320	20 %	20 %	40 %	20 %	385856220
52	NC_017518	AATGG	2	10	70491	70500	40 %	20 %	40 %	0 %	385856221
53	NC_017518	GGGTA	2	10	70675	70684	20 %	20 %	60 %	0 %	385856221
54	NC_017518	TCGGC	2	10	71068	71077	0 %	20 %	40 %	40 %	385856221
55	NC_017518	TGCTA	2	10	72477	72486	20 %	40 %	20 %	20 %	385856222
56	NC_017518	GTTTG	2	10	73342	73351	0 %	60 %	40 %	0 %	385856223
57	NC_017518	AGGCC	2	10	74912	74921	20 %	0 %	40 %	40 %	385856224
58	NC_017518	AAGCA	2	10	76487	76496	60 %	0 %	20 %	20 %	385856225
59	NC_017518	TTTAA	2	10	76737	76746	40 %	60 %	0 %	0 %	385856225
60	NC_017518	GATTT	2	10	78650	78659	20 %	60 %	20 %	0 %	385856227
61	NC_017518	TGTAT	2	10	80052	80061	20 %	60 %	20 %	0 %	385856228
62	NC_017518	AAAAG	2	10	80236	80245	80 %	0 %	20 %	0 %	385856229
63	NC_017518	TTTGA	2	10	80859	80868	20 %	60 %	20 %	0 %	385856229
64	NC_017518	TGGCT	2	10	81792	81801	0 %	40 %	40 %	20 %	385856230
65	NC_017518	GCAAG	2	10	83074	83083	40 %	0 %	40 %	20 %	385856232
66	NC_017518	GCGCG	2	10	84133	84142	0 %	0 %	60 %	40 %	385856232
67	NC_017518	CAACG	2	10	85055	85064	40 %	0 %	20 %	40 %	385856232
68	NC_017518	TTGAT	2	10	85368	85377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017518	TTTCC	2	10	85689	85698	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017518	ATTTT	2	10	86037	86046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017518	GCACG	2	10	87625	87634	20 %	0 %	40 %	40 %	385856234
72	NC_017518	GTTGG	2	10	88135	88144	0 %	40 %	60 %	0 %	385856234
73	NC_017518	ATATT	2	10	90072	90081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017518	TTGAT	2	10	90472	90481	20 %	60 %	20 %	0 %	385856237
75	NC_017518	GTTTG	2	10	90869	90878	0 %	60 %	40 %	0 %	385856237
76	NC_017518	CCCGT	2	10	91409	91418	0 %	20 %	20 %	60 %	385856237
77	NC_017518	CCGTA	2	10	91646	91655	20 %	20 %	20 %	40 %	385856237
78	NC_017518	ACATC	2	10	92547	92556	40 %	20 %	0 %	40 %	385856238
79	NC_017518	CGCAA	2	10	94256	94265	40 %	0 %	20 %	40 %	385856239
80	NC_017518	CAAGC	2	10	94621	94630	40 %	0 %	20 %	40 %	385856239
81	NC_017518	AAAAC	2	10	98862	98871	80 %	0 %	0 %	20 %	385856243
82	NC_017518	TTTGA	2	10	101188	101197	20 %	60 %	20 %	0 %	385856244
83	NC_017518	AAACC	2	10	102912	102921	60 %	0 %	0 %	40 %	385856245
84	NC_017518	ACCAA	2	10	104653	104662	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017518	ATTTA	2	10	105494	105503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017518	AAATA	2	10	105504	105513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017518	ATTAA	2	10	105528	105537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017518	CAGGT	2	10	107107	107116	20 %	20 %	40 %	20 %	385856247
89	NC_017518	TTTGA	2	10	107817	107826	20 %	60 %	20 %	0 %	385856247
90	NC_017518	AATGA	2	10	108524	108533	60 %	20 %	20 %	0 %	385856248
91	NC_017518	GAACA	2	10	110409	110418	60 %	0 %	20 %	20 %	385856248
92	NC_017518	CGTGC	2	10	111715	111724	0 %	20 %	40 %	40 %	385856251
93	NC_017518	GCCGC	2	10	112875	112884	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_017518	AATTG	2	10	113657	113666	40 %	40 %	20 %	0 %	385856252
95	NC_017518	AAAAT	2	10	113918	113927	80 %	20 %	0 %	0 %	385856252
96	NC_017518	CGGCG	2	10	115758	115767	0 %	0 %	60 %	40 %	385856255
97	NC_017518	CAGGT	2	10	117224	117233	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017518	CGCCT	2	10	117910	117919	0 %	20 %	20 %	60 %	385856257
99	NC_017518	GGTAT	2	10	118150	118159	20 %	40 %	40 %	0 %	385856257
100	NC_017518	GGCGC	2	10	118401	118410	0 %	0 %	60 %	40 %	385856257
101	NC_017518	TGCCG	2	10	119524	119533	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017518	CCGCC	2	10	119734	119743	0 %	0 %	20 %	80 %	385856259
103	NC_017518	TGGCG	2	10	119946	119955	0 %	20 %	60 %	20 %	385856259
104	NC_017518	CAAAG	2	10	120156	120165	60 %	0 %	20 %	20 %	385856259
105	NC_017518	GCGCC	2	10	121363	121372	0 %	0 %	40 %	60 %	385856260
106	NC_017518	GGCGC	2	10	121592	121601	0 %	0 %	60 %	40 %	385856260
107	NC_017518	TGAGT	2	10	123209	123218	20 %	40 %	40 %	0 %	385856262
108	NC_017518	GGCAA	2	10	123786	123795	40 %	0 %	40 %	20 %	385856262
109	NC_017518	GTTTT	2	10	126226	126235	0 %	80 %	20 %	0 %	385856264
110	NC_017518	CGTGT	2	10	127990	127999	0 %	40 %	40 %	20 %	385856266
111	NC_017518	GAAAA	2	10	128404	128413	80 %	0 %	20 %	0 %	385856266
112	NC_017518	AGGGC	2	10	128541	128550	20 %	0 %	60 %	20 %	385856266
113	NC_017518	TGATT	2	10	131448	131457	20 %	60 %	20 %	0 %	385856268
114	NC_017518	AATTC	2	10	131523	131532	40 %	40 %	0 %	20 %	385856268
115	NC_017518	GAAGG	2	10	135306	135315	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017518	GTACC	2	10	136877	136886	20 %	20 %	20 %	40 %	385856275
117	NC_017518	TTGGG	2	10	141907	141916	0 %	40 %	60 %	0 %	385856278
118	NC_017518	CATAC	2	10	144383	144392	40 %	20 %	0 %	40 %	385856279
119	NC_017518	GTGAT	2	10	145262	145271	20 %	40 %	40 %	0 %	385856279
120	NC_017518	CCTGC	2	10	150613	150622	0 %	20 %	20 %	60 %	385856285
121	NC_017518	CTTTA	2	10	153170	153179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017518	GAAAA	2	10	154877	154886	80 %	0 %	20 %	0 %	385856292
123	NC_017518	TGATT	2	10	155964	155973	20 %	60 %	20 %	0 %	385856294
124	NC_017518	AATGC	2	10	156658	156667	40 %	20 %	20 %	20 %	385856295
125	NC_017518	GTAAA	2	10	157609	157618	60 %	20 %	20 %	0 %	385856298
126	NC_017518	AATTT	2	10	157833	157842	40 %	60 %	0 %	0 %	385856299
127	NC_017518	TCAAA	2	10	158682	158691	60 %	20 %	0 %	20 %	385856301
128	NC_017518	TTTGG	2	10	159493	159502	0 %	60 %	40 %	0 %	385856303
129	NC_017518	GAAAT	2	10	163339	163348	60 %	20 %	20 %	0 %	385856310
130	NC_017518	AAAAT	2	10	163601	163610	80 %	20 %	0 %	0 %	385856312
131	NC_017518	GGGTT	2	10	165088	165097	0 %	40 %	60 %	0 %	385856315
132	NC_017518	GTCAT	2	10	165610	165619	20 %	40 %	20 %	20 %	385856316
133	NC_017518	GCAAA	2	10	167983	167992	60 %	0 %	20 %	20 %	385856319
134	NC_017518	CGGTT	2	10	168013	168022	0 %	40 %	40 %	20 %	385856319
135	NC_017518	TGGTT	2	10	172501	172510	0 %	60 %	40 %	0 %	385856322
136	NC_017518	CGGCG	2	10	173054	173063	0 %	0 %	60 %	40 %	385856323
137	NC_017518	CCAAA	2	10	173443	173452	60 %	0 %	0 %	40 %	385856323
138	NC_017518	TTTAT	2	10	173650	173659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_017518	TCATA	2	10	359848	359857	40 %	40 %	0 %	20 %	385856468
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500	NC_017518	TTTTA	2	10	718407	718416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

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